MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 129174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015422	CG	3	6	493984	493989	0 %	0 %	50 %	50 %	330823103
13002	NC_015422	TGC	4	12	493994	494005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823103
13003	NC_015422	GAC	2	6	494026	494031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823103
13004	NC_015422	CCG	2	6	494063	494068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823103
13005	NC_015422	CTC	2	6	494089	494094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330823103
13006	NC_015422	TCGGC	2	10	494114	494123	0 %	20 %	40 %	40 %	330823103
13007	NC_015422	AGG	2	6	494180	494185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823103
13008	NC_015422	GC	3	6	494190	494195	0 %	0 %	50 %	50 %	330823103
13009	NC_015422	GC	3	6	494245	494250	0 %	0 %	50 %	50 %	330823103
13010	NC_015422	CCGG	2	8	494285	494292	0 %	0 %	50 %	50 %	330823103
13011	NC_015422	CGA	2	6	494351	494356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13012	NC_015422	CTG	2	6	494358	494363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13013	NC_015422	CGCGC	2	10	494364	494373	0 %	0 %	40 %	60 %	330823104
13014	NC_015422	GC	5	10	494370	494379	0 %	0 %	50 %	50 %	330823104
13015	NC_015422	GCT	2	6	494396	494401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13016	NC_015422	CGA	2	6	494429	494434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13017	NC_015422	AGGGCG	2	12	494467	494478	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	330823104
13018	NC_015422	GGA	2	6	494516	494521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823104
13019	NC_015422	GCT	2	6	494540	494545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13020	NC_015422	CCG	2	6	494599	494604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823104
13021	NC_015422	TGC	2	6	494656	494661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823104
13022	NC_015422	TGG	2	6	494668	494673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823104
13023	NC_015422	ACC	2	6	494804	494809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823105
13024	NC_015422	CGA	2	6	494851	494856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
13025	NC_015422	CGCT	2	8	494897	494904	0 %	25 %	25 %	50 %	330823105
13026	NC_015422	CTG	2	6	494909	494914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
13027	NC_015422	GC	3	6	494923	494928	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
13028	NC_015422	CG	3	6	494959	494964	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
13029	NC_015422	TGC	2	6	494982	494987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
13030	NC_015422	CGC	2	6	495001	495006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823105
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13032	NC_015422	CGC	2	6	495045	495050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823105
13033	NC_015422	GCG	2	6	495063	495068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823105
13034	NC_015422	GC	3	6	495140	495145	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
13035	NC_015422	AGC	2	6	495156	495161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
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13037	NC_015422	ACC	2	6	495237	495242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823105
13038	NC_015422	GAC	2	6	495254	495259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
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13040	NC_015422	CG	4	8	495276	495283	0 %	0 %	50 %	50 %	330823105
13041	NC_015422	CTG	2	6	495284	495289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823105
13042	NC_015422	CAG	2	6	495302	495307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823105
13043	NC_015422	GCGT	2	8	495339	495346	0 %	25 %	50 %	25 %	330823105
13044	NC_015422	TCC	2	6	495591	495596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330823106
13045	NC_015422	GCCAG	2	10	495625	495634	20 %	0 %	40 %	40 %	330823106
13046	NC_015422	CTG	3	9	495638	495646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823106
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13050	NC_015422	GCA	2	6	495778	495783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823106
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13053	NC_015422	CGA	2	6	495992	495997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823107
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13055	NC_015422	TGC	2	6	496127	496132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823107
13056	NC_015422	GGT	2	6	496203	496208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823107
13057	NC_015422	CGG	2	6	496227	496232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823107
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13059	NC_015422	GC	3	6	496295	496300	0 %	0 %	50 %	50 %	330823107
13060	NC_015422	TGG	2	6	496310	496315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823107
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13062	NC_015422	CGCT	2	8	496375	496382	0 %	25 %	25 %	50 %	330823107
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13064	NC_015422	CTG	2	6	496479	496484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823107
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13069	NC_015422	GGCGCC	2	12	496623	496634	0 %	0 %	50 %	50 %	330823107
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13084	NC_015422	GGC	4	12	496933	496944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823107
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13104	NC_015422	CG	3	6	497522	497527	0 %	0 %	50 %	50 %	330823108
13105	NC_015422	GC	3	6	497584	497589	0 %	0 %	50 %	50 %	330823108
13106	NC_015422	CGA	2	6	497646	497651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823108
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13108	NC_015422	GCCGT	2	10	497677	497686	0 %	20 %	40 %	40 %	330823108
13109	NC_015422	CGT	2	6	497724	497729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823108
