MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	GCCGTT	2	12	1777	1788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917561
2	NC_015561	CCGGAC	2	12	2407	2418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333917562
3	NC_015561	GGGACG	2	12	8558	8569	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333917569
4	NC_015561	GCGAGG	2	12	8613	8624	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333917569
5	NC_015561	GCCACA	2	12	13531	13542	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917572
6	NC_015561	GAAGCA	2	12	18123	18134	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333917579
7	NC_015561	AGAACG	2	12	24091	24102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333917587
8	NC_015561	CGCCGT	2	12	25428	25439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917589
9	NC_015561	GGTGCG	2	12	27416	27427	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333917591
10	NC_015561	GTCATG	2	12	35042	35053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333917605
11	NC_015561	GCAGGA	2	12	37928	37939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333917608
12	NC_015561	GCACCA	2	12	40027	40038	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917610
13	NC_015561	CCGGCA	4	24	40141	40164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333917610
14	NC_015561	CGAACC	2	12	40719	40730	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917610
15	NC_015561	ACCGGA	2	12	40860	40871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917610
16	NC_015561	CGATCG	3	18	44801	44818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917618
17	NC_015561	CAAACA	2	12	54813	54824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917625
18	NC_015561	CGATGC	2	12	57608	57619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917629
19	NC_015561	GCGGCT	2	12	58945	58956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917630
20	NC_015561	TCGCGG	2	12	59897	59908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917631
21	NC_015561	CGGCCG	2	12	59961	59972	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
22	NC_015561	GCTTCG	2	12	60152	60163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
23	NC_015561	GTGGGT	2	12	61627	61638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917631
24	NC_015561	GCGCGA	2	12	61932	61943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333917631
25	NC_015561	GGCGAC	2	12	62023	62034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333917631
26	NC_015561	GGTGAG	2	12	66635	66646	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333917639
27	NC_015561	GGCATG	2	12	66899	66910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917640
28	NC_015561	GAGGCG	2	12	72269	72280	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333917646
29	NC_015561	CGCGGG	2	12	79259	79270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917649
30	NC_015561	CCGCGG	2	12	79346	79357	0 %	0 %	50 %	50 %	333917649
31	NC_015561	GCGGCC	2	12	79372	79383	0 %	0 %	50 %	50 %	333917649
32	NC_015561	GGCCTC	2	12	81137	81148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917650
33	NC_015561	GCCGAA	2	12	83908	83919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
34	NC_015561	ATCCTG	2	12	84877	84888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333917655
35	NC_015561	GCGAAG	2	12	88972	88983	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333917657
36	NC_015561	CACCGA	2	12	90845	90856	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917658
37	NC_015561	GCAGCT	2	12	98802	98813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917669
38	NC_015561	ACACCG	2	12	98849	98860	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917669
39	NC_015561	CGACGG	2	12	101031	101042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333917671
40	NC_015561	TCGCCT	2	12	105872	105883	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333917676

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.