MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015851	GCGA	2	8	183398	183405	25 %	0 %	50 %	25 %	340783809
3002	NC_015851	GCC	2	6	183409	183414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783809
3003	NC_015851	CAA	2	6	183504	183509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783809
3004	NC_015851	CTC	2	6	183523	183528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783809
3005	NC_015851	CTGGAA	2	12	183531	183542	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783809
3006	NC_015851	AAG	2	6	183604	183609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783810
3007	NC_015851	CGT	3	9	183616	183624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783810
3008	NC_015851	GAA	2	6	183631	183636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783810
3009	NC_015851	AGG	2	6	183665	183670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783810
3010	NC_015851	AGC	2	6	183680	183685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783810
3011	NC_015851	GGC	2	6	183687	183692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783810
3012	NC_015851	GTG	2	6	183717	183722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783810
3013	NC_015851	CAC	2	6	184003	184008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3014	NC_015851	CCA	2	6	184020	184025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3015	NC_015851	ACC	2	6	184035	184040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3016	NC_015851	CCA	3	9	184041	184049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783811
3017	NC_015851	CGC	2	6	184277	184282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783811
3018	NC_015851	ACT	2	6	185163	185168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783812
3019	NC_015851	CTG	2	6	185186	185191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3020	NC_015851	CGT	2	6	185246	185251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3021	NC_015851	GCC	2	6	185252	185257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783812
3022	NC_015851	GAG	2	6	185354	185359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783812
3023	NC_015851	CCA	2	6	185398	185403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783812
3024	NC_015851	GCTG	2	8	185572	185579	0 %	25 %	50 %	25 %	340783812
3025	NC_015851	G	6	6	185608	185613	0 %	0 %	100 %	0 %	340783812
3026	NC_015851	TCA	2	6	185670	185675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783812
3027	NC_015851	AAC	2	6	185774	185779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783812
3028	NC_015851	GATACG	2	12	185792	185803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783812
3029	NC_015851	TGC	2	6	185878	185883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783812
3030	NC_015851	TGC	2	6	185958	185963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783813
3031	NC_015851	GAT	2	6	186007	186012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
3032	NC_015851	CTG	2	6	186029	186034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783813
3033	NC_015851	TCA	2	6	186042	186047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783813
3034	NC_015851	GAT	2	6	186061	186066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783813
3035	NC_015851	CCGCAT	2	12	186122	186133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783813
3036	NC_015851	GTG	3	9	186164	186172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783813
3037	NC_015851	GCG	2	6	186254	186259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783813
3038	NC_015851	AAG	2	6	186263	186268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783813
3039	NC_015851	A	6	6	186527	186532	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
3040	NC_015851	ATT	2	6	186580	186585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3041	NC_015851	AGCGG	2	10	186673	186682	20 %	0 %	60 %	20 %	340783814
3042	NC_015851	A	7	7	186742	186748	100 %	0 %	0 %	0 %	340783814
3043	NC_015851	GCA	2	6	186760	186765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783814
3044	NC_015851	GGGGC	2	10	186932	186941	0 %	0 %	80 %	20 %	340783814
3045	NC_015851	GGA	2	6	186943	186948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783814
3046	NC_015851	TA	3	6	187007	187012	50 %	50 %	0 %	0 %	340783814
3047	NC_015851	GCG	2	6	187013	187018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783814
3048	NC_015851	CT	3	6	187047	187052	0 %	50 %	0 %	50 %	340783814
3049	NC_015851	CAT	2	6	187076	187081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783814
3050	NC_015851	CAA	2	6	187085	187090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3051	NC_015851	ATTTT	2	10	187095	187104	20 %	80 %	0 %	0 %	340783814
3052	NC_015851	GGT	2	6	187120	187125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783814
3053	NC_015851	ACA	2	6	187130	187135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3054	NC_015851	AGG	2	6	187140	187145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783814
3055	NC_015851	AATA	2	8	187167	187174	75 %	25 %	0 %	0 %	340783814
3056	NC_015851	TAT	2	6	187179	187184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3057	NC_015851	AC	4	8	187223	187230	50 %	0 %	0 %	50 %	340783814
3058	NC_015851	ATTG	2	8	187323	187330	25 %	50 %	25 %	0 %	340783814
3059	NC_015851	ACCA	2	8	187406	187413	50 %	0 %	0 %	50 %	340783814
3060	NC_015851	T	6	6	187513	187518	0 %	100 %	0 %	0 %	340783814
3061	NC_015851	AAC	2	6	187523	187528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783814
3062	NC_015851	ATA	2	6	187535	187540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783814
3063	NC_015851	TAT	2	6	187564	187569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783814
3064	NC_015851	TGC	2	6	187635	187640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783814
3065	NC_015851	CCA	2	6	187642	187647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783814
