MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50116	NC_015850	GCCC	2	8	2722115	2722122	0 %	0 %	25 %	75 %	340783410
50117	NC_015850	GAG	2	6	2722130	2722135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783410
50118	NC_015850	GCG	2	6	2722153	2722158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783410
50119	NC_015850	GCC	2	6	2722175	2722180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783410
50120	NC_015850	GCC	2	6	2722281	2722286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783410
50121	NC_015850	CTT	3	9	2722330	2722338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783410
50122	NC_015850	GCT	2	6	2722438	2722443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783410
50123	NC_015850	TGG	2	6	2722455	2722460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783410
50124	NC_015850	TCA	2	6	2722488	2722493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783410
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50127	NC_015850	TCG	2	6	2722590	2722595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783410
50128	NC_015850	GCT	2	6	2722714	2722719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783410
50129	NC_015850	CG	3	6	2722735	2722740	0 %	0 %	50 %	50 %	340783410
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50134	NC_015850	AGC	2	6	2722945	2722950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
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50149	NC_015850	AGC	3	9	2723477	2723485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783411
50150	NC_015850	ATCGC	2	10	2723492	2723501	20 %	20 %	20 %	40 %	340783411
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50154	NC_015850	GGC	2	6	2723661	2723666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783411
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50199	NC_015850	GCCG	2	8	2725653	2725660	0 %	0 %	50 %	50 %	340783412
50200	NC_015850	A	6	6	2725682	2725687	100 %	0 %	0 %	0 %	340783412
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50203	NC_015850	CCTG	2	8	2725937	2725944	0 %	25 %	25 %	50 %	340783413
50204	NC_015850	AGC	2	6	2725949	2725954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783413
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50206	NC_015850	CAG	2	6	2726013	2726018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783413
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50210	NC_015850	GTG	2	6	2726157	2726162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783413
50211	NC_015850	TGG	2	6	2726221	2726226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783413
50212	NC_015850	GGC	2	6	2726248	2726253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783413
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50214	NC_015850	GCC	2	6	2726410	2726415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783414
50215	NC_015850	GGT	2	6	2726532	2726537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783414
50216	NC_015850	GGCT	2	8	2726618	2726625	0 %	25 %	50 %	25 %	340783414
50217	NC_015850	ACA	2	6	2726714	2726719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783414
50218	NC_015850	TCG	2	6	2726723	2726728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783414
50219	NC_015850	AAG	2	6	2726740	2726745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783414
50220	NC_015850	GCC	2	6	2726869	2726874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783414
50221	NC_015850	GCTGG	2	10	2726886	2726895	0 %	20 %	60 %	20 %	340783414
50222	NC_015850	GTA	2	6	2726911	2726916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783414
50223	NC_015850	CAT	2	6	2726994	2726999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783414
50224	NC_015850	CCT	2	6	2727031	2727036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783414
50225	NC_015850	GCA	2	6	2727072	2727077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783414
50226	NC_015850	GGC	2	6	2727084	2727089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783414
50227	NC_015850	CTG	2	6	2727332	2727337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783415
50228	NC_015850	GAGCC	2	10	2727359	2727368	20 %	0 %	40 %	40 %	340783415
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50230	NC_015850	TGC	2	6	2727426	2727431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783415
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50330	NC_015850	TGG	2	6	2732177	2732182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783419
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50335	NC_015850	GA	3	6	2732400	2732405	50 %	0 %	50 %	0 %	340783420
50336	NC_015850	GCGA	2	8	2732420	2732427	25 %	0 %	50 %	25 %	340783420
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50344	NC_015850	GCTG	2	8	2732779	2732786	0 %	25 %	50 %	25 %	340783420
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50457	NC_015850	CCTC	2	8	2738381	2738388	0 %	25 %	0 %	75 %	340783425
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