MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015508	GCAGC	2	10	835799	835808	20 %	0 %	40 %	40 %	332716116
502	NC_015508	CAACG	2	10	836102	836111	40 %	0 %	20 %	40 %	332716117
503	NC_015508	TGCGC	2	10	838400	838409	0 %	20 %	40 %	40 %	332716119
504	NC_015508	TGTCG	2	10	840929	840938	0 %	40 %	40 %	20 %	332716120
505	NC_015508	ATCGT	2	10	842626	842635	20 %	40 %	20 %	20 %	332716122
506	NC_015508	CGGCC	2	10	843635	843644	0 %	0 %	40 %	60 %	332716124
507	NC_015508	GGACG	2	10	844840	844849	20 %	0 %	60 %	20 %	332716127
508	NC_015508	ACGGC	2	10	847255	847264	20 %	0 %	40 %	40 %	332716128
509	NC_015508	GATGC	2	10	848152	848161	20 %	20 %	40 %	20 %	332716129
510	NC_015508	GCTGG	2	10	848746	848755	0 %	20 %	60 %	20 %	332716130
511	NC_015508	TCTGG	2	10	850487	850496	0 %	40 %	40 %	20 %	332716132
512	NC_015508	CGCCT	2	10	852239	852248	0 %	20 %	20 %	60 %	332716134
513	NC_015508	CCGTA	2	10	855019	855028	20 %	20 %	20 %	40 %	332716139
514	NC_015508	TGGCG	2	10	855040	855049	0 %	20 %	60 %	20 %	332716139
515	NC_015508	CCGTG	2	10	855953	855962	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
516	NC_015508	GGTCC	2	10	856118	856127	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
517	NC_015508	CAGAT	2	10	856783	856792	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
518	NC_015508	GCAAT	2	10	857584	857593	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
519	NC_015508	ACGGC	2	10	857809	857818	20 %	0 %	40 %	40 %	332716142
520	NC_015508	GATGC	2	10	858826	858835	20 %	20 %	40 %	20 %	332716143
521	NC_015508	GCGCG	2	10	859365	859374	0 %	0 %	60 %	40 %	332716143
522	NC_015508	CGGAA	2	10	862879	862888	40 %	0 %	40 %	20 %	332716146
523	NC_015508	ACGGC	2	10	867904	867913	20 %	0 %	40 %	40 %	332716149
524	NC_015508	CCGGT	2	10	871463	871472	0 %	20 %	40 %	40 %	332716151
525	NC_015508	TACGT	2	10	871733	871742	20 %	40 %	20 %	20 %	332716151
526	NC_015508	TCGGC	2	10	871820	871829	0 %	20 %	40 %	40 %	332716151
527	NC_015508	CGCTG	2	10	872512	872521	0 %	20 %	40 %	40 %	332716152
528	NC_015508	GCTTC	2	10	872764	872773	0 %	40 %	20 %	40 %	332716152
529	NC_015508	TCCGC	2	10	873654	873663	0 %	20 %	20 %	60 %	332716154
530	NC_015508	CCACC	2	10	873900	873909	20 %	0 %	0 %	80 %	332716154
531	NC_015508	CCTGC	2	10	876265	876274	0 %	20 %	20 %	60 %	332716155
532	NC_015508	GGTCA	2	10	877169	877178	20 %	20 %	40 %	20 %	332716156
533	NC_015508	AGCGC	2	10	877317	877326	20 %	0 %	40 %	40 %	332716156
534	NC_015508	CGAAA	2	10	877762	877771	60 %	0 %	20 %	20 %	332716156
535	NC_015508	CGCCA	2	10	878986	878995	20 %	0 %	20 %	60 %	332716158
536	NC_015508	CCGCG	2	10	880321	880330	0 %	0 %	40 %	60 %	332716159
537	NC_015508	TCTCG	2	10	881246	881255	0 %	40 %	20 %	40 %	332716161
538	NC_015508	CTGGC	2	10	881317	881326	0 %	20 %	40 %	40 %	332716161
539	NC_015508	CGCGC	2	10	882767	882776	0 %	0 %	40 %	60 %	332716162
540	NC_015508	ATGTC	2	10	884868	884877	20 %	40 %	20 %	20 %	332716164
541	NC_015508	GGCGC	2	10	891976	891985	0 %	0 %	60 %	40 %	332716169
542	NC_015508	CGTCA	2	10	894031	894040	20 %	20 %	20 %	40 %	332716171
543	NC_015508	GGCTT	2	10	894503	894512	0 %	40 %	40 %	20 %	332716171
544	NC_015508	CCGCG	2	10	895119	895128	0 %	0 %	40 %	60 %	332716171
545	NC_015508	TCCCT	2	10	895166	895175	0 %	40 %	0 %	60 %	332716171
546	NC_015508	GTAAT	2	10	896505	896514	40 %	40 %	20 %	0 %	332716173
547	NC_015508	CTGTT	2	10	896769	896778	0 %	60 %	20 %	20 %	332716173
548	NC_015508	TTCGG	2	10	897619	897628	0 %	40 %	40 %	20 %	332716174
549	NC_015508	GAAGC	2	10	900126	900135	40 %	0 %	40 %	20 %	332716176
550	NC_015508	GGACA	2	10	900767	900776	40 %	0 %	40 %	20 %	332716176
551	NC_015508	AGCGA	2	10	902541	902550	40 %	0 %	40 %	20 %	332716178
552	NC_015508	TGCCG	2	10	903608	903617	0 %	20 %	40 %	40 %	332716178
553	NC_015508	GATCA	2	10	903903	903912	40 %	20 %	20 %	20 %	332716179
554	NC_015508	TCGGC	2	10	906527	906536	0 %	20 %	40 %	40 %	332716181
555	NC_015508	AACAG	2	10	910482	910491	60 %	0 %	20 %	20 %	332716184
