MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p2

Total Repeats: 18624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016586	TGG	2	6	231290	231295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999049
5002	NC_016586	CCG	2	6	231300	231305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5003	NC_016586	GC	5	10	231322	231331	0 %	0 %	50 %	50 %	374999049
5004	NC_016586	CCG	2	6	231333	231338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5005	NC_016586	GCCC	2	8	231353	231360	0 %	0 %	25 %	75 %	374999049
5006	NC_016586	GGA	2	6	231372	231377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999049
5007	NC_016586	GCG	2	6	231410	231415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999049
5008	NC_016586	CGA	2	6	231471	231476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999049
5009	NC_016586	CGG	2	6	231491	231496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999049
5010	NC_016586	GCG	2	6	231533	231538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999049
5011	NC_016586	GCG	2	6	231642	231647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999049
5012	NC_016586	GCCC	2	8	231653	231660	0 %	0 %	25 %	75 %	374999049
5013	NC_016586	GCC	3	9	231674	231682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5014	NC_016586	AGC	3	9	231683	231691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999049
5015	NC_016586	CGG	2	6	231711	231716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999049
5016	NC_016586	TCC	2	6	231731	231736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999049
5017	NC_016586	TCCGG	2	10	231860	231869	0 %	20 %	40 %	40 %	374999049
5018	NC_016586	TCG	2	6	231875	231880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999049
5019	NC_016586	CGA	2	6	231885	231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999049
5020	NC_016586	CAGCCC	2	12	231904	231915	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	374999049
5021	NC_016586	GCC	2	6	231931	231936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5022	NC_016586	GC	3	6	231972	231977	0 %	0 %	50 %	50 %	374999049
5023	NC_016586	CCGC	2	8	232005	232012	0 %	0 %	25 %	75 %	374999049
5024	NC_016586	CGC	2	6	232044	232049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5025	NC_016586	TCA	2	6	232059	232064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999049
5026	NC_016586	GCA	2	6	232065	232070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999049
5027	NC_016586	CCG	2	6	232113	232118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999049
5028	NC_016586	ACC	2	6	232628	232633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999050
5029	NC_016586	GCCG	2	8	232646	232653	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5030	NC_016586	TCG	2	6	232666	232671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5031	NC_016586	CGG	2	6	232686	232691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5032	NC_016586	GCT	3	9	232699	232707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5033	NC_016586	CGG	2	6	232710	232715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5034	NC_016586	GAA	2	6	232768	232773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999050
5035	NC_016586	TCCTTC	2	12	232877	232888	0 %	50 %	0 %	50 %	374999050
5036	NC_016586	CGA	2	6	232891	232896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5037	NC_016586	AGC	2	6	232899	232904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5038	NC_016586	CCT	2	6	232956	232961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999050
5039	NC_016586	CGA	2	6	233029	233034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5040	NC_016586	CTG	2	6	233044	233049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5041	NC_016586	CGT	2	6	233053	233058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5042	NC_016586	GCG	2	6	233069	233074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5043	NC_016586	TTC	2	6	233093	233098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999050
5044	NC_016586	CGTC	2	8	233112	233119	0 %	25 %	25 %	50 %	374999050
5045	NC_016586	GTC	2	6	233147	233152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5046	NC_016586	GAA	3	9	233155	233163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999050
5047	NC_016586	GC	3	6	233199	233204	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5048	NC_016586	AGA	2	6	233223	233228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374999050
5049	NC_016586	TGC	2	6	233238	233243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5050	NC_016586	GTC	2	6	233254	233259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5051	NC_016586	CGA	2	6	233263	233268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5052	NC_016586	CGGC	2	8	233281	233288	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5053	NC_016586	CGA	2	6	233314	233319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5054	NC_016586	GGC	3	9	233453	233461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5055	NC_016586	GC	3	6	233460	233465	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5056	NC_016586	GC	3	6	233546	233551	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5057	NC_016586	CAA	2	6	233662	233667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374999050
5058	NC_016586	CTT	2	6	233743	233748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999050
5059	NC_016586	ACCG	2	8	233756	233763	25 %	0 %	25 %	50 %	374999050
5060	NC_016586	CGGC	2	8	233778	233785	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5061	NC_016586	CAA	2	6	233794	233799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374999050
5062	NC_016586	GCC	2	6	233816	233821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999050
5063	NC_016586	TCG	2	6	233829	233834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5064	NC_016586	GCC	2	6	233874	233879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999050
5065	NC_016586	TCGAGG	2	12	233883	233894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374999050
5066	NC_016586	GCCG	2	8	233911	233918	0 %	0 %	50 %	50 %	374999050
5067	NC_016586	CGC	2	6	233952	233957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999050
5068	NC_016586	CGG	2	6	233965	233970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5069	NC_016586	CGC	2	6	234022	234027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999050
