MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 37989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	ACA	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966242
2	NC_016513	TGA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966242
3	NC_016513	AAC	2	6	206	211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966242
4	NC_016513	GAT	2	6	223	228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966242
5	NC_016513	TCA	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966242
6	NC_016513	TCA	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966242
7	NC_016513	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	365966243
8	NC_016513	AGTT	2	8	427	434	25 %	50 %	25 %	0 %	365966243
9	NC_016513	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966243
10	NC_016513	AAG	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966243
11	NC_016513	A	7	7	556	562	100 %	0 %	0 %	0 %	365966243
12	NC_016513	ATCG	2	8	726	733	25 %	25 %	25 %	25 %	365966244
13	NC_016513	TGT	2	6	857	862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966244
14	NC_016513	CTT	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966244
15	NC_016513	CTT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966245
16	NC_016513	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	365966245
17	NC_016513	CTT	2	6	995	1000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966245
18	NC_016513	GGTA	2	8	1021	1028	25 %	25 %	50 %	0 %	365966245
19	NC_016513	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966246
20	NC_016513	CG	3	6	1614	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	365966246
21	NC_016513	GAATG	2	10	1621	1630	40 %	20 %	40 %	0 %	365966246
22	NC_016513	TGA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966246
23	NC_016513	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	365966246
24	NC_016513	ATT	2	6	1726	1731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
25	NC_016513	A	6	6	1751	1756	100 %	0 %	0 %	0 %	365966246
26	NC_016513	TA	3	6	1787	1792	50 %	50 %	0 %	0 %	365966246
27	NC_016513	TCA	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966246
28	NC_016513	CAAA	2	8	1907	1914	75 %	0 %	0 %	25 %	365966246
29	NC_016513	AAAC	2	8	1916	1923	75 %	0 %	0 %	25 %	365966246
30	NC_016513	TTA	2	6	1950	1955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
31	NC_016513	TTA	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
32	NC_016513	AGTC	2	8	2048	2055	25 %	25 %	25 %	25 %	365966246
33	NC_016513	AAG	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966246
34	NC_016513	AATCA	2	10	2078	2087	60 %	20 %	0 %	20 %	365966246
35	NC_016513	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	365966247
36	NC_016513	ACT	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966247
37	NC_016513	AAC	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966247
38	NC_016513	CAT	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966247
39	NC_016513	AGC	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966247
40	NC_016513	GAA	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966247
41	NC_016513	GAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966248
42	NC_016513	ATTA	2	8	2643	2650	50 %	50 %	0 %	0 %	365966248
43	NC_016513	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966248
44	NC_016513	ACG	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966249
45	NC_016513	TTC	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966249
46	NC_016513	TGCACG	2	12	4081	4092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966249
47	NC_016513	ATATT	2	10	4109	4118	40 %	60 %	0 %	0 %	365966249
48	NC_016513	TCG	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966249
49	NC_016513	ACGC	2	8	4153	4160	25 %	0 %	25 %	50 %	365966249
50	NC_016513	TTG	2	6	4161	4166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966249
51	NC_016513	TGC	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966249
52	NC_016513	GTT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966249
53	NC_016513	CCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966249
54	NC_016513	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966249
55	NC_016513	GAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966249
56	NC_016513	CGC	2	6	4354	4359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966249
57	NC_016513	TTTA	2	8	4424	4431	25 %	75 %	0 %	0 %	365966250
58	NC_016513	CAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
59	NC_016513	AAG	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966250
60	NC_016513	T	6	6	4641	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
61	NC_016513	ATT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966250
62	NC_016513	TAA	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
63	NC_016513	CAC	2	6	4733	4738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
64	NC_016513	TAT	2	6	4832	4837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966250
65	NC_016513	AC	3	6	4901	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	365966250