556	NC_015508	CTCGC	2	10	910544	910553	0 %	20 %	20 %	60 %	332716184
557	NC_015508	GGCAG	2	10	910780	910789	20 %	0 %	60 %	20 %	332716184
558	NC_015508	GCTGG	2	10	912438	912447	0 %	20 %	60 %	20 %	332716184
559	NC_015508	GTTTC	2	10	913080	913089	0 %	60 %	20 %	20 %	332716185
560	NC_015508	GAACC	2	10	918375	918384	40 %	0 %	20 %	40 %	332716188
561	NC_015508	CCTGC	2	10	921355	921364	0 %	20 %	20 %	60 %	332716191
562	NC_015508	GCTCG	2	10	925014	925023	0 %	20 %	40 %	40 %	332716194
563	NC_015508	GCCGC	2	10	925683	925692	0 %	0 %	40 %	60 %	332716195
564	NC_015508	TCTGG	2	10	926005	926014	0 %	40 %	40 %	20 %	332716195
565	NC_015508	ACCAT	2	10	926840	926849	40 %	20 %	0 %	40 %	332716196
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569	NC_015508	GCACC	2	10	928654	928663	20 %	0 %	20 %	60 %	332716198
570	NC_015508	TGAAA	2	10	929934	929943	60 %	20 %	20 %	0 %	332716199
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573	NC_015508	GCGCA	2	10	930656	930665	20 %	0 %	40 %	40 %	332716200
574	NC_015508	CGGCC	2	10	931643	931652	0 %	0 %	40 %	60 %	332716201
575	NC_015508	GCCCG	2	10	935201	935210	0 %	0 %	40 %	60 %	332716204
576	NC_015508	CGCAT	2	10	935723	935732	20 %	20 %	20 %	40 %	332716205
577	NC_015508	CGGAA	2	10	937737	937746	40 %	0 %	40 %	20 %	332716206
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579	NC_015508	TATCG	2	10	945939	945948	20 %	40 %	20 %	20 %	332716214
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585	NC_015508	CCCCG	2	10	951407	951416	0 %	0 %	20 %	80 %	332716218
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587	NC_015508	CACGG	2	10	954372	954381	20 %	0 %	40 %	40 %	332716221
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589	NC_015508	GCACC	2	10	955124	955133	20 %	0 %	20 %	60 %	332716221
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591	NC_015508	CTCAT	2	10	955964	955973	20 %	40 %	0 %	40 %	332716222
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596	NC_015508	CGACC	2	10	959324	959333	20 %	0 %	20 %	60 %	332716225
597	NC_015508	GTCAG	2	10	960263	960272	20 %	20 %	40 %	20 %	332716226
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599	NC_015508	CCGCC	2	10	961147	961156	0 %	0 %	20 %	80 %	332716227
600	NC_015508	ACGAA	2	10	961299	961308	60 %	0 %	20 %	20 %	332716227
601	NC_015508	GACCC	2	10	961435	961444	20 %	0 %	20 %	60 %	332716228
602	NC_015508	CCGCG	2	10	961576	961585	0 %	0 %	40 %	60 %	332716228
603	NC_015508	CGATG	2	10	962294	962303	20 %	20 %	40 %	20 %	332716229
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606	NC_015508	CGGAG	2	10	966281	966290	20 %	0 %	60 %	20 %	332716233
607	NC_015508	TCGGG	2	10	967573	967582	0 %	20 %	60 %	20 %	332716234
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610	NC_015508	GCACG	2	10	970908	970917	20 %	0 %	40 %	40 %	332716236
611	NC_015508	GCGGT	2	10	971022	971031	0 %	20 %	60 %	20 %	332716236
612	NC_015508	CGCGG	2	10	971357	971366	0 %	0 %	60 %	40 %	332716237
613	NC_015508	TTCGC	2	10	974445	974454	0 %	40 %	20 %	40 %	332716240
614	NC_015508	GCCGA	2	10	975307	975316	20 %	0 %	40 %	40 %	332716241
615	NC_015508	ATCGC	2	10	976289	976298	20 %	20 %	20 %	40 %	332716241
616	NC_015508	CCTGC	2	10	978223	978232	0 %	20 %	20 %	60 %	332716243
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620	NC_015508	CCGGC	2	10	991693	991702	0 %	0 %	40 %	60 %	332716254
621	NC_015508	CTTTG	2	10	997818	997827	0 %	60 %	20 %	20 %	332716260
622	NC_015508	GGTGC	2	10	998080	998089	0 %	20 %	60 %	20 %	332716261
623	NC_015508	GGCGG	2	10	1000064	1000073	0 %	0 %	80 %	20 %	332716263
624	NC_015508	CCCGG	2	10	1005286	1005295	0 %	0 %	40 %	60 %	332716270
625	NC_015508	CACAT	2	10	1006628	1006637	40 %	20 %	0 %	40 %	332716271
626	NC_015508	CATTC	2	10	1008368	1008377	20 %	40 %	0 %	40 %	332716272
627	NC_015508	CGGCG	2	10	1008805	1008814	0 %	0 %	60 %	40 %	332716273
628	NC_015508	GCGCC	2	10	1009808	1009817	0 %	0 %	40 %	60 %	332716274
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