MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015942	TGGCT	2	10	423488	423497	0 %	40 %	40 %	20 %	344198636
8002	NC_015942	GGC	2	6	423546	423551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198636
8003	NC_015942	GCT	2	6	423594	423599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198636
8004	NC_015942	GAT	2	6	423634	423639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198636
8005	NC_015942	TGG	3	9	423668	423676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198636
8006	NC_015942	CGG	2	6	423765	423770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198636
8007	NC_015942	GAG	2	6	423813	423818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198636
8008	NC_015942	AAGC	2	8	423841	423848	50 %	0 %	25 %	25 %	344198637
8009	NC_015942	CCGG	2	8	423901	423908	0 %	0 %	50 %	50 %	344198637
8010	NC_015942	CGC	2	6	423916	423921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198637
8011	NC_015942	CTG	3	9	423929	423937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198637
8012	NC_015942	GAC	2	6	423968	423973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198637
8013	NC_015942	CTA	2	6	424019	424024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198637
8014	NC_015942	GGC	2	6	424058	424063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198637
8015	NC_015942	ACTGG	2	10	424084	424093	20 %	20 %	40 %	20 %	344198637
8016	NC_015942	AGG	2	6	424097	424102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198637
8017	NC_015942	TGA	2	6	424108	424113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198637
8018	NC_015942	GCG	2	6	424130	424135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198638
8019	NC_015942	ACG	2	6	424148	424153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198638
8020	NC_015942	TGG	2	6	424195	424200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198638
8021	NC_015942	GAC	2	6	424212	424217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198638
8022	NC_015942	GT	3	6	424309	424314	0 %	50 %	50 %	0 %	344198638
8023	NC_015942	GGA	2	6	424322	424327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198638
8024	NC_015942	GAC	2	6	424355	424360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198639
8025	NC_015942	ACC	2	6	424439	424444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198639
8026	NC_015942	CGC	2	6	424463	424468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198639
8027	NC_015942	GAA	2	6	424490	424495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198639
8028	NC_015942	AGC	2	6	424509	424514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198639
8029	NC_015942	CACGAT	2	12	424540	424551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344198639
8030	NC_015942	GC	3	6	424644	424649	0 %	0 %	50 %	50 %	344198639
8031	NC_015942	GTCT	2	8	424660	424667	0 %	50 %	25 %	25 %	344198639
8032	NC_015942	CGGA	2	8	424718	424725	25 %	0 %	50 %	25 %	344198639
8033	NC_015942	TAAAA	2	10	424840	424849	80 %	20 %	0 %	0 %	344198639
8034	NC_015942	GTCACC	2	12	424885	424896	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344198639
8035	NC_015942	ACC	3	9	424918	424926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198639
8036	NC_015942	GCC	2	6	424957	424962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198639
8037	NC_015942	CCA	2	6	424985	424990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198639
8038	NC_015942	GGC	2	6	425044	425049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198639
8039	NC_015942	CCG	2	6	425131	425136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198639
8040	NC_015942	CGG	2	6	425154	425159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198639
8041	NC_015942	TAC	2	6	425192	425197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198639
8042	NC_015942	CGC	2	6	425198	425203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198639
8043	NC_015942	TCGG	2	8	425213	425220	0 %	25 %	50 %	25 %	344198639
8044	NC_015942	AGC	2	6	425241	425246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198639
8045	NC_015942	GC	3	6	425263	425268	0 %	0 %	50 %	50 %	344198639
8046	NC_015942	GCG	2	6	425275	425280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198639
8047	NC_015942	GAT	2	6	425309	425314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198639
8048	NC_015942	GAG	2	6	425331	425336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198639
8049	NC_015942	GCC	2	6	425420	425425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198640
8050	NC_015942	CTG	2	6	425455	425460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198640
8051	NC_015942	TGG	2	6	425519	425524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198640
8052	NC_015942	TCA	2	6	425546	425551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198640
8053	NC_015942	CCGG	2	8	425554	425561	0 %	0 %	50 %	50 %	344198640
8054	NC_015942	GCC	2	6	425593	425598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198640
8055	NC_015942	CG	3	6	425608	425613	0 %	0 %	50 %	50 %	344198640
8056	NC_015942	GTG	2	6	425683	425688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198640
8057	NC_015942	GCC	2	6	425707	425712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198640
8058	NC_015942	GACG	2	8	425731	425738	25 %	0 %	50 %	25 %	344198640
8059	NC_015942	TCC	2	6	425747	425752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198640
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8061	NC_015942	CGC	2	6	425784	425789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198640
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8063	NC_015942	GTCC	2	8	425891	425898	0 %	25 %	25 %	50 %	344198640
8064	NC_015942	AGCG	2	8	425977	425984	25 %	0 %	50 %	25 %	344198640
8065	NC_015942	GTC	2	6	426001	426006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198640
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8073	NC_015942	CGT	2	6	426329	426334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198641
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8080	NC_015942	TCG	2	6	426610	426615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198641
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8106	NC_015942	ATCG	2	8	428135	428142	25 %	25 %	25 %	25 %	344198644
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8109	NC_015942	ACG	2	6	428258	428263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198644
8110	NC_015942	GGCC	2	8	428285	428292	0 %	0 %	50 %	50 %	344198644
8111	NC_015942	GCC	2	6	428327	428332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198644
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8120	NC_015942	ATGG	2	8	428726	428733	25 %	25 %	50 %	0 %	344198644
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8122	NC_015942	GGT	2	6	428773	428778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198644
8123	NC_015942	GC	3	6	428801	428806	0 %	0 %	50 %	50 %	344198644
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8232	NC_015942	TAC	2	6	436881	436886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198653
8233	NC_015942	AC	3	6	436896	436901	50 %	0 %	0 %	50 %	344198653
8234	NC_015942	T	6	6	436905	436910	0 %	100 %	0 %	0 %	344198653
8235	NC_015942	GGCG	2	8	436914	436921	0 %	0 %	75 %	25 %	344198653
8236	NC_015942	TAC	2	6	436926	436931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198653
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8239	NC_015942	GATGG	2	10	437192	437201	20 %	20 %	60 %	0 %	344198653
8240	NC_015942	ACC	2	6	437248	437253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198653
8241	NC_015942	TCG	2	6	437327	437332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198653
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8243	NC_015942	ATC	2	6	437400	437405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198653
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8487	NC_015942	CGG	3	9	449002	449010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198660
8488	NC_015942	CTC	3	9	449046	449054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198660
8489	NC_015942	GAT	3	9	449064	449072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198660
8490	NC_015942	CAT	2	6	449142	449147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198660
8491	NC_015942	GCC	2	6	449148	449153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198660
8492	NC_015942	GGC	2	6	449162	449167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198660
8493	NC_015942	GAG	2	6	449170	449175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198660
8494	NC_015942	GGT	2	6	449199	449204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198660
8495	NC_015942	ACC	2	6	449224	449229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198660
8496	NC_015942	GC	3	6	449251	449256	0 %	0 %	50 %	50 %	344198660
8497	NC_015942	ACCT	2	8	449287	449294	25 %	25 %	0 %	50 %	344198660
8498	NC_015942	CAG	2	6	449377	449382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198660
8499	NC_015942	ACAGC	2	10	449406	449415	40 %	0 %	20 %	40 %	344198660
8500	NC_015942	CAG	2	6	449425	449430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198660

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