MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 1921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017104	CGC	2	6	150510	150515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117679
1502	NC_017104	CCT	2	6	150572	150577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117679
1503	NC_017104	CAC	2	6	150675	150680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117679
1504	NC_017104	GCC	2	6	150706	150711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117679
1505	NC_017104	TCT	2	6	150782	150787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117679
1506	NC_017104	GGC	2	6	150802	150807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117679
1507	NC_017104	CCT	2	6	150863	150868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117679
1508	NC_017104	CTG	3	9	150882	150890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117679
1509	NC_017104	CGG	3	9	150897	150905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117679
1510	NC_017104	GAA	2	6	151001	151006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117679
1511	NC_017104	GTG	2	6	151016	151021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117679
1512	NC_017104	GCA	2	6	151034	151039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117679
1513	NC_017104	GCC	2	6	151052	151057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117679
1514	NC_017104	ATG	2	6	151083	151088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117679
1515	NC_017104	TGG	2	6	151155	151160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117679
1516	NC_017104	ATG	2	6	151250	151255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117680
1517	NC_017104	GGC	2	6	151452	151457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117680
1518	NC_017104	CGT	2	6	151507	151512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117680
1519	NC_017104	TGA	2	6	151564	151569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117680
1520	NC_017104	GAA	2	6	151582	151587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117680
1521	NC_017104	GGC	2	6	151611	151616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117680
1522	NC_017104	GTG	2	6	151778	151783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117680
1523	NC_017104	GAT	3	9	151810	151818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117680
1524	NC_017104	GCA	2	6	151859	151864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117680
1525	NC_017104	GCA	2	6	152003	152008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117680
1526	NC_017104	CGT	2	6	152030	152035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117680
1527	NC_017104	GAA	2	6	152111	152116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117680
1528	NC_017104	CCG	2	6	152161	152166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117680
1529	NC_017104	GGA	2	6	152259	152264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117680
1530	NC_017104	GAA	2	6	152267	152272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117680
1531	NC_017104	TCG	2	6	152480	152485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117680
1532	NC_017104	AGC	2	6	152855	152860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117681
1533	NC_017104	CCG	2	6	153010	153015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117681
1534	NC_017104	TGA	2	6	153072	153077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117681
1535	NC_017104	CAA	2	6	153096	153101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117681
1536	NC_017104	TGG	2	6	153290	153295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117681
1537	NC_017104	AGC	2	6	153305	153310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117681
1538	NC_017104	AGA	2	6	153357	153362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117681
1539	NC_017104	GAC	2	6	153546	153551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117681
1540	NC_017104	GCC	3	9	153556	153564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117681
1541	NC_017104	GTT	2	6	153816	153821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117681
1542	NC_017104	CCA	2	6	153848	153853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117681
1543	NC_017104	ACA	2	6	153881	153886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117681
1544	NC_017104	CCG	2	6	154568	154573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117682
1545	NC_017104	CAC	2	6	154581	154586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117682
1546	NC_017104	GCA	2	6	154645	154650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117682
1547	NC_017104	CTT	2	6	154680	154685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117682
1548	NC_017104	GCA	2	6	154699	154704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117682
1549	NC_017104	CTG	2	6	154969	154974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117683
1550	NC_017104	GGA	2	6	154991	154996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117683
1551	NC_017104	GCC	2	6	155002	155007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117683
1552	NC_017104	ATT	2	6	155009	155014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384117683
1553	NC_017104	TGG	2	6	155232	155237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117683
1554	NC_017104	GAG	2	6	155313	155318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117683
1555	NC_017104	ATG	2	6	155355	155360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117683
1556	NC_017104	ATT	3	9	155630	155638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384117683
1557	NC_017104	ATA	2	6	155720	155725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117683
1558	NC_017104	CTC	2	6	155786	155791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117683
1559	NC_017104	TCT	2	6	155913	155918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117684
1560	NC_017104	ATC	3	9	156017	156025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117684
1561	NC_017104	ACC	2	6	156033	156038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117684
1562	NC_017104	TTC	2	6	156050	156055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117684
1563	NC_017104	TCC	2	6	156059	156064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117684
1564	NC_017104	ACC	2	6	156631	156636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117685
1565	NC_017104	CAG	2	6	156637	156642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1566	NC_017104	CAA	2	6	156668	156673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117685
1567	NC_017104	TGC	2	6	156738	156743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1568	NC_017104	GGC	2	6	156786	156791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117685
1569	NC_017104	CGT	2	6	156798	156803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1570	NC_017104	CCA	2	6	156932	156937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117685
1571	NC_017104	CAG	2	6	156961	156966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1572	NC_017104	GCA	3	9	156988	156996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1573	NC_017104	CTG	2	6	157091	157096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117685
1574	NC_017104	TCA	2	6	157177	157182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117685
1575	NC_017104	TGC	2	6	157299	157304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117686
1576	NC_017104	TGA	2	6	157418	157423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117686
1577	NC_017104	AAT	2	6	157432	157437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117686
1578	NC_017104	GTG	2	6	157802	157807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117687
1579	NC_017104	AGC	2	6	157840	157845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117687
1580	NC_017104	TGC	2	6	158044	158049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117687
1581	NC_017104	ATG	2	6	158056	158061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117687
1582	NC_017104	GCA	2	6	158110	158115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117688
1583	NC_017104	GTC	2	6	158522	158527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117689
1584	NC_017104	ACA	2	6	158533	158538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117689
1585	NC_017104	GCC	2	6	158564	158569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117689
1586	NC_017104	CAA	2	6	158747	158752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117690
1587	NC_017104	CAG	2	6	158845	158850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117690
1588	NC_017104	GCA	2	6	159126	159131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117691
1589	NC_017104	GAT	2	6	159220	159225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117691
1590	NC_017104	TGA	2	6	159303	159308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117691
1591	NC_017104	AAG	2	6	159319	159324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117691
1592	NC_017104	TCT	2	6	159343	159348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117692
1593	NC_017104	GGC	2	6	159354	159359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117692
1594	NC_017104	CGG	2	6	159484	159489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117692
1595	NC_017104	ATT	2	6	159549	159554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384117692
1596	NC_017104	CCT	2	6	160030	160035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117693
1597	NC_017104	TGT	2	6	160093	160098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117693
1598	NC_017104	CTG	2	6	160118	160123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117693
1599	NC_017104	CCT	2	6	160440	160445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117694
1600	NC_017104	TGA	2	6	160522	160527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117694
1601	NC_017104	GCC	2	6	160542	160547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117694
1602	NC_017104	TGC	2	6	160552	160557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117694
1603	NC_017104	GTC	2	6	160707	160712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117694
1604	NC_017104	AGG	2	6	160717	160722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117694
1605	NC_017104	GCA	2	6	160736	160741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117694
1606	NC_017104	TCT	2	6	160989	160994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117694
1607	NC_017104	CCG	2	6	161068	161073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117694
1608	NC_017104	TGA	2	6	161154	161159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117694
1609	NC_017104	GCC	2	6	161261	161266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117694
1610	NC_017104	CCT	2	6	161295	161300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117694
1611	NC_017104	CGC	2	6	161330	161335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117694
1612	NC_017104	ATC	2	6	161379	161384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117694
1613	NC_017104	CAC	2	6	161395	161400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117694
1614	NC_017104	CTG	2	6	161576	161581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117694
1615	NC_017104	GCT	2	6	161653	161658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117694
1616	NC_017104	GAA	2	6	161784	161789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117694
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.