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13112	NC_015422	GC	3	6	498057	498062	0 %	0 %	50 %	50 %	330823108
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13120	NC_015422	GGCGCA	2	12	498981	498992	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330823109
13121	NC_015422	CAA	2	6	498993	498998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823109
13122	NC_015422	GCT	2	6	499011	499016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13123	NC_015422	CTG	2	6	499030	499035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13124	NC_015422	GC	3	6	499111	499116	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13125	NC_015422	GCT	2	6	499212	499217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13126	NC_015422	CCG	2	6	499322	499327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823109
13127	NC_015422	GCAG	2	8	499371	499378	25 %	0 %	50 %	25 %	330823109
13128	NC_015422	CG	3	6	499455	499460	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13129	NC_015422	GGC	2	6	499470	499475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823109
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13131	NC_015422	CGG	2	6	499524	499529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823109
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13133	NC_015422	CGTGCG	2	12	499674	499685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330823109
13134	NC_015422	CGA	2	6	499725	499730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13135	NC_015422	CG	3	6	499748	499753	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13136	NC_015422	T	6	6	499814	499819	0 %	100 %	0 %	0 %	330823109
13137	NC_015422	GC	3	6	499829	499834	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13138	NC_015422	CAC	2	6	499866	499871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823109
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13140	NC_015422	GGT	2	6	499950	499955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823109
13141	NC_015422	CGC	2	6	499993	499998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823109
13142	NC_015422	GCCT	2	8	500033	500040	0 %	25 %	25 %	50 %	330823109
13143	NC_015422	TGC	2	6	500059	500064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13144	NC_015422	CAA	3	9	500067	500075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823109
13145	NC_015422	GCT	2	6	500148	500153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
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13149	NC_015422	GCC	2	6	500392	500397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823109
13150	NC_015422	CTG	2	6	500401	500406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823109
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13152	NC_015422	GC	3	6	500476	500481	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13153	NC_015422	GCA	2	6	500507	500512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823109
13154	NC_015422	CG	4	8	500562	500569	0 %	0 %	50 %	50 %	330823109
13155	NC_015422	CATG	2	8	500592	500599	25 %	25 %	25 %	25 %	330823109
13156	NC_015422	CAGC	2	8	500712	500719	25 %	0 %	25 %	50 %	330823110
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13160	NC_015422	GCGTG	2	10	500877	500886	0 %	20 %	60 %	20 %	330823110
13161	NC_015422	GCG	3	9	500948	500956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823110
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13194	NC_015422	GCAG	2	8	501807	501814	25 %	0 %	50 %	25 %	330823110
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13225	NC_015422	GGGC	2	8	502987	502994	0 %	0 %	75 %	25 %	330823111
13226	NC_015422	GCT	2	6	503007	503012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823111
13227	NC_015422	CG	3	6	503224	503229	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
13228	NC_015422	TCT	2	6	503433	503438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330823111
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13230	NC_015422	GGCG	2	8	503494	503501	0 %	0 %	75 %	25 %	330823111
13231	NC_015422	CAG	2	6	503566	503571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823111
13232	NC_015422	GCTG	2	8	503589	503596	0 %	25 %	50 %	25 %	330823111
13233	NC_015422	GCA	2	6	503598	503603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823111
13234	NC_015422	CAG	2	6	503608	503613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823111
13235	NC_015422	CAC	2	6	503638	503643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823111
13236	NC_015422	TGA	2	6	503715	503720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823111
13237	NC_015422	CG	5	10	503731	503740	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
13238	NC_015422	CGT	2	6	503745	503750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823111
13239	NC_015422	TGGCC	2	10	503763	503772	0 %	20 %	40 %	40 %	330823111
13240	NC_015422	GAT	2	6	503776	503781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823111
13241	NC_015422	GC	3	6	503805	503810	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
13242	NC_015422	GCG	2	6	503825	503830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823111
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13246	NC_015422	GC	3	6	503907	503912	0 %	0 %	50 %	50 %	330823111
13247	NC_015422	TGTC	2	8	503928	503935	0 %	50 %	25 %	25 %	330823111
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13360	NC_015422	GC	3	6	507482	507487	0 %	0 %	50 %	50 %	330823115
13361	NC_015422	CGC	2	6	507503	507508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823115
13362	NC_015422	ACG	2	6	507511	507516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823115
13363	NC_015422	TCC	2	6	507541	507546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330823115
13364	NC_015422	TGA	2	6	507560	507565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823115
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13367	NC_015422	CG	4	8	507611	507618	0 %	0 %	50 %	50 %	330823115
13368	NC_015422	GCT	2	6	507620	507625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823115
13369	NC_015422	GCC	2	6	507663	507668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823115