66	NC_016513	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966250
67	NC_016513	T	6	6	5064	5069	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
68	NC_016513	CAC	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
69	NC_016513	TCA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
70	NC_016513	ACC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
71	NC_016513	CAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966250
72	NC_016513	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
73	NC_016513	TCCAT	2	10	5562	5571	20 %	40 %	0 %	40 %	365966250
74	NC_016513	GGGC	2	8	5593	5600	0 %	0 %	75 %	25 %	365966250
75	NC_016513	TCA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
76	NC_016513	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
77	NC_016513	ACT	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
78	NC_016513	T	6	6	5705	5710	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
79	NC_016513	TTC	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
80	NC_016513	GTTC	2	8	5811	5818	0 %	50 %	25 %	25 %	365966251
81	NC_016513	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966251
82	NC_016513	A	7	7	5944	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	365966251
83	NC_016513	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966251
84	NC_016513	ATA	2	6	5990	5995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966251
85	NC_016513	TTTA	2	8	6067	6074	25 %	75 %	0 %	0 %	365966251
86	NC_016513	TAC	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966251
87	NC_016513	GCC	3	9	6097	6105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966251
88	NC_016513	A	7	7	6121	6127	100 %	0 %	0 %	0 %	365966251
89	NC_016513	CGCTTT	2	12	6166	6177	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	365966251
90	NC_016513	CTGC	2	8	6375	6382	0 %	25 %	25 %	50 %	365966251
91	NC_016513	CTT	3	9	6396	6404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
92	NC_016513	GCA	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966251
93	NC_016513	TCAGCT	2	12	6440	6451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966251
94	NC_016513	CAG	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966251
95	NC_016513	TTC	2	6	6535	6540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
96	NC_016513	TTCT	2	8	6601	6608	0 %	75 %	0 %	25 %	365966251
97	NC_016513	GTT	2	6	6630	6635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966251
98	NC_016513	GTT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966251
99	NC_016513	TCT	2	6	6662	6667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
100	NC_016513	TGTC	2	8	6716	6723	0 %	50 %	25 %	25 %	365966251
101	NC_016513	T	6	6	6733	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	365966251
102	NC_016513	TGT	2	6	6740	6745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966251
103	NC_016513	CCG	2	6	6824	6829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966251
104	NC_016513	AAC	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966251
105	NC_016513	ATG	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966251
106	NC_016513	TTAA	2	8	6961	6968	50 %	50 %	0 %	0 %	365966252
107	NC_016513	CTT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966252
108	NC_016513	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966252
109	NC_016513	ATTGT	2	10	7077	7086	20 %	60 %	20 %	0 %	365966252
110	NC_016513	GCC	2	6	7154	7159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966252
111	NC_016513	TAA	2	6	7276	7281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966252
112	NC_016513	CGA	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966252
113	NC_016513	AATT	2	8	7471	7478	50 %	50 %	0 %	0 %	365966253
114	NC_016513	TGG	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365966253
115	NC_016513	GCA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966253
116	NC_016513	CAAT	2	8	7631	7638	50 %	25 %	0 %	25 %	365966253
117	NC_016513	TGC	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966253
118	NC_016513	A	6	6	7910	7915	100 %	0 %	0 %	0 %	365966253
119	NC_016513	TTTA	2	8	7968	7975	25 %	75 %	0 %	0 %	365966253
120	NC_016513	ATG	2	6	8053	8058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966253
121	NC_016513	GATTAA	2	12	8085	8096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365966253
122	NC_016513	AAAT	2	8	8130	8137	75 %	25 %	0 %	0 %	365966253
123	NC_016513	CTG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966253
124	NC_016513	CAT	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966254
125	NC_016513	A	6	6	8317	8322	100 %	0 %	0 %	0 %	365966254
126	NC_016513	CAG	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966254
127	NC_016513	CGC	2	6	8384	8389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966254
128	NC_016513	AAT	2	6	8395	8400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966254
129	NC_016513	ACG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966254
130	NC_016513	AAC	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966254
