MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015184	GCT	2	6	522588	522593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168856
9002	NC_015184	CGG	2	6	522635	522640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168856
9003	NC_015184	ATC	2	6	522658	522663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168856
9004	NC_015184	GACGTC	3	18	522727	522744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168856
9005	NC_015184	CTTC	2	8	522861	522868	0 %	50 %	0 %	50 %	325168856
9006	NC_015184	CG	3	6	522966	522971	0 %	0 %	50 %	50 %	325168856
9007	NC_015184	TTG	2	6	523058	523063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168856
9008	NC_015184	TGAA	2	8	523070	523077	50 %	25 %	25 %	0 %	325168856
9009	NC_015184	TCG	2	6	523136	523141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168856
9010	NC_015184	GGA	2	6	523190	523195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168856
9011	NC_015184	GTT	2	6	523331	523336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168856
9012	NC_015184	TGG	2	6	523356	523361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168856
9013	NC_015184	GCC	2	6	523408	523413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168856
9014	NC_015184	CAAC	2	8	523415	523422	50 %	0 %	0 %	50 %	325168856
9015	NC_015184	CA	3	6	523438	523443	50 %	0 %	0 %	50 %	325168856
9016	NC_015184	CGCC	2	8	523518	523525	0 %	0 %	25 %	75 %	325168856
9017	NC_015184	CGCT	2	8	523714	523721	0 %	25 %	25 %	50 %	325168857
9018	NC_015184	TGC	2	6	523752	523757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168857
9019	NC_015184	TCA	2	6	523823	523828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168857
9020	NC_015184	CG	3	6	523958	523963	0 %	0 %	50 %	50 %	325168857
9021	NC_015184	GGC	2	6	524028	524033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168857
9022	NC_015184	TTC	2	6	524034	524039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168857
9023	NC_015184	TTG	2	6	524080	524085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168857
9024	NC_015184	AG	3	6	524098	524103	50 %	0 %	50 %	0 %	325168857
9025	NC_015184	TC	3	6	524135	524140	0 %	50 %	0 %	50 %	325168857
9026	NC_015184	GGA	2	6	524270	524275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168858
9027	NC_015184	GCG	2	6	524334	524339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168858
9028	NC_015184	CGT	2	6	524409	524414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168858
9029	NC_015184	GCC	2	6	524566	524571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168858
9030	NC_015184	CTC	2	6	524641	524646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168858
9031	NC_015184	CGC	2	6	524679	524684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168858
9032	NC_015184	AGC	2	6	524753	524758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168858
9033	NC_015184	GC	3	6	524790	524795	0 %	0 %	50 %	50 %	325168858
9034	NC_015184	GTC	3	9	524989	524997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168858
9035	NC_015184	GCG	2	6	525200	525205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168858
9036	NC_015184	TCA	2	6	525230	525235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168858
9037	NC_015184	CCG	2	6	525324	525329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168859
9038	NC_015184	CAG	2	6	525332	525337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9039	NC_015184	G	6	6	525399	525404	0 %	0 %	100 %	0 %	325168859
9040	NC_015184	GTTCC	2	10	525410	525419	0 %	40 %	20 %	40 %	325168859
9041	NC_015184	CGC	2	6	525433	525438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168859
9042	NC_015184	CTG	2	6	525446	525451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9043	NC_015184	GGCGC	2	10	525488	525497	0 %	0 %	60 %	40 %	325168859
9044	NC_015184	GAT	3	9	525523	525531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168859
9045	NC_015184	CAG	2	6	525538	525543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9046	NC_015184	GGGC	2	8	525625	525632	0 %	0 %	75 %	25 %	325168859
9047	NC_015184	TGG	2	6	525651	525656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168859
9048	NC_015184	ATC	2	6	525662	525667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168859
9049	NC_015184	GCT	2	6	525673	525678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9050	NC_015184	TTG	2	6	525723	525728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168859
9051	NC_015184	GCC	2	6	525826	525831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168859
9052	NC_015184	CTG	2	6	525836	525841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9053	NC_015184	CTG	2	6	525866	525871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9054	NC_015184	CGG	2	6	525915	525920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168859
9055	NC_015184	CGC	2	6	525964	525969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168859
9056	NC_015184	CGG	2	6	526012	526017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168859
9057	NC_015184	GCA	2	6	526118	526123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9058	NC_015184	GT	3	6	526191	526196	0 %	50 %	50 %	0 %	325168859
9059	NC_015184	CCTG	2	8	526201	526208	0 %	25 %	25 %	50 %	325168859
9060	NC_015184	TGC	2	6	526213	526218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168859
9061	NC_015184	CCA	2	6	526281	526286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168859
9062	NC_015184	CGG	2	6	526543	526548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168860
9063	NC_015184	GCA	2	6	526567	526572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168860
9064	NC_015184	TTC	2	6	526640	526645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168860
9065	NC_015184	ACG	2	6	526647	526652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168860
