MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 1275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016513	TGCCA	2	10	850204	850213	20 %	20 %	20 %	40 %	365967114
502	NC_016513	AGGTC	2	10	851900	851909	20 %	20 %	40 %	20 %	365967115
503	NC_016513	AACGC	2	10	855811	855820	40 %	0 %	20 %	40 %	365967119
504	NC_016513	ATGCG	2	10	858282	858291	20 %	20 %	40 %	20 %	365967122
505	NC_016513	AGTTT	2	10	864165	864174	20 %	60 %	20 %	0 %	365967128
506	NC_016513	GGCGT	2	10	864416	864425	0 %	20 %	60 %	20 %	365967128
507	NC_016513	GAAAA	2	10	866922	866931	80 %	0 %	20 %	0 %	365967131
508	NC_016513	TTGCT	2	10	870884	870893	0 %	60 %	20 %	20 %	365967138
509	NC_016513	TGATT	2	10	871983	871992	20 %	60 %	20 %	0 %	365967138
510	NC_016513	TTTAA	2	10	873066	873075	40 %	60 %	0 %	0 %	365967139
511	NC_016513	AAAAT	2	10	880248	880257	80 %	20 %	0 %	0 %	365967149
512	NC_016513	ATGAA	2	10	881034	881043	60 %	20 %	20 %	0 %	365967149
513	NC_016513	TCAAA	2	10	881428	881437	60 %	20 %	0 %	20 %	365967149
514	NC_016513	TGCCG	2	10	882001	882010	0 %	20 %	40 %	40 %	365967150
515	NC_016513	CAAAT	2	10	882165	882174	60 %	20 %	0 %	20 %	365967151
516	NC_016513	TGTTT	2	10	885691	885700	0 %	80 %	20 %	0 %	365967156
517	NC_016513	ATAAG	2	10	885795	885804	60 %	20 %	20 %	0 %	365967156
518	NC_016513	GCAGC	2	10	886973	886982	20 %	0 %	40 %	40 %	365967158
519	NC_016513	CTATT	2	10	890046	890055	20 %	60 %	0 %	20 %	365967161
520	NC_016513	AACAA	2	10	890186	890195	80 %	0 %	0 %	20 %	365967161
521	NC_016513	TGAAG	2	10	890805	890814	40 %	20 %	40 %	0 %	365967161
522	NC_016513	AGCTC	2	10	891022	891031	20 %	20 %	20 %	40 %	365967162
523	NC_016513	GTTTG	2	10	892828	892837	0 %	60 %	40 %	0 %	365967163
524	NC_016513	ACCGA	2	10	894330	894339	40 %	0 %	20 %	40 %	365967165
525	NC_016513	CGCAC	2	10	895119	895128	20 %	0 %	20 %	60 %	365967165
526	NC_016513	ACCAA	2	10	898709	898718	60 %	0 %	0 %	40 %	365967169
527	NC_016513	AAGCC	2	10	900867	900876	40 %	0 %	20 %	40 %	365967172
528	NC_016513	ACAAA	2	10	903363	903372	80 %	0 %	0 %	20 %	365967174
529	NC_016513	ACGGC	2	10	904822	904831	20 %	0 %	40 %	40 %	365967176
530	NC_016513	CCGCC	2	10	905115	905124	0 %	0 %	20 %	80 %	365967176
531	NC_016513	GAATG	2	10	905417	905426	40 %	20 %	40 %	0 %	365967176
532	NC_016513	CGTGG	2	10	906553	906562	0 %	20 %	60 %	20 %	365967177
533	NC_016513	CTTGG	2	10	907578	907587	0 %	40 %	40 %	20 %	365967178
534	NC_016513	GGCAG	2	10	907752	907761	20 %	0 %	60 %	20 %	365967178
535	NC_016513	GCAAC	2	10	910168	910177	40 %	0 %	20 %	40 %	365967181
536	NC_016513	GATTT	2	10	913487	913496	20 %	60 %	20 %	0 %	365967184
537	NC_016513	AAATT	2	10	915938	915947	60 %	40 %	0 %	0 %	365967185
