MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015564	GCA	2	6	75015	75020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917754
1502	NC_015564	GTG	2	6	75051	75056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917754
1503	NC_015564	ACT	2	6	75096	75101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917754
1504	NC_015564	GCT	2	6	75175	75180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917754
1505	NC_015564	TGA	2	6	75191	75196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917754
1506	NC_015564	CCCG	2	8	75239	75246	0 %	0 %	25 %	75 %	333917754
1507	NC_015564	TCA	2	6	75250	75255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917754
1508	NC_015564	GGT	2	6	75264	75269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917754
1509	NC_015564	CA	3	6	75700	75705	50 %	0 %	0 %	50 %	333917755
1510	NC_015564	GTT	2	6	75723	75728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917755
1511	NC_015564	TGG	2	6	75734	75739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917755
1512	NC_015564	TCG	2	6	75803	75808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917755
1513	NC_015564	ACCGAT	2	12	75859	75870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333917755
1514	NC_015564	CGT	2	6	75876	75881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917755
1515	NC_015564	TGC	2	6	75924	75929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917755
1516	NC_015564	TTC	2	6	75947	75952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917755
1517	NC_015564	CGAGCG	2	12	75986	75997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333917755
1518	NC_015564	CGG	2	6	76109	76114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917755
1519	NC_015564	GAG	2	6	76189	76194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917755
1520	NC_015564	GAAA	2	8	76254	76261	75 %	0 %	25 %	0 %	333917756
1521	NC_015564	TCG	2	6	76386	76391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917756
1522	NC_015564	GTTC	2	8	76402	76409	0 %	50 %	25 %	25 %	333917756
1523	NC_015564	CGC	2	6	76435	76440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917756
1524	NC_015564	AG	3	6	76450	76455	50 %	0 %	50 %	0 %	333917756
1525	NC_015564	GGC	2	6	76600	76605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917756
1526	NC_015564	CTC	2	6	76639	76644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917756
1527	NC_015564	CTG	2	6	76709	76714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917756
1528	NC_015564	TGG	2	6	76742	76747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917756
1529	NC_015564	GC	3	6	76823	76828	0 %	0 %	50 %	50 %	333917756
1530	NC_015564	GGC	2	6	76849	76854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917756
1531	NC_015564	TGG	2	6	76856	76861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917756
1532	NC_015564	GGTG	2	8	76890	76897	0 %	25 %	75 %	0 %	333917756
1533	NC_015564	GAA	2	6	76910	76915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917756
1534	NC_015564	GC	4	8	76924	76931	0 %	0 %	50 %	50 %	333917756
1535	NC_015564	GAC	2	6	77108	77113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917756
1536	NC_015564	ACG	2	6	77134	77139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917756
1537	NC_015564	CGCTG	2	10	77172	77181	0 %	20 %	40 %	40 %	333917756
1538	NC_015564	CGC	2	6	77261	77266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917757
1539	NC_015564	AACG	2	8	77319	77326	50 %	0 %	25 %	25 %	333917757
1540	NC_015564	CG	3	6	77352	77357	0 %	0 %	50 %	50 %	333917757
1541	NC_015564	GTC	2	6	77377	77382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917757
1542	NC_015564	TCG	2	6	77384	77389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917757
1543	NC_015564	CCT	2	6	77393	77398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917757
1544	NC_015564	TCG	2	6	77452	77457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917757
1545	NC_015564	ATC	3	9	77614	77622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917757
1546	NC_015564	AT	3	6	77710	77715	50 %	50 %	0 %	0 %	333917757
1547	NC_015564	TGC	2	6	77716	77721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917757
1548	NC_015564	TGA	2	6	77762	77767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917757
1549	NC_015564	TGA	2	6	77946	77951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917758
1550	NC_015564	CGT	2	6	78003	78008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917758
1551	NC_015564	ACC	2	6	78055	78060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917758
1552	NC_015564	TGC	2	6	78180	78185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917758
1553	NC_015564	TGCC	2	8	78354	78361	0 %	25 %	25 %	50 %	333917758
1554	NC_015564	CGC	2	6	78399	78404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917758
1555	NC_015564	TTC	2	6	78478	78483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917758
1556	NC_015564	AGC	2	6	78497	78502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917758
1557	NC_015564	CAAATG	2	12	78513	78524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333917758
1558	NC_015564	T	6	6	78534	78539	0 %	100 %	0 %	0 %	333917758
1559	NC_015564	CAC	2	6	78600	78605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917758
1560	NC_015564	AGA	2	6	78623	78628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917758
1561	NC_015564	AGT	2	6	78664	78669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917758
1562	NC_015564	AGG	2	6	78765	78770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917758
1563	NC_015564	CAG	2	6	78802	78807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917758
