MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015138	CGC	2	6	140039	140044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3502	NC_015138	TTG	2	6	140058	140063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326314953
3503	NC_015138	GC	3	6	140176	140181	0 %	0 %	50 %	50 %	326314953
3504	NC_015138	GGCC	2	8	140218	140225	0 %	0 %	50 %	50 %	326314953
3505	NC_015138	CGG	2	6	140236	140241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3506	NC_015138	TGG	2	6	140254	140259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314953
3507	NC_015138	GCC	2	6	140303	140308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3508	NC_015138	CGC	2	6	140314	140319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3509	NC_015138	TGG	2	6	140326	140331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314953
3510	NC_015138	CCA	2	6	140425	140430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314953
3511	NC_015138	CAG	2	6	140453	140458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3512	NC_015138	AGGC	2	8	140476	140483	25 %	0 %	50 %	25 %	326314953
3513	NC_015138	GCG	2	6	140484	140489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3514	NC_015138	CCAG	2	8	140503	140510	25 %	0 %	25 %	50 %	326314953
3515	NC_015138	GCCCAG	2	12	140546	140557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326314953
3516	NC_015138	AGC	2	6	140568	140573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3517	NC_015138	GGC	2	6	140588	140593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3518	NC_015138	AGC	2	6	140613	140618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3519	NC_015138	GCA	2	6	140623	140628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3520	NC_015138	CG	3	6	140632	140637	0 %	0 %	50 %	50 %	326314953
3521	NC_015138	GGC	2	6	140672	140677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3522	NC_015138	TTG	2	6	140697	140702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326314953
3523	NC_015138	GCC	2	6	140703	140708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3524	NC_015138	ACC	2	6	140754	140759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314953
3525	NC_015138	CAC	2	6	140768	140773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314953
3526	NC_015138	GGC	2	6	140775	140780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3527	NC_015138	GAT	2	6	140855	140860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314953
3528	NC_015138	GCC	2	6	140861	140866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3529	NC_015138	CGGGCC	2	12	140891	140902	0 %	0 %	50 %	50 %	326314953
3530	NC_015138	GGC	2	6	140915	140920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3531	NC_015138	CAC	2	6	140924	140929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314953
3532	NC_015138	GCC	2	6	140972	140977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3533	NC_015138	GAA	2	6	140987	140992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314953
3534	NC_015138	TCA	2	6	141013	141018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314953
3535	NC_015138	TGC	2	6	141090	141095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3536	NC_015138	GGC	2	6	141104	141109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3537	NC_015138	TCG	2	6	141132	141137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3538	NC_015138	CGG	2	6	141157	141162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314953
3539	NC_015138	GCC	2	6	141172	141177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3540	NC_015138	GAA	2	6	141192	141197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314953
3541	NC_015138	GCG	2	6	141457	141462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3542	NC_015138	GGGCC	2	10	141491	141500	0 %	0 %	60 %	40 %	326314954
3543	NC_015138	GCG	2	6	141517	141522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3544	NC_015138	GGC	2	6	141548	141553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3545	NC_015138	TGG	3	9	141567	141575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314954
3546	NC_015138	CGA	2	6	141584	141589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3547	NC_015138	GC	3	6	141602	141607	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3548	NC_015138	CTG	2	6	141627	141632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3549	NC_015138	GTG	3	9	141642	141650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314954
3550	NC_015138	CTG	2	6	141669	141674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3551	NC_015138	TGC	2	6	141691	141696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3552	NC_015138	AGG	2	6	141715	141720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314954
3553	NC_015138	CGG	2	6	141730	141735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3554	NC_015138	GC	3	6	141753	141758	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3555	NC_015138	CTG	2	6	141768	141773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3556	NC_015138	GCGGCT	2	12	141794	141805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326314954
3557	NC_015138	CGGCC	2	10	141869	141878	0 %	0 %	40 %	60 %	326314954
3558	NC_015138	GC	3	6	141917	141922	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3559	NC_015138	CGGC	2	8	141947	141954	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3560	NC_015138	CGG	2	6	141974	141979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3561	NC_015138	GGC	2	6	142003	142008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3562	NC_015138	GCT	2	6	142019	142024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3563	NC_015138	CGC	2	6	142042	142047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3564	NC_015138	CG	3	6	142049	142054	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3565	NC_015138	GC	3	6	142091	142096	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3566	NC_015138	CGGC	2	8	142105	142112	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3567	NC_015138	GCG	2	6	142126	142131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3568	NC_015138	GCTC	2	8	142174	142181	0 %	25 %	25 %	50 %	326314954
