MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 3998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015851	TGA	2	6	126346	126351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783751
2002	NC_015851	CGG	2	6	126373	126378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2003	NC_015851	GGCG	2	8	126487	126494	0 %	0 %	75 %	25 %	340783751
2004	NC_015851	TCC	2	6	126594	126599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783751
2005	NC_015851	TGC	2	6	126625	126630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783751
2006	NC_015851	TC	3	6	126667	126672	0 %	50 %	0 %	50 %	340783751
2007	NC_015851	AGC	3	9	126696	126704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783751
2008	NC_015851	TCC	2	6	126723	126728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783751
2009	NC_015851	CGG	2	6	126736	126741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2010	NC_015851	CGG	2	6	126778	126783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2011	NC_015851	AAT	2	6	126816	126821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783751
2012	NC_015851	GCG	2	6	126870	126875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2013	NC_015851	GTT	2	6	126887	126892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783751
2014	NC_015851	TCG	2	6	126919	126924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783751
2015	NC_015851	CGAGAT	2	12	126934	126945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340783751
2016	NC_015851	ACGCCG	2	12	127035	127046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340783751
2017	NC_015851	TGG	2	6	127134	127139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783751
2018	NC_015851	CGG	2	6	127174	127179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2019	NC_015851	CGG	2	6	127234	127239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783751
2020	NC_015851	CGA	2	6	127249	127254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783751
2021	NC_015851	T	6	6	127407	127412	0 %	100 %	0 %	0 %	340783751
2022	NC_015851	TGC	2	6	127433	127438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783751
2023	NC_015851	AGCC	2	8	127469	127476	25 %	0 %	25 %	50 %	340783751
2024	NC_015851	CGCCA	2	10	127508	127517	20 %	0 %	20 %	60 %	340783751
2025	NC_015851	CG	3	6	127518	127523	0 %	0 %	50 %	50 %	340783751
2026	NC_015851	CCT	2	6	127618	127623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783752
2027	NC_015851	CG	3	6	127706	127711	0 %	0 %	50 %	50 %	340783752
2028	NC_015851	GCG	2	6	127713	127718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783752
2029	NC_015851	TGC	2	6	127754	127759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783752
2030	NC_015851	TTC	2	6	127787	127792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783752
2031	NC_015851	ACC	2	6	127802	127807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783752
2032	NC_015851	ACA	2	6	127812	127817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783752
2033	NC_015851	CG	4	8	127819	127826	0 %	0 %	50 %	50 %	340783752
2034	NC_015851	CCGG	2	8	127838	127845	0 %	0 %	50 %	50 %	340783752
2035	NC_015851	TGG	2	6	127864	127869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783752
2036	NC_015851	CGA	2	6	128073	128078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783753
2037	NC_015851	TGG	2	6	128079	128084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783753
2038	NC_015851	CTG	2	6	128136	128141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783753
2039	NC_015851	TCG	2	6	128193	128198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783753
2040	NC_015851	CAA	2	6	128214	128219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783753
2041	NC_015851	ATG	2	6	128246	128251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783753
2042	NC_015851	CCA	2	6	128262	128267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783753
2043	NC_015851	A	6	6	128308	128313	100 %	0 %	0 %	0 %	340783753
2044	NC_015851	GCC	2	6	128314	128319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783753
2045	NC_015851	GT	3	6	128378	128383	0 %	50 %	50 %	0 %	340783754
2046	NC_015851	TC	3	6	128448	128453	0 %	50 %	0 %	50 %	340783754
2047	NC_015851	GGT	2	6	128479	128484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783754
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2049	NC_015851	TCG	2	6	128747	128752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783754
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2051	NC_015851	GCC	2	6	128894	128899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783754
2052	NC_015851	TCC	2	6	128930	128935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783754
2053	NC_015851	T	6	6	128964	128969	0 %	100 %	0 %	0 %	340783754
2054	NC_015851	GAA	2	6	129031	129036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783754
2055	NC_015851	C	6	6	129046	129051	0 %	0 %	0 %	100 %	340783754
2056	NC_015851	ACG	2	6	129088	129093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783754
2057	NC_015851	CCGT	2	8	129101	129108	0 %	25 %	25 %	50 %	340783754
2058	NC_015851	GCA	2	6	129216	129221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783754
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2061	NC_015851	CCGT	2	8	129485	129492	0 %	25 %	25 %	50 %	340783754
2062	NC_015851	CAG	2	6	129544	129549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783754
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2065	NC_015851	TCC	2	6	129722	129727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783754
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2072	NC_015851	GTCG	2	8	129985	129992	0 %	25 %	50 %	25 %	340783754
2073	NC_015851	GCTG	2	8	130002	130009	0 %	25 %	50 %	25 %	340783754
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2103	NC_015851	TGCATG	2	12	131849	131860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783756
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2105	NC_015851	CCA	3	9	131969	131977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783757
2106	NC_015851	CTT	2	6	132005	132010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783757
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2111	NC_015851	CGA	2	6	132214	132219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783757
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2117	NC_015851	GGCACC	2	12	132493	132504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340783757
2118	NC_015851	CCG	2	6	132515	132520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783757
2119	NC_015851	GC	3	6	132575	132580	0 %	0 %	50 %	50 %	340783757
2120	NC_015851	GATC	2	8	132596	132603	25 %	25 %	25 %	25 %	340783757
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2122	NC_015851	TGA	2	6	132694	132699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783757
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2243	NC_015851	CGG	2	6	138842	138847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
2244	NC_015851	CG	3	6	138862	138867	0 %	0 %	50 %	50 %	340783764
2245	NC_015851	GCG	2	6	138886	138891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783764
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2351	NC_015851	CTTC	2	8	145091	145098	0 %	50 %	0 %	50 %	340783773
2352	NC_015851	GCT	2	6	145127	145132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783773
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2355	NC_015851	CTC	2	6	145182	145187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783774
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2359	NC_015851	GGA	2	6	145321	145326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783775
2360	NC_015851	AAGC	2	8	145387	145394	50 %	0 %	25 %	25 %	340783775
2361	NC_015851	GCCA	2	8	145397	145404	25 %	0 %	25 %	50 %	340783775
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2484	NC_015851	TGC	2	6	153642	153647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783785
2485	NC_015851	ACG	2	6	153656	153661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783785
2486	NC_015851	GCG	2	6	153688	153693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783785
2487	NC_015851	GC	3	6	153731	153736	0 %	0 %	50 %	50 %	340783785
2488	NC_015851	CGTC	2	8	153921	153928	0 %	25 %	25 %	50 %	340783785
2489	NC_015851	CGG	2	6	153936	153941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783785
2490	NC_015851	CCTTG	2	10	153972	153981	0 %	40 %	20 %	40 %	340783785
2491	NC_015851	GTTCTT	2	12	153991	154002	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340783785
2492	NC_015851	CTTGAG	2	12	154147	154158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783785
2493	NC_015851	GAT	2	6	154173	154178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783785
2494	NC_015851	GCC	2	6	154261	154266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783785
2495	NC_015851	GTG	2	6	154322	154327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783785
2496	NC_015851	GGT	2	6	154338	154343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783785
2497	NC_015851	CAG	2	6	154352	154357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783785
2498	NC_015851	CGG	2	6	154434	154439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783785
2499	NC_015851	GCC	2	6	154527	154532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783785
2500	NC_015851	CAG	2	6	154618	154623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783785

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