MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_015850	GCA	2	6	2100429	2100434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782792
38003	NC_015850	AAG	2	6	2100999	2101004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782793
38004	NC_015850	CCA	2	6	2101017	2101022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782793
38005	NC_015850	TC	3	6	2101989	2101994	0 %	50 %	0 %	50 %	340782794
38006	NC_015850	CTGCG	2	10	2102058	2102067	0 %	20 %	40 %	40 %	340782794
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38009	NC_015850	TC	3	6	2102169	2102174	0 %	50 %	0 %	50 %	340782794
38010	NC_015850	AAAGG	2	10	2102182	2102191	60 %	0 %	40 %	0 %	340782794
38011	NC_015850	TGC	2	6	2102433	2102438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782794
38012	NC_015850	CAA	2	6	2102502	2102507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782794
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38016	NC_015850	CGC	2	6	2102928	2102933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782795
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38019	NC_015850	GTG	2	6	2103068	2103073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782795
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38022	NC_015850	CTG	2	6	2103918	2103923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782796
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38031	NC_015850	CATA	2	8	2104650	2104657	50 %	25 %	0 %	25 %	340782797
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38042	NC_015850	GCCTTG	2	12	2105723	2105734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782798
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38051	NC_015850	GAA	2	6	2106652	2106657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782798
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38107	NC_015850	GCA	2	6	2109821	2109826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782801
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38233	NC_015850	GACG	2	8	2119883	2119890	25 %	0 %	50 %	25 %	340782817
38234	NC_015850	GGC	2	6	2119935	2119940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782817
38235	NC_015850	CGG	2	6	2120012	2120017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782817
38236	NC_015850	GTT	2	6	2120022	2120027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782817
38237	NC_015850	GTC	2	6	2120085	2120090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782817
38238	NC_015850	CAG	2	6	2120103	2120108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782817
38239	NC_015850	ACG	2	6	2120122	2120127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782817
38240	NC_015850	CTT	2	6	2120163	2120168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782817
38241	NC_015850	CAG	2	6	2120187	2120192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782817
38242	NC_015850	TCC	2	6	2120248	2120253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782817
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38244	NC_015850	TCC	2	6	2120305	2120310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782817
38245	NC_015850	TGGC	2	8	2120311	2120318	0 %	25 %	50 %	25 %	340782817
38246	NC_015850	GAG	2	6	2120479	2120484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782817
38247	NC_015850	CCA	2	6	2120492	2120497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782817
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38249	NC_015850	TGACG	2	10	2120639	2120648	20 %	20 %	40 %	20 %	340782817
38250	NC_015850	CAC	2	6	2120655	2120660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782817
38251	NC_015850	CAC	2	6	2120758	2120763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782817
38252	NC_015850	CCG	2	6	2120775	2120780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782817
38253	NC_015850	TC	3	6	2120782	2120787	0 %	50 %	0 %	50 %	340782817
38254	NC_015850	GCC	2	6	2120804	2120809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782817
38255	NC_015850	TGA	2	6	2120869	2120874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782817
38256	NC_015850	TGG	2	6	2121787	2121792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782818
38257	NC_015850	GCT	2	6	2121811	2121816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782818
38258	NC_015850	TCT	2	6	2121868	2121873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782818
38259	NC_015850	TCCAGG	2	12	2121874	2121885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782818
38260	NC_015850	ATGA	2	8	2122415	2122422	50 %	25 %	25 %	0 %	340782819
38261	NC_015850	GGAG	2	8	2122483	2122490	25 %	0 %	75 %	0 %	340782819
38262	NC_015850	GGCCG	2	10	2122528	2122537	0 %	0 %	60 %	40 %	340782819
38263	NC_015850	CAT	2	6	2122566	2122571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782819
38264	NC_015850	GGT	2	6	2122597	2122602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782819
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38267	NC_015850	T	6	6	2122790	2122795	0 %	100 %	0 %	0 %	340782819