9066	NC_015184	CGAA	2	8	526677	526684	50 %	0 %	25 %	25 %	325168860
9067	NC_015184	CAT	2	6	526712	526717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168860
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9069	NC_015184	CGG	2	6	526798	526803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168860
9070	NC_015184	GCC	2	6	526862	526867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168860
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9072	NC_015184	CAT	2	6	527039	527044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168860
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9074	NC_015184	CGC	2	6	527096	527101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168860
9075	NC_015184	GAT	2	6	527174	527179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168860
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9077	NC_015184	TCG	2	6	527478	527483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168860
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9079	NC_015184	CAG	2	6	527521	527526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168860
9080	NC_015184	AGA	2	6	527544	527549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168860
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9083	NC_015184	GCAAG	2	10	527838	527847	40 %	0 %	40 %	20 %	325168860
9084	NC_015184	GCC	2	6	527857	527862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168860
9085	NC_015184	CCA	2	6	527870	527875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168860
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9087	NC_015184	CCA	2	6	528013	528018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168860
9088	NC_015184	ATA	2	6	528020	528025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168860
9089	NC_015184	CG	3	6	528048	528053	0 %	0 %	50 %	50 %	325168860
9090	NC_015184	GCGG	2	8	528137	528144	0 %	0 %	75 %	25 %	325168860
9091	NC_015184	CCCG	2	8	528145	528152	0 %	0 %	25 %	75 %	325168860
9092	NC_015184	ACA	2	6	528168	528173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168860
9093	NC_015184	CGA	2	6	528223	528228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168860
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9099	NC_015184	TTC	2	6	528876	528881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168862
9100	NC_015184	CG	3	6	528928	528933	0 %	0 %	50 %	50 %	325168862
9101	NC_015184	CGAG	2	8	528963	528970	25 %	0 %	50 %	25 %	325168862
9102	NC_015184	GTC	2	6	528972	528977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168862
9103	NC_015184	GTCA	2	8	528984	528991	25 %	25 %	25 %	25 %	325168862
9104	NC_015184	C	6	6	529055	529060	0 %	0 %	0 %	100 %	325168863
9105	NC_015184	CCTG	2	8	529178	529185	0 %	25 %	25 %	50 %	325168863
9106	NC_015184	CGG	2	6	529202	529207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168863
9107	NC_015184	AT	3	6	529223	529228	50 %	50 %	0 %	0 %	325168863
9108	NC_015184	CGG	2	6	529251	529256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168863
9109	NC_015184	TGC	2	6	529306	529311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168863
9110	NC_015184	GCC	2	6	529417	529422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168863
9111	NC_015184	CAG	2	6	529435	529440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168863
9112	NC_015184	CGC	2	6	529591	529596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168863
9113	NC_015184	GTCT	2	8	529659	529666	0 %	50 %	25 %	25 %	325168863
9114	NC_015184	GGC	2	6	529693	529698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168863
9115	NC_015184	CGA	2	6	529710	529715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168863
9116	NC_015184	CGC	2	6	529792	529797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168863
9117	NC_015184	ATGGCG	2	12	529892	529903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325168863
9118	NC_015184	CTA	2	6	530025	530030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168864
9119	NC_015184	CGTT	2	8	530123	530130	0 %	50 %	25 %	25 %	325168864
9120	NC_015184	CGG	2	6	530136	530141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168864
9121	NC_015184	GTCA	2	8	530199	530206	25 %	25 %	25 %	25 %	325168864
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9241	NC_015184	GATT	2	8	536865	536872	25 %	50 %	25 %	0 %	325168871
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9485	NC_015184	CG	3	6	550084	550089	0 %	0 %	50 %	50 %	325168883
9486	NC_015184	GGA	2	6	550112	550117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168883
9487	NC_015184	CGA	2	6	550510	550515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9488	NC_015184	TTCGAC	2	12	550537	550548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325168884
9489	NC_015184	GCG	2	6	550555	550560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168884
9490	NC_015184	ATGT	2	8	550565	550572	25 %	50 %	25 %	0 %	325168884
9491	NC_015184	TGG	2	6	550620	550625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168884
9492	NC_015184	GCC	2	6	550630	550635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168884
9493	NC_015184	TGC	2	6	550692	550697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9494	NC_015184	TGG	2	6	550728	550733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168884
9495	NC_015184	CGC	2	6	550766	550771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168884
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9498	NC_015184	CGG	2	6	551007	551012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168884
9499	NC_015184	TGG	2	6	551016	551021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168884
9500	NC_015184	GAT	2	6	551047	551052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168884

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