MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015942	GCC	2	6	281119	281124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198492
5502	NC_015942	GAA	2	6	281343	281348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198492
5503	NC_015942	GGAG	2	8	281589	281596	25 %	0 %	75 %	0 %	344198492
5504	NC_015942	CTG	2	6	281661	281666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198493
5505	NC_015942	GGC	3	9	281675	281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198493
5506	NC_015942	GC	3	6	281731	281736	0 %	0 %	50 %	50 %	344198493
5507	NC_015942	CAT	2	6	281741	281746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198493
5508	NC_015942	GCG	2	6	281766	281771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198493
5509	NC_015942	TGT	2	6	281893	281898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198493
5510	NC_015942	CTG	3	9	282016	282024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198494
5511	NC_015942	GCC	2	6	282102	282107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198494
5512	NC_015942	CGC	2	6	282141	282146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198494
5513	NC_015942	ATT	2	6	282160	282165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198494
5514	NC_015942	TGC	2	6	282176	282181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198494
5515	NC_015942	T	6	6	282183	282188	0 %	100 %	0 %	0 %	344198494
5516	NC_015942	TCT	2	6	282220	282225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198494
5517	NC_015942	CTG	2	6	282236	282241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5518	NC_015942	TTC	2	6	282261	282266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198495
5519	NC_015942	CGG	2	6	282380	282385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5520	NC_015942	TTCT	2	8	282399	282406	0 %	75 %	0 %	25 %	344198495
5521	NC_015942	T	6	6	282471	282476	0 %	100 %	0 %	0 %	344198495
5522	NC_015942	CCA	2	6	282484	282489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198495
5523	NC_015942	GCC	2	6	282582	282587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
5524	NC_015942	CTGA	2	8	282594	282601	25 %	25 %	25 %	25 %	344198495
5525	NC_015942	TGG	2	6	282743	282748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198495
5526	NC_015942	CGGG	2	8	282774	282781	0 %	0 %	75 %	25 %	344198495
5527	NC_015942	AGC	2	6	282796	282801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5528	NC_015942	CGC	2	6	282815	282820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
5529	NC_015942	AAAG	2	8	282863	282870	75 %	0 %	25 %	0 %	344198495
5530	NC_015942	CCT	2	6	282998	283003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198495
5531	NC_015942	CGG	2	6	283015	283020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5532	NC_015942	GTC	2	6	283069	283074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5533	NC_015942	GAT	2	6	283095	283100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198495
5534	NC_015942	CGC	2	6	283112	283117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
5535	NC_015942	CCG	2	6	283211	283216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198495
5536	NC_015942	CTG	2	6	283242	283247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5537	NC_015942	GC	3	6	283261	283266	0 %	0 %	50 %	50 %	344198495
5538	NC_015942	TCA	2	6	283267	283272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198495
5539	NC_015942	GAC	2	6	283286	283291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5540	NC_015942	GGC	2	6	283295	283300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5541	NC_015942	CCT	2	6	283346	283351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198495
5542	NC_015942	CGG	3	9	283382	283390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5543	NC_015942	CGG	2	6	283394	283399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5544	NC_015942	TGA	2	6	283520	283525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198495
5545	NC_015942	GCA	2	6	283547	283552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5546	NC_015942	TGGT	2	8	283591	283598	0 %	50 %	50 %	0 %	344198495
5547	NC_015942	TCG	2	6	283603	283608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5548	NC_015942	CGA	2	6	283631	283636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5549	NC_015942	GGC	2	6	283641	283646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198495
5550	NC_015942	GCATGA	2	12	283774	283785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344198495
5551	NC_015942	CGT	2	6	283787	283792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5552	NC_015942	CAGG	2	8	283819	283826	25 %	0 %	50 %	25 %	344198495
5553	NC_015942	CCAC	2	8	283913	283920	25 %	0 %	0 %	75 %	344198495
5554	NC_015942	CAG	2	6	284043	284048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198495
5555	NC_015942	CAG	2	6	284321	284326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
5556	NC_015942	CTT	2	6	284386	284391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198496
5557	NC_015942	CTG	2	6	284396	284401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198496
5558	NC_015942	CCAG	2	8	284404	284411	25 %	0 %	25 %	50 %	344198496
5559	NC_015942	GAG	2	6	284432	284437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198496
5560	NC_015942	CGC	2	6	284473	284478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198496
5561	NC_015942	GCG	2	6	284493	284498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198496
5562	NC_015942	CGA	2	6	284527	284532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198496
5563	NC_015942	AAC	2	6	284749	284754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
5564	NC_015942	CGC	2	6	284797	284802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
5565	NC_015942	CAGC	2	8	284877	284884	25 %	0 %	25 %	50 %	344198497
5566	NC_015942	CTG	2	6	284929	284934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
5567	NC_015942	ACC	2	6	284939	284944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198497
