MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_015942	ACC	2	6	2020651	2020656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200161
36502	NC_015942	CCCG	2	8	2020683	2020690	0 %	0 %	25 %	75 %	344200161
36503	NC_015942	GTTT	2	8	2020740	2020747	0 %	75 %	25 %	0 %	344200161
36504	NC_015942	TTA	2	6	2020777	2020782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200161
36505	NC_015942	CG	3	6	2020787	2020792	0 %	0 %	50 %	50 %	344200161
36506	NC_015942	ATT	2	6	2020821	2020826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200161
36507	NC_015942	GCT	2	6	2020889	2020894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200161
36508	NC_015942	CTTT	2	8	2020924	2020931	0 %	75 %	0 %	25 %	344200161
36509	NC_015942	ATCC	2	8	2020986	2020993	25 %	25 %	0 %	50 %	344200161
36510	NC_015942	AGCA	2	8	2021081	2021088	50 %	0 %	25 %	25 %	344200161
36511	NC_015942	TTA	2	6	2021349	2021354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200162
36512	NC_015942	GGC	2	6	2021395	2021400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200162
36513	NC_015942	CGC	2	6	2021406	2021411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200162
36514	NC_015942	CGC	2	6	2021442	2021447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200162
36515	NC_015942	CGG	2	6	2021542	2021547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200162
36516	NC_015942	CTG	3	9	2021561	2021569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36517	NC_015942	CGCC	2	8	2021644	2021651	0 %	0 %	25 %	75 %	344200162
36518	NC_015942	ATC	2	6	2021699	2021704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200162
36519	NC_015942	CTA	2	6	2021848	2021853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200162
36520	NC_015942	GCA	2	6	2021868	2021873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36521	NC_015942	GTC	2	6	2021913	2021918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36522	NC_015942	TGC	2	6	2021970	2021975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36523	NC_015942	TGC	2	6	2021989	2021994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36524	NC_015942	GCC	2	6	2022020	2022025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200162
36525	NC_015942	AGG	2	6	2022060	2022065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200162
36526	NC_015942	GAA	2	6	2022086	2022091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200162
36527	NC_015942	CAG	2	6	2022146	2022151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36528	NC_015942	GCC	2	6	2022161	2022166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200162
36529	NC_015942	CTC	2	6	2022188	2022193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200162
36530	NC_015942	GCGCG	2	10	2022210	2022219	0 %	0 %	60 %	40 %	344200162
36531	NC_015942	GTT	2	6	2022223	2022228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200162
36532	NC_015942	GC	3	6	2022234	2022239	0 %	0 %	50 %	50 %	344200162
36533	NC_015942	GCT	2	6	2022304	2022309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36534	NC_015942	CAG	2	6	2022347	2022352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36535	NC_015942	GCA	2	6	2022376	2022381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36536	NC_015942	GCC	2	6	2022383	2022388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200162
36537	NC_015942	TCG	2	6	2022430	2022435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36538	NC_015942	GCG	2	6	2022484	2022489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200162
36539	NC_015942	CGG	2	6	2022490	2022495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200162
36540	NC_015942	GCT	2	6	2022511	2022516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36541	NC_015942	AGC	2	6	2022569	2022574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36542	NC_015942	TGG	2	6	2022591	2022596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200162
36543	NC_015942	TGG	2	6	2022599	2022604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200162
36544	NC_015942	ATG	2	6	2022627	2022632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200162
36545	NC_015942	GAA	2	6	2022665	2022670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200162
36546	NC_015942	AGC	2	6	2022682	2022687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36547	NC_015942	CGGCGA	2	12	2022725	2022736	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344200162
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36550	NC_015942	GAC	2	6	2022800	2022805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200162
36551	NC_015942	CA	3	6	2022905	2022910	50 %	0 %	0 %	50 %	344200163
36552	NC_015942	TGC	2	6	2022922	2022927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36553	NC_015942	GCT	2	6	2022947	2022952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36554	NC_015942	TGC	2	6	2022980	2022985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36555	NC_015942	CGG	2	6	2023013	2023018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200163
36556	NC_015942	ACC	2	6	2023042	2023047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200163
36557	NC_015942	CTG	2	6	2023252	2023257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36558	NC_015942	CAGA	2	8	2023263	2023270	50 %	0 %	25 %	25 %	344200163
36559	NC_015942	CCG	2	6	2023277	2023282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200163
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36562	NC_015942	GAC	2	6	2023413	2023418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36563	NC_015942	TCCAAC	2	12	2023459	2023470	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344200163
36564	NC_015942	CG	3	6	2023483	2023488	0 %	0 %	50 %	50 %	344200163
36565	NC_015942	CTG	2	6	2023491	2023496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36566	NC_015942	GAG	2	6	2023497	2023502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200163
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36568	NC_015942	CG	3	6	2023538	2023543	0 %	0 %	50 %	50 %	344200163
36569	NC_015942	CCG	2	6	2023741	2023746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200163
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36571	NC_015942	GGC	3	9	2023877	2023885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200163
36572	NC_015942	CAGTG	2	10	2023895	2023904	20 %	20 %	40 %	20 %	344200163
36573	NC_015942	TCGCTG	2	12	2023920	2023931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200163
36574	NC_015942	CTA	2	6	2023994	2023999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200163
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36577	NC_015942	TCCA	2	8	2024181	2024188	25 %	25 %	0 %	50 %	344200163
36578	NC_015942	GCA	2	6	2024214	2024219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200164
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36582	NC_015942	CGCC	2	8	2024362	2024369	0 %	0 %	25 %	75 %	344200164
