MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 16603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016623	GC	3	6	230	235	0 %	0 %	50 %	50 %	374293520
2	NC_016623	TGG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293520
3	NC_016623	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293520
4	NC_016623	CGT	2	6	541	546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293521
5	NC_016623	GCA	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
6	NC_016623	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
7	NC_016623	GTG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
8	NC_016623	GTG	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
9	NC_016623	CTG	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
10	NC_016623	CGA	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
11	NC_016623	TCA	3	9	1481	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
12	NC_016623	CTT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293522
13	NC_016623	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374293522
14	NC_016623	GC	3	6	1646	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	374293522
15	NC_016623	GCG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
16	NC_016623	GCACC	2	10	1692	1701	20 %	0 %	20 %	60 %	374293522
17	NC_016623	TGGG	2	8	1745	1752	0 %	25 %	75 %	0 %	374293522
18	NC_016623	TGA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293522
19	NC_016623	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
20	NC_016623	GAG	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293522
21	NC_016623	GGT	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
22	NC_016623	CTG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
23	NC_016623	GCG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
24	NC_016623	CGG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
25	NC_016623	CTGC	2	8	1981	1988	0 %	25 %	25 %	50 %	374293522
26	NC_016623	TCG	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
27	NC_016623	CCG	2	6	2079	2084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
28	NC_016623	CTG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
29	NC_016623	CGA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
30	NC_016623	GCC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
31	NC_016623	CTG	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
32	NC_016623	GGT	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293522
33	NC_016623	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
34	NC_016623	TCG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
35	NC_016623	GCG	3	9	2292	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
36	NC_016623	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
37	NC_016623	CTG	3	9	2386	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
38	NC_016623	CGG	2	6	2405	2410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
39	NC_016623	GCC	2	6	2462	2467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293522
40	NC_016623	GCCGGC	2	12	2477	2488	0 %	0 %	50 %	50 %	374293522
41	NC_016623	TCA	3	9	2513	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
42	NC_016623	TCG	3	9	2528	2536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
43	NC_016623	GGC	3	9	2571	2579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
44	NC_016623	GAT	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293522
45	NC_016623	ATC	3	9	2644	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293522
46	NC_016623	CTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
47	NC_016623	GCT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
48	NC_016623	CG	4	8	2736	2743	0 %	0 %	50 %	50 %	374293522
49	NC_016623	CGG	2	6	2750	2755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
50	NC_016623	GGC	3	9	2778	2786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
51	NC_016623	CAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374293522
52	NC_016623	GCG	2	6	2815	2820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
53	NC_016623	CAG	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293522
54	NC_016623	CGG	2	6	2970	2975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293522
55	NC_016623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293522
56	NC_016623	GAGG	2	8	3077	3084	25 %	0 %	75 %	0 %	374293522
57	NC_016623	AGG	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293523
58	NC_016623	GC	3	6	3261	3266	0 %	0 %	50 %	50 %	374293523
59	NC_016623	GGTCG	2	10	3271	3280	0 %	20 %	60 %	20 %	374293523
60	NC_016623	CTG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
61	NC_016623	GTG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293523
62	NC_016623	GCG	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293523
63	NC_016623	CGGGTG	2	12	3356	3367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374293523
64	NC_016623	CGACAC	2	12	3403	3414	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374293523
65	NC_016623	CAT	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293523
66	NC_016623	GTC	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
67	NC_016623	GGCT	2	8	3494	3501	0 %	25 %	50 %	25 %	374293523
68	NC_016623	GCT	3	9	3526	3534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293523
69	NC_016623	CAC	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293524
70	NC_016623	CGG	2	6	3649	3654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293524
71	NC_016623	CCG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293524
72	NC_016623	GCGG	2	8	3743	3750	0 %	0 %	75 %	25 %	374293524
73	NC_016623	TCC	2	6	3783	3788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293524
74	NC_016623	TTC	2	6	3800	3805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293524
75	NC_016623	TCG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293524
76	NC_016623	CTG	2	6	3849	3854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293524
77	NC_016623	GCG	3	9	3912	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293524
78	NC_016623	CAG	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
79	NC_016623	TCC	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293524
80	NC_016623	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
81	NC_016623	TGG	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293524
82	NC_016623	G	6	6	4142	4147	0 %	0 %	100 %	0 %	374293524
83	NC_016623	CAG	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293524
84	NC_016623	CGGC	2	8	4233	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	374293525
85	NC_016623	CAG	2	6	4267	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293525
86	NC_016623	TCG	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
87	NC_016623	TCT	2	6	4326	4331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293525
88	NC_016623	GAT	2	6	4366	4371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293525
89	NC_016623	GGC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293525
90	NC_016623	TCG	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
