MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015850	GCA	2	6	327129	327134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781051
6002	NC_015850	CCCGCA	2	12	327149	327160	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340781051
6003	NC_015850	CTG	2	6	327226	327231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781051
6004	NC_015850	GAA	2	6	327241	327246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781051
6005	NC_015850	TGG	2	6	327322	327327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781051
6006	NC_015850	GGT	2	6	327408	327413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781051
6007	NC_015850	GC	3	6	327417	327422	0 %	0 %	50 %	50 %	340781051
6008	NC_015850	GC	3	6	327424	327429	0 %	0 %	50 %	50 %	340781051
6009	NC_015850	GCG	2	6	327478	327483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781051
6010	NC_015850	CGGG	2	8	327528	327535	0 %	0 %	75 %	25 %	340781051
6011	NC_015850	CGC	2	6	327630	327635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781051
6012	NC_015850	TTTGG	2	10	327712	327721	0 %	60 %	40 %	0 %	340781051
6013	NC_015850	GCG	3	9	327819	327827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781051
6014	NC_015850	GC	4	8	327884	327891	0 %	0 %	50 %	50 %	340781052
6015	NC_015850	ACC	2	6	327912	327917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781052
6016	NC_015850	CGA	2	6	327918	327923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781052
6017	NC_015850	GAG	2	6	327932	327937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781052
6018	NC_015850	GGC	2	6	327956	327961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781052
6019	NC_015850	ACG	2	6	328053	328058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781052
6020	NC_015850	GCG	2	6	328074	328079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781052
6021	NC_015850	TGGC	2	8	328117	328124	0 %	25 %	50 %	25 %	340781052
6022	NC_015850	CGC	2	6	328165	328170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781052
6023	NC_015850	CGT	3	9	328201	328209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781052
6024	NC_015850	TCA	2	6	328255	328260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781052
6025	NC_015850	CGC	2	6	328374	328379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781053
6026	NC_015850	CTCC	2	8	328380	328387	0 %	25 %	0 %	75 %	340781053
6027	NC_015850	CAT	2	6	328445	328450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781053
6028	NC_015850	TCG	2	6	328495	328500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6029	NC_015850	GTG	2	6	328525	328530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781053
6030	NC_015850	GCG	2	6	328571	328576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781053
6031	NC_015850	AGG	2	6	328657	328662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781053
6032	NC_015850	CCA	2	6	328684	328689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781053
6033	NC_015850	TGC	2	6	328786	328791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6034	NC_015850	TTC	2	6	328803	328808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781053
6035	NC_015850	GCC	2	6	328833	328838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781053
6036	NC_015850	CGACGG	2	12	328882	328893	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781053
6037	NC_015850	TCG	2	6	328921	328926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6038	NC_015850	GTG	2	6	328953	328958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781053
6039	NC_015850	ACA	2	6	329071	329076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781053
6040	NC_015850	GGGT	2	8	329089	329096	0 %	25 %	75 %	0 %	340781053
6041	NC_015850	CGG	2	6	329101	329106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781053
6042	NC_015850	TGC	2	6	329192	329197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6043	NC_015850	AGC	2	6	329245	329250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6044	NC_015850	TGGTC	2	10	329456	329465	0 %	40 %	40 %	20 %	340781053
6045	NC_015850	AGC	2	6	329473	329478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781053
6046	NC_015850	GGGCA	2	10	329586	329595	20 %	0 %	60 %	20 %	340781054
6047	NC_015850	CGA	2	6	329621	329626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6048	NC_015850	CGG	2	6	329634	329639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6049	NC_015850	CGG	2	6	329668	329673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6050	NC_015850	GTA	2	6	329739	329744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781054
6051	NC_015850	GTC	2	6	329766	329771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6052	NC_015850	GGC	2	6	329781	329786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6053	NC_015850	CCCG	2	8	329793	329800	0 %	0 %	25 %	75 %	340781054
6054	NC_015850	CG	3	6	329799	329804	0 %	0 %	50 %	50 %	340781054
6055	NC_015850	GTG	2	6	329838	329843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6056	NC_015850	CAA	2	6	329849	329854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781054
6057	NC_015850	GCT	2	6	329858	329863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6058	NC_015850	GCG	2	6	329889	329894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6059	NC_015850	GC	3	6	329901	329906	0 %	0 %	50 %	50 %	340781054
