MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52226	NC_015850	TCA	2	6	2827606	2827611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783511
52227	NC_015850	TGCC	2	8	2827651	2827658	0 %	25 %	25 %	50 %	340783511
52228	NC_015850	GAC	2	6	2827791	2827796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783511
52229	NC_015850	GGA	2	6	2827844	2827849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783511
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52231	NC_015850	C	6	6	2827995	2828000	0 %	0 %	0 %	100 %	340783512
52232	NC_015850	GGT	2	6	2828134	2828139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783512
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52234	NC_015850	CGC	2	6	2828204	2828209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783512
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52347	NC_015850	GCT	3	9	2833551	2833559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783518
52348	NC_015850	GCC	2	6	2833566	2833571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783518
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52400	NC_015850	CGCT	2	8	2835888	2835895	0 %	25 %	25 %	50 %	340783521
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52433	NC_015850	GGAG	2	8	2842796	2842803	25 %	0 %	75 %	0 %	340783524
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52439	NC_015850	TAG	2	6	2843021	2843026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783524
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52442	NC_015850	CAAC	2	8	2843208	2843215	50 %	0 %	0 %	50 %	340783524
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52444	NC_015850	GC	3	6	2843255	2843260	0 %	0 %	50 %	50 %	340783524
52445	NC_015850	GCT	2	6	2843319	2843324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783524
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52450	NC_015850	CGG	2	6	2843517	2843522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783524
52451	NC_015850	TGC	2	6	2843538	2843543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783524
52452	NC_015850	GCA	2	6	2843634	2843639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783524
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52456	NC_015850	GC	3	6	2843784	2843789	0 %	0 %	50 %	50 %	340783524
52457	NC_015850	CCAT	2	8	2843801	2843808	25 %	25 %	0 %	50 %	340783524
52458	NC_015850	GCC	2	6	2844179	2844184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783525
52459	NC_015850	GGC	2	6	2844208	2844213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783525
52460	NC_015850	CCAC	2	8	2844242	2844249	25 %	0 %	0 %	75 %	340783525
52461	NC_015850	ATC	2	6	2844324	2844329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783525
52462	NC_015850	CAC	2	6	2844373	2844378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783525
52463	NC_015850	GC	4	8	2844391	2844398	0 %	0 %	50 %	50 %	340783525
52464	NC_015850	TGC	2	6	2844405	2844410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783525
52465	NC_015850	ATCA	2	8	2844419	2844426	50 %	25 %	0 %	25 %	340783525
52466	NC_015850	TTC	2	6	2844440	2844445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783525
52467	NC_015850	TAA	2	6	2844460	2844465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783525
52468	NC_015850	GGTC	2	8	2844553	2844560	0 %	25 %	50 %	25 %	340783525
52469	NC_015850	CG	3	6	2844566	2844571	0 %	0 %	50 %	50 %	340783525
52470	NC_015850	TCA	2	6	2844618	2844623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783525
52471	NC_015850	TGA	2	6	2844645	2844650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783525
52472	NC_015850	TGG	2	6	2844819	2844824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783525
52473	NC_015850	TGC	2	6	2844841	2844846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783525
52474	NC_015850	CAAT	2	8	2844850	2844857	50 %	25 %	0 %	25 %	340783525
52475	NC_015850	GCA	2	6	2844875	2844880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783525
52476	NC_015850	CGG	2	6	2844904	2844909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783525
52477	NC_015850	GGC	2	6	2844938	2844943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783525
52478	NC_015850	ACA	2	6	2844987	2844992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783525
52479	NC_015850	CGG	2	6	2845098	2845103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783525
52480	NC_015850	GCG	2	6	2845127	2845132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783525
52481	NC_015850	CCA	2	6	2845213	2845218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783525
52482	NC_015850	CAA	2	6	2845261	2845266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783525
52483	NC_015850	CGC	2	6	2845494	2845499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783526
52484	NC_015850	CTG	3	9	2845516	2845524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783526
52485	NC_015850	GTGCC	2	10	2845526	2845535	0 %	20 %	40 %	40 %	340783526
52486	NC_015850	ATC	2	6	2845598	2845603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783526
52487	NC_015850	GTG	2	6	2845621	2845626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783526
52488	NC_015850	CAA	2	6	2845671	2845676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783526
52489	NC_015850	CTG	2	6	2845687	2845692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783526
52490	NC_015850	GTG	3	9	2845723	2845731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783526
52491	NC_015850	TACC	2	8	2845756	2845763	25 %	25 %	0 %	50 %	340783526
52492	NC_015850	CGC	2	6	2845779	2845784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783526
52493	NC_015850	TG	3	6	2845824	2845829	0 %	50 %	50 %	0 %	340783526
52494	NC_015850	GGA	2	6	2845842	2845847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783526
52495	NC_015850	GCC	2	6	2845872	2845877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783526
52496	NC_015850	GGT	2	6	2845890	2845895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783526
52497	NC_015850	CCG	2	6	2845904	2845909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783526
52498	NC_015850	TCCA	2	8	2846153	2846160	25 %	25 %	0 %	50 %	340783527
52499	NC_015850	ATGG	2	8	2846231	2846238	25 %	25 %	50 %	0 %	340783527
52500	NC_015850	CGGGCG	2	12	2846292	2846303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783527

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