MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_015183	AAC	2	6	2787727	2787732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294175
54003	NC_015183	CG	5	10	2787758	2787767	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
54004	NC_015183	CG	3	6	2787770	2787775	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
54005	NC_015183	CGC	2	6	2787810	2787815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294175
54006	NC_015183	GCG	2	6	2787830	2787835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294175
54007	NC_015183	ACC	2	6	2787841	2787846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294175
54008	NC_015183	CGA	2	6	2787936	2787941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294175
54009	NC_015183	TTC	2	6	2788030	2788035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294175
54010	NC_015183	GCC	2	6	2788124	2788129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294175
54011	NC_015183	CTT	2	6	2788131	2788136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294175
54012	NC_015183	CGC	2	6	2788169	2788174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294175
54013	NC_015183	GCG	2	6	2788190	2788195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294175
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54016	NC_015183	CGG	2	6	2788285	2788290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294175
54017	NC_015183	CGC	2	6	2788377	2788382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294175
54018	NC_015183	CTT	2	6	2788467	2788472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294175
54019	NC_015183	CGCC	2	8	2788473	2788480	0 %	0 %	25 %	75 %	325294175
54020	NC_015183	CGTCGG	2	12	2788501	2788512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325294175
54021	NC_015183	GCA	2	6	2788529	2788534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294175
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54023	NC_015183	GGC	2	6	2788608	2788613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294175
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54028	NC_015183	GCATCG	2	12	2788772	2788783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325294175
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54030	NC_015183	CGG	4	12	2788862	2788873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294175
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54045	NC_015183	CG	3	6	2789820	2789825	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
54046	NC_015183	CCGTC	2	10	2789840	2789849	0 %	20 %	20 %	60 %	325294175
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54069	NC_015183	CTGC	2	8	2790600	2790607	0 %	25 %	25 %	50 %	325294175
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54099	NC_015183	GC	3	6	2791817	2791822	0 %	0 %	50 %	50 %	325294177
54100	NC_015183	GGC	2	6	2791849	2791854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294177
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54115	NC_015183	GACGA	2	10	2793043	2793052	40 %	0 %	40 %	20 %	325294178
54116	NC_015183	GTC	2	6	2793118	2793123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294178
54117	NC_015183	GGCG	2	8	2793246	2793253	0 %	0 %	75 %	25 %	325294178
54118	NC_015183	TGG	2	6	2793342	2793347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294179
54119	NC_015183	GCG	2	6	2793422	2793427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294179
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54122	NC_015183	GCA	2	6	2793479	2793484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294179
54123	NC_015183	GTC	2	6	2793551	2793556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294179
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54130	NC_015183	GAT	2	6	2793916	2793921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294179
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54145	NC_015183	GAC	2	6	2794477	2794482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294179
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54181	NC_015183	CGG	2	6	2796540	2796545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294181
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54200	NC_015183	GTCA	2	8	2797536	2797543	25 %	25 %	25 %	25 %	325294182
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54220	NC_015183	CGCA	2	8	2798399	2798406	25 %	0 %	25 %	50 %	325294184
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54227	NC_015183	TCG	2	6	2798649	2798654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54228	NC_015183	TGCC	2	8	2798660	2798667	0 %	25 %	25 %	50 %	325294184
54229	NC_015183	CAGCTT	2	12	2798744	2798755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325294184
54230	NC_015183	ATC	2	6	2798771	2798776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294184
54231	NC_015183	CAC	2	6	2798783	2798788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294184
54232	NC_015183	GGGT	2	8	2798793	2798800	0 %	25 %	75 %	0 %	325294184
54233	NC_015183	CCT	2	6	2798818	2798823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294184
54234	NC_015183	GATC	2	8	2798872	2798879	25 %	25 %	25 %	25 %	325294184
54235	NC_015183	CCG	2	6	2798950	2798955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294184
54236	NC_015183	TCG	2	6	2798967	2798972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54237	NC_015183	AAC	2	6	2798984	2798989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294184
54238	NC_015183	CAG	2	6	2799074	2799079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54239	NC_015183	GTC	2	6	2799125	2799130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54240	NC_015183	CGAA	2	8	2799148	2799155	50 %	0 %	25 %	25 %	325294184
54241	NC_015183	GCC	3	9	2799237	2799245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294184
54242	NC_015183	GC	5	10	2799250	2799259	0 %	0 %	50 %	50 %	325294184
54243	NC_015183	TGC	2	6	2799347	2799352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54244	NC_015183	GTC	2	6	2799381	2799386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54245	NC_015183	AGA	2	6	2799459	2799464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294184
