MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015508	GCA	2	6	140353	140358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2502	NC_015508	CTA	2	6	140405	140410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715511
2503	NC_015508	GAC	2	6	140483	140488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2504	NC_015508	CAT	2	6	140498	140503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715511
2505	NC_015508	CGA	2	6	140522	140527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2506	NC_015508	ATC	2	6	140583	140588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715511
2507	NC_015508	GAACG	2	10	140714	140723	40 %	0 %	40 %	20 %	332715511
2508	NC_015508	GACG	2	8	140727	140734	25 %	0 %	50 %	25 %	332715511
2509	NC_015508	CTG	2	6	140972	140977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2510	NC_015508	GAA	2	6	140991	140996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715511
2511	NC_015508	CG	3	6	141022	141027	0 %	0 %	50 %	50 %	332715511
2512	NC_015508	CCG	2	6	141039	141044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715511
2513	NC_015508	ATG	2	6	141069	141074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715511
2514	NC_015508	CAC	2	6	141098	141103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715511
2515	NC_015508	GCA	2	6	141167	141172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2516	NC_015508	CTG	2	6	141174	141179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2517	NC_015508	GCC	2	6	141203	141208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715511
2518	NC_015508	CGC	2	6	141239	141244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715511
2519	NC_015508	GCTC	2	8	141274	141281	0 %	25 %	25 %	50 %	332715511
2520	NC_015508	GTC	3	9	141303	141311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2521	NC_015508	TCG	2	6	141403	141408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2522	NC_015508	GAC	2	6	141443	141448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2523	NC_015508	CT	3	6	141463	141468	0 %	50 %	0 %	50 %	332715511
2524	NC_015508	GCC	2	6	141498	141503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715511
2525	NC_015508	CG	3	6	141504	141509	0 %	0 %	50 %	50 %	332715511
2526	NC_015508	TGC	2	6	141550	141555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715511
2527	NC_015508	GCC	2	6	141587	141592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715511
2528	NC_015508	GCGA	2	8	141607	141614	25 %	0 %	50 %	25 %	332715511
2529	NC_015508	GC	3	6	141869	141874	0 %	0 %	50 %	50 %	332715512
2530	NC_015508	CGAA	2	8	141881	141888	50 %	0 %	25 %	25 %	332715512
2531	NC_015508	GCA	2	6	141932	141937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2532	NC_015508	CCGT	2	8	141953	141960	0 %	25 %	25 %	50 %	332715512
2533	NC_015508	CGT	2	6	141996	142001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2534	NC_015508	ACGAG	2	10	142020	142029	40 %	0 %	40 %	20 %	332715512
2535	NC_015508	GTA	2	6	142042	142047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715512
2536	NC_015508	GCA	2	6	142100	142105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2537	NC_015508	GTA	2	6	142126	142131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715512
2538	NC_015508	ACC	2	6	142237	142242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715512
2539	NC_015508	AG	3	6	142253	142258	50 %	0 %	50 %	0 %	332715512
2540	NC_015508	CAA	2	6	142284	142289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715512
2541	NC_015508	TGT	3	9	142311	142319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715512
2542	NC_015508	TTG	2	6	142322	142327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715512
2543	NC_015508	AGAA	2	8	142377	142384	75 %	0 %	25 %	0 %	332715512
2544	NC_015508	AACG	2	8	142401	142408	50 %	0 %	25 %	25 %	332715512
2545	NC_015508	GA	3	6	142451	142456	50 %	0 %	50 %	0 %	332715512
2546	NC_015508	CAT	2	6	142458	142463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715512
2547	NC_015508	CCA	2	6	142465	142470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715512
2548	NC_015508	TGA	2	6	142517	142522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715512
2549	NC_015508	GTG	2	6	142559	142564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715512
2550	NC_015508	AGC	2	6	142567	142572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2551	NC_015508	CAC	2	6	142593	142598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715512
2552	NC_015508	GC	3	6	142664	142669	0 %	0 %	50 %	50 %	332715512
2553	NC_015508	CAGG	2	8	142747	142754	25 %	0 %	50 %	25 %	332715512
2554	NC_015508	AGA	2	6	142773	142778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715512
2555	NC_015508	CGA	2	6	142836	142841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2556	NC_015508	CTG	2	6	142869	142874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715512
2557	NC_015508	GAG	2	6	142897	142902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715512
2558	NC_015508	ATT	2	6	143427	143432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715513
