MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015183	TCG	2	6	2633378	2633383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294038
51002	NC_015183	TCG	2	6	2633456	2633461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294038
51003	NC_015183	ACCG	2	8	2633466	2633473	25 %	0 %	25 %	50 %	325294038
51004	NC_015183	CGGG	2	8	2633529	2633536	0 %	0 %	75 %	25 %	325294038
51005	NC_015183	TGA	2	6	2633546	2633551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294038
51006	NC_015183	TCA	2	6	2633612	2633617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294038
51007	NC_015183	GGGCA	2	10	2633659	2633668	20 %	0 %	60 %	20 %	325294038
51008	NC_015183	TCA	3	9	2633693	2633701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294038
51009	NC_015183	CAC	2	6	2633724	2633729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294038
51010	NC_015183	CCG	2	6	2633731	2633736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294038
51011	NC_015183	CAG	2	6	2633897	2633902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294038
51012	NC_015183	GACG	2	8	2634000	2634007	25 %	0 %	50 %	25 %	325294038
51013	NC_015183	CCG	2	6	2634083	2634088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294038
51014	NC_015183	GCC	2	6	2634296	2634301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294039
51015	NC_015183	TCG	2	6	2634471	2634476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294039
51016	NC_015183	CGG	2	6	2634508	2634513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294039
51017	NC_015183	GCC	2	6	2634515	2634520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294039
51018	NC_015183	TCA	2	6	2634660	2634665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294039
51019	NC_015183	ATCCG	2	10	2634703	2634712	20 %	20 %	20 %	40 %	325294039
51020	NC_015183	ATC	2	6	2634752	2634757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294039
51021	NC_015183	ATCGGC	2	12	2634770	2634781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325294039
51022	NC_015183	TCG	2	6	2634783	2634788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294039
51023	NC_015183	GCC	2	6	2634791	2634796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294039
51024	NC_015183	CAA	2	6	2634823	2634828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294039
51025	NC_015183	TCA	2	6	2634956	2634961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294040
51026	NC_015183	TCA	2	6	2634981	2634986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294040
51027	NC_015183	GCA	2	6	2635087	2635092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294040
51028	NC_015183	GTC	2	6	2635149	2635154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294040
51029	NC_015183	ACC	2	6	2635170	2635175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294040
51030	NC_015183	TGC	2	6	2635220	2635225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294040
51031	NC_015183	AGC	2	6	2635239	2635244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294040
51032	NC_015183	GCCT	2	8	2635287	2635294	0 %	25 %	25 %	50 %	325294040
51033	NC_015183	ACA	2	6	2635306	2635311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294040
51034	NC_015183	AGCGA	2	10	2635353	2635362	40 %	0 %	40 %	20 %	325294040
51035	NC_015183	GAA	2	6	2635373	2635378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294040
51036	NC_015183	CAA	2	6	2635406	2635411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294040
51037	NC_015183	CGC	2	6	2635433	2635438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294040
51038	NC_015183	GC	3	6	2635465	2635470	0 %	0 %	50 %	50 %	325294040
51039	NC_015183	GCCA	2	8	2635478	2635485	25 %	0 %	25 %	50 %	325294040
51040	NC_015183	CG	3	6	2635501	2635506	0 %	0 %	50 %	50 %	325294040
51041	NC_015183	GTT	2	6	2635530	2635535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294040
51042	NC_015183	CCA	2	6	2635554	2635559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294040
51043	NC_015183	CCG	2	6	2635809	2635814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294041
51044	NC_015183	AC	3	6	2635904	2635909	50 %	0 %	0 %	50 %	325294041
51045	NC_015183	GAT	2	6	2635957	2635962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294041
51046	NC_015183	CGA	3	9	2635977	2635985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294041
51047	NC_015183	GC	3	6	2636037	2636042	0 %	0 %	50 %	50 %	325294041
51048	NC_015183	AGAT	2	8	2636081	2636088	50 %	25 %	25 %	0 %	325294041
51049	NC_015183	GC	4	8	2636114	2636121	0 %	0 %	50 %	50 %	325294041
51050	NC_015183	AGACCG	2	12	2636249	2636260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294041
51051	NC_015183	ATC	2	6	2636273	2636278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294041
