MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 3546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015320	GGCT	2	8	1874343	1874350	0 %	25 %	50 %	25 %	327401980
3502	NC_015320	AGCC	2	8	1874778	1874785	25 %	0 %	25 %	50 %	327401982
3503	NC_015320	TAAA	2	8	1875254	1875261	75 %	25 %	0 %	0 %	327401983
3504	NC_015320	CCTC	2	8	1875593	1875600	0 %	25 %	0 %	75 %	327401984
3505	NC_015320	CTTC	2	8	1875756	1875763	0 %	50 %	0 %	50 %	327401984
3506	NC_015320	GATG	2	8	1875803	1875810	25 %	25 %	50 %	0 %	327401985
3507	NC_015320	CCCG	2	8	1876077	1876084	0 %	0 %	25 %	75 %	327401985
3508	NC_015320	CTCA	2	8	1876257	1876264	25 %	25 %	0 %	50 %	327401985
3509	NC_015320	CTTC	2	8	1876331	1876338	0 %	50 %	0 %	50 %	327401985
3510	NC_015320	CTTT	2	8	1877795	1877802	0 %	75 %	0 %	25 %	327401987
3511	NC_015320	CAGA	2	8	1878987	1878994	50 %	0 %	25 %	25 %	327401989
3512	NC_015320	GTTT	2	8	1879198	1879205	0 %	75 %	25 %	0 %	327401989
3513	NC_015320	AAGA	2	8	1879665	1879672	75 %	0 %	25 %	0 %	327401990
3514	NC_015320	CACC	2	8	1880375	1880382	25 %	0 %	0 %	75 %	327401990
3515	NC_015320	TGCT	2	8	1881020	1881027	0 %	50 %	25 %	25 %	327401990
3516	NC_015320	AGCA	2	8	1881534	1881541	50 %	0 %	25 %	25 %	327401991
3517	NC_015320	CTTC	2	8	1882760	1882767	0 %	50 %	0 %	50 %	327401992
3518	NC_015320	GTAA	2	8	1884644	1884651	50 %	25 %	25 %	0 %	327401993
3519	NC_015320	AAAG	2	8	1884776	1884783	75 %	0 %	25 %	0 %	327401994
3520	NC_015320	GGAA	2	8	1884977	1884984	50 %	0 %	50 %	0 %	327401994
3521	NC_015320	AGAA	2	8	1885056	1885063	75 %	0 %	25 %	0 %	327401994
3522	NC_015320	TTCT	2	8	1886374	1886381	0 %	75 %	0 %	25 %	327401995
3523	NC_015320	CCTC	2	8	1887131	1887138	0 %	25 %	0 %	75 %	327401995
3524	NC_015320	AAAG	2	8	1887200	1887207	75 %	0 %	25 %	0 %	327401995
3525	NC_015320	GAGG	2	8	1887374	1887381	25 %	0 %	75 %	0 %	327401995
3526	NC_015320	TTTG	2	8	1887515	1887522	0 %	75 %	25 %	0 %	327401996
3527	NC_015320	AGGA	2	8	1888095	1888102	50 %	0 %	50 %	0 %	327401996
3528	NC_015320	GGAT	2	8	1889614	1889621	25 %	25 %	50 %	0 %	327401997
3529	NC_015320	GCCT	2	8	1890908	1890915	0 %	25 %	25 %	50 %	327401998
3530	NC_015320	GGTC	2	8	1891279	1891286	0 %	25 %	50 %	25 %	327401999
3531	NC_015320	TCCA	2	8	1891792	1891799	25 %	25 %	0 %	50 %	327401999
3532	NC_015320	GAGC	2	8	1892220	1892227	25 %	0 %	50 %	25 %	327401999
3533	NC_015320	GAAG	2	8	1892441	1892448	50 %	0 %	50 %	0 %	327402000
3534	NC_015320	CAAC	2	8	1893451	1893458	50 %	0 %	0 %	50 %	327402000
3535	NC_015320	TTAA	2	8	1894041	1894048	50 %	50 %	0 %	0 %	327402000
3536	NC_015320	ATCT	2	8	1894585	1894592	25 %	50 %	0 %	25 %	327402001
3537	NC_015320	CCTT	2	8	1894597	1894604	0 %	50 %	0 %	50 %	327402001
3538	NC_015320	TACT	2	8	1894692	1894699	25 %	50 %	0 %	25 %	327402001
3539	NC_015320	GTAG	2	8	1894970	1894977	25 %	25 %	50 %	0 %	327402002
3540	NC_015320	TGGA	2	8	1896332	1896339	25 %	25 %	50 %	0 %	327402004
3541	NC_015320	CAGA	2	8	1897424	1897431	50 %	0 %	25 %	25 %	327402004
3542	NC_015320	GATG	2	8	1897769	1897776	25 %	25 %	50 %	0 %	327402004
3543	NC_015320	GAAC	2	8	1898676	1898683	50 %	0 %	25 %	25 %	327402006
3544	NC_015320	GCTC	2	8	1898841	1898848	0 %	25 %	25 %	50 %	327402006
3545	NC_015320	TTTG	2	8	1899601	1899608	0 %	75 %	25 %	0 %	327402007
3546	NC_015320	AGAA	2	8	1900638	1900645	75 %	0 %	25 %	0 %	327402008

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.