2559	NC_015508	TCA	2	6	143463	143468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715513
2560	NC_015508	GGC	2	6	143508	143513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2561	NC_015508	TAA	2	6	143519	143524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715513
2562	NC_015508	GC	3	6	143549	143554	0 %	0 %	50 %	50 %	332715513
2563	NC_015508	CTGC	2	8	143562	143569	0 %	25 %	25 %	50 %	332715513
2564	NC_015508	ATG	2	6	143630	143635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
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2566	NC_015508	ATCT	2	8	143689	143696	25 %	50 %	0 %	25 %	332715513
2567	NC_015508	ATC	2	6	143755	143760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715513
2568	NC_015508	TGA	2	6	143787	143792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
2569	NC_015508	ATG	2	6	143828	143833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
2570	NC_015508	GCC	2	6	143914	143919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2571	NC_015508	GGC	2	6	143960	143965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2572	NC_015508	AGGC	2	8	143996	144003	25 %	0 %	50 %	25 %	332715513
2573	NC_015508	TTC	2	6	144005	144010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
2574	NC_015508	TTC	2	6	144046	144051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
2575	NC_015508	TGC	2	6	144098	144103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715513
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2578	NC_015508	ATC	2	6	144235	144240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715513
2579	NC_015508	GCG	2	6	144249	144254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2580	NC_015508	CATA	2	8	144294	144301	50 %	25 %	0 %	25 %	332715513
2581	NC_015508	CCG	2	6	144327	144332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2582	NC_015508	ATGCC	2	10	144357	144366	20 %	20 %	20 %	40 %	332715513
2583	NC_015508	TGC	2	6	144369	144374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715513
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2585	NC_015508	ATG	2	6	144476	144481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
2586	NC_015508	ACA	2	6	144558	144563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715513
2587	NC_015508	ATCGAG	2	12	144613	144624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715513
2588	NC_015508	CGCTT	2	10	144644	144653	0 %	40 %	20 %	40 %	332715513
2589	NC_015508	TGC	2	6	144661	144666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715513
2590	NC_015508	GCG	2	6	144697	144702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
2591	NC_015508	CCG	2	6	144753	144758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2592	NC_015508	CGAT	2	8	144767	144774	25 %	25 %	25 %	25 %	332715513
2593	NC_015508	GC	3	6	144790	144795	0 %	0 %	50 %	50 %	332715513
2594	NC_015508	GGC	3	9	144796	144804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
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2596	NC_015508	GCCG	2	8	145015	145022	0 %	0 %	50 %	50 %	332715513
2597	NC_015508	TTC	2	6	145087	145092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
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2600	NC_015508	TGCGCC	2	12	145139	145150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332715513
2601	NC_015508	CTT	2	6	145171	145176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715513
2602	NC_015508	GAT	2	6	145210	145215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715513
2603	NC_015508	CG	3	6	145242	145247	0 %	0 %	50 %	50 %	332715513
2604	NC_015508	CAT	2	6	145249	145254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715513
2605	NC_015508	CAGC	2	8	145255	145262	25 %	0 %	25 %	50 %	332715513
2606	NC_015508	CGC	2	6	145272	145277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715513
2607	NC_015508	GATC	2	8	145500	145507	25 %	25 %	25 %	25 %	332715513
2608	NC_015508	AGC	2	6	145517	145522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715513
2609	NC_015508	GGC	2	6	145538	145543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715513
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2611	NC_015508	GC	3	6	145992	145997	0 %	0 %	50 %	50 %	332715514
2612	NC_015508	GTGC	2	8	146006	146013	0 %	25 %	50 %	25 %	332715514
2613	NC_015508	GCG	2	6	146026	146031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2614	NC_015508	CGG	2	6	146239	146244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2615	NC_015508	GGC	4	12	146246	146257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2616	NC_015508	GAT	2	6	146258	146263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715514
2617	NC_015508	GGC	2	6	146279	146284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2618	NC_015508	GC	3	6	146351	146356	0 %	0 %	50 %	50 %	332715514
2619	NC_015508	GGCCAA	2	12	146398	146409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715514
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2621	NC_015508	CCG	2	6	146551	146556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715514