5070	NC_016586	AGG	2	6	234039	234044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999050
5071	NC_016586	CGA	2	6	234121	234126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999050
5072	NC_016586	ACC	2	6	234158	234163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999050
5073	NC_016586	AGG	2	6	234186	234191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999050
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5075	NC_016586	CACCGG	2	12	234241	234252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374999050
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5080	NC_016586	GCG	2	6	234411	234416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999050
5081	NC_016586	ACC	2	6	234431	234436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999050
5082	NC_016586	CAT	2	6	234591	234596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999051
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5086	NC_016586	CCCG	2	8	234734	234741	0 %	0 %	25 %	75 %	374999051
5087	NC_016586	CGG	2	6	234744	234749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999051
5088	NC_016586	GAG	2	6	234754	234759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999051
5089	NC_016586	CCA	2	6	234767	234772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999051
5090	NC_016586	CG	3	6	234797	234802	0 %	0 %	50 %	50 %	374999051
5091	NC_016586	GCG	2	6	235007	235012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999051
5092	NC_016586	CCG	2	6	235067	235072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999051
5093	NC_016586	AGG	2	6	235142	235147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999051
5094	NC_016586	CTGTCC	2	12	235153	235164	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374999051
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5098	NC_016586	CAG	2	6	235322	235327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999052
5099	NC_016586	CTGCG	2	10	235337	235346	0 %	20 %	40 %	40 %	374999052
5100	NC_016586	CGC	2	6	235367	235372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999052
5101	NC_016586	GCC	2	6	235386	235391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999052
5102	NC_016586	CGA	2	6	235540	235545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999052
5103	NC_016586	CGA	2	6	235552	235557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999052
5104	NC_016586	AGGC	2	8	235858	235865	25 %	0 %	50 %	25 %	374999053
5105	NC_016586	CTG	2	6	235920	235925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999053
5106	NC_016586	GCG	2	6	236076	236081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999053
5107	NC_016586	CCG	2	6	236146	236151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999053
5108	NC_016586	CCA	2	6	236164	236169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999053
5109	NC_016586	GCCG	2	8	236204	236211	0 %	0 %	50 %	50 %	374999053
5110	NC_016586	GGC	2	6	236219	236224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999053
5111	NC_016586	CTG	2	6	236410	236415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999054
5112	NC_016586	GCG	2	6	236536	236541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999054
5113	NC_016586	GCC	2	6	236575	236580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
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5115	NC_016586	CCG	2	6	236633	236638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
5116	NC_016586	CGAGG	2	10	236728	236737	20 %	0 %	60 %	20 %	374999054
5117	NC_016586	TGG	2	6	236750	236755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999054
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5119	NC_016586	CGA	2	6	236784	236789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999054
5120	NC_016586	CGC	2	6	236793	236798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
5121	NC_016586	GT	3	6	236834	236839	0 %	50 %	50 %	0 %	374999054
5122	NC_016586	TCG	2	6	236840	236845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999054
5123	NC_016586	GCT	2	6	236882	236887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999054
5124	NC_016586	GGA	2	6	236904	236909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999054
5125	NC_016586	CTG	2	6	236938	236943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999054
5126	NC_016586	CCG	2	6	236955	236960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
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5130	NC_016586	GGC	3	9	237042	237050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999054
5131	NC_016586	GCC	2	6	237103	237108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
5132	NC_016586	GGC	2	6	237129	237134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999054
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5134	NC_016586	CCA	2	6	237191	237196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999054
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5139	NC_016586	CCAT	2	8	237383	237390	25 %	25 %	0 %	50 %	374999054
5140	NC_016586	GGGC	2	8	237407	237414	0 %	0 %	75 %	25 %	374999054
5141	NC_016586	CGG	2	6	237461	237466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999054
5142	NC_016586	GAT	2	6	237468	237473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374999054
5143	NC_016586	CTT	2	6	237477	237482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999054
5144	NC_016586	GCC	2	6	237501	237506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999054
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5146	NC_016586	GGA	2	6	238004	238009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999055
5147	NC_016586	GGC	2	6	238041	238046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999055
5148	NC_016586	CG	3	6	238090	238095	0 %	0 %	50 %	50 %	374999055
5149	NC_016586	TCG	2	6	238096	238101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999055
5150	NC_016586	CCGG	2	8	238131	238138	0 %	0 %	50 %	50 %	374999055
5151	NC_016586	GTG	3	9	238143	238151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374999055
5152	NC_016586	CGAC	2	8	238249	238256	25 %	0 %	25 %	50 %	374999055
5153	NC_016586	GGA	2	6	238322	238327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999055
5154	NC_016586	TGCTGA	2	12	238360	238371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374999055
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5159	NC_016586	CCG	2	6	238471	238476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999055