91	NC_016623	GCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293525
92	NC_016623	GC	3	6	4477	4482	0 %	0 %	50 %	50 %	374293525
93	NC_016623	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293525
94	NC_016623	CGC	2	6	4532	4537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293525
95	NC_016623	AGC	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293525
96	NC_016623	TCC	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293525
97	NC_016623	CGT	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
98	NC_016623	TCG	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293525
99	NC_016623	GGCC	2	8	4655	4662	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
100	NC_016623	GC	3	6	4667	4672	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
101	NC_016623	ATCC	2	8	4708	4715	25 %	25 %	0 %	50 %	374293526
102	NC_016623	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293526
103	NC_016623	CCTCGG	2	12	4756	4767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374293526
104	NC_016623	G	6	6	4783	4788	0 %	0 %	100 %	0 %	374293526
105	NC_016623	ATGACG	2	12	4791	4802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374293526
106	NC_016623	CAG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
107	NC_016623	CGG	2	6	4903	4908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
108	NC_016623	CCT	3	9	4924	4932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
109	NC_016623	AGG	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293526
110	NC_016623	TCG	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
111	NC_016623	CGG	2	6	5101	5106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
112	NC_016623	CGG	2	6	5136	5141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
113	NC_016623	GAG	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374293526
114	NC_016623	ATG	3	9	5148	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293526
115	NC_016623	CAG	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
116	NC_016623	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374293526
117	NC_016623	CAG	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
118	NC_016623	GC	3	6	5247	5252	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
119	NC_016623	CCG	2	6	5293	5298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
120	NC_016623	TCG	3	9	5361	5369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
121	NC_016623	GCGG	2	8	5387	5394	0 %	0 %	75 %	25 %	374293526
122	NC_016623	GGCC	2	8	5413	5420	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
123	NC_016623	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
124	NC_016623	TC	3	6	5527	5532	0 %	50 %	0 %	50 %	374293526
125	NC_016623	CCAGCC	2	12	5566	5577	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374293526
126	NC_016623	GCG	2	6	5591	5596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
127	NC_016623	GTG	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374293526
128	NC_016623	GGC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
129	NC_016623	ATGCCG	2	12	5658	5669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374293526
130	NC_016623	CCG	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
131	NC_016623	GC	3	6	5742	5747	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
132	NC_016623	CGAC	2	8	5749	5756	25 %	0 %	25 %	50 %	374293526
133	NC_016623	GGC	2	6	5786	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
134	NC_016623	CAC	2	6	5828	5833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293526
135	NC_016623	CTT	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293526
136	NC_016623	CAG	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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138	NC_016623	TCT	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374293526
139	NC_016623	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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141	NC_016623	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
142	NC_016623	GGCG	2	8	6205	6212	0 %	0 %	75 %	25 %	374293526
143	NC_016623	CTC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
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145	NC_016623	CGGCG	2	10	6340	6349	0 %	0 %	60 %	40 %	374293526
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149	NC_016623	GTC	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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151	NC_016623	GGC	3	9	6455	6463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293526
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153	NC_016623	CGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374293526
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156	NC_016623	CTC	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
157	NC_016623	CCT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293526
158	NC_016623	CGGCG	2	10	6616	6625	0 %	0 %	60 %	40 %	374293526
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163	NC_016623	CCCG	2	8	6768	6775	0 %	0 %	25 %	75 %	374293526
164	NC_016623	CGC	2	6	6776	6781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293526
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181	NC_016623	CG	3	6	7332	7337	0 %	0 %	50 %	50 %	374293526
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250	NC_016623	GCC	2	6	9800	9805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293528
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252	NC_016623	CGG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293528
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255	NC_016623	CCG	2	6	9990	9995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374293529
256	NC_016623	GAT	2	6	10028	10033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293529
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258	NC_016623	CCT	3	9	10144	10152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374293529
259	NC_016623	GAT	2	6	10193	10198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374293529
260	NC_016623	CGATGC	2	12	10225	10236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374293529
261	NC_016623	CCA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293529
262	NC_016623	GTC	2	6	10316	10321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374293529
263	NC_016623	GCGG	2	8	10325	10332	0 %	0 %	75 %	25 %	374293529
264	NC_016623	CCTC	2	8	10342	10349	0 %	25 %	0 %	75 %	374293529
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270	NC_016623	CGG	2	6	10468	10473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293529
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371	NC_016623	CGG	2	6	14523	14528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374293532
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387	NC_016623	CG	3	6	15189	15194	0 %	0 %	50 %	50 %	374293532
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500	NC_016623	ACC	2	6	19678	19683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374293538

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