1564	NC_015564	CCGACC	2	12	78815	78826	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333917758
1565	NC_015564	CAG	3	9	78841	78849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917758
1566	NC_015564	CCGGC	2	10	79277	79286	0 %	0 %	40 %	60 %	333917759
1567	NC_015564	GCT	2	6	79294	79299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917759
1568	NC_015564	GC	3	6	79304	79309	0 %	0 %	50 %	50 %	333917759
1569	NC_015564	CGGT	2	8	79348	79355	0 %	25 %	50 %	25 %	333917759
1570	NC_015564	CGG	2	6	79416	79421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917759
1571	NC_015564	TCG	2	6	79443	79448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917759
1572	NC_015564	GCCA	2	8	79479	79486	25 %	0 %	25 %	50 %	333917759
1573	NC_015564	AGCG	2	8	79517	79524	25 %	0 %	50 %	25 %	333917759
1574	NC_015564	GAA	2	6	79528	79533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917759
1575	NC_015564	CGA	2	6	79600	79605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917759
1576	NC_015564	CGC	2	6	79660	79665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917759
1577	NC_015564	TCA	2	6	79689	79694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917759
1578	NC_015564	TCG	2	6	79713	79718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917759
1579	NC_015564	CCT	2	6	79738	79743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917759
1580	NC_015564	CG	3	6	79765	79770	0 %	0 %	50 %	50 %	333917759
1581	NC_015564	TCG	2	6	79791	79796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917759
1582	NC_015564	CAC	2	6	79805	79810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917759
1583	NC_015564	TTC	2	6	79826	79831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917759
1584	NC_015564	GCG	2	6	79860	79865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917759
1585	NC_015564	CGC	2	6	79872	79877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917759
1586	NC_015564	GTAC	2	8	79987	79994	25 %	25 %	25 %	25 %	333917759
1587	NC_015564	GAAC	2	8	80175	80182	50 %	0 %	25 %	25 %	333917760
1588	NC_015564	TCAC	2	8	80209	80216	25 %	25 %	0 %	50 %	333917760
1589	NC_015564	GGC	2	6	80256	80261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917760
1590	NC_015564	GC	3	6	80260	80265	0 %	0 %	50 %	50 %	333917760
1591	NC_015564	TGA	2	6	80294	80299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917760
1592	NC_015564	TGCGAC	2	12	80303	80314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917760
1593	NC_015564	TGT	2	6	80315	80320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917760
1594	NC_015564	GA	3	6	80334	80339	50 %	0 %	50 %	0 %	333917760
1595	NC_015564	GC	3	6	80393	80398	0 %	0 %	50 %	50 %	333917760
1596	NC_015564	CGA	2	6	80416	80421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1597	NC_015564	CGA	2	6	80425	80430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1598	NC_015564	AGC	2	6	80454	80459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1599	NC_015564	GGT	2	6	80548	80553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917761
1600	NC_015564	GAG	2	6	80624	80629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917761
1601	NC_015564	ACG	3	9	80634	80642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1602	NC_015564	GCG	2	6	80655	80660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917761
1603	NC_015564	CCA	2	6	80699	80704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917761
1604	NC_015564	GAC	2	6	80726	80731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1605	NC_015564	CCG	2	6	80794	80799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917761
1606	NC_015564	GCCA	2	8	80850	80857	25 %	0 %	25 %	50 %	333917761
1607	NC_015564	GGC	2	6	80861	80866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917761
1608	NC_015564	CAG	2	6	80879	80884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1609	NC_015564	ACG	2	6	80919	80924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1610	NC_015564	CG	3	6	80937	80942	0 %	0 %	50 %	50 %	333917761
1611	NC_015564	GAT	2	6	80948	80953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917761
1612	NC_015564	TGA	2	6	81067	81072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917761
1613	NC_015564	GAC	2	6	81074	81079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1614	NC_015564	CAG	2	6	81098	81103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917761
1615	NC_015564	CGC	2	6	81105	81110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917761
1616	NC_015564	CG	3	6	81211	81216	0 %	0 %	50 %	50 %	333917762
1617	NC_015564	CTGA	2	8	81259	81266	25 %	25 %	25 %	25 %	333917762
1618	NC_015564	TCGC	2	8	81326	81333	0 %	25 %	25 %	50 %	333917762
1619	NC_015564	GC	4	8	81398	81405	0 %	0 %	50 %	50 %	333917762
1620	NC_015564	CGGCT	2	10	81502	81511	0 %	20 %	40 %	40 %	333917762
1621	NC_015564	GCA	2	6	81585	81590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917762
1622	NC_015564	CGC	2	6	81637	81642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917762
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1624	NC_015564	TCG	2	6	81746	81751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917762
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1998	NC_015564	GGC	2	6	100469	100474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917781
1999	NC_015564	TCG	2	6	100512	100517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917781
2000	NC_015564	CTGGCT	2	12	100525	100536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917781

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