6060	NC_015850	TGG	2	6	329914	329919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6061	NC_015850	GGC	2	6	329927	329932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6062	NC_015850	CAT	2	6	330008	330013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781054
6063	NC_015850	GGT	2	6	330135	330140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6064	NC_015850	CGG	2	6	330297	330302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6065	NC_015850	GAC	2	6	330306	330311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6066	NC_015850	CACCC	2	10	330330	330339	20 %	0 %	0 %	80 %	340781054
6067	NC_015850	GCCA	2	8	330348	330355	25 %	0 %	25 %	50 %	340781054
6068	NC_015850	GTG	2	6	330436	330441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6069	NC_015850	TGG	2	6	330481	330486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6070	NC_015850	CTG	2	6	330570	330575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6071	NC_015850	GCC	2	6	330582	330587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
6072	NC_015850	CCGGC	2	10	330626	330635	0 %	0 %	40 %	60 %	340781054
6073	NC_015850	GGC	2	6	330650	330655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
6074	NC_015850	GCC	2	6	330663	330668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
6075	NC_015850	TGC	2	6	330739	330744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
6076	NC_015850	GCC	2	6	330771	330776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
6077	NC_015850	GGT	2	6	330807	330812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
6078	NC_015850	CAT	2	6	330920	330925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781055
6079	NC_015850	CGC	2	6	330994	330999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
6080	NC_015850	GAG	2	6	331128	331133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781055
6081	NC_015850	GAT	2	6	331142	331147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781055
6082	NC_015850	CGG	3	9	331174	331182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
6083	NC_015850	CGC	2	6	331193	331198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
6084	NC_015850	GC	3	6	331211	331216	0 %	0 %	50 %	50 %	340781055
6085	NC_015850	ATG	2	6	331269	331274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781055
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6087	NC_015850	AGA	2	6	331399	331404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781055
6088	NC_015850	CCG	2	6	331405	331410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
6089	NC_015850	ATC	2	6	331419	331424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781055
6090	NC_015850	G	8	8	331433	331440	0 %	0 %	100 %	0 %	340781055
6091	NC_015850	TGGG	2	8	331494	331501	0 %	25 %	75 %	0 %	340781055
6092	NC_015850	GGT	2	6	331593	331598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
6093	NC_015850	GTG	2	6	331740	331745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
6094	NC_015850	GCG	2	6	331753	331758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
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6096	NC_015850	GCTG	2	8	331804	331811	0 %	25 %	50 %	25 %	340781055
6097	NC_015850	GCA	2	6	331814	331819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781055
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6099	NC_015850	GTC	2	6	331866	331871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781055
6100	NC_015850	GCC	2	6	331875	331880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
6101	NC_015850	CG	3	6	331881	331886	0 %	0 %	50 %	50 %	340781055
6102	NC_015850	GGT	2	6	331910	331915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
6103	NC_015850	GGC	2	6	331968	331973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
6104	NC_015850	TGA	2	6	332031	332036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781055
6105	NC_015850	GGTG	2	8	332086	332093	0 %	25 %	75 %	0 %	340781056
6106	NC_015850	CAG	2	6	332142	332147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781056
6107	NC_015850	CTG	2	6	332174	332179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
6108	NC_015850	CTGC	2	8	332195	332202	0 %	25 %	25 %	50 %	340781056
6109	NC_015850	CTG	2	6	332210	332215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
6110	NC_015850	CCG	2	6	332220	332225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781056
6111	NC_015850	TGC	2	6	332301	332306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
6112	NC_015850	GC	3	6	332393	332398	0 %	0 %	50 %	50 %	340781056
6113	NC_015850	CAGC	2	8	332446	332453	25 %	0 %	25 %	50 %	340781056
6114	NC_015850	GCA	2	6	332482	332487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781056
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6117	NC_015850	CCG	2	6	332572	332577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781056
6118	NC_015850	ACT	2	6	332607	332612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781056
6119	NC_015850	TGGGG	2	10	332621	332630	0 %	20 %	80 %	0 %	340781056
6120	NC_015850	TGCC	3	12	332633	332644	0 %	25 %	25 %	50 %	340781056
6121	NC_015850	CGG	2	6	332658	332663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781056
6122	NC_015850	AGC	2	6	332817	332822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781056
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6124	NC_015850	GCT	2	6	332904	332909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
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