538	NC_016513	GTCCA	2	10	917361	917370	20 %	20 %	20 %	40 %	365967188
539	NC_016513	CACCT	2	10	917759	917768	20 %	20 %	0 %	60 %	365967188
540	NC_016513	AAAAT	2	10	917950	917959	80 %	20 %	0 %	0 %	365967188
541	NC_016513	TTTAT	2	10	918194	918203	20 %	80 %	0 %	0 %	365967189
542	NC_016513	AAAGT	2	10	919710	919719	60 %	20 %	20 %	0 %	365967190
543	NC_016513	TGGCA	2	10	920427	920436	20 %	20 %	40 %	20 %	365967191
544	NC_016513	TTAAC	2	10	920583	920592	40 %	40 %	0 %	20 %	365967191
545	NC_016513	ACCGA	2	10	921200	921209	40 %	0 %	20 %	40 %	365967191
546	NC_016513	ACCCA	2	10	921255	921264	40 %	0 %	0 %	60 %	365967191
547	NC_016513	GTGCG	2	10	922253	922262	0 %	20 %	60 %	20 %	365967192
548	NC_016513	CACTG	2	10	924047	924056	20 %	20 %	20 %	40 %	365967193
549	NC_016513	CGGCA	2	10	925580	925589	20 %	0 %	40 %	40 %	365967193
550	NC_016513	AACCC	2	10	927160	927169	40 %	0 %	0 %	60 %	365967194
551	NC_016513	TGCAA	2	10	928959	928968	40 %	20 %	20 %	20 %	365967194
552	NC_016513	GGAAC	2	10	929737	929746	40 %	0 %	40 %	20 %	365967196
553	NC_016513	GGCAC	2	10	933577	933586	20 %	0 %	40 %	40 %	365967198
554	NC_016513	TGAAA	2	10	937863	937872	60 %	20 %	20 %	0 %	365967202
555	NC_016513	TTTTC	2	10	938265	938274	0 %	80 %	0 %	20 %	365967203
556	NC_016513	TTGAT	2	10	938470	938479	20 %	60 %	20 %	0 %	365967203
557	NC_016513	TGAAA	2	10	938717	938726	60 %	20 %	20 %	0 %	365967203
558	NC_016513	ATTTT	2	10	940948	940957	20 %	80 %	0 %	0 %	365967207
559	NC_016513	GCGGT	2	10	944964	944973	0 %	20 %	60 %	20 %	365967210
560	NC_016513	ATTTG	2	10	946490	946499	20 %	60 %	20 %	0 %	365967211
561	NC_016513	ATTTG	2	10	946817	946826	20 %	60 %	20 %	0 %	365967211
562	NC_016513	ACCGA	2	10	947656	947665	40 %	0 %	20 %	40 %	365967212
563	NC_016513	CTGGT	2	10	949081	949090	0 %	40 %	40 %	20 %	365967213
564	NC_016513	TTGAT	2	10	953425	953434	20 %	60 %	20 %	0 %	365967216
565	NC_016513	CAGTG	2	10	954614	954623	20 %	20 %	40 %	20 %	365967217
566	NC_016513	ACGCC	2	10	954733	954742	20 %	0 %	20 %	60 %	365967217
567	NC_016513	GAGAA	2	10	955468	955477	60 %	0 %	40 %	0 %	365967217
568	NC_016513	CCTTG	2	10	956050	956059	0 %	40 %	20 %	40 %	365967217
569	NC_016513	AATCC	2	10	959214	959223	40 %	20 %	0 %	40 %	365967221
570	NC_016513	TAATT	2	10	960570	960579	40 %	60 %	0 %	0 %	365967222
571	NC_016513	TACAA	2	10	963900	963909	60 %	20 %	0 %	20 %	365967224
572	NC_016513	CCGAT	2	10	965057	965066	20 %	20 %	20 %	40 %	365967226
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574	NC_016513	AAAAT	2	10	970948	970957	80 %	20 %	0 %	0 %	365967234
575	NC_016513	GACCG	2	10	971851	971860	20 %	0 %	40 %	40 %	365967235
