MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015184	GACC	2	8	381334	381341	25 %	0 %	25 %	50 %	325168717
6502	NC_015184	GCT	2	6	381342	381347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6503	NC_015184	CG	3	6	381397	381402	0 %	0 %	50 %	50 %	325168717
6504	NC_015184	CCGC	2	8	381482	381489	0 %	0 %	25 %	75 %	325168717
6505	NC_015184	ATC	2	6	381502	381507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6506	NC_015184	ATC	2	6	381538	381543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6507	NC_015184	GCG	2	6	381617	381622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168717
6508	NC_015184	GAT	2	6	381633	381638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168717
6509	NC_015184	GTC	2	6	381654	381659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6510	NC_015184	GATCA	2	10	381685	381694	40 %	20 %	20 %	20 %	325168717
6511	NC_015184	GCT	2	6	381756	381761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6512	NC_015184	CGG	2	6	381822	381827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168717
6513	NC_015184	GC	3	6	381837	381842	0 %	0 %	50 %	50 %	325168717
6514	NC_015184	CGA	2	6	381888	381893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6515	NC_015184	ACG	2	6	381916	381921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6516	NC_015184	GCATG	2	10	381963	381972	20 %	20 %	40 %	20 %	325168717
6517	NC_015184	TCA	2	6	381983	381988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6518	NC_015184	GTG	2	6	382003	382008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168717
6519	NC_015184	GCCC	2	8	382162	382169	0 %	0 %	25 %	75 %	325168717
6520	NC_015184	GCT	2	6	382263	382268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6521	NC_015184	TCG	2	6	382289	382294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6522	NC_015184	GGT	2	6	382392	382397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168717
6523	NC_015184	GCG	2	6	382432	382437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168717
6524	NC_015184	GTTCG	2	10	382470	382479	0 %	40 %	40 %	20 %	325168717
6525	NC_015184	GCT	2	6	382521	382526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6526	NC_015184	CCGG	2	8	382600	382607	0 %	0 %	50 %	50 %	325168717
6527	NC_015184	CGG	2	6	382635	382640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168717
6528	NC_015184	CCAGCG	2	12	382641	382652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325168717
6529	NC_015184	ATC	2	6	382690	382695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6530	NC_015184	TCA	2	6	382796	382801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6531	NC_015184	TCA	2	6	382817	382822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168717
6532	NC_015184	TTG	2	6	382865	382870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168717
6533	NC_015184	CG	3	6	382955	382960	0 %	0 %	50 %	50 %	325168717
6534	NC_015184	GCC	2	6	382995	383000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168717
6535	NC_015184	GCT	2	6	383017	383022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168717
6536	NC_015184	ATCG	2	8	383082	383089	25 %	25 %	25 %	25 %	325168718
6537	NC_015184	TCG	2	6	383134	383139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168718
6538	NC_015184	TCC	3	9	383281	383289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168718
6539	NC_015184	GCC	2	6	383364	383369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168718
6540	NC_015184	GGC	2	6	383372	383377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168718
6541	NC_015184	GCG	2	6	383404	383409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168718
6542	NC_015184	CGG	2	6	383464	383469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168718
6543	NC_015184	GGA	2	6	383474	383479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168718
6544	NC_015184	GGT	2	6	383567	383572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168718
6545	NC_015184	CGCT	2	8	383595	383602	0 %	25 %	25 %	50 %	325168718
6546	NC_015184	GCC	2	6	383667	383672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168718
6547	NC_015184	TCT	2	6	383831	383836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168718
6548	NC_015184	GGT	2	6	383883	383888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168718
6549	NC_015184	CGC	2	6	383944	383949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168718
6550	NC_015184	CCG	2	6	383974	383979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168718
6551	NC_015184	CCG	2	6	383995	384000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168718
6552	NC_015184	CAG	2	6	384003	384008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168718
6553	NC_015184	TGG	2	6	384059	384064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168718
6554	NC_015184	TGT	2	6	384101	384106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168718
6555	NC_015184	GGAT	2	8	384125	384132	25 %	25 %	50 %	0 %	325168718
6556	NC_015184	GACC	2	8	384150	384157	25 %	0 %	25 %	50 %	325168718
6557	NC_015184	GATG	2	8	384173	384180	25 %	25 %	50 %	0 %	325168718
6558	NC_015184	CAC	2	6	384337	384342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168719
6559	NC_015184	GGA	2	6	384375	384380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168719
6560	NC_015184	CTT	2	6	384487	384492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168719
6561	NC_015184	CGA	2	6	384538	384543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168719
6562	NC_015184	GGC	2	6	384564	384569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168719
6563	NC_015184	T	6	6	384642	384647	0 %	100 %	0 %	0 %	325168719
6564	NC_015184	TGGC	2	8	384720	384727	0 %	25 %	50 %	25 %	325168719
6565	NC_015184	ACG	2	6	384856	384861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168719
6566	NC_015184	GC	3	6	384895	384900	0 %	0 %	50 %	50 %	325168719
6567	NC_015184	CGAT	2	8	385497	385504	25 %	25 %	25 %	25 %	325168720
6568	NC_015184	CGA	2	6	385636	385641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168720
6569	NC_015184	GCC	2	6	385648	385653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168720
6570	NC_015184	AGA	2	6	385670	385675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168720
6571	NC_015184	TCTT	2	8	385722	385729	0 %	75 %	0 %	25 %	325168720
6572	NC_015184	CCA	2	6	385810	385815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168720