3066	NC_015851	CGG	2	6	187688	187693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783814
3067	NC_015851	TA	3	6	187717	187722	50 %	50 %	0 %	0 %	340783814
3068	NC_015851	ATA	2	6	187724	187729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783814
3069	NC_015851	TTC	2	6	187745	187750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783814
3070	NC_015851	TGCG	2	8	187851	187858	0 %	25 %	50 %	25 %	340783815
3071	NC_015851	GCCTTG	2	12	187869	187880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783815
3072	NC_015851	ATG	2	6	187968	187973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783815
3073	NC_015851	GGC	2	6	187995	188000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783815
3074	NC_015851	TGG	2	6	188052	188057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783815
3075	NC_015851	TTTC	2	8	188152	188159	0 %	75 %	0 %	25 %	340783815
3076	NC_015851	CGT	2	6	188248	188253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783815
3077	NC_015851	ACC	2	6	188387	188392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783815
3078	NC_015851	CTG	2	6	188514	188519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783815
3079	NC_015851	GCA	2	6	188562	188567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783815
3080	NC_015851	GAA	2	6	188798	188803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783815
3081	NC_015851	GCC	2	6	188812	188817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783815
3082	NC_015851	CTC	2	6	188849	188854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783815
3083	NC_015851	AGCA	2	8	188866	188873	50 %	0 %	25 %	25 %	340783815
3084	NC_015851	TCC	2	6	188919	188924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783815
3085	NC_015851	CCA	2	6	188944	188949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783815
3086	NC_015851	CGG	2	6	188954	188959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783815
3087	NC_015851	GA	3	6	188975	188980	50 %	0 %	50 %	0 %	340783815
3088	NC_015851	CGA	2	6	189308	189313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783816
3089	NC_015851	TTA	3	9	189326	189334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783816
3090	NC_015851	T	6	6	189423	189428	0 %	100 %	0 %	0 %	340783816
3091	NC_015851	ACGA	2	8	189437	189444	50 %	0 %	25 %	25 %	340783816
3092	NC_015851	TTA	2	6	189467	189472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783816
3093	NC_015851	T	6	6	189588	189593	0 %	100 %	0 %	0 %	340783816
3094	NC_015851	ACA	2	6	189658	189663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783816
3095	NC_015851	GTT	2	6	189728	189733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783816
3096	NC_015851	AAG	2	6	189858	189863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783816
3097	NC_015851	GCAG	2	8	189901	189908	25 %	0 %	50 %	25 %	340783816
3098	NC_015851	GGA	2	6	190005	190010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783816
3099	NC_015851	AAT	2	6	190053	190058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783816
3100	NC_015851	GAA	2	6	190080	190085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783816
3101	NC_015851	TGG	2	6	190136	190141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783816
3102	NC_015851	GT	3	6	190163	190168	0 %	50 %	50 %	0 %	340783816
3103	NC_015851	CAC	2	6	190354	190359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783817
3104	NC_015851	GGC	2	6	190417	190422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783817
3105	NC_015851	ATG	2	6	190491	190496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783817
3106	NC_015851	TGA	2	6	190517	190522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783817
3107	NC_015851	CAA	2	6	190587	190592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783817
3108	NC_015851	AGG	2	6	190615	190620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783817
3109	NC_015851	TGG	2	6	190658	190663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783817
3110	NC_015851	GGT	2	6	190788	190793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783817
3111	NC_015851	TGG	2	6	190847	190852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783817
3112	NC_015851	CCGG	2	8	190934	190941	0 %	0 %	50 %	50 %	340783818
3113	NC_015851	CCG	2	6	191007	191012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783818
3114	NC_015851	TCCC	2	8	191097	191104	0 %	25 %	0 %	75 %	340783818
3115	NC_015851	TCCT	2	8	191127	191134	0 %	50 %	0 %	50 %	340783819
3116	NC_015851	CCTT	2	8	191194	191201	0 %	50 %	0 %	50 %	340783819
3117	NC_015851	ATCCAG	2	12	191232	191243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783819
3118	NC_015851	TGG	2	6	191273	191278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783819
3119	NC_015851	CG	3	6	191283	191288	0 %	0 %	50 %	50 %	340783819
3120	NC_015851	CAC	2	6	191379	191384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783819
3121	NC_015851	GAA	2	6	191406	191411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783819
3122	NC_015851	TGGCC	2	10	191564	191573	0 %	20 %	40 %	40 %	340783820
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3240	NC_015851	AGA	2	6	200140	200145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783827
3241	NC_015851	GGT	2	6	200153	200158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783827
3242	NC_015851	AGC	2	6	200209	200214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783827
3243	NC_015851	GGGC	2	8	200219	200226	0 %	0 %	75 %	25 %	340783827
3244	NC_015851	TCC	2	6	200228	200233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783827
3245	NC_015851	TGG	2	6	200263	200268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783827
3246	NC_015851	CTG	2	6	200313	200318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783827
3247	NC_015851	TCG	2	6	200321	200326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783827