51052	NC_015183	AGC	2	6	2636291	2636296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294041
51053	NC_015183	ATC	2	6	2636345	2636350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294041
51054	NC_015183	GAT	2	6	2636473	2636478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294041
51055	NC_015183	TGG	2	6	2636742	2636747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294042
51056	NC_015183	CAG	2	6	2636790	2636795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294042
51057	NC_015183	CTT	2	6	2636797	2636802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294042
51058	NC_015183	AAC	2	6	2636875	2636880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294042
51059	NC_015183	ACCGC	2	10	2636933	2636942	20 %	0 %	20 %	60 %	325294042
51060	NC_015183	GC	3	6	2636941	2636946	0 %	0 %	50 %	50 %	325294042
51061	NC_015183	CGG	2	6	2636961	2636966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294042
51062	NC_015183	GCC	2	6	2637005	2637010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294042
51063	NC_015183	GTCG	2	8	2637034	2637041	0 %	25 %	50 %	25 %	325294042
51064	NC_015183	GC	3	6	2637074	2637079	0 %	0 %	50 %	50 %	325294042
51065	NC_015183	CGG	2	6	2637096	2637101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294042
51066	NC_015183	GGCC	2	8	2637132	2637139	0 %	0 %	50 %	50 %	325294042
51067	NC_015183	TCAGCC	2	12	2637143	2637154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325294042
51068	NC_015183	CGG	2	6	2637189	2637194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294042
51069	NC_015183	GCA	2	6	2637267	2637272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294042
51070	NC_015183	CG	3	6	2637372	2637377	0 %	0 %	50 %	50 %	325294042
51071	NC_015183	CGC	2	6	2637379	2637384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294042
51072	NC_015183	ACG	2	6	2637386	2637391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294042
51073	NC_015183	CTGCG	2	10	2637460	2637469	0 %	20 %	40 %	40 %	325294042
51074	NC_015183	CCTT	2	8	2637518	2637525	0 %	50 %	0 %	50 %	325294042
51075	NC_015183	GCG	2	6	2637566	2637571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294042
51076	NC_015183	GAAT	2	8	2637666	2637673	50 %	25 %	25 %	0 %	325294042
51077	NC_015183	GTC	2	6	2637793	2637798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294043
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51081	NC_015183	CG	3	6	2637906	2637911	0 %	0 %	50 %	50 %	325294043
51082	NC_015183	TGAT	2	8	2637941	2637948	25 %	50 %	25 %	0 %	325294043
51083	NC_015183	GCG	2	6	2638126	2638131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294043
51084	NC_015183	TTG	2	6	2638193	2638198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294043
51085	NC_015183	TCG	2	6	2638223	2638228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294043
51086	NC_015183	ACG	2	6	2638295	2638300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294043
51087	NC_015183	GCCCAT	2	12	2638405	2638416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325294043
51088	NC_015183	GA	3	6	2638523	2638528	50 %	0 %	50 %	0 %	325294043
51089	NC_015183	CTT	2	6	2638635	2638640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294043
51090	NC_015183	TCTCGA	2	12	2638656	2638667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325294043
51091	NC_015183	CG	3	6	2638683	2638688	0 %	0 %	50 %	50 %	325294043
51092	NC_015183	CGT	2	6	2638719	2638724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294043
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51094	NC_015183	CGGG	2	8	2638750	2638757	0 %	0 %	75 %	25 %	325294043
51095	NC_015183	GCT	2	6	2638769	2638774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294043
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51098	NC_015183	GAATAG	2	12	2639278	2639289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294044
51099	NC_015183	GCC	2	6	2639337	2639342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294044
51100	NC_015183	TTC	2	6	2639367	2639372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294044
51101	NC_015183	GCA	2	6	2639374	2639379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294044
51102	NC_015183	TTG	2	6	2639425	2639430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294044
51103	NC_015183	CCA	2	6	2639474	2639479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294044
51104	NC_015183	GAA	2	6	2639529	2639534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294044
51105	NC_015183	CTG	2	6	2639643	2639648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294044
51106	NC_015183	CTT	2	6	2639719	2639724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294044