36583	NC_015942	CTC	2	6	2024396	2024401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200164
36584	NC_015942	CGA	2	6	2024446	2024451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200164
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36586	NC_015942	CCTG	2	8	2024632	2024639	0 %	25 %	25 %	50 %	344200164
36587	NC_015942	ATC	2	6	2024734	2024739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200165
36588	NC_015942	GCA	3	9	2024922	2024930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200165
36589	NC_015942	ATC	2	6	2024950	2024955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200165
36590	NC_015942	GC	3	6	2024968	2024973	0 %	0 %	50 %	50 %	344200165
36591	NC_015942	AGA	2	6	2025009	2025014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200165
36592	NC_015942	TGA	2	6	2025074	2025079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200165
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36594	NC_015942	CGTG	2	8	2025190	2025197	0 %	25 %	50 %	25 %	344200165
36595	NC_015942	CCTG	2	8	2025218	2025225	0 %	25 %	25 %	50 %	344200165
36596	NC_015942	GAG	2	6	2025316	2025321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200165
36597	NC_015942	TC	3	6	2025458	2025463	0 %	50 %	0 %	50 %	344200166
36598	NC_015942	TGG	2	6	2025468	2025473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200166
36599	NC_015942	CGA	2	6	2025484	2025489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200166
36600	NC_015942	TGG	2	6	2025534	2025539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200166
36601	NC_015942	G	6	6	2025543	2025548	0 %	0 %	100 %	0 %	344200166
36602	NC_015942	CTG	2	6	2025632	2025637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200166
36603	NC_015942	TCA	2	6	2025654	2025659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200166
36604	NC_015942	GC	3	6	2025803	2025808	0 %	0 %	50 %	50 %	344200166
36605	NC_015942	TGG	2	6	2025834	2025839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200166
36606	NC_015942	TCG	2	6	2025855	2025860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200166
36607	NC_015942	GGC	2	6	2025886	2025891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200166
36608	NC_015942	CCGGA	2	10	2025936	2025945	20 %	0 %	40 %	40 %	344200166
36609	NC_015942	CGT	2	6	2026097	2026102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200166
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36611	NC_015942	GGA	2	6	2026298	2026303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200167
36612	NC_015942	CG	3	6	2026402	2026407	0 %	0 %	50 %	50 %	344200167
36613	NC_015942	CGT	2	6	2026424	2026429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200167
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36731	NC_015942	ATC	2	6	2031643	2031648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200170
36732	NC_015942	AAAGGC	2	12	2031655	2031666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344200170
36733	NC_015942	GCT	2	6	2031690	2031695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200170
36734	NC_015942	CCG	2	6	2031696	2031701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200170
36735	NC_015942	GCA	2	6	2031740	2031745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200170
36736	NC_015942	CCG	2	6	2031775	2031780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200170
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36739	NC_015942	CTG	2	6	2031859	2031864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200170
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36742	NC_015942	CGG	2	6	2032037	2032042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200171
36743	NC_015942	CTG	2	6	2032151	2032156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200171
36744	NC_015942	CAAC	2	8	2032169	2032176	50 %	0 %	0 %	50 %	344200171
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36746	NC_015942	GCT	2	6	2032280	2032285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200171
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36748	NC_015942	C	6	6	2032321	2032326	0 %	0 %	0 %	100 %	344200171
36749	NC_015942	ATCTC	2	10	2032367	2032376	20 %	40 %	0 %	40 %	344200171
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36752	NC_015942	ATC	2	6	2032565	2032570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200172
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36754	NC_015942	GA	3	6	2032680	2032685	50 %	0 %	50 %	0 %	344200172
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36757	NC_015942	GCT	2	6	2032946	2032951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200172
36758	NC_015942	CGGG	2	8	2032954	2032961	0 %	0 %	75 %	25 %	344200172
36759	NC_015942	CAG	2	6	2032967	2032972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200172
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36762	NC_015942	GCCA	2	8	2033085	2033092	25 %	0 %	25 %	50 %	344200172
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36766	NC_015942	GC	3	6	2033151	2033156	0 %	0 %	50 %	50 %	344200172
36767	NC_015942	GCT	2	6	2033497	2033502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200173
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36818	NC_015942	CGT	2	6	2035957	2035962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200174
36819	NC_015942	TGC	2	6	2036025	2036030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200174
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36822	NC_015942	CAT	2	6	2036134	2036139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200174
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36826	NC_015942	GC	3	6	2036231	2036236	0 %	0 %	50 %	50 %	344200174
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36829	NC_015942	CCAC	2	8	2036373	2036380	25 %	0 %	0 %	75 %	344200174
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36831	NC_015942	CGCC	2	8	2036554	2036561	0 %	0 %	25 %	75 %	344200174
36832	NC_015942	GAA	2	6	2036579	2036584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200174
36833	NC_015942	GCCC	2	8	2036614	2036621	0 %	0 %	25 %	75 %	344200174
36834	NC_015942	CT	3	6	2036628	2036633	0 %	50 %	0 %	50 %	344200174
36835	NC_015942	CGG	2	6	2036652	2036657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200174
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36837	NC_015942	GCTC	2	8	2036834	2036841	0 %	25 %	25 %	50 %	344200175
36838	NC_015942	GAA	2	6	2036920	2036925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200175
36839	NC_015942	CGACG	2	10	2036929	2036938	20 %	0 %	40 %	40 %	344200175
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36842	NC_015942	CTGG	2	8	2037133	2037140	0 %	25 %	50 %	25 %	344200176
36843	NC_015942	GCC	2	6	2037161	2037166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200176
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