6573	NC_015184	GCG	2	6	385856	385861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168720
6574	NC_015184	GAC	2	6	385876	385881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168720
6575	NC_015184	AGT	2	6	385968	385973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168720
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6577	NC_015184	GAT	2	6	386066	386071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168720
6578	NC_015184	CGA	2	6	386206	386211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168721
6579	NC_015184	ATC	2	6	386294	386299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168721
6580	NC_015184	CGC	2	6	386334	386339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168721
6581	NC_015184	GCG	2	6	386435	386440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168721
6582	NC_015184	TCG	2	6	386479	386484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168721
6583	NC_015184	ATA	2	6	386523	386528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168721
6584	NC_015184	AGCC	2	8	386562	386569	25 %	0 %	25 %	50 %	325168721
6585	NC_015184	GCC	2	6	386648	386653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168721
6586	NC_015184	CAA	2	6	386683	386688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168721
6587	NC_015184	GCA	2	6	386714	386719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168721
6588	NC_015184	GAA	2	6	386774	386779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168721
6589	NC_015184	CTGCG	2	10	386849	386858	0 %	20 %	40 %	40 %	325168721
6590	NC_015184	TCG	2	6	386961	386966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168721
6591	NC_015184	CAC	2	6	386969	386974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168721
6592	NC_015184	GC	3	6	387003	387008	0 %	0 %	50 %	50 %	325168721
6593	NC_015184	AAG	2	6	387059	387064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168721
6594	NC_015184	GCC	2	6	387117	387122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168721
6595	NC_015184	TGGC	2	8	387139	387146	0 %	25 %	50 %	25 %	325168721
6596	NC_015184	CAG	2	6	387151	387156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168721
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6598	NC_015184	GTC	2	6	387306	387311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6599	NC_015184	GC	3	6	387320	387325	0 %	0 %	50 %	50 %	325168722
6600	NC_015184	ATCG	2	8	387354	387361	25 %	25 %	25 %	25 %	325168722
6601	NC_015184	CGG	2	6	387446	387451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168722
6602	NC_015184	CA	3	6	387473	387478	50 %	0 %	0 %	50 %	325168722
6603	NC_015184	ACTG	2	8	387507	387514	25 %	25 %	25 %	25 %	325168722
6604	NC_015184	TGA	2	6	387551	387556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168722
6605	NC_015184	TGG	2	6	387561	387566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168722
6606	NC_015184	ATG	2	6	387601	387606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168722
6607	NC_015184	AGC	2	6	387613	387618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6608	NC_015184	TCG	2	6	387754	387759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6609	NC_015184	CCG	2	6	387803	387808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168722
6610	NC_015184	TGCC	2	8	387878	387885	0 %	25 %	25 %	50 %	325168722
6611	NC_015184	CGA	2	6	387899	387904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6612	NC_015184	TCC	2	6	387927	387932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168722
6613	NC_015184	CTG	2	6	387959	387964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6614	NC_015184	GAT	2	6	387984	387989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168722
6615	NC_015184	CGG	2	6	388056	388061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168722
6616	NC_015184	CCT	2	6	388085	388090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168722
6617	NC_015184	CGATGC	2	12	388106	388117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6618	NC_015184	ACCG	2	8	388141	388148	25 %	0 %	25 %	50 %	325168722
6619	NC_015184	GGAT	2	8	388188	388195	25 %	25 %	50 %	0 %	325168722
6620	NC_015184	GATGCG	2	12	388204	388215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325168722
6621	NC_015184	CCCGC	2	10	388232	388241	0 %	0 %	20 %	80 %	325168722
6622	NC_015184	GCA	2	6	388293	388298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168722
6623	NC_015184	TCT	2	6	388322	388327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168722
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6626	NC_015184	TTG	2	6	388353	388358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168722
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6630	NC_015184	TGC	2	6	388526	388531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168722
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6983	NC_015184	GCG	2	6	405955	405960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168738
6984	NC_015184	TTA	2	6	406008	406013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168738
6985	NC_015184	GCG	2	6	406090	406095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168738
6986	NC_015184	CGG	2	6	406159	406164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168739
6987	NC_015184	GTT	2	6	406232	406237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168739
6988	NC_015184	GC	3	6	406238	406243	0 %	0 %	50 %	50 %	325168739
6989	NC_015184	CGTC	2	8	406304	406311	0 %	25 %	25 %	50 %	325168739
6990	NC_015184	TCTCG	2	10	406388	406397	0 %	40 %	20 %	40 %	325168739
6991	NC_015184	GGCAA	2	10	406563	406572	40 %	0 %	40 %	20 %	325168739
6992	NC_015184	CCG	2	6	406591	406596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168739
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6995	NC_015184	TTG	2	6	406792	406797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168739
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6997	NC_015184	ATTG	2	8	406853	406860	25 %	50 %	25 %	0 %	325168739
6998	NC_015184	GCC	2	6	406863	406868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168739
6999	NC_015184	TTC	2	6	407038	407043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168739
7000	NC_015184	CTG	2	6	407142	407147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168739

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