MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 129174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015422	TGC	2	6	218834	218839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6002	NC_015422	GCT	2	6	218880	218885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6003	NC_015422	GC	4	8	218898	218905	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6004	NC_015422	CCA	2	6	218940	218945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822845
6005	NC_015422	CTG	2	6	218965	218970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6006	NC_015422	CACT	2	8	218993	219000	25 %	25 %	0 %	50 %	330822845
6007	NC_015422	GCT	2	6	219072	219077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6008	NC_015422	GGA	2	6	219108	219113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822845
6009	NC_015422	GC	3	6	219160	219165	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6010	NC_015422	GTT	2	6	219171	219176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822845
6011	NC_015422	TCG	2	6	219314	219319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6012	NC_015422	CG	3	6	219366	219371	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6013	NC_015422	CTGCG	2	10	219380	219389	0 %	20 %	40 %	40 %	330822845
6014	NC_015422	CGC	2	6	219390	219395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822845
6015	NC_015422	TCA	2	6	219398	219403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822845
6016	NC_015422	ACC	2	6	219437	219442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822845
6017	NC_015422	ACG	2	6	219464	219469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6018	NC_015422	GGA	2	6	219480	219485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822845
6019	NC_015422	TCCGT	2	10	219512	219521	0 %	40 %	20 %	40 %	330822845
6020	NC_015422	TGG	2	6	219662	219667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822845
6021	NC_015422	CGGC	2	8	219690	219697	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6022	NC_015422	GGT	2	6	219705	219710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822845
6023	NC_015422	GC	3	6	219721	219726	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6024	NC_015422	AGCGC	2	10	219759	219768	20 %	0 %	40 %	40 %	330822845
6025	NC_015422	GCG	2	6	219786	219791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822845
6026	NC_015422	GC	3	6	219796	219801	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6027	NC_015422	GCG	2	6	219926	219931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822845
6028	NC_015422	GCC	2	6	219943	219948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822845
6029	NC_015422	TGC	2	6	219950	219955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6030	NC_015422	GAC	2	6	220006	220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6031	NC_015422	AAC	2	6	220018	220023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822845
6032	NC_015422	GCTG	2	8	220190	220197	0 %	25 %	50 %	25 %	330822845
6033	NC_015422	CG	3	6	220222	220227	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6034	NC_015422	CG	3	6	220250	220255	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6035	NC_015422	GCC	2	6	220258	220263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822845
6036	NC_015422	CG	3	6	220292	220297	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6037	NC_015422	GTT	2	6	220320	220325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822845
6038	NC_015422	ACG	2	6	220346	220351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6039	NC_015422	GAA	2	6	220371	220376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822845
6040	NC_015422	ACC	2	6	220385	220390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822845
6041	NC_015422	GC	3	6	220471	220476	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6042	NC_015422	TGG	2	6	220496	220501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822845
6043	NC_015422	CATGCC	2	12	220506	220517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330822845
6044	NC_015422	GAT	2	6	220602	220607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822845
6045	NC_015422	CCT	2	6	220616	220621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822845
6046	NC_015422	GCG	2	6	220653	220658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822845
6047	NC_015422	G	7	7	220779	220785	0 %	0 %	100 %	0 %	330822845
6048	NC_015422	GGGAGG	2	12	220829	220840	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	330822845
6049	NC_015422	CGT	2	6	220866	220871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6050	NC_015422	GC	3	6	220872	220877	0 %	0 %	50 %	50 %	330822845
6051	NC_015422	GGA	2	6	220879	220884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822845
6052	NC_015422	TGGA	2	8	220973	220980	25 %	25 %	50 %	0 %	330822845
6053	NC_015422	CAAG	2	8	221079	221086	50 %	0 %	25 %	25 %	330822845
6054	NC_015422	GAC	2	6	221195	221200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822845
6055	NC_015422	TCG	2	6	221215	221220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6056	NC_015422	GAC	2	6	221229	221234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6057	NC_015422	CGG	2	6	221235	221240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822846
6058	NC_015422	CGTG	2	8	221270	221277	0 %	25 %	50 %	25 %	330822846
6059	NC_015422	GAC	2	6	221319	221324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6060	NC_015422	TGC	2	6	221327	221332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6061	NC_015422	CAA	2	6	221366	221371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822846
6062	NC_015422	TGTGC	2	10	221408	221417	0 %	40 %	40 %	20 %	330822846