51107	NC_015183	CCT	2	6	2640039	2640044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294045
51108	NC_015183	GTC	2	6	2640136	2640141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294045
51109	NC_015183	ATG	2	6	2640188	2640193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294045
51110	NC_015183	ATG	2	6	2640215	2640220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294045
51111	NC_015183	GCG	2	6	2640234	2640239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294045
51112	NC_015183	AAT	2	6	2640258	2640263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294045
51113	NC_015183	GCT	2	6	2640266	2640271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294045
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51115	NC_015183	TCA	2	6	2640300	2640305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294045
51116	NC_015183	GC	3	6	2640332	2640337	0 %	0 %	50 %	50 %	325294045
51117	NC_015183	ACG	2	6	2640338	2640343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294045
51118	NC_015183	CGTTCG	2	12	2640344	2640355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294045
51119	NC_015183	CAT	2	6	2640402	2640407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294045
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51122	NC_015183	CG	3	6	2640564	2640569	0 %	0 %	50 %	50 %	325294046
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51216	NC_015183	GAG	2	6	2645439	2645444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325294051
51217	NC_015183	GC	3	6	2645456	2645461	0 %	0 %	50 %	50 %	325294051
51218	NC_015183	CGA	2	6	2645479	2645484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294051
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51220	NC_015183	CGTCCT	2	12	2645588	2645599	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325294051
51221	NC_015183	GCC	2	6	2645613	2645618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294051
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51223	NC_015183	CTG	2	6	2645679	2645684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294051
51224	NC_015183	AT	3	6	2645705	2645710	50 %	50 %	0 %	0 %	325294051
51225	NC_015183	CCG	2	6	2645728	2645733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294051
51226	NC_015183	CGG	2	6	2645750	2645755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294051
51227	NC_015183	CAT	2	6	2645783	2645788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294051
51228	NC_015183	GTC	3	9	2645832	2645840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294051
51229	NC_015183	AAT	2	6	2645929	2645934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294051
51230	NC_015183	GAT	2	6	2646211	2646216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294052
51231	NC_015183	TCA	2	6	2646276	2646281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
51232	NC_015183	GCG	2	6	2646290	2646295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294052
51233	NC_015183	ACC	2	6	2646317	2646322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294052
51234	NC_015183	TTCT	2	8	2646398	2646405	0 %	75 %	0 %	25 %	325294052
51235	NC_015183	GCC	2	6	2646437	2646442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294052
51236	NC_015183	GCG	2	6	2646464	2646469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294052
51237	NC_015183	CGT	2	6	2646520	2646525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294052
51238	NC_015183	TTC	2	6	2646533	2646538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294052
51239	NC_015183	GC	3	6	2646558	2646563	0 %	0 %	50 %	50 %	325294052
51240	NC_015183	GAA	2	6	2646586	2646591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294052
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51242	NC_015183	ATC	2	6	2646641	2646646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
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51245	NC_015183	TGGC	2	8	2646789	2646796	0 %	25 %	50 %	25 %	325294052
51246	NC_015183	TCA	2	6	2646837	2646842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294052
51247	NC_015183	TCC	2	6	2646855	2646860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294052
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51258	NC_015183	GCC	2	6	2647905	2647910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294054
51259	NC_015183	CCA	2	6	2647925	2647930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294054
51260	NC_015183	TTC	2	6	2648017	2648022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294054
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51262	NC_015183	TCA	2	6	2648125	2648130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294054
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51283	NC_015183	TGCGGA	2	12	2649254	2649265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325294055