5568	NC_015942	GGT	2	6	284951	284956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198497
5569	NC_015942	CCG	2	6	284982	284987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
5570	NC_015942	CTG	2	6	285040	285045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
5571	NC_015942	CAA	2	6	285095	285100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
5572	NC_015942	GAA	2	6	285213	285218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198497
5573	NC_015942	CCG	2	6	285221	285226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
5574	NC_015942	CGG	2	6	285248	285253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198497
5575	NC_015942	CTC	2	6	285258	285263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198497
5576	NC_015942	ACA	2	6	285265	285270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
5577	NC_015942	GCC	2	6	285331	285336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198497
5578	NC_015942	C	7	7	285335	285341	0 %	0 %	0 %	100 %	344198497
5579	NC_015942	AAC	2	6	285342	285347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198497
5580	NC_015942	CG	3	6	285418	285423	0 %	0 %	50 %	50 %	344198497
5581	NC_015942	GCG	2	6	285447	285452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198497
5582	NC_015942	GCTT	2	8	285457	285464	0 %	50 %	25 %	25 %	344198497
5583	NC_015942	ACC	2	6	285538	285543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198497
5584	NC_015942	CTG	2	6	285552	285557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198497
5585	NC_015942	GGA	2	6	285587	285592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198497
5586	NC_015942	GTT	2	6	285741	285746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198498
5587	NC_015942	TTG	2	6	285769	285774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198498
5588	NC_015942	ATT	2	6	285900	285905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198498
5589	NC_015942	GCG	2	6	285941	285946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198498
5590	NC_015942	GAA	2	6	285957	285962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198498
5591	NC_015942	GGC	2	6	285964	285969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198498
5592	NC_015942	GCC	2	6	286000	286005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
5593	NC_015942	ATC	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198498
5594	NC_015942	ATG	2	6	286049	286054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
5595	NC_015942	AGA	2	6	286104	286109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198498
5596	NC_015942	GAT	2	6	286110	286115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198498
5597	NC_015942	CGC	3	9	286163	286171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198498
5598	NC_015942	CGA	2	6	286291	286296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198498
5599	NC_015942	T	6	6	286675	286680	0 %	100 %	0 %	0 %	344198499
5600	NC_015942	T	6	6	286682	286687	0 %	100 %	0 %	0 %	344198499
5601	NC_015942	CCT	2	6	286696	286701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
5602	NC_015942	CAT	2	6	286723	286728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198499
5603	NC_015942	AGC	2	6	286740	286745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
5604	NC_015942	CAAT	2	8	286776	286783	50 %	25 %	0 %	25 %	344198499
5605	NC_015942	GCA	2	6	286912	286917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198499
5606	NC_015942	TCC	2	6	287045	287050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198499
5607	NC_015942	GTG	2	6	287155	287160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198499
5608	NC_015942	A	6	6	287222	287227	100 %	0 %	0 %	0 %	344198499
5609	NC_015942	AG	3	6	287237	287242	50 %	0 %	50 %	0 %	344198499
5610	NC_015942	GAT	2	6	287285	287290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
5611	NC_015942	AT	3	6	287302	287307	50 %	50 %	0 %	0 %	344198500
5612	NC_015942	CGA	2	6	287339	287344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198500
5613	NC_015942	TTAA	2	8	287345	287352	50 %	50 %	0 %	0 %	344198500
5614	NC_015942	ATG	2	6	287415	287420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
5615	NC_015942	TGA	2	6	287439	287444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198500
5616	NC_015942	CAC	2	6	287449	287454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198500
5617	NC_015942	ATA	2	6	287495	287500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198500
5618	NC_015942	AATG	2	8	287560	287567	50 %	25 %	25 %	0 %	344198500
5619	NC_015942	TGTT	2	8	287587	287594	0 %	75 %	25 %	0 %	344198500
5620	NC_015942	CTT	2	6	287598	287603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198500
5621	NC_015942	TTA	2	6	287687	287692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198500
5622	NC_015942	GTC	2	6	287710	287715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198500
5623	NC_015942	AAG	2	6	287749	287754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198500
5624	NC_015942	TTC	2	6	287757	287762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198500
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5626	NC_015942	GGT	2	6	287837	287842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
5627	NC_015942	GGT	2	6	287857	287862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198500
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5632	NC_015942	T	7	7	287993	287999	0 %	100 %	0 %	0 %	344198500
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5634	NC_015942	CCT	2	6	288042	288047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198500
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5642	NC_015942	ATGC	2	8	288241	288248	25 %	25 %	25 %	25 %	344198500
5643	NC_015942	GCC	2	6	288281	288286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198501
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5646	NC_015942	TCA	2	6	288381	288386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198501
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5648	NC_015942	CGG	2	6	288640	288645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198501