6063	NC_015422	TGC	3	9	221443	221451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6064	NC_015422	CAAGC	2	10	221472	221481	40 %	0 %	20 %	40 %	330822846
6065	NC_015422	GCCT	2	8	221506	221513	0 %	25 %	25 %	50 %	330822846
6066	NC_015422	GCG	2	6	221532	221537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822846
6067	NC_015422	AGC	2	6	221557	221562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6068	NC_015422	GCC	2	6	221565	221570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822846
6069	NC_015422	GCC	2	6	221586	221591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822846
6070	NC_015422	TTGC	2	8	221604	221611	0 %	50 %	25 %	25 %	330822846
6071	NC_015422	GCG	2	6	221632	221637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822846
6072	NC_015422	AGGGC	2	10	221654	221663	20 %	0 %	60 %	20 %	330822846
6073	NC_015422	CGC	2	6	221667	221672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822846
6074	NC_015422	CGC	2	6	221703	221708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822846
6075	NC_015422	GCT	2	6	221735	221740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822846
6076	NC_015422	GTG	2	6	221784	221789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822846
6077	NC_015422	TGG	2	6	221851	221856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822846
6078	NC_015422	GTG	2	6	221883	221888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822846
6079	NC_015422	GC	3	6	221948	221953	0 %	0 %	50 %	50 %	330822846
6080	NC_015422	TGCA	2	8	222015	222022	25 %	25 %	25 %	25 %	330822846
6081	NC_015422	TGG	2	6	222181	222186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822847
6082	NC_015422	GTG	2	6	222204	222209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822847
6083	NC_015422	GCG	2	6	222221	222226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822847
6084	NC_015422	CG	3	6	222225	222230	0 %	0 %	50 %	50 %	330822847
6085	NC_015422	TGT	2	6	222331	222336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822847
6086	NC_015422	GCA	2	6	222755	222760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6087	NC_015422	TTC	2	6	222762	222767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822848
6088	NC_015422	GC	3	6	222843	222848	0 %	0 %	50 %	50 %	330822848
6089	NC_015422	TCA	2	6	222863	222868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822848
6090	NC_015422	CGG	2	6	222869	222874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822848
6091	NC_015422	CCGC	2	8	222875	222882	0 %	0 %	25 %	75 %	330822848
6092	NC_015422	CG	3	6	222888	222893	0 %	0 %	50 %	50 %	330822848
6093	NC_015422	AAC	2	6	222907	222912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822848
6094	NC_015422	TTG	2	6	222961	222966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822848
6095	NC_015422	CGG	2	6	222969	222974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822848
6096	NC_015422	CGA	2	6	222989	222994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6097	NC_015422	CTG	2	6	223065	223070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6098	NC_015422	GCA	2	6	223076	223081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6099	NC_015422	TGC	2	6	223120	223125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822848
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6101	NC_015422	GAA	2	6	223248	223253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822848
6102	NC_015422	GTC	2	6	223326	223331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6103	NC_015422	TCA	2	6	223507	223512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822848
6104	NC_015422	CCA	2	6	223685	223690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822848
6105	NC_015422	CAG	2	6	223701	223706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6106	NC_015422	GGT	2	6	223890	223895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822848
6107	NC_015422	CGCGG	2	10	223919	223928	0 %	0 %	60 %	40 %	330822848
6108	NC_015422	GGC	2	6	223987	223992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822848
6109	NC_015422	CCG	2	6	224018	224023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822848
6110	NC_015422	CAG	2	6	224049	224054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6111	NC_015422	GCG	2	6	224089	224094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822848
6112	NC_015422	AGC	2	6	224110	224115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6113	NC_015422	GC	3	6	224114	224119	0 %	0 %	50 %	50 %	330822848
6114	NC_015422	GC	4	8	224144	224151	0 %	0 %	50 %	50 %	330822848
6115	NC_015422	CAG	2	6	224169	224174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6116	NC_015422	TCG	2	6	224227	224232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822848
6117	NC_015422	TGGC	2	8	224240	224247	0 %	25 %	50 %	25 %	330822848
6118	NC_015422	GC	3	6	224461	224466	0 %	0 %	50 %	50 %	330822849
6119	NC_015422	GCCA	2	8	224468	224475	25 %	0 %	25 %	50 %	330822849
6120	NC_015422	CT	3	6	224517	224522	0 %	50 %	0 %	50 %	330822849
6121	NC_015422	CG	3	6	224602	224607	0 %	0 %	50 %	50 %	330822849
6122	NC_015422	GTG	2	6	224621	224626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822849
6123	NC_015422	GCCA	2	8	224627	224634	25 %	0 %	25 %	50 %	330822849
6124	NC_015422	CAA	2	6	224658	224663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822850
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6126	NC_015422	CGG	2	6	224687	224692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822850
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6152	NC_015422	AGC	2	6	227242	227247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822851