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51289	NC_015183	GTC	2	6	2649531	2649536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294055
51290	NC_015183	GTC	2	6	2649711	2649716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294055
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51294	NC_015183	GGT	2	6	2649930	2649935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294055
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51300	NC_015183	GGC	2	6	2650283	2650288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294055
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51312	NC_015183	CAGG	2	8	2650694	2650701	25 %	0 %	50 %	25 %	325294055
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51322	NC_015183	TGC	2	6	2651867	2651872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294056
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51339	NC_015183	CGGCC	2	10	2652700	2652709	0 %	0 %	40 %	60 %	325294057
51340	NC_015183	GC	3	6	2652723	2652728	0 %	0 %	50 %	50 %	325294057
51341	NC_015183	CTC	2	6	2652740	2652745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294057
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51343	NC_015183	TCGCC	2	10	2652882	2652891	0 %	20 %	20 %	60 %	325294057
51344	NC_015183	CGCC	2	8	2652963	2652970	0 %	0 %	25 %	75 %	325294057
51345	NC_015183	GGTG	2	8	2652988	2652995	0 %	25 %	75 %	0 %	325294057
51346	NC_015183	TTGCC	2	10	2653008	2653017	0 %	40 %	20 %	40 %	325294057
51347	NC_015183	GCG	2	6	2653020	2653025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294057
51348	NC_015183	TGC	2	6	2653047	2653052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294057
51349	NC_015183	GCG	2	6	2653097	2653102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294057
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51441	NC_015183	CGA	3	9	2657999	2658007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294064
51442	NC_015183	TG	3	6	2658023	2658028	0 %	50 %	50 %	0 %	325294064
51443	NC_015183	ATG	2	6	2658088	2658093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294064
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51448	NC_015183	GCCCG	2	10	2658290	2658299	0 %	0 %	40 %	60 %	325294064
51449	NC_015183	GCG	2	6	2658329	2658334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294064
51450	NC_015183	CGCT	2	8	2658355	2658362	0 %	25 %	25 %	50 %	325294064
51451	NC_015183	AGC	2	6	2658439	2658444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294064
51452	NC_015183	CATC	2	8	2658446	2658453	25 %	25 %	0 %	50 %	325294064
51453	NC_015183	TTC	2	6	2658504	2658509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294064
51454	NC_015183	ACAGCG	2	12	2658530	2658541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294064
51455	NC_015183	AAC	2	6	2658543	2658548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294064
51456	NC_015183	GCG	2	6	2658584	2658589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294064
51457	NC_015183	TCC	2	6	2658598	2658603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294064
51458	NC_015183	GCTTCG	2	12	2658700	2658711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294064
51459	NC_015183	GAAA	2	8	2658804	2658811	75 %	0 %	25 %	0 %	325294064
51460	NC_015183	T	6	6	2658816	2658821	0 %	100 %	0 %	0 %	325294064
51461	NC_015183	CCA	3	9	2658968	2658976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294065
51462	NC_015183	AACC	2	8	2659034	2659041	50 %	0 %	0 %	50 %	325294065
51463	NC_015183	CGC	2	6	2659092	2659097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294065
51464	NC_015183	CGC	2	6	2659137	2659142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294065
51465	NC_015183	TTC	2	6	2659197	2659202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294065
51466	NC_015183	TCGG	2	8	2659240	2659247	0 %	25 %	50 %	25 %	325294065
51467	NC_015183	CCGG	2	8	2659283	2659290	0 %	0 %	50 %	50 %	325294065
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51492	NC_015183	ATG	2	6	2660235	2660240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294066
51493	NC_015183	GC	3	6	2660333	2660338	0 %	0 %	50 %	50 %	325294066
51494	NC_015183	GGT	2	6	2660476	2660481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325294066
51495	NC_015183	A	6	6	2660539	2660544	100 %	0 %	0 %	0 %	325294066
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51497	NC_015183	GAAGGT	2	12	2660750	2660761	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325294066
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51500	NC_015183	TGATC	2	10	2660899	2660908	20 %	40 %	20 %	20 %	325294066

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