MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015850	GGA	2	6	202636	202641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780942
3502	NC_015850	GC	3	6	202648	202653	0 %	0 %	50 %	50 %	340780942
3503	NC_015850	ACG	2	6	202674	202679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780942
3504	NC_015850	TCA	2	6	202696	202701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780942
3505	NC_015850	TCAG	2	8	202741	202748	25 %	25 %	25 %	25 %	340780942
3506	NC_015850	TGT	2	6	202807	202812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780942
3507	NC_015850	GATC	2	8	202887	202894	25 %	25 %	25 %	25 %	340780942
3508	NC_015850	TTG	2	6	202910	202915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780942
3509	NC_015850	GGC	2	6	202936	202941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780942
3510	NC_015850	GC	4	8	202940	202947	0 %	0 %	50 %	50 %	340780942
3511	NC_015850	ATA	2	6	203025	203030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780942
3512	NC_015850	AAG	2	6	203055	203060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780942
3513	NC_015850	GTC	2	6	203123	203128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780942
3514	NC_015850	TCA	2	6	203149	203154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780942
3515	NC_015850	TGA	2	6	203163	203168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780942
3516	NC_015850	CTA	2	6	203169	203174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780942
3517	NC_015850	GCG	2	6	203222	203227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780942
3518	NC_015850	A	8	8	203240	203247	100 %	0 %	0 %	0 %	340780942
3519	NC_015850	ATC	2	6	203292	203297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780942
3520	NC_015850	CGATGG	2	12	203320	203331	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340780942
3521	NC_015850	TCGA	2	8	203415	203422	25 %	25 %	25 %	25 %	340780942
3522	NC_015850	AAT	2	6	203449	203454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780942
3523	NC_015850	GAA	2	6	203464	203469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780942
3524	NC_015850	TGA	2	6	203603	203608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780943
3525	NC_015850	CTT	2	6	203671	203676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780943
3526	NC_015850	GC	3	6	203783	203788	0 %	0 %	50 %	50 %	340780943
3527	NC_015850	ATC	2	6	203827	203832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780943
3528	NC_015850	GTG	2	6	203836	203841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780943
3529	NC_015850	CCTT	2	8	203844	203851	0 %	50 %	0 %	50 %	340780943
3530	NC_015850	GGT	2	6	203853	203858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780943
3531	NC_015850	CTG	2	6	203887	203892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780943
3532	NC_015850	GGA	2	6	203931	203936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780943
3533	NC_015850	GAA	2	6	203941	203946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780943
3534	NC_015850	CTGGA	2	10	203956	203965	20 %	20 %	40 %	20 %	340780943
3535	NC_015850	GCC	2	6	203992	203997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780943
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3537	NC_015850	TGA	2	6	204027	204032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780943
3538	NC_015850	TGC	2	6	204092	204097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780943
3539	NC_015850	GCA	2	6	204126	204131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780943
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3541	NC_015850	GAC	2	6	204178	204183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780943
3542	NC_015850	GAAG	2	8	204258	204265	50 %	0 %	50 %	0 %	340780943
3543	NC_015850	GACC	2	8	204345	204352	25 %	0 %	25 %	50 %	340780943
3544	NC_015850	ATGG	2	8	204367	204374	25 %	25 %	50 %	0 %	340780943
3545	NC_015850	CT	3	6	204441	204446	0 %	50 %	0 %	50 %	340780943
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3550	NC_015850	CGGA	2	8	204892	204899	25 %	0 %	50 %	25 %	340780944
3551	NC_015850	CAG	2	6	204966	204971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780944
3552	NC_015850	CGCT	2	8	205039	205046	0 %	25 %	25 %	50 %	340780944
3553	NC_015850	ACC	2	6	205102	205107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780944
3554	NC_015850	AGG	2	6	205129	205134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780944
3555	NC_015850	CCT	2	6	205190	205195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780944
3556	NC_015850	GCC	2	6	205206	205211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780944
3557	NC_015850	GCC	2	6	205218	205223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780944
3558	NC_015850	GTC	2	6	205254	205259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780944
3559	NC_015850	AGG	2	6	205294	205299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780944
3560	NC_015850	CCA	2	6	205327	205332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780944
3561	NC_015850	CAG	2	6	205334	205339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780944
3562	NC_015850	CGC	2	6	205448	205453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780944
3563	NC_015850	ACCC	2	8	205532	205539	25 %	0 %	0 %	75 %	340780944
3564	NC_015850	TGCG	2	8	205540	205547	0 %	25 %	50 %	25 %	340780944
3565	NC_015850	ACC	2	6	205561	205566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780944
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3568	NC_015850	CGC	2	6	205648	205653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780944
3569	NC_015850	CAG	3	9	205713	205721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780944
3570	NC_015850	AGG	2	6	205741	205746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780944
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3573	NC_015850	GAG	2	6	205900	205905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780945
3574	NC_015850	AGC	2	6	205926	205931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780945
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3578	NC_015850	AGC	2	6	206220	206225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780945
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3580	NC_015850	TTCAGA	2	12	206309	206320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340780945
3581	NC_015850	TGG	2	6	206373	206378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780945
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3584	NC_015850	GA	3	6	206583	206588	50 %	0 %	50 %	0 %	340780945
3585	NC_015850	GATC	2	8	206643	206650	25 %	25 %	25 %	25 %	340780945
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3587	NC_015850	GCA	2	6	206719	206724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780945
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3589	NC_015850	AAT	2	6	206824	206829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340780945
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3591	NC_015850	CCT	2	6	207069	207074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780945
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3593	NC_015850	C	7	7	207166	207172	0 %	0 %	0 %	100 %	340780945
3594	NC_015850	GGA	2	6	207180	207185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780945
3595	NC_015850	CAT	2	6	207201	207206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780945
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3599	NC_015850	GATC	2	8	207411	207418	25 %	25 %	25 %	25 %	340780945
3600	NC_015850	TTCG	2	8	207424	207431	0 %	50 %	25 %	25 %	340780945
3601	NC_015850	ATTC	2	8	207465	207472	25 %	50 %	0 %	25 %	340780945
3602	NC_015850	CGT	2	6	207507	207512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780945
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3605	NC_015850	CTT	2	6	207835	207840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780945
3606	NC_015850	GCC	2	6	207844	207849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780945
3607	NC_015850	AAG	2	6	207878	207883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780945
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3609	NC_015850	AGC	2	6	208519	208524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780946
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3611	NC_015850	GAA	2	6	208723	208728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780946
3612	NC_015850	CTG	2	6	208730	208735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780946
3613	NC_015850	GTGGAA	2	12	208756	208767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340780946
3614	NC_015850	GCCA	2	8	208777	208784	25 %	0 %	25 %	50 %	340780946
3615	NC_015850	AGCG	2	8	208863	208870	25 %	0 %	50 %	25 %	340780946
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3619	NC_015850	ACC	2	6	209343	209348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780946
3620	NC_015850	CCT	2	6	209368	209373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780946
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3622	NC_015850	ACCG	2	8	209938	209945	25 %	0 %	25 %	50 %	340780947
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3861	NC_015850	CTG	2	6	224834	224839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780960
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3863	NC_015850	CGG	2	6	224891	224896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780960
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3985	NC_015850	TGTT	2	8	233349	233356	0 %	75 %	25 %	0 %	340780968
3986	NC_015850	GTG	2	6	233365	233370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780968
3987	NC_015850	AAG	2	6	233396	233401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780968
3988	NC_015850	CCAGGC	2	12	233633	233644	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340780968
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3990	NC_015850	CGA	2	6	233797	233802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780968
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