2622	NC_015508	GT	3	6	146569	146574	0 %	50 %	50 %	0 %	332715514
2623	NC_015508	CGA	2	6	146644	146649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715514
2624	NC_015508	GCG	2	6	146667	146672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715514
2625	NC_015508	CCG	2	6	146680	146685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715514
2626	NC_015508	GAC	2	6	146708	146713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715514
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2630	NC_015508	AGT	2	6	146846	146851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715514
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2726	NC_015508	GCCC	2	8	152339	152346	0 %	0 %	25 %	75 %	332715521
2727	NC_015508	AGC	2	6	152356	152361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715521
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2733	NC_015508	CGG	3	9	152619	152627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715521
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2738	NC_015508	TCA	2	6	152853	152858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715522
2739	NC_015508	GC	4	8	152859	152866	0 %	0 %	50 %	50 %	332715522
2740	NC_015508	CTG	2	6	152967	152972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2741	NC_015508	CTG	2	6	152983	152988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2742	NC_015508	GC	3	6	153051	153056	0 %	0 %	50 %	50 %	332715522
2743	NC_015508	TCC	2	6	153062	153067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715522
2744	NC_015508	CCG	2	6	153174	153179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715522
2745	NC_015508	GCA	2	6	153225	153230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2746	NC_015508	GTG	2	6	153245	153250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715522
2747	NC_015508	GCG	2	6	153257	153262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2748	NC_015508	ATC	2	6	153277	153282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715522
2749	NC_015508	TGC	2	6	153295	153300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2750	NC_015508	CGG	2	6	153422	153427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2751	NC_015508	CGTG	2	8	153508	153515	0 %	25 %	50 %	25 %	332715522
2752	NC_015508	ATTCG	2	10	153547	153556	20 %	40 %	20 %	20 %	332715522
2753	NC_015508	GCG	2	6	153582	153587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2754	NC_015508	GCG	2	6	153662	153667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
2755	NC_015508	TCC	2	6	153680	153685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715522
2756	NC_015508	GC	4	8	153696	153703	0 %	0 %	50 %	50 %	332715522
2757	NC_015508	GTC	2	6	153737	153742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
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2759	NC_015508	TCT	2	6	153774	153779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715522
2760	NC_015508	CGA	2	6	153843	153848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2761	NC_015508	CTG	2	6	153862	153867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2762	NC_015508	GGC	2	6	153868	153873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715522
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2764	NC_015508	CTG	2	6	153898	153903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
2765	NC_015508	GTC	2	6	153940	153945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
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2774	NC_015508	TGC	2	6	154383	154388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715522
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2781	NC_015508	CCAT	2	8	154734	154741	25 %	25 %	0 %	50 %	332715523
2782	NC_015508	GCC	2	6	154747	154752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
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2784	NC_015508	GCCC	2	8	154833	154840	0 %	0 %	25 %	75 %	332715523
2785	NC_015508	CCG	2	6	154853	154858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715523
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2791	NC_015508	ATGCG	2	10	155006	155015	20 %	20 %	40 %	20 %	332715523
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2799	NC_015508	GCA	2	6	155379	155384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715523
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2807	NC_015508	CGAT	2	8	155681	155688	25 %	25 %	25 %	25 %	332715523
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2810	NC_015508	ATC	2	6	155935	155940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715524
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2812	NC_015508	CCA	2	6	155987	155992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715524
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2815	NC_015508	GCT	3	9	156074	156082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715524
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2819	NC_015508	ATCG	2	8	156342	156349	25 %	25 %	25 %	25 %	332715524
