MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_015183	GCT	2	6	1777669	1777674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293220
34502	NC_015183	CGG	2	6	1777680	1777685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293220
34503	NC_015183	ACA	2	6	1777775	1777780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293220
34504	NC_015183	GAG	2	6	1777810	1777815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293220
34505	NC_015183	GCA	2	6	1777831	1777836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293220
34506	NC_015183	ACG	2	6	1777858	1777863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293220
34507	NC_015183	GCT	2	6	1777968	1777973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293221
34508	NC_015183	GCC	2	6	1777982	1777987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293221
34509	NC_015183	GTT	2	6	1778047	1778052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325293221
34510	NC_015183	CGG	2	6	1778118	1778123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293221
34511	NC_015183	GCC	2	6	1778221	1778226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293221
34512	NC_015183	CTT	2	6	1778227	1778232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293221
34513	NC_015183	CGA	2	6	1778274	1778279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293221
34514	NC_015183	CG	3	6	1778289	1778294	0 %	0 %	50 %	50 %	325293221
34515	NC_015183	GCA	2	6	1778297	1778302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293221
34516	NC_015183	GGTCAT	2	12	1778308	1778319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325293221
34517	NC_015183	CGG	2	6	1778501	1778506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293222
34518	NC_015183	GTC	2	6	1778639	1778644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293222
34519	NC_015183	CGT	2	6	1778731	1778736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293222
34520	NC_015183	TCG	2	6	1778754	1778759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293222
34521	NC_015183	CAT	2	6	1778797	1778802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293222
34522	NC_015183	GC	3	6	1778869	1778874	0 %	0 %	50 %	50 %	325293223
34523	NC_015183	GCAC	2	8	1778996	1779003	25 %	0 %	25 %	50 %	325293223
34524	NC_015183	CGC	2	6	1779009	1779014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293223
34525	NC_015183	GAT	2	6	1779100	1779105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293223
34526	NC_015183	GCA	2	6	1779137	1779142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293223
34527	NC_015183	GCG	2	6	1779264	1779269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293223
34528	NC_015183	ATC	2	6	1779308	1779313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293223
34529	NC_015183	CGC	3	9	1779315	1779323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293223
34530	NC_015183	T	6	6	1779597	1779602	0 %	100 %	0 %	0 %	325293223
34531	NC_015183	TCA	2	6	1779629	1779634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293223
34532	NC_015183	TCG	2	6	1779731	1779736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293223
34533	NC_015183	CCGTAA	2	12	1779758	1779769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325293223
34534	NC_015183	GGA	2	6	1779793	1779798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293223
34535	NC_015183	CG	3	6	1779855	1779860	0 %	0 %	50 %	50 %	325293223
34536	NC_015183	CAC	2	6	1779958	1779963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293223
34537	NC_015183	CG	3	6	1780023	1780028	0 %	0 %	50 %	50 %	325293223
34538	NC_015183	GCC	2	6	1780073	1780078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293223
34539	NC_015183	GCG	2	6	1780082	1780087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293223
34540	NC_015183	ATG	2	6	1780103	1780108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293223
34541	NC_015183	CCAG	2	8	1780111	1780118	25 %	0 %	25 %	50 %	325293224
34542	NC_015183	GAT	2	6	1780124	1780129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293224
34543	NC_015183	TCT	2	6	1780155	1780160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293224
34544	NC_015183	CGA	2	6	1780183	1780188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34545	NC_015183	CGC	2	6	1780228	1780233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293224
34546	NC_015183	GC	3	6	1780232	1780237	0 %	0 %	50 %	50 %	325293224
34547	NC_015183	ATA	2	6	1780244	1780249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325293224
34548	NC_015183	GTC	2	6	1780259	1780264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34549	NC_015183	CGT	2	6	1780300	1780305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34550	NC_015183	CAG	2	6	1780358	1780363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34551	NC_015183	TCT	2	6	1780390	1780395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293224
34552	NC_015183	CGC	2	6	1780531	1780536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293224
