MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015184	GCG	2	6	30177	30182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
502	NC_015184	TGC	2	6	30183	30188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
503	NC_015184	TGC	2	6	30213	30218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
504	NC_015184	GCA	2	6	30262	30267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168313
505	NC_015184	CGGC	2	8	30280	30287	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
506	NC_015184	TGC	2	6	30292	30297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
507	NC_015184	CCT	2	6	30301	30306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168313
508	NC_015184	GC	3	6	30330	30335	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
509	NC_015184	GCC	2	6	30341	30346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168313
510	NC_015184	ATCGCG	2	12	30390	30401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168313
511	NC_015184	GCT	2	6	30409	30414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
512	NC_015184	GGC	2	6	30436	30441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
513	NC_015184	GC	3	6	30482	30487	0 %	0 %	50 %	50 %	325168313
514	NC_015184	CGT	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168313
515	NC_015184	TTGA	2	8	30542	30549	25 %	50 %	25 %	0 %	325168313
516	NC_015184	TGG	2	6	30585	30590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168313
517	NC_015184	CGC	2	6	30609	30614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168313
518	NC_015184	GGC	2	6	30616	30621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
519	NC_015184	GCG	2	6	30622	30627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168313
520	NC_015184	GGGGAG	2	12	30661	30672	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	325168313
521	NC_015184	AGA	2	6	30868	30873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168314
522	NC_015184	CTG	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168314
523	NC_015184	TCCG	2	8	30940	30947	0 %	25 %	25 %	50 %	325168314
524	NC_015184	CT	3	6	30977	30982	0 %	50 %	0 %	50 %	325168314
525	NC_015184	GTCT	2	8	31019	31026	0 %	50 %	25 %	25 %	325168314
526	NC_015184	CCG	2	6	31056	31061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168314
527	NC_015184	TCG	2	6	31091	31096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168314
528	NC_015184	TTG	2	6	31321	31326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168315
529	NC_015184	TGA	2	6	31332	31337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168315
530	NC_015184	CGT	2	6	31362	31367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
531	NC_015184	GGC	2	6	31390	31395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168315
532	NC_015184	TCA	2	6	31400	31405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168315
533	NC_015184	TGC	2	6	31477	31482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
534	NC_015184	GCC	2	6	31483	31488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168315
535	NC_015184	CTG	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
536	NC_015184	CAA	2	6	31560	31565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
537	NC_015184	GGT	2	6	31663	31668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168315
538	NC_015184	CCCA	2	8	31722	31729	25 %	0 %	0 %	75 %	325168315
539	NC_015184	CG	3	6	31735	31740	0 %	0 %	50 %	50 %	325168315
540	NC_015184	TCG	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
541	NC_015184	GCC	2	6	32033	32038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168315
542	NC_015184	ATC	2	6	32068	32073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168315
543	NC_015184	TGG	2	6	32107	32112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168315
544	NC_015184	CT	4	8	32126	32133	0 %	50 %	0 %	50 %	325168315
545	NC_015184	GA	3	6	32141	32146	50 %	0 %	50 %	0 %	325168315
546	NC_015184	CAA	2	6	32181	32186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
547	NC_015184	AGT	2	6	32219	32224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168315
548	NC_015184	GGAA	2	8	32225	32232	50 %	0 %	50 %	0 %	325168315
549	NC_015184	TCA	2	6	32264	32269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168315
550	NC_015184	TCG	2	6	32285	32290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
551	NC_015184	TCGA	2	8	32293	32300	25 %	25 %	25 %	25 %	325168315
552	NC_015184	ACA	2	6	32372	32377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168315
553	NC_015184	CGA	2	6	32412	32417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168315
554	NC_015184	TGT	2	6	32431	32436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168315
555	NC_015184	GC	3	6	32458	32463	0 %	0 %	50 %	50 %	325168315
556	NC_015184	CG	3	6	32529	32534	0 %	0 %	50 %	50 %	325168315
557	NC_015184	TGC	2	6	32572	32577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168315
558	NC_015184	TTC	2	6	32611	32616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168315
559	NC_015184	GAC	2	6	32636	32641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168315
560	NC_015184	GCC	2	6	32657	32662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168315
561	NC_015184	CAC	2	6	32752	32757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168315
562	NC_015184	CTG	2	6	32770	32775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168316
563	NC_015184	GGC	3	9	32780	32788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168316
564	NC_015184	CAT	2	6	32818	32823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168316
