MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117720
2	NC_017105	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384117728
3	NC_017105	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
4	NC_017105	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117732
5	NC_017105	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117734
6	NC_017105	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117748
7	NC_017105	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117752
8	NC_017105	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384117753
9	NC_017105	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384117757
10	NC_017105	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384117758
11	NC_017105	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384117761
12	NC_017105	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384117762
13	NC_017105	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384117764
14	NC_017105	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117765
15	NC_017105	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384117768
16	NC_017105	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117770
17	NC_017105	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384117779
18	NC_017105	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384117794
19	NC_017105	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384117801
20	NC_017105	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117802
21	NC_017105	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384117805
22	NC_017105	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117808
23	NC_017105	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117811
24	NC_017105	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384117814
25	NC_017105	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384117814
26	NC_017105	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117825
27	NC_017105	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117828
28	NC_017105	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117835
29	NC_017105	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384117838
30	NC_017105	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384117838
31	NC_017105	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117839
32	NC_017105	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384117844
33	NC_017105	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117850
34	NC_017105	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384117857
35	NC_017105	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117859
36	NC_017105	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117859
37	NC_017105	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384117859
38	NC_017105	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384117863
39	NC_017105	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384117863
40	NC_017105	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117874
41	NC_017105	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117875
42	NC_017105	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384117878
43	NC_017105	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384117880
44	NC_017105	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384117882
45	NC_017105	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117887
46	NC_017105	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384117888
47	NC_017105	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.