576	NC_016513	ACATC	2	10	972336	972345	40 %	20 %	0 %	40 %	365967235
577	NC_016513	GATTT	2	10	973866	973875	20 %	60 %	20 %	0 %	365967236
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579	NC_016513	CGCAC	2	10	975512	975521	20 %	0 %	20 %	60 %	365967237
580	NC_016513	GTCAA	2	10	976671	976680	40 %	20 %	20 %	20 %	365967238
581	NC_016513	AATCC	2	10	980739	980748	40 %	20 %	0 %	40 %	365967242
582	NC_016513	GTTAT	2	10	981029	981038	20 %	60 %	20 %	0 %	365967243
583	NC_016513	ATTAA	2	10	982352	982361	60 %	40 %	0 %	0 %	365967244
584	NC_016513	AGATT	2	10	985115	985124	40 %	40 %	20 %	0 %	365967247
585	NC_016513	TAGCA	2	10	985212	985221	40 %	20 %	20 %	20 %	365967247
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587	NC_016513	TAACA	2	10	986044	986053	60 %	20 %	0 %	20 %	365967248
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589	NC_016513	AAACA	2	10	987162	987171	80 %	0 %	0 %	20 %	365967249
590	NC_016513	ACTTC	2	10	988721	988730	20 %	40 %	0 %	40 %	365967250
591	NC_016513	TAAAG	2	10	989551	989560	60 %	20 %	20 %	0 %	365967251
592	NC_016513	AACAC	2	10	989615	989624	60 %	0 %	0 %	40 %	365967251
593	NC_016513	TACTA	2	10	989639	989648	40 %	40 %	0 %	20 %	365967251
594	NC_016513	CAATG	2	10	990383	990392	40 %	20 %	20 %	20 %	365967252
595	NC_016513	GTTCG	2	10	990997	991006	0 %	40 %	40 %	20 %	365967253
596	NC_016513	TCTTT	2	10	991656	991665	0 %	80 %	0 %	20 %	365967253
597	NC_016513	GGCTT	2	10	994828	994837	0 %	40 %	40 %	20 %	365967258
598	NC_016513	AATCG	2	10	996813	996822	40 %	20 %	20 %	20 %	365967260
599	NC_016513	TTTCC	2	10	997182	997191	0 %	60 %	0 %	40 %	365967260
600	NC_016513	TTGCC	2	10	997493	997502	0 %	40 %	20 %	40 %	365967260
601	NC_016513	GTGCG	2	10	998485	998494	0 %	20 %	60 %	20 %	365967262
602	NC_016513	ATCAA	2	10	1001901	1001910	60 %	20 %	0 %	20 %	365967263
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610	NC_016513	AAATT	2	10	1021637	1021646	60 %	40 %	0 %	0 %	365967281
611	NC_016513	AAAAC	2	10	1022209	1022218	80 %	0 %	0 %	20 %	365967281
612	NC_016513	GGCTT	2	10	1022923	1022932	0 %	40 %	40 %	20 %	365967282
613	NC_016513	CATGC	2	10	1026861	1026870	20 %	20 %	20 %	40 %	365967285
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615	NC_016513	AATTT	2	10	1030640	1030649	40 %	60 %	0 %	0 %	365967288
616	NC_016513	ATTCA	2	10	1033283	1033292	40 %	40 %	0 %	20 %	365967291
617	NC_016513	AATTG	2	10	1033345	1033354	40 %	40 %	20 %	0 %	365967291
618	NC_016513	AAAAG	2	10	1033588	1033597	80 %	0 %	20 %	0 %	365967292
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627	NC_016513	GCGAC	2	10	1043342	1043351	20 %	0 %	40 %	40 %	365967302
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