MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 12293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016624	CGG	3	9	19484	19492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
502	NC_016624	CGC	2	6	19512	19517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294083
503	NC_016624	CGG	3	9	19544	19552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
504	NC_016624	CCGG	3	12	19553	19564	0 %	0 %	50 %	50 %	374294083
505	NC_016624	GCGGA	2	10	19573	19582	20 %	0 %	60 %	20 %	374294083
506	NC_016624	GCT	2	6	19599	19604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
507	NC_016624	TCG	2	6	19606	19611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
508	NC_016624	CGG	2	6	19612	19617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
509	NC_016624	GC	3	6	19621	19626	0 %	0 %	50 %	50 %	374294083
510	NC_016624	CGG	2	6	19643	19648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
511	NC_016624	GCT	2	6	19829	19834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
512	NC_016624	CTG	2	6	19890	19895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
513	NC_016624	CGG	2	6	19902	19907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
514	NC_016624	GTG	2	6	19936	19941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294083
515	NC_016624	CGC	3	9	19956	19964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294083
516	NC_016624	GCG	2	6	19967	19972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
517	NC_016624	GGC	2	6	19983	19988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
518	NC_016624	TGC	2	6	20018	20023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
519	NC_016624	CCG	2	6	20036	20041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294083
520	NC_016624	GAC	2	6	20046	20051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294083
521	NC_016624	GCG	3	9	20074	20082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
522	NC_016624	TCG	2	6	20140	20145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
523	NC_016624	GTC	2	6	20163	20168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
524	NC_016624	TCG	2	6	20200	20205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294083
525	NC_016624	CGG	2	6	20207	20212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294083
526	NC_016624	CCG	2	6	20215	20220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294083
527	NC_016624	GGGCG	2	10	20236	20245	0 %	0 %	80 %	20 %	374294083
528	NC_016624	CGG	2	6	20308	20313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
529	NC_016624	GGC	2	6	20315	20320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
530	NC_016624	GCC	2	6	20355	20360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294084
531	NC_016624	GCG	2	6	20381	20386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
532	NC_016624	GCG	2	6	20448	20453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
533	NC_016624	CGA	2	6	20482	20487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294084
534	NC_016624	GC	3	6	20516	20521	0 %	0 %	50 %	50 %	374294084
535	NC_016624	CG	3	6	20527	20532	0 %	0 %	50 %	50 %	374294084
536	NC_016624	CCA	2	6	20554	20559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294084
537	NC_016624	CTG	2	6	20576	20581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294084
538	NC_016624	TCA	2	6	20599	20604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294084
539	NC_016624	CG	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	374294084
540	NC_016624	GGC	2	6	20669	20674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
541	NC_016624	GCCG	2	8	20707	20714	0 %	0 %	50 %	50 %	374294084
542	NC_016624	TCG	2	6	20733	20738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294084
543	NC_016624	GGC	2	6	20741	20746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
544	NC_016624	GC	3	6	20745	20750	0 %	0 %	50 %	50 %	374294084
545	NC_016624	CGG	3	9	20789	20797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
546	NC_016624	GCC	3	9	20853	20861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294084
547	NC_016624	CGG	2	6	20863	20868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294084
548	NC_016624	GGTC	2	8	20905	20912	0 %	25 %	50 %	25 %	374294084
549	NC_016624	CTG	2	6	20951	20956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294084
550	NC_016624	GGA	2	6	21034	21039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294084
551	NC_016624	CG	3	6	21083	21088	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
552	NC_016624	CGT	2	6	21171	21176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294085
553	NC_016624	GC	3	6	21194	21199	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
554	NC_016624	GCC	2	6	21307	21312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294085
555	NC_016624	CCGG	2	8	21361	21368	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
556	NC_016624	CG	4	8	21369	21376	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
557	NC_016624	GGC	2	6	21402	21407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294085
558	NC_016624	GCA	2	6	21408	21413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294085
559	NC_016624	TCC	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294085
560	NC_016624	GCGG	2	8	21445	21452	0 %	0 %	75 %	25 %	374294085
561	NC_016624	TCC	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294085
562	NC_016624	CG	3	6	21505	21510	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
563	NC_016624	GTC	2	6	21517	21522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294085
564	NC_016624	CG	3	6	21530	21535	0 %	0 %	50 %	50 %	374294085
565	NC_016624	CCA	2	6	21555	21560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294085
566	NC_016624	GTC	2	6	21583	21588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294085
567	NC_016624	GCA	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294085
568	NC_016624	TTG	2	6	21659	21664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294085
569	NC_016624	TGT	2	6	21784	21789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294086
570	NC_016624	GCCAG	2	10	21892	21901	20 %	0 %	40 %	40 %	374294086
571	NC_016624	CCAGCT	2	12	21943	21954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294086
572	NC_016624	TTC	2	6	21972	21977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294086
573	NC_016624	CTCCAC	2	12	22100	22111	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374294086
574	NC_016624	GAT	2	6	22127	22132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294086
575	NC_016624	TGG	2	6	22138	22143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294086
576	NC_016624	TGG	2	6	22153	22158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294086
577	NC_016624	CAC	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294086
578	NC_016624	TCA	2	6	22249	22254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294086
579	NC_016624	GC	3	6	22290	22295	0 %	0 %	50 %	50 %	374294086
580	NC_016624	CCG	2	6	22319	22324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294086
581	NC_016624	CAG	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294086
582	NC_016624	CAT	2	6	22343	22348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294086
583	NC_016624	GC	3	6	22360	22365	0 %	0 %	50 %	50 %	374294086