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5650	NC_015942	GCTGCC	2	12	288689	288700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198501
5651	NC_015942	GAT	2	6	288724	288729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198501
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5654	NC_015942	CCCG	2	8	288963	288970	0 %	0 %	25 %	75 %	344198501
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5660	NC_015942	GCCGC	2	10	289127	289136	0 %	0 %	40 %	60 %	344198501
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5664	NC_015942	GCACC	2	10	289280	289289	20 %	0 %	20 %	60 %	344198502
5665	NC_015942	GCT	2	6	289337	289342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198502
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5678	NC_015942	GC	3	6	289923	289928	0 %	0 %	50 %	50 %	344198502
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5723	NC_015942	TCG	2	6	292114	292119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198503
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5725	NC_015942	ATC	2	6	292245	292250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198503
5726	NC_015942	TGGC	3	12	292321	292332	0 %	25 %	50 %	25 %	344198504
5727	NC_015942	CGTTGC	2	12	292349	292360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198504
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5730	NC_015942	CGC	3	9	292479	292487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198504
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5733	NC_015942	GCG	2	6	292783	292788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198504
5734	NC_015942	GCTG	2	8	292901	292908	0 %	25 %	50 %	25 %	344198504
5735	NC_015942	GAC	2	6	293025	293030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198504
5736	NC_015942	CCCG	2	8	293031	293038	0 %	0 %	25 %	75 %	344198504
5737	NC_015942	CG	3	6	293065	293070	0 %	0 %	50 %	50 %	344198504
5738	NC_015942	GGCA	2	8	293097	293104	25 %	0 %	50 %	25 %	344198504
5739	NC_015942	ACC	3	9	293119	293127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198504
5740	NC_015942	GCT	2	6	293171	293176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198504
5741	NC_015942	CGA	2	6	293246	293251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198504
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5743	NC_015942	GGT	2	6	293299	293304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198504
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5852	NC_015942	GGGCT	2	10	300234	300243	0 %	20 %	60 %	20 %	344198512
5853	NC_015942	ACTT	2	8	300649	300656	25 %	50 %	0 %	25 %	344198513
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5859	NC_015942	GCT	3	9	300817	300825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198513
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5865	NC_015942	TGCA	2	8	300921	300928	25 %	25 %	25 %	25 %	344198513
5866	NC_015942	ATG	2	6	300947	300952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198513
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5868	NC_015942	GCA	2	6	300985	300990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198513
5869	NC_015942	AGC	2	6	301059	301064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198513
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5885	NC_015942	TGA	2	6	301922	301927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198514
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5887	NC_015942	G	7	7	302132	302138	0 %	0 %	100 %	0 %	344198514
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5933	NC_015942	ACG	2	6	304617	304622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198518
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5975	NC_015942	TTGCA	2	10	307013	307022	20 %	40 %	20 %	20 %	344198522
5976	NC_015942	CCT	2	6	307099	307104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198522
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5978	NC_015942	CGT	2	6	307137	307142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198522
5979	NC_015942	GCGCC	2	10	307151	307160	0 %	0 %	40 %	60 %	344198522
5980	NC_015942	CTA	2	6	307166	307171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198522
5981	NC_015942	CGCA	2	8	307196	307203	25 %	0 %	25 %	50 %	344198522
5982	NC_015942	GC	3	6	307376	307381	0 %	0 %	50 %	50 %	344198523
5983	NC_015942	TTG	2	6	307398	307403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198523
5984	NC_015942	TGG	2	6	307410	307415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
5985	NC_015942	GCC	3	9	307416	307424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
5986	NC_015942	CTC	2	6	307467	307472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198523
5987	NC_015942	TGCAGG	2	12	307516	307527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344198523
5988	NC_015942	CAGC	2	8	307542	307549	25 %	0 %	25 %	50 %	344198523
5989	NC_015942	CGCTG	2	10	307562	307571	0 %	20 %	40 %	40 %	344198523
5990	NC_015942	GCC	2	6	307581	307586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
5991	NC_015942	GCT	2	6	307664	307669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198523
5992	NC_015942	GGA	2	6	307682	307687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198523
5993	NC_015942	ATG	2	6	307786	307791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198523
5994	NC_015942	CCG	3	9	307792	307800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
5995	NC_015942	CTGC	2	8	307860	307867	0 %	25 %	25 %	50 %	344198523
5996	NC_015942	GGT	3	9	307877	307885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
5997	NC_015942	TGA	2	6	308038	308043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198523
5998	NC_015942	GTG	3	9	308053	308061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
5999	NC_015942	ACCGC	2	10	308123	308132	20 %	0 %	20 %	60 %	344198523
6000	NC_015942	GGCA	2	8	308140	308147	25 %	0 %	50 %	25 %	344198523

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