MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015183	TGT	2	6	339566	339571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291781
6502	NC_015183	CTC	2	6	339601	339606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291781
6503	NC_015183	TGC	2	6	339623	339628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291781
6504	NC_015183	GCC	3	9	339631	339639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291781
6505	NC_015183	TCC	2	6	339691	339696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291781
6506	NC_015183	CCT	2	6	339698	339703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291781
6507	NC_015183	CAT	2	6	339726	339731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291781
6508	NC_015183	TTTCG	2	10	339774	339783	0 %	60 %	20 %	20 %	325291781
6509	NC_015183	GGT	2	6	339784	339789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291781
6510	NC_015183	AG	3	6	339809	339814	50 %	0 %	50 %	0 %	325291781
6511	NC_015183	CAA	2	6	339831	339836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291781
6512	NC_015183	TCA	2	6	339892	339897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291782
6513	NC_015183	GTG	2	6	339903	339908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291782
6514	NC_015183	TGA	2	6	339980	339985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291782
6515	NC_015183	GCTG	2	8	339994	340001	0 %	25 %	50 %	25 %	325291782
6516	NC_015183	GTG	2	6	340002	340007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291782
6517	NC_015183	CTTG	2	8	340037	340044	0 %	50 %	25 %	25 %	325291782
6518	NC_015183	CGA	2	6	340121	340126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291782
6519	NC_015183	GC	3	6	340155	340160	0 %	0 %	50 %	50 %	325291782
6520	NC_015183	GAA	2	6	340176	340181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291782
6521	NC_015183	TCT	2	6	340244	340249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291782
6522	NC_015183	CGT	2	6	340494	340499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6523	NC_015183	GCC	2	6	340567	340572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291783
6524	NC_015183	GCA	2	6	340632	340637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6525	NC_015183	TGGA	2	8	340681	340688	25 %	25 %	50 %	0 %	325291783
6526	NC_015183	GCT	2	6	340746	340751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6527	NC_015183	CG	3	6	340792	340797	0 %	0 %	50 %	50 %	325291783
6528	NC_015183	CGA	2	6	340815	340820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6529	NC_015183	AGC	2	6	340826	340831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6530	NC_015183	TGG	2	6	340955	340960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291783
6531	NC_015183	CGG	2	6	340971	340976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291783
6532	NC_015183	AAG	2	6	341014	341019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291783
6533	NC_015183	AAG	2	6	341095	341100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291783
6534	NC_015183	GCC	2	6	341150	341155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291783
6535	NC_015183	CGG	2	6	341229	341234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291783
6536	NC_015183	CAG	2	6	341236	341241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6537	NC_015183	TCG	2	6	341264	341269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6538	NC_015183	CAA	2	6	341298	341303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291783
6539	NC_015183	GCC	2	6	341312	341317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291783
6540	NC_015183	CGA	2	6	341322	341327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291783
6541	NC_015183	GTG	2	6	341360	341365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291783
6542	NC_015183	GC	6	12	341367	341378	0 %	0 %	50 %	50 %	325291783
6543	NC_015183	CAT	2	6	341412	341417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291783
6544	NC_015183	TCG	2	6	341584	341589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291784
6545	NC_015183	AC	3	6	341613	341618	50 %	0 %	0 %	50 %	325291784
6546	NC_015183	GTC	2	6	341649	341654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291784
6547	NC_015183	CAG	2	6	341714	341719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291784
6548	NC_015183	GAG	2	6	341759	341764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291784
6549	NC_015183	GGC	2	6	341843	341848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291784
6550	NC_015183	GGC	2	6	341908	341913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291784
6551	NC_015183	CGA	2	6	341919	341924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291784
6552	NC_015183	TCC	2	6	341948	341953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291784
6553	NC_015183	TTCA	2	8	342213	342220	25 %	50 %	0 %	25 %	325291785
6554	NC_015183	GGT	2	6	342269	342274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291785
6555	NC_015183	CGCAGG	2	12	342310	342321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325291785
6556	NC_015183	CGC	2	6	342325	342330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291785
6557	NC_015183	TCA	2	6	342388	342393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291785
6558	NC_015183	GCA	2	6	342419	342424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291785
6559	NC_015183	GCC	2	6	342472	342477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291785
6560	NC_015183	CAT	2	6	342479	342484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291785
6561	NC_015183	TCG	2	6	342553	342558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291785