3248	NC_015851	ATCGG	2	10	200401	200410	20 %	20 %	40 %	20 %	340783827
3249	NC_015851	GC	3	6	200460	200465	0 %	0 %	50 %	50 %	340783827
3250	NC_015851	TCG	2	6	200491	200496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783827
3251	NC_015851	AGC	2	6	200521	200526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783827
3252	NC_015851	AAG	2	6	200628	200633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783827
3253	NC_015851	ATTC	2	8	200690	200697	25 %	50 %	0 %	25 %	340783827
3254	NC_015851	GT	3	6	200720	200725	0 %	50 %	50 %	0 %	340783827
3255	NC_015851	GCG	2	6	200748	200753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783827
3256	NC_015851	GAG	2	6	200817	200822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783827
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3259	NC_015851	ATG	2	6	201024	201029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783827
3260	NC_015851	TGG	2	6	201493	201498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783828
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3262	NC_015851	TGT	2	6	201552	201557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783828
3263	NC_015851	T	6	6	201634	201639	0 %	100 %	0 %	0 %	340783829
3264	NC_015851	CGG	2	6	201642	201647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783829
3265	NC_015851	GTTGGG	2	12	201654	201665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783829
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3267	NC_015851	ACC	2	6	201764	201769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783829
3268	NC_015851	C	6	6	201785	201790	0 %	0 %	0 %	100 %	340783829
3269	NC_015851	TGG	2	6	201791	201796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783829
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3272	NC_015851	CAC	2	6	201877	201882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783829
3273	NC_015851	CAG	2	6	201898	201903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783829
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3280	NC_015851	GAT	2	6	202195	202200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783830
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3331	NC_015851	CTG	2	6	204613	204618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783833
3332	NC_015851	CGA	2	6	204675	204680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783833
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3342	NC_015851	TGCT	2	8	205648	205655	0 %	50 %	25 %	25 %	340783834
3343	NC_015851	GAG	2	6	205667	205672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783834
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3346	NC_015851	TGC	2	6	205954	205959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783834
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3349	NC_015851	GAC	2	6	206267	206272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783834
3350	NC_015851	AGAA	2	8	206361	206368	75 %	0 %	25 %	0 %	340783834
3351	NC_015851	CCA	2	6	206464	206469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783834
3352	NC_015851	GCC	2	6	206521	206526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783834
3353	NC_015851	CAT	2	6	206548	206553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783834
3354	NC_015851	GCCAAG	2	12	206639	206650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783834
3355	NC_015851	CGCA	2	8	206663	206670	25 %	0 %	25 %	50 %	340783834
3356	NC_015851	GCC	2	6	206791	206796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783835
3357	NC_015851	ATA	2	6	206843	206848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783835
3358	NC_015851	CAT	2	6	206922	206927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783835
3359	NC_015851	TTCCA	2	10	206981	206990	20 %	40 %	0 %	40 %	340783835
3360	NC_015851	CGA	2	6	206998	207003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783835
3361	NC_015851	GTTGG	2	10	207022	207031	0 %	40 %	60 %	0 %	340783835
3362	NC_015851	TGG	2	6	207171	207176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783835
3363	NC_015851	CAA	2	6	207198	207203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783835
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3483	NC_015851	AGT	2	6	214980	214985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783839
3484	NC_015851	GCCGA	2	10	215594	215603	20 %	0 %	40 %	40 %	340783840
3485	NC_015851	GCG	2	6	215656	215661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783840
3486	NC_015851	TCCAGG	2	12	215682	215693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783840
3487	NC_015851	ATT	2	6	215738	215743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783840
3488	NC_015851	ATA	2	6	215765	215770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783840
3489	NC_015851	GAT	2	6	215899	215904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783841
3490	NC_015851	GC	3	6	215906	215911	0 %	0 %	50 %	50 %	340783841
3491	NC_015851	GAA	2	6	215923	215928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783841
3492	NC_015851	AGA	2	6	215988	215993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783841
3493	NC_015851	GGT	2	6	216001	216006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783841
3494	NC_015851	AGC	2	6	216057	216062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783841
3495	NC_015851	CCGA	2	8	216086	216093	25 %	0 %	25 %	50 %	340783841
3496	NC_015851	TGG	2	6	216111	216116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783841
3497	NC_015851	CT	3	6	216134	216139	0 %	50 %	0 %	50 %	340783841
3498	NC_015851	CGC	2	6	216170	216175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783841
3499	NC_015851	GCT	2	6	216397	216402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783841
3500	NC_015851	GCG	2	6	216442	216447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783841

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