MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_015850	CTT	2	6	420090	420095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781152
8003	NC_015850	CGA	2	6	420096	420101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781152
8004	NC_015850	ACC	2	6	420304	420309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781152
8005	NC_015850	GAG	2	6	420364	420369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781152
8006	NC_015850	CG	3	6	420377	420382	0 %	0 %	50 %	50 %	340781152
8007	NC_015850	GCT	2	6	420393	420398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781152
8008	NC_015850	GC	3	6	420478	420483	0 %	0 %	50 %	50 %	340781152
8009	NC_015850	TGG	3	9	420586	420594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781152
8010	NC_015850	CTACGC	2	12	420633	420644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340781152
8011	NC_015850	GCT	2	6	420654	420659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781152
8012	NC_015850	TGC	2	6	420725	420730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781152
8013	NC_015850	GGT	2	6	420759	420764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781152
8014	NC_015850	GATC	2	8	420777	420784	25 %	25 %	25 %	25 %	340781152
8015	NC_015850	TCG	2	6	420833	420838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781152
8016	NC_015850	GAG	2	6	420890	420895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781153
8017	NC_015850	GGC	2	6	420922	420927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
8018	NC_015850	GC	3	6	420942	420947	0 %	0 %	50 %	50 %	340781153
8019	NC_015850	CCT	2	6	421063	421068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781153
8020	NC_015850	GCC	2	6	421069	421074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781153
8021	NC_015850	CGC	3	9	421081	421089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781153
8022	NC_015850	CGG	2	6	421104	421109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
8023	NC_015850	CGC	2	6	421233	421238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781153
8024	NC_015850	TCC	2	6	421289	421294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781153
8025	NC_015850	TGC	2	6	421329	421334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781153
8026	NC_015850	GGC	2	6	421335	421340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
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8028	NC_015850	TCGG	2	8	421425	421432	0 %	25 %	50 %	25 %	340781153
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8030	NC_015850	GAG	2	6	421508	421513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781153
8031	NC_015850	CGG	2	6	421542	421547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
8032	NC_015850	GGA	2	6	421556	421561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781153
8033	NC_015850	CGG	2	6	421653	421658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
8034	NC_015850	GCC	2	6	421709	421714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781153
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8043	NC_015850	CGG	2	6	422054	422059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
8044	NC_015850	CGCT	2	8	422084	422091	0 %	25 %	25 %	50 %	340781153
8045	NC_015850	GCG	3	9	422135	422143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781153
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8048	NC_015850	CGA	2	6	422215	422220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781153
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8050	NC_015850	A	6	6	422280	422285	100 %	0 %	0 %	0 %	340781153
8051	NC_015850	GCA	2	6	422385	422390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781154
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8053	NC_015850	GAT	2	6	422685	422690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781154
8054	NC_015850	GC	4	8	422691	422698	0 %	0 %	50 %	50 %	340781154
8055	NC_015850	CTGC	3	12	422780	422791	0 %	25 %	25 %	50 %	340781154
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8059	NC_015850	TCG	2	6	423128	423133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781154
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8062	NC_015850	TGG	2	6	423290	423295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781154
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8106	NC_015850	AGA	2	6	425812	425817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781156
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8119	NC_015850	CCA	2	6	426343	426348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781156
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8121	NC_015850	ATG	2	6	426387	426392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781156
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8240	NC_015850	GC	3	6	431826	431831	0 %	0 %	50 %	50 %	340781163
8241	NC_015850	CGC	3	9	431829	431837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781163
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8243	NC_015850	GCA	2	6	431915	431920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781163
8244	NC_015850	CGC	2	6	431972	431977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781163
8245	NC_015850	CGC	2	6	432017	432022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781163
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8262	NC_015850	TCG	2	6	432604	432609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781163
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8485	NC_015850	GAT	2	6	445437	445442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781178
8486	NC_015850	AGC	3	9	445560	445568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781178
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8488	NC_015850	CGCA	2	8	445596	445603	25 %	0 %	25 %	50 %	340781178
8489	NC_015850	GTT	2	6	445691	445696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781178
8490	NC_015850	TGA	2	6	445733	445738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781178
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8493	NC_015850	CATCC	2	10	445880	445889	20 %	20 %	0 %	60 %	340781178
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