MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39503	NC_015942	TGC	2	6	2175378	2175383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200307
39504	NC_015942	ATC	2	6	2175402	2175407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200307
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39506	NC_015942	GAC	2	6	2175432	2175437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200307
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39513	NC_015942	TGC	2	6	2175856	2175861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200307
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39607	NC_015942	GC	3	6	2180350	2180355	0 %	0 %	50 %	50 %	344200312
39608	NC_015942	C	6	6	2180355	2180360	0 %	0 %	0 %	100 %	344200312
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39615	NC_015942	CAA	2	6	2180609	2180614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200313
39616	NC_015942	GCT	2	6	2180664	2180669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200313
39617	NC_015942	GCGATA	2	12	2180692	2180703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344200313
39618	NC_015942	CCG	2	6	2180731	2180736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200313
39619	NC_015942	GCC	2	6	2180768	2180773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200313
39620	NC_015942	TCC	2	6	2180796	2180801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200313
39621	NC_015942	CAG	3	9	2180826	2180834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200313
39622	NC_015942	GCC	2	6	2180881	2180886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200313
39623	NC_015942	GCA	2	6	2180894	2180899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200313
39624	NC_015942	TGC	2	6	2180980	2180985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200313
39625	NC_015942	CAG	2	6	2181002	2181007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200313
39626	NC_015942	TGA	2	6	2181038	2181043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200313
39627	NC_015942	GGC	2	6	2181046	2181051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200313
39628	NC_015942	GCC	3	9	2181142	2181150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200313
39629	NC_015942	GC	4	8	2181151	2181158	0 %	0 %	50 %	50 %	344200313
39630	NC_015942	GCC	2	6	2181344	2181349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200314
39631	NC_015942	CTG	2	6	2181400	2181405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200314
39632	NC_015942	GGTC	2	8	2181417	2181424	0 %	25 %	50 %	25 %	344200314
39633	NC_015942	GCT	2	6	2181621	2181626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200314
39634	NC_015942	ATAACG	2	12	2181716	2181727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344200314
39635	NC_015942	G	6	6	2181836	2181841	0 %	0 %	100 %	0 %	344200314
39636	NC_015942	CAC	2	6	2181866	2181871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200314
39637	NC_015942	CGA	2	6	2181910	2181915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200314
39638	NC_015942	GCCA	2	8	2181997	2182004	25 %	0 %	25 %	50 %	344200314
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39640	NC_015942	CTG	2	6	2182122	2182127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200315
39641	NC_015942	GCT	2	6	2182131	2182136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200315
39642	NC_015942	CG	3	6	2182166	2182171	0 %	0 %	50 %	50 %	344200315
39643	NC_015942	GCA	2	6	2182255	2182260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200315
39644	NC_015942	AGA	2	6	2182278	2182283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200315
39645	NC_015942	GGCGG	2	10	2182309	2182318	0 %	0 %	80 %	20 %	344200315
39646	NC_015942	TCA	2	6	2182330	2182335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200315
39647	NC_015942	AGCTGG	2	12	2182365	2182376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344200315
39648	NC_015942	CATC	2	8	2182448	2182455	25 %	25 %	0 %	50 %	344200315
39649	NC_015942	TCC	2	6	2182498	2182503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200315
39650	NC_015942	CTT	3	9	2182514	2182522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200315
39651	NC_015942	CGGT	2	8	2182532	2182539	0 %	25 %	50 %	25 %	344200315
39652	NC_015942	CAG	2	6	2182613	2182618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200315
39653	NC_015942	GCC	2	6	2182651	2182656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200315
39654	NC_015942	GTC	2	6	2182657	2182662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200315
39655	NC_015942	CA	3	6	2182729	2182734	50 %	0 %	0 %	50 %	344200315
39656	NC_015942	AGC	2	6	2182819	2182824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200315
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39674	NC_015942	CAG	2	6	2183546	2183551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200315
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39685	NC_015942	ACT	2	6	2184072	2184077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200315
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39693	NC_015942	ATC	2	6	2184612	2184617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200316
39694	NC_015942	GAC	2	6	2184618	2184623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200316
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39697	NC_015942	TTC	2	6	2184801	2184806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200316
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39700	NC_015942	TTC	2	6	2184930	2184935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200316
