MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 1067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015423	CGG	2	6	84	89	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827326
2	NC_015423	AGC	2	6	192	197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827326
3	NC_015423	GCC	2	6	204	209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827326
4	NC_015423	GGC	2	6	304	309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827326
5	NC_015423	TTG	2	6	312	317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330827326
6	NC_015423	GCA	2	6	331	336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827326
7	NC_015423	AGG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827326
8	NC_015423	GTG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827327
9	NC_015423	ACG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
10	NC_015423	CGA	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
11	NC_015423	CGG	2	6	737	742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827327
12	NC_015423	TGG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827327
13	NC_015423	TGG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827327
14	NC_015423	CGA	2	6	890	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
15	NC_015423	CAG	2	6	990	995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
16	NC_015423	GAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827327
17	NC_015423	TGA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827327
18	NC_015423	ACA	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827327
19	NC_015423	GCC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827327
20	NC_015423	TTG	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330827327
21	NC_015423	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827327
22	NC_015423	TCA	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827327
23	NC_015423	GCT	3	9	1808	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827327
24	NC_015423	GCG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827327
25	NC_015423	CTG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827327
26	NC_015423	CGG	2	6	2128	2133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827327
27	NC_015423	CAG	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
28	NC_015423	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827327
29	NC_015423	ATC	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827327
30	NC_015423	GAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827327
31	NC_015423	AAG	2	6	2361	2366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827327
32	NC_015423	AGG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827327
33	NC_015423	GCC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827328
34	NC_015423	GGC	2	6	2455	2460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827328
35	NC_015423	TGC	2	6	2493	2498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827328
36	NC_015423	TGA	2	6	2503	2508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827328
37	NC_015423	GTG	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827328
38	NC_015423	CAT	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827328
39	NC_015423	GCC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827328
40	NC_015423	CTA	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827328
41	NC_015423	TGG	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827328
42	NC_015423	GCG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827328
43	NC_015423	GGA	2	6	2843	2848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827328
44	NC_015423	GAT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827328
45	NC_015423	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827329
46	NC_015423	ACT	2	6	2918	2923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827329
47	NC_015423	CTT	2	6	3012	3017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827329
48	NC_015423	GGC	2	6	3195	3200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
49	NC_015423	AAG	2	6	3205	3210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
50	NC_015423	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827329
51	NC_015423	CCA	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827329
52	NC_015423	GGA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827329
53	NC_015423	GAA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
54	NC_015423	CGC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827329
55	NC_015423	CGA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827329
56	NC_015423	GGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
57	NC_015423	CGA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827329
58	NC_015423	GGT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
59	NC_015423	GTG	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
60	NC_015423	GGC	3	9	3888	3896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
61	NC_015423	TGG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
62	NC_015423	AAG	2	6	4006	4011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
63	NC_015423	GAT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827329
64	NC_015423	AGG	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827329
65	NC_015423	GGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
66	NC_015423	GGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
67	NC_015423	AGA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
68	NC_015423	CCG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827329
69	NC_015423	CAT	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827329
70	NC_015423	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827329
71	NC_015423	GAG	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827329
72	NC_015423	GCC	2	6	4808	4813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827329
73	NC_015423	TGG	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
74	NC_015423	AGG	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827329
75	NC_015423	TAC	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827329
76	NC_015423	GTG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827329
77	NC_015423	CAG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827329
78	NC_015423	AAG	2	6	5083	5088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
79	NC_015423	GAA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
80	NC_015423	CAA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827329
81	NC_015423	CAA	2	6	5376	5381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827329
82	NC_015423	GAA	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827329
83	NC_015423	GGC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
84	NC_015423	GGC	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827329
85	NC_015423	CGC	2	6	5711	5716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827329
86	NC_015423	ATG	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827330
87	NC_015423	CGA	2	6	6021	6026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827330
88	NC_015423	GAA	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827330
89	NC_015423	TAT	2	6	6192	6197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330827331
90	NC_015423	GCC	2	6	6331	6336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827331
91	NC_015423	ACG	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827331
92	NC_015423	CGC	2	6	6437	6442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827331
93	NC_015423	CAA	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827331
94	NC_015423	CAG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827331
95	NC_015423	TCA	2	6	6758	6763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827331
96	NC_015423	GTG	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827331
97	NC_015423	CCA	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827331
98	NC_015423	TTG	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330827331
99	NC_015423	GCT	2	6	7106	7111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827332
100	NC_015423	CAA	2	6	7196	7201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827332
101	NC_015423	GAC	2	6	7245	7250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827332
102	NC_015423	GGT	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827332
103	NC_015423	GCC	2	6	7360	7365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827333