565	NC_015184	CTA	2	6	32853	32858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168316
566	NC_015184	CCG	2	6	32925	32930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168316
567	NC_015184	GAC	2	6	33047	33052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168316
568	NC_015184	GTT	2	6	33073	33078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168316
569	NC_015184	CCA	2	6	33099	33104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168316
570	NC_015184	CTT	2	6	33110	33115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168316
571	NC_015184	GGA	2	6	33147	33152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168316
572	NC_015184	ACG	2	6	33195	33200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168316
573	NC_015184	A	6	6	33230	33235	100 %	0 %	0 %	0 %	325168316
574	NC_015184	GC	3	6	33242	33247	0 %	0 %	50 %	50 %	325168316
575	NC_015184	TGC	2	6	33522	33527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168317
576	NC_015184	TCA	2	6	33537	33542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168317
577	NC_015184	GC	4	8	33585	33592	0 %	0 %	50 %	50 %	325168317
578	NC_015184	TTGA	2	8	33626	33633	25 %	50 %	25 %	0 %	325168317
579	NC_015184	TCA	2	6	33699	33704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168317
580	NC_015184	CG	3	6	33774	33779	0 %	0 %	50 %	50 %	325168317
581	NC_015184	CGA	2	6	33823	33828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168317
582	NC_015184	CAT	2	6	33869	33874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168317
583	NC_015184	G	6	6	33894	33899	0 %	0 %	100 %	0 %	325168317
584	NC_015184	CGCT	2	8	33920	33927	0 %	25 %	25 %	50 %	325168317
585	NC_015184	TCA	2	6	34170	34175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168317
586	NC_015184	ACGGA	2	10	34266	34275	40 %	0 %	40 %	20 %	325168317
587	NC_015184	CG	3	6	34334	34339	0 %	0 %	50 %	50 %	325168317
588	NC_015184	GTC	2	6	34357	34362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168317
589	NC_015184	T	6	6	34403	34408	0 %	100 %	0 %	0 %	325168317
590	NC_015184	TGC	2	6	34419	34424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168317
591	NC_015184	TCT	2	6	34437	34442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168317
592	NC_015184	GGT	2	6	34477	34482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168317
593	NC_015184	TCT	2	6	34506	34511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168317
594	NC_015184	TGG	2	6	34658	34663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168317
595	NC_015184	AGG	2	6	34686	34691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168317
596	NC_015184	CGA	2	6	34711	34716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168317
597	NC_015184	GAGATT	2	12	34730	34741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168317
598	NC_015184	TCT	2	6	34776	34781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168317
599	NC_015184	CCGA	2	8	34805	34812	25 %	0 %	25 %	50 %	325168317
600	NC_015184	TCT	2	6	34813	34818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168317
601	NC_015184	CGC	2	6	34839	34844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168317
602	NC_015184	CGA	2	6	34903	34908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168317
603	NC_015184	ATG	2	6	35149	35154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168318
604	NC_015184	GCA	2	6	35319	35324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168318
605	NC_015184	GGC	2	6	35384	35389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168318
606	NC_015184	CG	4	8	35426	35433	0 %	0 %	50 %	50 %	325168318
607	NC_015184	GGCT	2	8	35470	35477	0 %	25 %	50 %	25 %	325168318
608	NC_015184	GAA	2	6	35482	35487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168318
609	NC_015184	GCT	2	6	35550	35555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168318
610	NC_015184	CGG	2	6	35626	35631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168318
611	NC_015184	ACC	2	6	35668	35673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168318
612	NC_015184	CTG	2	6	35787	35792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168318
613	NC_015184	GAT	2	6	35916	35921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168318
614	NC_015184	CATG	2	8	35940	35947	25 %	25 %	25 %	25 %	325168318
615	NC_015184	TGA	2	6	35991	35996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168318
616	NC_015184	TTC	2	6	36107	36112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168318
617	NC_015184	ATT	2	6	36124	36129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168318
618	NC_015184	GAC	2	6	36156	36161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168318
619	NC_015184	GAC	2	6	36379	36384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168318
620	NC_015184	CGC	2	6	36386	36391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168318
621	NC_015184	AGC	2	6	36472	36477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168319
622	NC_015184	GCC	2	6	36491	36496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168319
623	NC_015184	CG	4	8	36810	36817	0 %	0 %	50 %	50 %	325168320
624	NC_015184	GGC	2	6	36854	36859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168320
625	NC_015184	TC	3	6	36891	36896	0 %	50 %	0 %	50 %	325168320
626	NC_015184	CTG	2	6	37031	37036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168320
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1000	NC_015184	AGG	2	6	57679	57684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168342

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