6562	NC_015183	CCA	2	6	342559	342564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291785
6563	NC_015183	CTG	2	6	342573	342578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291785
6564	NC_015183	CCGCC	2	10	342590	342599	0 %	0 %	20 %	80 %	325291785
6565	NC_015183	TGG	2	6	342611	342616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291785
6566	NC_015183	TCC	2	6	342690	342695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291785
6567	NC_015183	TGAT	2	8	342925	342932	25 %	50 %	25 %	0 %	325291786
6568	NC_015183	GCA	2	6	342941	342946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291786
6569	NC_015183	GCC	2	6	343029	343034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291786
6570	NC_015183	CAT	2	6	343104	343109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291786
6571	NC_015183	CTG	2	6	343110	343115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291786
6572	NC_015183	CGGC	2	8	343124	343131	0 %	0 %	50 %	50 %	325291786
6573	NC_015183	GGAT	2	8	343190	343197	25 %	25 %	50 %	0 %	325291786
6574	NC_015183	CGC	2	6	343198	343203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291786
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6577	NC_015183	CCG	2	6	343279	343284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291786
6578	NC_015183	CG	3	6	343346	343351	0 %	0 %	50 %	50 %	325291786
6579	NC_015183	GCA	2	6	343553	343558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291787
6580	NC_015183	TGCGC	2	10	343589	343598	0 %	20 %	40 %	40 %	325291787
6581	NC_015183	CG	3	6	343667	343672	0 %	0 %	50 %	50 %	325291787
6582	NC_015183	GGT	2	6	343704	343709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291787
6583	NC_015183	GC	3	6	343719	343724	0 %	0 %	50 %	50 %	325291787
6584	NC_015183	CG	3	6	343775	343780	0 %	0 %	50 %	50 %	325291787
6585	NC_015183	CCGT	2	8	343813	343820	0 %	25 %	25 %	50 %	325291787
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6588	NC_015183	GGA	2	6	344090	344095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291788
6589	NC_015183	TGC	2	6	344152	344157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291788
6590	NC_015183	GAG	2	6	344184	344189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291788
6591	NC_015183	CCG	2	6	344195	344200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291788
6592	NC_015183	TCC	2	6	344202	344207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291788
6593	NC_015183	CAT	2	6	344273	344278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291788
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6596	NC_015183	GAA	2	6	344357	344362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291788
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6598	NC_015183	ATG	2	6	344526	344531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291789
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6600	NC_015183	GCCTT	2	10	344605	344614	0 %	40 %	20 %	40 %	325291789
6601	NC_015183	CGC	2	6	344631	344636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291789
6602	NC_015183	TTCTCG	2	12	344758	344769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325291789
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6604	NC_015183	GGCT	2	8	344829	344836	0 %	25 %	50 %	25 %	325291789
6605	NC_015183	GCA	2	6	344881	344886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291789
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6609	NC_015183	TGT	2	6	344941	344946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291789
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6611	NC_015183	ACC	2	6	345109	345114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291789
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6619	NC_015183	GGA	2	6	345543	345548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291790
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6983	NC_015183	GA	3	6	362354	362359	50 %	0 %	50 %	0 %	325291806
6984	NC_015183	CGT	2	6	362373	362378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291806
6985	NC_015183	GCT	2	6	362430	362435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291806
6986	NC_015183	CGA	2	6	362454	362459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291806
6987	NC_015183	CGGC	2	8	362637	362644	0 %	0 %	50 %	50 %	325291807
6988	NC_015183	CAC	2	6	362725	362730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291807
6989	NC_015183	TTCC	2	8	362749	362756	0 %	50 %	0 %	50 %	325291807
6990	NC_015183	CGC	2	6	362839	362844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291807
6991	NC_015183	ATC	2	6	362888	362893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291807
6992	NC_015183	GCTTTC	2	12	362969	362980	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325291807
6993	NC_015183	AGC	2	6	362997	363002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291807
6994	NC_015183	ACC	2	6	363023	363028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291807
6995	NC_015183	GCG	2	6	363140	363145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291807
6996	NC_015183	TCGC	2	8	363155	363162	0 %	25 %	25 %	50 %	325291807
6997	NC_015183	CAC	2	6	363223	363228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291807
6998	NC_015183	GAT	2	6	363268	363273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291807
6999	NC_015183	GGC	2	6	363371	363376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291807
7000	NC_015183	CCG	2	6	363389	363394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291807

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