54246	NC_015183	GT	3	6	2799493	2799498	0 %	50 %	50 %	0 %	325294184
54247	NC_015183	GTC	2	6	2799501	2799506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294184
54248	NC_015183	CCA	2	6	2799516	2799521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294185
54249	NC_015183	TGA	2	6	2799528	2799533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294185
54250	NC_015183	TCAG	2	8	2799548	2799555	25 %	25 %	25 %	25 %	325294185
54251	NC_015183	GTGA	2	8	2799595	2799602	25 %	25 %	50 %	0 %	325294185
54252	NC_015183	TCC	2	6	2799656	2799661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294185
54253	NC_015183	GGCGT	2	10	2799662	2799671	0 %	20 %	60 %	20 %	325294185
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54256	NC_015183	CGA	2	6	2799774	2799779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294185
54257	NC_015183	GAA	2	6	2799835	2799840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294185
54258	NC_015183	CGC	2	6	2799843	2799848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294185
54259	NC_015183	CGGT	2	8	2799935	2799942	0 %	25 %	50 %	25 %	325294185
54260	NC_015183	ATC	2	6	2799953	2799958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294185
54261	NC_015183	TCACC	2	10	2799960	2799969	20 %	20 %	0 %	60 %	325294185
54262	NC_015183	AACCGC	2	12	2799988	2799999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325294185
54263	NC_015183	CGA	2	6	2800020	2800025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294185
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54265	NC_015183	GC	3	6	2800071	2800076	0 %	0 %	50 %	50 %	325294185
54266	NC_015183	GCC	2	6	2800100	2800105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294185
54267	NC_015183	TGC	2	6	2800142	2800147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294185
54268	NC_015183	GCC	2	6	2800171	2800176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294185
54269	NC_015183	GCA	2	6	2800210	2800215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294185
54270	NC_015183	CAC	2	6	2800248	2800253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294185
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54272	NC_015183	ATG	2	6	2800346	2800351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294185
54273	NC_015183	CGA	2	6	2800418	2800423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294185
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54276	NC_015183	AACG	2	8	2800542	2800549	50 %	0 %	25 %	25 %	325294186
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54284	NC_015183	GCG	2	6	2800914	2800919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294186
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54300	NC_015183	GC	4	8	2801471	2801478	0 %	0 %	50 %	50 %	325294187
54301	NC_015183	GCAGC	2	10	2801521	2801530	20 %	0 %	40 %	40 %	325294187
54302	NC_015183	CGT	2	6	2801551	2801556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294187
54303	NC_015183	TGA	2	6	2801587	2801592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294187
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54305	NC_015183	AAGGC	2	10	2801703	2801712	40 %	0 %	40 %	20 %	325294187
54306	NC_015183	CTG	2	6	2801714	2801719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294187
54307	NC_015183	CGGC	2	8	2801736	2801743	0 %	0 %	50 %	50 %	325294187
54308	NC_015183	CGA	2	6	2801785	2801790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294187
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54310	NC_015183	GCT	2	6	2801881	2801886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294187
54311	NC_015183	AGT	2	6	2801890	2801895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294187
54312	NC_015183	GCT	2	6	2801971	2801976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294187
54313	NC_015183	AAT	2	6	2802013	2802018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294187
54314	NC_015183	GCG	2	6	2802040	2802045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294187
54315	NC_015183	CGAC	2	8	2802096	2802103	25 %	0 %	25 %	50 %	325294187
54316	NC_015183	TGG	2	6	2802106	2802111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294187
54317	NC_015183	ACGGC	2	10	2802318	2802327	20 %	0 %	40 %	40 %	325294187
54318	NC_015183	TAA	2	6	2802480	2802485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294188
54319	NC_015183	ACA	3	9	2802528	2802536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294188
54320	NC_015183	CGA	2	6	2802547	2802552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294188
54321	NC_015183	TGA	2	6	2802574	2802579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294188
54322	NC_015183	ACG	2	6	2802630	2802635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294188
54323	NC_015183	GC	3	6	2802733	2802738	0 %	0 %	50 %	50 %	325294188
54324	NC_015183	GGC	2	6	2802797	2802802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294188
54325	NC_015183	CTGCGA	2	12	2802839	2802850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325294188
54326	NC_015183	ACCGGC	2	12	2802929	2802940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325294188
54327	NC_015183	CCTT	2	8	2802966	2802973	0 %	50 %	0 %	50 %	325294188
54328	NC_015183	AGC	2	6	2802998	2803003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294188
54329	NC_015183	AGGA	2	8	2803035	2803042	50 %	0 %	50 %	0 %	325294188
54330	NC_015183	ATA	2	6	2803046	2803051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294188
54331	NC_015183	CGC	2	6	2803277	2803282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294188
54332	NC_015183	GAT	3	9	2803549	2803557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294189
54333	NC_015183	CGC	2	6	2803653	2803658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294189
54334	NC_015183	GCC	2	6	2803672	2803677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294189
54335	NC_015183	GGCTG	2	10	2803727	2803736	0 %	20 %	60 %	20 %	325294189