104	NC_015423	TCT	2	6	7401	7406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827333
105	NC_015423	CTG	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827333
106	NC_015423	GGC	2	6	7474	7479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827333
107	NC_015423	GCG	2	6	7502	7507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827333
108	NC_015423	TGA	2	6	7509	7514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827333
109	NC_015423	CGC	2	6	7561	7566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827333
110	NC_015423	GAA	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827333
111	NC_015423	CCG	2	6	7654	7659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827333
112	NC_015423	ACG	2	6	7722	7727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827333
113	NC_015423	AGC	2	6	7767	7772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827333
114	NC_015423	TGG	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827333
115	NC_015423	GCT	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827333
116	NC_015423	ATG	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827333
117	NC_015423	CAT	2	6	7864	7869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827333
118	NC_015423	TGG	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827333
119	NC_015423	ATC	2	6	8036	8041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827333
120	NC_015423	CCA	2	6	8101	8106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827333
121	NC_015423	CAA	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827333
122	NC_015423	TGG	2	6	8233	8238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827333
123	NC_015423	GGC	2	6	8254	8259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827333
124	NC_015423	TCA	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827334
125	NC_015423	TGG	2	6	8417	8422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827334
126	NC_015423	GAT	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827334
127	NC_015423	GTC	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827334
128	NC_015423	AGT	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827334
129	NC_015423	CAC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827334
130	NC_015423	AAG	2	6	8824	8829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827334
131	NC_015423	CTA	2	6	8864	8869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827334
132	NC_015423	CAG	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827334
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162	NC_015423	GCC	2	6	11223	11228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827339
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246	NC_015423	GCT	3	9	16394	16402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827345
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249	NC_015423	CGA	2	6	16550	16555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827345
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252	NC_015423	CGT	2	6	16668	16673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827345
253	NC_015423	CAG	2	6	16707	16712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827345
254	NC_015423	GAC	2	6	16929	16934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827345
255	NC_015423	GAT	2	6	16973	16978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827345
256	NC_015423	CCG	2	6	17047	17052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827345
257	NC_015423	GCA	2	6	17131	17136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827345
258	NC_015423	AGC	2	6	17164	17169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827345
259	NC_015423	CTT	2	6	17204	17209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827345
260	NC_015423	TGG	2	6	17245	17250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827345
261	NC_015423	GAA	2	6	17270	17275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827345
262	NC_015423	GTG	2	6	17295	17300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827345
263	NC_015423	AAG	2	6	17355	17360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827345
264	NC_015423	CCG	2	6	17435	17440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827345
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267	NC_015423	ACA	2	6	17524	17529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827345
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269	NC_015423	TGC	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827345
270	NC_015423	GTG	2	6	17697	17702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827345
271	NC_015423	CTG	2	6	17727	17732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827345
272	NC_015423	GCT	2	6	17774	17779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827345
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274	NC_015423	AAC	2	6	17842	17847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827345
275	NC_015423	GGA	2	6	17860	17865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827345
276	NC_015423	ACT	2	6	17872	17877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827345
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279	NC_015423	TCA	2	6	18017	18022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827346
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281	NC_015423	CGA	2	6	18126	18131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827346
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283	NC_015423	CAA	2	6	18228	18233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827346
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285	NC_015423	GCT	2	6	18240	18245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827346
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287	NC_015423	GCC	3	9	18357	18365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827347
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377	NC_015423	ACG	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827353
378	NC_015423	GCG	2	6	23835	23840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827353
379	NC_015423	GCT	2	6	23896	23901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827353
380	NC_015423	TCA	2	6	23916	23921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827353
381	NC_015423	AAG	2	6	23969	23974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827353
382	NC_015423	ACT	2	6	24027	24032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827353
383	NC_015423	ATG	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827354
384	NC_015423	CTG	2	6	24093	24098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
385	NC_015423	CTG	2	6	24102	24107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
386	NC_015423	GCA	2	6	24239	24244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827354
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392	NC_015423	TGC	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
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398	NC_015423	GGC	2	6	25153	25158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
399	NC_015423	TCA	2	6	25166	25171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827355
400	NC_015423	TGC	2	6	25193	25198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827355
401	NC_015423	GGC	2	6	25335	25340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
402	NC_015423	TGA	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827355
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413	NC_015423	ACC	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827355
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493	NC_015423	ACA	3	9	30920	30928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827358
494	NC_015423	GCC	2	6	30940	30945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827358
495	NC_015423	TCC	2	6	30947	30952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330827358
496	NC_015423	TGC	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827359
497	NC_015423	CAA	2	6	31240	31245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827359
498	NC_015423	CTG	2	6	31291	31296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827359
499	NC_015423	CTG	2	6	31367	31372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827359
500	NC_015423	AGG	2	6	31422	31427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827359

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