MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015561	GCT	3	9	31621	31629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917597
502	NC_015561	CACC	2	8	31702	31709	25 %	0 %	0 %	75 %	333917597
503	NC_015561	GCT	2	6	31726	31731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917597
504	NC_015561	ATCG	2	8	31774	31781	25 %	25 %	25 %	25 %	333917597
505	NC_015561	TGG	2	6	31798	31803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917597
506	NC_015561	TTG	2	6	31827	31832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917597
507	NC_015561	TGC	2	6	31868	31873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917598
508	NC_015561	GC	3	6	31901	31906	0 %	0 %	50 %	50 %	333917598
509	NC_015561	GC	3	6	31931	31936	0 %	0 %	50 %	50 %	333917598
510	NC_015561	GGT	2	6	31950	31955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917598
511	NC_015561	CACCG	2	10	31966	31975	20 %	0 %	20 %	60 %	333917598
512	NC_015561	GAG	2	6	32054	32059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917598
513	NC_015561	GC	3	6	32105	32110	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
514	NC_015561	GATC	2	8	32139	32146	25 %	25 %	25 %	25 %	333917599
515	NC_015561	CTT	2	6	32200	32205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917599
516	NC_015561	CGG	2	6	32211	32216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917599
517	NC_015561	GGC	2	6	32248	32253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917599
518	NC_015561	GC	3	6	32270	32275	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
519	NC_015561	CG	3	6	32302	32307	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
520	NC_015561	GCC	3	9	32464	32472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917599
521	NC_015561	GGT	2	6	32538	32543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917600
522	NC_015561	ATG	2	6	32563	32568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917600
523	NC_015561	CA	3	6	32637	32642	50 %	0 %	0 %	50 %	333917600
524	NC_015561	CGG	2	6	32773	32778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917601
525	NC_015561	GCCC	2	8	32805	32812	0 %	0 %	25 %	75 %	333917601
526	NC_015561	GAA	2	6	32819	32824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917601
527	NC_015561	CGAC	2	8	32914	32921	25 %	0 %	25 %	50 %	333917601
528	NC_015561	GCC	2	6	32946	32951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917601
529	NC_015561	CAG	2	6	32953	32958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917601
530	NC_015561	GA	4	8	33068	33075	50 %	0 %	50 %	0 %	333917602
531	NC_015561	GCCA	2	8	33117	33124	25 %	0 %	25 %	50 %	333917602
532	NC_015561	TCC	2	6	33189	33194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917602
533	NC_015561	CGC	2	6	33203	33208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917602
534	NC_015561	AGC	2	6	33215	33220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917602
535	NC_015561	TGCG	2	8	33403	33410	0 %	25 %	50 %	25 %	333917603
536	NC_015561	GGT	2	6	33414	33419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917603
537	NC_015561	ACTG	2	8	33427	33434	25 %	25 %	25 %	25 %	333917603
538	NC_015561	TGA	2	6	33441	33446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917603
539	NC_015561	TCG	2	6	33505	33510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917603
540	NC_015561	CTG	2	6	33524	33529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917603
541	NC_015561	GCAG	2	8	33531	33538	25 %	0 %	50 %	25 %	333917603
542	NC_015561	GCC	2	6	33565	33570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917603
543	NC_015561	GTC	2	6	33823	33828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917603
544	NC_015561	GGC	2	6	33835	33840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917603
545	NC_015561	CG	4	8	33848	33855	0 %	0 %	50 %	50 %	333917603
546	NC_015561	CGC	2	6	33927	33932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917603
547	NC_015561	CGC	2	6	33945	33950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917603
548	NC_015561	TGTGG	2	10	33963	33972	0 %	40 %	60 %	0 %	333917603
549	NC_015561	CACCG	2	10	33987	33996	20 %	0 %	20 %	60 %	333917603
550	NC_015561	ATTG	2	8	34110	34117	25 %	50 %	25 %	0 %	333917603
551	NC_015561	TGC	3	9	34137	34145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917603
552	NC_015561	CAG	2	6	34297	34302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917603
553	NC_015561	TGAG	2	8	34341	34348	25 %	25 %	50 %	0 %	333917604
554	NC_015561	GC	3	6	34351	34356	0 %	0 %	50 %	50 %	333917604
555	NC_015561	GCC	2	6	34477	34482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917604
556	NC_015561	TGC	2	6	34608	34613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917604
557	NC_015561	TCAG	2	8	34621	34628	25 %	25 %	25 %	25 %	333917604
558	NC_015561	GCC	2	6	34636	34641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917604
559	NC_015561	TGC	2	6	34650	34655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917604
560	NC_015561	CGT	2	6	34668	34673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917604
561	NC_015561	CGA	2	6	34681	34686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917604
562	NC_015561	GAT	2	6	34693	34698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917604
563	NC_015561	GCT	2	6	34744	34749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917604
564	NC_015561	GAA	2	6	34780	34785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917604
565	NC_015561	CTG	2	6	34853	34858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917605
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567	NC_015561	CGCT	2	8	34910	34917	0 %	25 %	25 %	50 %	333917605
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569	NC_015561	CGG	2	6	34951	34956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917605
570	NC_015561	TCGGT	2	10	35010	35019	0 %	40 %	40 %	20 %	333917605
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573	NC_015561	GGA	2	6	35112	35117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917605
574	NC_015561	GTG	2	6	35153	35158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917605
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582	NC_015561	TGC	2	6	35478	35483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917605
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587	NC_015561	GC	3	6	35613	35618	0 %	0 %	50 %	50 %	333917605
588	NC_015561	ACG	2	6	35661	35666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917605
589	NC_015561	GC	3	6	35671	35676	0 %	0 %	50 %	50 %	333917605
590	NC_015561	CGT	2	6	35697	35702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917605
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592	NC_015561	C	6	6	35772	35777	0 %	0 %	0 %	100 %	333917605
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596	NC_015561	GCGT	2	8	36262	36269	0 %	25 %	50 %	25 %	333917606
597	NC_015561	GCT	2	6	36276	36281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917606
598	NC_015561	GAG	2	6	36367	36372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917606
599	NC_015561	TTTC	2	8	36425	36432	0 %	75 %	0 %	25 %	333917606
600	NC_015561	GCG	2	6	36494	36499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917606
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606	NC_015561	CCG	2	6	36835	36840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917606
607	NC_015561	CG	3	6	36850	36855	0 %	0 %	50 %	50 %	333917606
608	NC_015561	GCA	2	6	36869	36874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917606
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610	NC_015561	GCG	2	6	37088	37093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917607
611	NC_015561	GCGA	2	8	37181	37188	25 %	0 %	50 %	25 %	333917607
612	NC_015561	GC	3	6	37207	37212	0 %	0 %	50 %	50 %	333917607
613	NC_015561	CTC	2	6	37267	37272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917607
614	NC_015561	CGA	2	6	37284	37289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917607
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624	NC_015561	TGAG	2	8	38148	38155	25 %	25 %	50 %	0 %	333917608
625	NC_015561	GC	3	6	38180	38185	0 %	0 %	50 %	50 %	333917608
626	NC_015561	CGG	2	6	38236	38241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917608
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628	NC_015561	CGG	2	6	38310	38315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917608
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751	NC_015561	GGC	2	6	43821	43826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917616
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754	NC_015561	CGCGA	2	10	44006	44015	20 %	0 %	40 %	40 %	333917616
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