131	NC_016513	TTG	2	6	8453	8458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966254
132	NC_016513	AAATT	2	10	8463	8472	60 %	40 %	0 %	0 %	365966254
133	NC_016513	A	6	6	8502	8507	100 %	0 %	0 %	0 %	365966254
134	NC_016513	GCGT	2	8	8516	8523	0 %	25 %	50 %	25 %	365966254
135	NC_016513	ATA	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966254
136	NC_016513	TTC	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966255
137	NC_016513	CAC	2	6	9198	9203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966255
138	NC_016513	AAG	2	6	9217	9222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966255
139	NC_016513	TAA	2	6	9267	9272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966255
140	NC_016513	ATGG	2	8	9292	9299	25 %	25 %	50 %	0 %	365966255
141	NC_016513	ATG	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966255
142	NC_016513	AAG	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966255
143	NC_016513	GTT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966255
144	NC_016513	CTT	2	6	9503	9508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966255
145	NC_016513	ATCA	2	8	9537	9544	50 %	25 %	0 %	25 %	365966255
146	NC_016513	ACA	2	6	9553	9558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966255
147	NC_016513	CACC	2	8	9620	9627	25 %	0 %	0 %	75 %	365966255
148	NC_016513	GGT	2	6	9696	9701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365966255
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150	NC_016513	TGT	2	6	9781	9786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966255
151	NC_016513	TAA	2	6	9816	9821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966255
152	NC_016513	AAC	2	6	9871	9876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966255
153	NC_016513	GGC	2	6	9954	9959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365966255
154	NC_016513	ATC	2	6	9970	9975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966255
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156	NC_016513	GCG	2	6	10076	10081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365966255
157	NC_016513	ATA	2	6	10096	10101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966255
158	NC_016513	CTT	2	6	10112	10117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966255
159	NC_016513	T	6	6	10116	10121	0 %	100 %	0 %	0 %	365966255
160	NC_016513	CCA	2	6	10206	10211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966255
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168	NC_016513	GAC	2	6	10549	10554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966256
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171	NC_016513	CAT	2	6	10625	10630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966256
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174	NC_016513	TTC	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966256
175	NC_016513	T	6	6	10815	10820	0 %	100 %	0 %	0 %	365966256
176	NC_016513	CTC	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365966256
177	NC_016513	TC	3	6	10825	10830	0 %	50 %	0 %	50 %	365966256
178	NC_016513	GTT	2	6	10832	10837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966256
179	NC_016513	TTGT	2	8	10914	10921	0 %	75 %	25 %	0 %	365966256
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181	NC_016513	TCTGC	2	10	10982	10991	0 %	40 %	20 %	40 %	365966256
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187	NC_016513	ACCG	2	8	11355	11362	25 %	0 %	25 %	50 %	365966256
188	NC_016513	A	6	6	11475	11480	100 %	0 %	0 %	0 %	365966256
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249	NC_016513	TTCT	2	8	15309	15316	0 %	75 %	0 %	25 %	365966261
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251	NC_016513	AT	4	8	15382	15389	50 %	50 %	0 %	0 %	365966261
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256	NC_016513	GTA	2	6	15484	15489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966262
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258	NC_016513	TCT	2	6	15636	15641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966262
259	NC_016513	GCC	2	6	15662	15667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966262
260	NC_016513	TGC	2	6	15674	15679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966262
261	NC_016513	T	6	6	15725	15730	0 %	100 %	0 %	0 %	365966262
262	NC_016513	CCA	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966262
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264	NC_016513	CCG	2	6	15909	15914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966262
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388	NC_016513	CA	3	6	21950	21955	50 %	0 %	0 %	50 %	365966269
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390	NC_016513	GA	3	6	22136	22141	50 %	0 %	50 %	0 %	365966269
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392	NC_016513	ACC	2	6	22194	22199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966269
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