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13377	NC_015422	GTC	2	6	508063	508068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823116
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13382	NC_015422	CAGCGT	2	12	508216	508227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330823116
13383	NC_015422	GTG	2	6	508270	508275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823116
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13385	NC_015422	GTC	2	6	508360	508365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823116
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13391	NC_015422	CGC	3	9	508574	508582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823117
13392	NC_015422	GC	3	6	508581	508586	0 %	0 %	50 %	50 %	330823117
13393	NC_015422	CG	3	6	508600	508605	0 %	0 %	50 %	50 %	330823117
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13397	NC_015422	GC	3	6	508863	508868	0 %	0 %	50 %	50 %	330823117
13398	NC_015422	CAG	2	6	508869	508874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823117
13399	NC_015422	GC	3	6	508876	508881	0 %	0 %	50 %	50 %	330823117
13400	NC_015422	GGC	2	6	508914	508919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823117
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13404	NC_015422	CTG	2	6	509049	509054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823117
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13432	NC_015422	CGC	2	6	510207	510212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823118
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13439	NC_015422	CGCC	2	8	510453	510460	0 %	0 %	25 %	75 %	330823118
13440	NC_015422	GCC	2	6	510485	510490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823118
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13443	NC_015422	CG	4	8	510594	510601	0 %	0 %	50 %	50 %	330823118
13444	NC_015422	GC	4	8	510613	510620	0 %	0 %	50 %	50 %	330823118
13445	NC_015422	GAG	2	6	510697	510702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823118
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13453	NC_015422	CG	3	6	510881	510886	0 %	0 %	50 %	50 %	330823119
13454	NC_015422	GCT	2	6	510894	510899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823119
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13457	NC_015422	CCAGT	2	10	510966	510975	20 %	20 %	20 %	40 %	330823119
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13462	NC_015422	CAGC	2	8	511224	511231	25 %	0 %	25 %	50 %	330823119
13463	NC_015422	GC	3	6	511270	511275	0 %	0 %	50 %	50 %	330823119
13464	NC_015422	TC	3	6	511296	511301	0 %	50 %	0 %	50 %	330823119
13465	NC_015422	CTG	2	6	511330	511335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823119
13466	NC_015422	ACC	2	6	511435	511440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823119
13467	NC_015422	GGCG	2	8	511458	511465	0 %	0 %	75 %	25 %	330823119
13468	NC_015422	GCA	2	6	511494	511499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823119
13469	NC_015422	ACT	2	6	511539	511544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823119
13470	NC_015422	CAA	2	6	511548	511553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823119
13471	NC_015422	ACCTGC	2	12	511562	511573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330823119
13472	NC_015422	CTG	2	6	511596	511601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823119
13473	NC_015422	CGC	2	6	511745	511750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823120
13474	NC_015422	GCG	2	6	511754	511759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13475	NC_015422	CGC	2	6	511817	511822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330823120
13476	NC_015422	CAC	2	6	511865	511870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823120
13477	NC_015422	GTG	2	6	511875	511880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823120
13478	NC_015422	CGG	2	6	511901	511906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13479	NC_015422	GC	3	6	511931	511936	0 %	0 %	50 %	50 %	330823120
13480	NC_015422	AGCA	2	8	511986	511993	50 %	0 %	25 %	25 %	330823120
13481	NC_015422	TGC	2	6	512038	512043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823120
13482	NC_015422	GGC	3	9	512045	512053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13483	NC_015422	GCA	2	6	512054	512059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330823120
13484	NC_015422	GCCG	2	8	512108	512115	0 %	0 %	50 %	50 %	330823120
13485	NC_015422	AGG	2	6	512116	512121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330823120
13486	NC_015422	GCG	4	12	512122	512133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13487	NC_015422	CG	4	8	512132	512139	0 %	0 %	50 %	50 %	330823120
13488	NC_015422	GAT	2	6	512141	512146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330823120
13489	NC_015422	CCCGTG	2	12	512328	512339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330823120
13490	NC_015422	CAT	2	6	512369	512374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330823120
13491	NC_015422	CAA	2	6	512381	512386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330823120
13492	NC_015422	CCA	2	6	512440	512445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330823120
13493	NC_015422	GTG	2	6	512448	512453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330823120
13494	NC_015422	TGC	2	6	512467	512472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823120
13495	NC_015422	CTG	2	6	512502	512507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330823120
13496	NC_015422	GCG	2	6	512519	512524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13497	NC_015422	GCG	2	6	512553	512558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330823120
13498	NC_015422	CGAGTT	2	12	512573	512584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330823120
13499	NC_015422	GCCGAG	2	12	512619	512630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330823120
13500	NC_015422	CG	3	6	512633	512638	0 %	0 %	50 %	50 %	330823120

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