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6155	NC_015422	GC	3	6	232921	232926	0 %	0 %	50 %	50 %	330822852
6156	NC_015422	GTCGCG	2	12	232945	232956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330822852
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6224	NC_015422	GCG	2	6	235417	235422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822855
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6231	NC_015422	GAT	2	6	235772	235777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822855
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6235	NC_015422	AGC	2	6	235893	235898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822855
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6237	NC_015422	TGG	2	6	235969	235974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822855
6238	NC_015422	CGGT	2	8	235989	235996	0 %	25 %	50 %	25 %	330822855
6239	NC_015422	GTG	2	6	236000	236005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822855
6240	NC_015422	ATGG	2	8	236040	236047	25 %	25 %	50 %	0 %	330822855
6241	NC_015422	CAT	2	6	236230	236235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822856
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6366	NC_015422	CG	3	6	239556	239561	0 %	0 %	50 %	50 %	330822858
6367	NC_015422	TGC	2	6	239625	239630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
6368	NC_015422	CTG	2	6	239648	239653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
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6370	NC_015422	CGC	2	6	239684	239689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822858
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6372	NC_015422	CGCGC	2	10	239824	239833	0 %	0 %	40 %	60 %	330822858
6373	NC_015422	CTG	2	6	239834	239839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
6374	NC_015422	CGGC	2	8	239856	239863	0 %	0 %	50 %	50 %	330822858
6375	NC_015422	CCG	2	6	239871	239876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822858
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6378	NC_015422	ACT	2	6	240007	240012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822858
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6381	NC_015422	C	6	6	240159	240164	0 %	0 %	0 %	100 %	330822858
6382	NC_015422	TGC	2	6	240165	240170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
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6387	NC_015422	CGCC	2	8	240382	240389	0 %	0 %	25 %	75 %	330822858
6388	NC_015422	GCC	2	6	240462	240467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822858
6389	NC_015422	GCC	2	6	240469	240474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822858
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6393	NC_015422	GCG	3	9	240582	240590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822858
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6396	NC_015422	TGC	2	6	240642	240647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
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6400	NC_015422	GGGCAT	2	12	240724	240735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	330822858
6401	NC_015422	CTG	2	6	240737	240742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822858
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6403	NC_015422	GC	3	6	240854	240859	0 %	0 %	50 %	50 %	330822858
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6432	NC_015422	GCCGG	2	10	241875	241884	0 %	0 %	60 %	40 %	330822859
6433	NC_015422	CGCCAC	2	12	241885	241896	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330822859
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6462	NC_015422	ACG	2	6	242841	242846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822859
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6465	NC_015422	TGC	2	6	242910	242915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822859
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6479	NC_015422	CG	4	8	243264	243271	0 %	0 %	50 %	50 %	330822859
6480	NC_015422	CTG	2	6	243278	243283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822859
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6482	NC_015422	CGG	2	6	243351	243356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822859
6483	NC_015422	GCA	2	6	243357	243362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822859
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6485	NC_015422	GC	3	6	243414	243419	0 %	0 %	50 %	50 %	330822859
6486	NC_015422	GCT	2	6	243508	243513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822859
6487	NC_015422	CGA	2	6	243556	243561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822859
6488	NC_015422	GC	3	6	243652	243657	0 %	0 %	50 %	50 %	330822859
6489	NC_015422	CCA	2	6	243699	243704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822859
6490	NC_015422	GCGCC	2	10	243727	243736	0 %	0 %	40 %	60 %	330822859
6491	NC_015422	GTGA	2	8	243773	243780	25 %	25 %	50 %	0 %	330822859
6492	NC_015422	GCCA	2	8	243821	243828	25 %	0 %	25 %	50 %	330822859
6493	NC_015422	ACG	2	6	243843	243848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822859
6494	NC_015422	TCG	2	6	243855	243860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822859
6495	NC_015422	CG	3	6	243906	243911	0 %	0 %	50 %	50 %	330822859
6496	NC_015422	GCA	2	6	245642	245647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822860
6497	NC_015422	CTGTA	2	10	245653	245662	20 %	40 %	20 %	20 %	330822860
6498	NC_015422	CGC	2	6	245700	245705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822860
6499	NC_015422	GTGC	2	8	245719	245726	0 %	25 %	50 %	25 %	330822860
6500	NC_015422	GC	3	6	245735	245740	0 %	0 %	50 %	50 %	330822860

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