584	NC_016624	TTG	2	6	22581	22586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294086
585	NC_016624	CGC	2	6	22633	22638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294086
586	NC_016624	GC	3	6	22645	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	374294086
587	NC_016624	CAG	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294086
588	NC_016624	TCC	2	6	22674	22679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294086
589	NC_016624	TCGCC	2	10	22717	22726	0 %	20 %	20 %	60 %	374294086
590	NC_016624	GGC	2	6	22745	22750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294086
591	NC_016624	GCG	2	6	22758	22763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294086
592	NC_016624	GGCGG	2	10	22764	22773	0 %	0 %	80 %	20 %	374294086
593	NC_016624	CTG	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294086
594	NC_016624	GCG	2	6	22791	22796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294086
595	NC_016624	GCG	2	6	22809	22814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294086
596	NC_016624	TCG	2	6	22833	22838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294086
597	NC_016624	ATGG	2	8	22860	22867	25 %	25 %	50 %	0 %	374294086
598	NC_016624	GCA	2	6	22934	22939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294087
599	NC_016624	GAC	2	6	22950	22955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294087
600	NC_016624	GCCG	2	8	22961	22968	0 %	0 %	50 %	50 %	374294087
601	NC_016624	GCG	2	6	22995	23000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294087
602	NC_016624	GTC	2	6	23046	23051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294087
603	NC_016624	CG	3	6	23103	23108	0 %	0 %	50 %	50 %	374294087
604	NC_016624	TCGCGG	2	12	23119	23130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374294087
605	NC_016624	CGC	2	6	23182	23187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294087
606	NC_016624	ACC	2	6	23194	23199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294087
607	NC_016624	CGGC	2	8	23225	23232	0 %	0 %	50 %	50 %	374294087
608	NC_016624	CGC	2	6	23244	23249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294087
609	NC_016624	CGG	2	6	23279	23284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294087
610	NC_016624	CGG	2	6	23306	23311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294087
611	NC_016624	GGCG	2	8	23348	23355	0 %	0 %	75 %	25 %	374294087
612	NC_016624	GCT	2	6	23689	23694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294088
613	NC_016624	CTG	2	6	23750	23755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294088
614	NC_016624	CGC	2	6	23772	23777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294088
615	NC_016624	GCCG	2	8	23804	23811	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
616	NC_016624	ACG	2	6	23867	23872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294088
617	NC_016624	GCCC	2	8	23932	23939	0 %	0 %	25 %	75 %	374294088
618	NC_016624	GCG	2	6	23943	23948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294088
619	NC_016624	GC	3	6	24019	24024	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
620	NC_016624	CG	4	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
621	NC_016624	GAG	2	6	24107	24112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294088
622	NC_016624	GC	3	6	24123	24128	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
623	NC_016624	GGT	3	9	24145	24153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294088
624	NC_016624	GCG	2	6	24170	24175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294088
625	NC_016624	CCG	2	6	24216	24221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294088
626	NC_016624	CGGTGA	2	12	24246	24257	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374294088
627	NC_016624	TTC	2	6	24262	24267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294088
628	NC_016624	CTG	2	6	24278	24283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294088
629	NC_016624	GC	3	6	24314	24319	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
630	NC_016624	GGC	2	6	24337	24342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294088
631	NC_016624	CGC	2	6	24418	24423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294088
632	NC_016624	GGT	2	6	24445	24450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294088
633	NC_016624	GTC	2	6	24482	24487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294088
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643	NC_016624	TCCGC	2	10	24810	24819	0 %	20 %	20 %	60 %	374294088
644	NC_016624	GC	3	6	24836	24841	0 %	0 %	50 %	50 %	374294088
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650	NC_016624	CGG	2	6	25047	25052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294088
651	NC_016624	CCGGC	2	10	25107	25116	0 %	0 %	40 %	60 %	374294088
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660	NC_016624	CGA	2	6	25321	25326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294088
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703	NC_016624	CGC	2	6	26688	26693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294091
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750	NC_016624	CGG	3	9	28109	28117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294093
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753	NC_016624	CCG	2	6	28171	28176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294093
754	NC_016624	TGC	2	6	28235	28240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294093
755	NC_016624	ATCGA	2	10	28246	28255	40 %	20 %	20 %	20 %	374294093
756	NC_016624	CGA	2	6	28368	28373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294093
757	NC_016624	AGC	2	6	28412	28417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294093
758	NC_016624	CCG	2	6	28476	28481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294093
759	NC_016624	GC	3	6	28517	28522	0 %	0 %	50 %	50 %	374294093
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761	NC_016624	ACG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294093
762	NC_016624	CGA	2	6	28671	28676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294093
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770	NC_016624	CGG	2	6	28852	28857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294094
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772	NC_016624	TGCC	2	8	28953	28960	0 %	25 %	25 %	50 %	374294094
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774	NC_016624	CGGC	2	8	29011	29018	0 %	0 %	50 %	50 %	374294094
775	NC_016624	CGC	2	6	29045	29050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294094
776	NC_016624	CGG	2	6	29072	29077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294094
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786	NC_016624	GCC	2	6	29373	29378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294094
787	NC_016624	CTGG	2	8	29432	29439	0 %	25 %	50 %	25 %	374294094
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997	NC_016624	CAG	2	6	38126	38131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294105
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1000	NC_016624	CGG	3	9	38261	38269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294105

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