54336	NC_015183	GCA	2	6	2803841	2803846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294189
54337	NC_015183	CAGC	2	8	2803911	2803918	25 %	0 %	25 %	50 %	325294189
54338	NC_015183	ACC	2	6	2803925	2803930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294189
54339	NC_015183	TCA	2	6	2803982	2803987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294189
54340	NC_015183	CG	3	6	2804060	2804065	0 %	0 %	50 %	50 %	325294189
54341	NC_015183	GCCAC	2	10	2804081	2804090	20 %	0 %	20 %	60 %	325294189
54342	NC_015183	CAT	2	6	2804101	2804106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294189
54343	NC_015183	TGA	2	6	2804160	2804165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294189
54344	NC_015183	AGC	2	6	2804195	2804200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294189
54345	NC_015183	ACCGGC	2	12	2804207	2804218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325294189
54346	NC_015183	ACG	2	6	2804249	2804254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294189
54347	NC_015183	AGCA	2	8	2804263	2804270	50 %	0 %	25 %	25 %	325294189
54348	NC_015183	GCC	2	6	2804293	2804298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294189
54349	NC_015183	TGA	3	9	2804301	2804309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294189
54350	NC_015183	TTG	2	6	2804372	2804377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294189
54351	NC_015183	GAA	2	6	2804383	2804388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294189
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54353	NC_015183	GAT	2	6	2804455	2804460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294189
54354	NC_015183	CTT	2	6	2804491	2804496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294189
54355	NC_015183	CGGCC	2	10	2804534	2804543	0 %	0 %	40 %	60 %	325294190
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54358	NC_015183	TGA	2	6	2804672	2804677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294190
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54362	NC_015183	CG	3	6	2804780	2804785	0 %	0 %	50 %	50 %	325294190
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54364	NC_015183	CTG	2	6	2804820	2804825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294190
54365	NC_015183	AGC	2	6	2804839	2804844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294190
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54407	NC_015183	AC	3	6	2807348	2807353	50 %	0 %	0 %	50 %	325294192
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54449	NC_015183	CCA	2	6	2809217	2809222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294193
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54454	NC_015183	GC	4	8	2809398	2809405	0 %	0 %	50 %	50 %	325294193
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54457	NC_015183	GCT	2	6	2809551	2809556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294193
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54461	NC_015183	CAT	2	6	2809734	2809739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294193
54462	NC_015183	GCG	2	6	2809742	2809747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294193
54463	NC_015183	GGC	2	6	2809765	2809770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294193
54464	NC_015183	AGG	2	6	2809791	2809796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325294193
54465	NC_015183	CCA	2	6	2809824	2809829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294193
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54470	NC_015183	TGA	2	6	2809983	2809988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294193
54471	NC_015183	GA	3	6	2809991	2809996	50 %	0 %	50 %	0 %	325294193
54472	NC_015183	CAT	2	6	2810043	2810048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294193
54473	NC_015183	CCA	2	6	2810066	2810071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294193
54474	NC_015183	CCAT	2	8	2810102	2810109	25 %	25 %	0 %	50 %	325294193
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54476	NC_015183	CAG	2	6	2810194	2810199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294193
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54481	NC_015183	CTG	2	6	2810545	2810550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54482	NC_015183	GGT	2	6	2810632	2810637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294194
54483	NC_015183	CTC	2	6	2810665	2810670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294194
54484	NC_015183	GGAT	2	8	2810696	2810703	25 %	25 %	50 %	0 %	325294194
54485	NC_015183	CCG	2	6	2810718	2810723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54486	NC_015183	CAC	2	6	2810746	2810751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294194
54487	NC_015183	TCG	2	6	2810756	2810761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54488	NC_015183	CAT	2	6	2810874	2810879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294194
54489	NC_015183	CGG	2	6	2810900	2810905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294194
54490	NC_015183	CTGA	2	8	2810914	2810921	25 %	25 %	25 %	25 %	325294194
54491	NC_015183	GAC	2	6	2810972	2810977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54492	NC_015183	GCC	2	6	2811005	2811010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54493	NC_015183	TGC	2	6	2811040	2811045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54494	NC_015183	CCG	2	6	2811138	2811143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54495	NC_015183	GAT	2	6	2811166	2811171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294194
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54497	NC_015183	GAT	2	6	2811195	2811200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294194
54498	NC_015183	GCA	2	6	2811213	2811218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54499	NC_015183	CGGC	3	12	2811226	2811237	0 %	0 %	50 %	50 %	325294194
54500	NC_015183	TCA	2	6	2811242	2811247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294194

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