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2823	NC_015508	GAT	2	6	156405	156410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715524
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2834	NC_015508	GAG	2	6	156949	156954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715525
2835	NC_015508	GAT	2	6	157036	157041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715525
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2838	NC_015508	CT	3	6	157157	157162	0 %	50 %	0 %	50 %	332715526
2839	NC_015508	GGC	2	6	157195	157200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715526
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2842	NC_015508	CGAG	2	8	157332	157339	25 %	0 %	50 %	25 %	332715526
2843	NC_015508	TCA	2	6	157341	157346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715526
2844	NC_015508	TGGT	2	8	157364	157371	0 %	50 %	50 %	0 %	332715526
2845	NC_015508	GGCA	2	8	157372	157379	25 %	0 %	50 %	25 %	332715526
2846	NC_015508	GCA	2	6	157392	157397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715526
2847	NC_015508	ATG	3	9	157406	157414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715526
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2849	NC_015508	TTG	2	6	157523	157528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715526
2850	NC_015508	CGG	2	6	157650	157655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715526
2851	NC_015508	CAC	2	6	157756	157761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715526
2852	NC_015508	CAG	2	6	157771	157776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715526
2853	NC_015508	CGC	2	6	157937	157942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715527
2854	NC_015508	CTG	2	6	157986	157991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2855	NC_015508	TGA	2	6	157994	157999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715527
2856	NC_015508	TGA	2	6	158015	158020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715527
2857	NC_015508	AG	3	6	158045	158050	50 %	0 %	50 %	0 %	332715527
2858	NC_015508	ACC	2	6	158083	158088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715527
2859	NC_015508	GGTCGA	2	12	158133	158144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332715527
2860	NC_015508	GC	3	6	158389	158394	0 %	0 %	50 %	50 %	332715527
2861	NC_015508	CGA	2	6	158477	158482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715527
2862	NC_015508	AAT	2	6	158522	158527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715527
2863	NC_015508	GTT	2	6	158547	158552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715527
2864	NC_015508	TCA	2	6	158557	158562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715527
2865	NC_015508	CG	3	6	158563	158568	0 %	0 %	50 %	50 %	332715527
2866	NC_015508	CAGCG	2	10	158599	158608	20 %	0 %	40 %	40 %	332715527
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2881	NC_015508	GCCT	2	8	159324	159331	0 %	25 %	25 %	50 %	332715529
2882	NC_015508	TGG	2	6	159336	159341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715529
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2890	NC_015508	CGA	2	6	159666	159671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715529
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2982	NC_015508	TCG	2	6	164780	164785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715535
2983	NC_015508	GCC	3	9	164811	164819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715535
2984	NC_015508	GGT	2	6	164825	164830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715535
2985	NC_015508	GCC	2	6	164834	164839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715535
2986	NC_015508	AGA	2	6	164840	164845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715535
2987	NC_015508	TTC	2	6	164859	164864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715535
2988	NC_015508	TCT	2	6	164932	164937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715535
2989	NC_015508	CCG	2	6	164981	164986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715535
2990	NC_015508	AAC	2	6	165004	165009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715535
2991	NC_015508	CG	3	6	165037	165042	0 %	0 %	50 %	50 %	332715535
2992	NC_015508	TTC	2	6	165169	165174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715535
2993	NC_015508	CTG	2	6	165194	165199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715535
2994	NC_015508	GTG	2	6	165220	165225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715535
2995	NC_015508	GCC	2	6	165231	165236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715535
2996	NC_015508	TCGCT	2	10	165248	165257	0 %	40 %	20 %	40 %	332715535
2997	NC_015508	TCC	2	6	165274	165279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715535
2998	NC_015508	GAA	2	6	165280	165285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715535
2999	NC_015508	CG	3	6	165567	165572	0 %	0 %	50 %	50 %	332715536
3000	NC_015508	GC	3	6	165574	165579	0 %	0 %	50 %	50 %	332715536

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