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5161	NC_016586	CGGC	2	8	238605	238612	0 %	0 %	50 %	50 %	374999055
5162	NC_016586	CCTTCG	2	12	238642	238653	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374999055
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5164	NC_016586	CGCTG	2	10	238733	238742	0 %	20 %	40 %	40 %	374999055
5165	NC_016586	CCG	2	6	238775	238780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999055
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5168	NC_016586	CGCGG	2	10	238867	238876	0 %	0 %	60 %	40 %	374999055
5169	NC_016586	CAT	2	6	238913	238918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999055
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5171	NC_016586	GCG	2	6	239017	239022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999055
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5176	NC_016586	GC	3	6	239226	239231	0 %	0 %	50 %	50 %	374999056
5177	NC_016586	TCA	2	6	239268	239273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999056
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5180	NC_016586	CGA	2	6	239467	239472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999056
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5211	NC_016586	GCA	2	6	240894	240899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999058
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5217	NC_016586	GATCAG	2	12	241183	241194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374999058
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5221	NC_016586	ATC	2	6	241280	241285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374999058
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5226	NC_016586	GACG	2	8	241453	241460	25 %	0 %	50 %	25 %	374999058
5227	NC_016586	CGA	2	6	241473	241478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999058
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5230	NC_016586	ACG	2	6	241886	241891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999059
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5232	NC_016586	CCG	2	6	241947	241952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999059
5233	NC_016586	GGC	2	6	241957	241962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999059
5234	NC_016586	CAG	2	6	242035	242040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999059
5235	NC_016586	TCG	2	6	242042	242047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999059
5236	NC_016586	CGCGA	2	10	242060	242069	20 %	0 %	40 %	40 %	374999059
5237	NC_016586	GC	3	6	242076	242081	0 %	0 %	50 %	50 %	374999059
5238	NC_016586	CCA	2	6	242118	242123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374999059
5239	NC_016586	TCC	2	6	242168	242173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999059
5240	NC_016586	CCG	2	6	242220	242225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999059
5241	NC_016586	GCG	2	6	242270	242275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999059
5242	NC_016586	AAGG	2	8	242276	242283	50 %	0 %	50 %	0 %	374999059
5243	NC_016586	GC	3	6	242302	242307	0 %	0 %	50 %	50 %	374999059
5244	NC_016586	CGG	2	6	242313	242318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999059
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5352	NC_016586	CTGGG	2	10	246637	246646	0 %	20 %	60 %	20 %	374999062
5353	NC_016586	GCA	2	6	246660	246665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999062
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5357	NC_016586	CG	3	6	246843	246848	0 %	0 %	50 %	50 %	374999063
5358	NC_016586	CCT	2	6	246850	246855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374999063
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5362	NC_016586	TGCC	2	8	246902	246909	0 %	25 %	25 %	50 %	374999063
5363	NC_016586	GCC	2	6	246925	246930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999063
5364	NC_016586	TGATCG	2	12	246942	246953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374999063
5365	NC_016586	CCG	2	6	246969	246974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999063
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5367	NC_016586	GGA	2	6	246991	246996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999063
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5375	NC_016586	GCT	2	6	247198	247203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999063
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5480	NC_016586	GCTCG	2	10	251160	251169	0 %	20 %	40 %	40 %	374999067
5481	NC_016586	CTG	2	6	251191	251196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999067
5482	NC_016586	CACCGT	2	12	251232	251243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374999067
5483	NC_016586	CGG	2	6	251244	251249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999067
5484	NC_016586	CAG	2	6	251293	251298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999067
5485	NC_016586	CCG	2	6	251376	251381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5486	NC_016586	CGC	3	9	251382	251390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5487	NC_016586	TCG	2	6	251408	251413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999067
5488	NC_016586	GGC	2	6	251455	251460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999067
5489	NC_016586	CTG	3	9	251491	251499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374999067
5490	NC_016586	CGC	2	6	251532	251537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5491	NC_016586	AGG	2	6	251567	251572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374999067
5492	NC_016586	AGC	2	6	251594	251599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374999067
5493	NC_016586	CA	3	6	251652	251657	50 %	0 %	0 %	50 %	374999067
5494	NC_016586	GCCG	2	8	251675	251682	0 %	0 %	50 %	50 %	374999067
5495	NC_016586	GCC	2	6	251684	251689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5496	NC_016586	CCGCGC	2	12	251716	251727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5497	NC_016586	CGC	2	6	251811	251816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374999067
5498	NC_016586	CGG	2	6	251936	251941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374999068
5499	NC_016586	AAAG	2	8	251984	251991	75 %	0 %	25 %	0 %	374999068
5500	NC_016586	TTC	2	6	252019	252024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374999068

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