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38275	NC_015850	GTC	2	6	2123230	2123235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782819
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38303	NC_015850	CTG	2	6	2125986	2125991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782823
38304	NC_015850	GAT	2	6	2126067	2126072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782823
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38306	NC_015850	AT	3	6	2126116	2126121	50 %	50 %	0 %	0 %	340782823
38307	NC_015850	GGC	2	6	2126135	2126140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782823
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38309	NC_015850	TCA	2	6	2126179	2126184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782823
38310	NC_015850	CGG	2	6	2126226	2126231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782823
38311	NC_015850	TGC	2	6	2126308	2126313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782823
38312	NC_015850	CAA	2	6	2126354	2126359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782823
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38328	NC_015850	GCCG	2	8	2127016	2127023	0 %	0 %	50 %	50 %	340782823
38329	NC_015850	AG	3	6	2127785	2127790	50 %	0 %	50 %	0 %	340782824
38330	NC_015850	GGA	2	6	2127804	2127809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782824
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38332	NC_015850	CG	3	6	2127854	2127859	0 %	0 %	50 %	50 %	340782824
38333	NC_015850	AGGTGC	2	12	2127889	2127900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340782824
38334	NC_015850	GGA	2	6	2127905	2127910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782824
38335	NC_015850	CGT	2	6	2127947	2127952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782824
38336	NC_015850	CGG	2	6	2127988	2127993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782824
38337	NC_015850	TTC	2	6	2128058	2128063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782824
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38465	NC_015850	TGCT	2	8	2136065	2136072	0 %	50 %	25 %	25 %	340782832
38466	NC_015850	CT	4	8	2136071	2136078	0 %	50 %	0 %	50 %	340782832
38467	NC_015850	TC	3	6	2136165	2136170	0 %	50 %	0 %	50 %	340782832
38468	NC_015850	GCG	2	6	2136195	2136200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782832
38469	NC_015850	GGT	2	6	2136249	2136254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782832
38470	NC_015850	CGG	2	6	2136343	2136348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782832
38471	NC_015850	TGG	2	6	2136359	2136364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782832
38472	NC_015850	TGGT	2	8	2136392	2136399	0 %	50 %	50 %	0 %	340782832
38473	NC_015850	TGG	2	6	2136529	2136534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782832
38474	NC_015850	GAT	2	6	2136547	2136552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782832
38475	NC_015850	G	7	7	2136555	2136561	0 %	0 %	100 %	0 %	340782832
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38477	NC_015850	GGT	2	6	2136753	2136758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782832
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38479	NC_015850	GCA	2	6	2136838	2136843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782833
38480	NC_015850	CGC	2	6	2136851	2136856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782833
38481	NC_015850	ATGCAG	2	12	2136872	2136883	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782833
38482	NC_015850	TGG	2	6	2136912	2136917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782833
38483	NC_015850	GC	3	6	2136941	2136946	0 %	0 %	50 %	50 %	340782833
38484	NC_015850	GAGTG	2	10	2136980	2136989	20 %	20 %	60 %	0 %	340782833
38485	NC_015850	TGC	2	6	2137011	2137016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782833
38486	NC_015850	CAG	2	6	2137022	2137027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782833
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38488	NC_015850	GCG	2	6	2137436	2137441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782833
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38491	NC_015850	GCG	2	6	2137508	2137513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782833
38492	NC_015850	TG	3	6	2137789	2137794	0 %	50 %	50 %	0 %	340782834
38493	NC_015850	TCT	2	6	2137830	2137835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782834
38494	NC_015850	TAT	2	6	2137851	2137856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782834
38495	NC_015850	T	6	6	2137870	2137875	0 %	100 %	0 %	0 %	340782834
38496	NC_015850	CCT	2	6	2137882	2137887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782834
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38499	NC_015850	ATG	2	6	2138005	2138010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782834
38500	NC_015850	TGA	2	6	2138204	2138209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782835

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