34553	NC_015183	CGC	2	6	1780549	1780554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293224
34554	NC_015183	GCC	2	6	1780616	1780621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293224
34555	NC_015183	TGA	2	6	1780627	1780632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293224
34556	NC_015183	TGC	2	6	1780707	1780712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34557	NC_015183	GAT	2	6	1780715	1780720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293224
34558	NC_015183	GGA	2	6	1780763	1780768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325293224
34559	NC_015183	GGC	2	6	1780775	1780780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293224
34560	NC_015183	ACCTG	2	10	1780860	1780869	20 %	20 %	20 %	40 %	325293224
34561	NC_015183	CGT	2	6	1780975	1780980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293224
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34564	NC_015183	GACG	2	8	1781099	1781106	25 %	0 %	50 %	25 %	325293224
34565	NC_015183	ACA	2	6	1781115	1781120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325293224
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34568	NC_015183	TCG	2	6	1781241	1781246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293224
34569	NC_015183	GCG	2	6	1781262	1781267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293224
34570	NC_015183	GAT	2	6	1781408	1781413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34571	NC_015183	GAT	2	6	1781468	1781473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34572	NC_015183	TGA	2	6	1781539	1781544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34573	NC_015183	TCG	2	6	1781631	1781636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293225
34574	NC_015183	CAG	2	6	1781657	1781662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293225
34575	NC_015183	GC	3	6	1781682	1781687	0 %	0 %	50 %	50 %	325293225
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34578	NC_015183	CATGTC	2	12	1781732	1781743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325293225
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34581	NC_015183	GC	3	6	1781813	1781818	0 %	0 %	50 %	50 %	325293225
34582	NC_015183	GCT	2	6	1781824	1781829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293225
34583	NC_015183	TGG	2	6	1781857	1781862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325293225
34584	NC_015183	GC	3	6	1781916	1781921	0 %	0 %	50 %	50 %	325293225
34585	NC_015183	CGG	2	6	1781923	1781928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293225
34586	NC_015183	ATG	2	6	1782045	1782050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34587	NC_015183	GCA	2	6	1782066	1782071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325293225
34588	NC_015183	TGA	2	6	1782091	1782096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34589	NC_015183	GAT	2	6	1782134	1782139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293225
34590	NC_015183	CCGA	2	8	1782225	1782232	25 %	0 %	25 %	50 %	325293226
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34594	NC_015183	GC	3	6	1782460	1782465	0 %	0 %	50 %	50 %	325293226
34595	NC_015183	CGG	2	6	1782571	1782576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293226
34596	NC_015183	GAT	2	6	1782590	1782595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293226
34597	NC_015183	ATC	2	6	1782624	1782629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325293226
34598	NC_015183	CTG	2	6	1782647	1782652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293226
34599	NC_015183	GTC	2	6	1782695	1782700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293226
34600	NC_015183	CGC	2	6	1782793	1782798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293226
34601	NC_015183	GCC	2	6	1782821	1782826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325293226
34602	NC_015183	TCG	2	6	1782885	1782890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293226
34603	NC_015183	CCA	2	6	1782895	1782900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293226
34604	NC_015183	CCA	2	6	1782904	1782909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325293226
34605	NC_015183	CGG	2	6	1782910	1782915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325293226
34606	NC_015183	TCG	2	6	1782930	1782935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325293226
34607	NC_015183	CTT	2	6	1782979	1782984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293226
34608	NC_015183	GAT	2	6	1782989	1782994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325293226
34609	NC_015183	CACGAA	2	12	1783079	1783090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325293226
34610	NC_015183	TGTC	2	8	1783135	1783142	0 %	50 %	25 %	25 %	325293226
34611	NC_015183	ACCGA	2	10	1783152	1783161	40 %	0 %	20 %	40 %	325293226
34612	NC_015183	TTC	2	6	1783167	1783172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325293226
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