39701	NC_015942	CCG	2	6	2184942	2184947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200316
39702	NC_015942	CAC	2	6	2184953	2184958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200316
39703	NC_015942	ACC	3	9	2184979	2184987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200316
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39705	NC_015942	ATA	2	6	2185063	2185068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200316
39706	NC_015942	CAC	2	6	2185113	2185118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200316
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39708	NC_015942	CA	3	6	2185167	2185172	50 %	0 %	0 %	50 %	344200316
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39710	NC_015942	CCG	2	6	2185313	2185318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200316
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39712	NC_015942	CAG	2	6	2185332	2185337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200316
39713	NC_015942	GCT	2	6	2185364	2185369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200316
39714	NC_015942	GCA	2	6	2185379	2185384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200316
39715	NC_015942	TTCAGG	2	12	2185460	2185471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344200317
39716	NC_015942	CCG	2	6	2185536	2185541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200317
39717	NC_015942	TGC	2	6	2185565	2185570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200317
39718	NC_015942	CCG	2	6	2185572	2185577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200317
39719	NC_015942	GCA	2	6	2185620	2185625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200317
39720	NC_015942	ATGG	2	8	2185696	2185703	25 %	25 %	50 %	0 %	344200317
39721	NC_015942	GCA	2	6	2185743	2185748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200317
39722	NC_015942	AGAA	2	8	2185783	2185790	75 %	0 %	25 %	0 %	344200317
39723	NC_015942	CAG	2	6	2185813	2185818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200317
39724	NC_015942	GGC	2	6	2185855	2185860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200317
39725	NC_015942	CATA	2	8	2185869	2185876	50 %	25 %	0 %	25 %	344200317
39726	NC_015942	ACC	2	6	2185919	2185924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200317
39727	NC_015942	CG	3	6	2186094	2186099	0 %	0 %	50 %	50 %	344200317
39728	NC_015942	CAC	2	6	2186134	2186139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200317
39729	NC_015942	GCGCAG	2	12	2186245	2186256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344200317
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39731	NC_015942	CCG	2	6	2186334	2186339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200317
39732	NC_015942	ATC	2	6	2186374	2186379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200317
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39835	NC_015942	CTC	2	6	2191650	2191655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200324
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39848	NC_015942	TGG	2	6	2192156	2192161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200325
39849	NC_015942	GAT	2	6	2192187	2192192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200325
39850	NC_015942	GA	4	8	2192196	2192203	50 %	0 %	50 %	0 %	344200325
39851	NC_015942	C	7	7	2192234	2192240	0 %	0 %	0 %	100 %	344200325
39852	NC_015942	CAC	2	6	2192287	2192292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200325
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39854	NC_015942	TGGGCG	2	12	2192363	2192374	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344200325
39855	NC_015942	GCC	2	6	2192411	2192416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200325
39856	NC_015942	GCG	2	6	2192448	2192453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200325
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39859	NC_015942	GCT	2	6	2192735	2192740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200325
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39922	NC_015942	TTA	2	6	2195339	2195344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200328
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39960	NC_015942	TGG	2	6	2197748	2197753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200330
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39964	NC_015942	CCG	2	6	2197853	2197858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200330
39965	NC_015942	CTG	2	6	2197870	2197875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200330
39966	NC_015942	TAC	2	6	2197909	2197914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200330
39967	NC_015942	TCA	3	9	2197947	2197955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200331
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39972	NC_015942	TCG	2	6	2198166	2198171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200331
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39975	NC_015942	CTG	2	6	2198261	2198266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200331
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39991	NC_015942	TGA	4	12	2199007	2199018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200331
39992	NC_015942	CTG	2	6	2199020	2199025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200331
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39999	NC_015942	CAGC	2	8	2199532	2199539	25 %	0 %	25 %	50 %	344200332
40000	NC_015942	GCG	2	6	2199635	2199640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200332

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