MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57502	NC_015942	TGG	2	6	3180650	3180655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201309
57503	NC_015942	CGG	2	6	3180682	3180687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57504	NC_015942	ATC	2	6	3180715	3180720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201309
57505	NC_015942	CTT	2	6	3180761	3180766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201309
57506	NC_015942	AGG	2	6	3180794	3180799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201309
57507	NC_015942	GAT	2	6	3180842	3180847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201309
57508	NC_015942	GC	4	8	3180851	3180858	0 %	0 %	50 %	50 %	344201309
57509	NC_015942	ACG	2	6	3180913	3180918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201309
57510	NC_015942	GCA	2	6	3180947	3180952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201309
57511	NC_015942	GGC	2	6	3181011	3181016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57512	NC_015942	TGC	2	6	3181039	3181044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201309
57513	NC_015942	GC	3	6	3181118	3181123	0 %	0 %	50 %	50 %	344201309
57514	NC_015942	GA	3	6	3181144	3181149	50 %	0 %	50 %	0 %	344201309
57515	NC_015942	GGC	2	6	3181176	3181181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57516	NC_015942	GGC	2	6	3181194	3181199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57517	NC_015942	CGG	2	6	3181253	3181258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57518	NC_015942	GCG	2	6	3181264	3181269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201309
57519	NC_015942	TGA	2	6	3181274	3181279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201309
57520	NC_015942	CCG	2	6	3181304	3181309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201309
57521	NC_015942	GCA	2	6	3181361	3181366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201309
57522	NC_015942	GC	3	6	3181415	3181420	0 %	0 %	50 %	50 %	344201309
57523	NC_015942	CAG	3	9	3181422	3181430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201309
57524	NC_015942	CAG	2	6	3181520	3181525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201310
57525	NC_015942	G	6	6	3181676	3181681	0 %	0 %	100 %	0 %	344201310
57526	NC_015942	CTG	2	6	3181694	3181699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201310
57527	NC_015942	AG	3	6	3181709	3181714	50 %	0 %	50 %	0 %	344201310
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57529	NC_015942	GCA	2	6	3181843	3181848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201310
57530	NC_015942	CTG	2	6	3181853	3181858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201310
57531	NC_015942	GC	3	6	3181914	3181919	0 %	0 %	50 %	50 %	344201310
57532	NC_015942	TGA	2	6	3181972	3181977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201310
57533	NC_015942	TGGC	2	8	3182014	3182021	0 %	25 %	50 %	25 %	344201310
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57535	NC_015942	TTC	2	6	3182164	3182169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201311
57536	NC_015942	CGTG	2	8	3182208	3182215	0 %	25 %	50 %	25 %	344201311
57537	NC_015942	CTG	2	6	3182345	3182350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201311
57538	NC_015942	CCGTCG	2	12	3182351	3182362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344201311
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57541	NC_015942	TTC	2	6	3182413	3182418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201311
57542	NC_015942	TGGCC	2	10	3182427	3182436	0 %	20 %	40 %	40 %	344201311
57543	NC_015942	CGA	2	6	3182451	3182456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201311
57544	NC_015942	CG	3	6	3182511	3182516	0 %	0 %	50 %	50 %	344201311
57545	NC_015942	CTC	2	6	3182605	3182610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201311
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57547	NC_015942	TCG	2	6	3182720	3182725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201311
57548	NC_015942	GTA	2	6	3182782	3182787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201311
57549	NC_015942	GCT	2	6	3182817	3182822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201311
57550	NC_015942	CCG	2	6	3182864	3182869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201311
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57552	NC_015942	AACA	2	8	3183108	3183115	75 %	0 %	0 %	25 %	344201312
57553	NC_015942	GCC	2	6	3183186	3183191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201312
57554	NC_015942	TGC	2	6	3183202	3183207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
57555	NC_015942	CATGGC	2	12	3183296	3183307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201312
57556	NC_015942	G	6	6	3183326	3183331	0 %	0 %	100 %	0 %	344201312
57557	NC_015942	GGCG	2	8	3183335	3183342	0 %	0 %	75 %	25 %	344201312
57558	NC_015942	ACCG	2	8	3183351	3183358	25 %	0 %	25 %	50 %	344201312
57559	NC_015942	CGC	2	6	3183366	3183371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201312
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57562	NC_015942	CAGC	2	8	3183524	3183531	25 %	0 %	25 %	50 %	344201312
57563	NC_015942	CCTGG	2	10	3183566	3183575	0 %	20 %	40 %	40 %	344201312
57564	NC_015942	CTG	2	6	3183615	3183620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
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57568	NC_015942	TGC	3	9	3183847	3183855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201312
57569	NC_015942	TCTG	2	8	3183901	3183908	0 %	50 %	25 %	25 %	344201312
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57577	NC_015942	CGGC	2	8	3184264	3184271	0 %	0 %	50 %	50 %	344201312
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57585	NC_015942	GC	3	6	3184821	3184826	0 %	0 %	50 %	50 %	344201313
57586	NC_015942	GAA	2	6	3184842	3184847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201313
57587	NC_015942	GCGCG	2	10	3184861	3184870	0 %	0 %	60 %	40 %	344201313
57588	NC_015942	CCA	2	6	3184926	3184931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201313
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57591	NC_015942	GCGCG	2	10	3185177	3185186	0 %	0 %	60 %	40 %	344201313
57592	NC_015942	CAG	2	6	3185265	3185270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201314
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57603	NC_015942	CGCC	2	8	3185690	3185697	0 %	0 %	25 %	75 %	344201314
57604	NC_015942	CCGC	2	8	3185758	3185765	0 %	0 %	25 %	75 %	344201314
57605	NC_015942	GTGG	2	8	3185787	3185794	0 %	25 %	75 %	0 %	344201314
57606	NC_015942	CAG	2	6	3185826	3185831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201314
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57615	NC_015942	GGC	2	6	3186143	3186148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201314
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57848	NC_015942	GAA	2	6	3196994	3196999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201329
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57961	NC_015942	TA	3	6	3204282	3204287	50 %	50 %	0 %	0 %	344201334
57962	NC_015942	CA	3	6	3204294	3204299	50 %	0 %	0 %	50 %	344201334
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57965	NC_015942	ACG	2	6	3204504	3204509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201335
57966	NC_015942	GAT	2	6	3204519	3204524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201335
57967	NC_015942	TCA	2	6	3204566	3204571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201335
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57980	NC_015942	GTA	2	6	3205023	3205028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201336
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57991	NC_015942	TCA	2	6	3205678	3205683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201336
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57993	NC_015942	GC	3	6	3205960	3205965	0 %	0 %	50 %	50 %	344201336
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57999	NC_015942	CCG	2	6	3206539	3206544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201336
58000	NC_015942	CCCG	2	8	3206550	3206557	0 %	0 %	25 %	75 %	344201336

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