3569	NC_015138	TGG	2	6	142201	142206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314954
3570	NC_015138	TCGA	2	8	142229	142236	25 %	25 %	25 %	25 %	326314954
3571	NC_015138	GCCAG	2	10	142246	142255	20 %	0 %	40 %	40 %	326314954
3572	NC_015138	CGA	2	6	142283	142288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3573	NC_015138	GCC	2	6	142371	142376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3574	NC_015138	GGC	2	6	142401	142406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3575	NC_015138	CGG	2	6	142457	142462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3576	NC_015138	TGG	2	6	142570	142575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314954
3577	NC_015138	CGT	2	6	142580	142585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314954
3578	NC_015138	CGG	2	6	142604	142609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3579	NC_015138	GCC	2	6	142637	142642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3580	NC_015138	CGC	2	6	142643	142648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3581	NC_015138	CTGG	2	8	142650	142657	0 %	25 %	50 %	25 %	326314954
3582	NC_015138	CGC	2	6	142658	142663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3583	NC_015138	GGT	2	6	142673	142678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314954
3584	NC_015138	GC	4	8	142705	142712	0 %	0 %	50 %	50 %	326314954
3585	NC_015138	GCG	2	6	142727	142732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3586	NC_015138	CGG	2	6	142739	142744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3587	NC_015138	AGA	2	6	142745	142750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314954
3588	NC_015138	CAGG	2	8	142751	142758	25 %	0 %	50 %	25 %	326314954
3589	NC_015138	GCC	2	6	142760	142765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3590	NC_015138	CAC	2	6	142768	142773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314954
3591	NC_015138	GCC	2	6	142774	142779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3592	NC_015138	GCC	2	6	142781	142786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314954
3593	NC_015138	CGG	2	6	142791	142796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314954
3594	NC_015138	GTC	3	9	142880	142888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3595	NC_015138	TG	3	6	142897	142902	0 %	50 %	50 %	0 %	326314955
3596	NC_015138	CGGC	2	8	142903	142910	0 %	0 %	50 %	50 %	326314955
3597	NC_015138	CGG	2	6	142915	142920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3598	NC_015138	GCC	2	6	142959	142964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314955
3599	NC_015138	GGCCG	2	10	142967	142976	0 %	0 %	60 %	40 %	326314955
3600	NC_015138	CG	3	6	142991	142996	0 %	0 %	50 %	50 %	326314955
3601	NC_015138	TGC	2	6	143035	143040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3602	NC_015138	GGC	2	6	143084	143089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3603	NC_015138	TGC	2	6	143102	143107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3604	NC_015138	GCA	2	6	143136	143141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3605	NC_015138	GCG	2	6	143142	143147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3606	NC_015138	GGCGCA	2	12	143160	143171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326314955
3607	NC_015138	GC	3	6	143172	143177	0 %	0 %	50 %	50 %	326314955
3608	NC_015138	CTG	3	9	143231	143239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3609	NC_015138	GCG	3	9	143253	143261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3610	NC_015138	TCC	2	6	143265	143270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326314955
3611	NC_015138	GCG	2	6	143277	143282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3612	NC_015138	CTG	2	6	143285	143290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3613	NC_015138	CG	3	6	143350	143355	0 %	0 %	50 %	50 %	326314955
3614	NC_015138	GGC	2	6	143357	143362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3615	NC_015138	CTG	2	6	143399	143404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314955
3616	NC_015138	TGG	2	6	143419	143424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314955
3617	NC_015138	CCA	2	6	143437	143442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314955
3618	NC_015138	CGTGCC	2	12	143447	143458	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326314955
3619	NC_015138	GCC	2	6	143502	143507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314955
3620	NC_015138	GC	4	8	143527	143534	0 %	0 %	50 %	50 %	326314955
3621	NC_015138	GGC	2	6	143582	143587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314955
3622	NC_015138	GAT	2	6	143648	143653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314955
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3624	NC_015138	ACC	2	6	143700	143705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314955
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3654	NC_015138	GGT	2	6	144977	144982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314956
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3733	NC_015138	AG	4	8	148166	148173	50 %	0 %	50 %	0 %	326314958
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3739	NC_015138	CGTC	2	8	148541	148548	0 %	25 %	25 %	50 %	326314958
3740	NC_015138	GGCGT	2	10	148552	148561	0 %	20 %	60 %	20 %	326314958
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3743	NC_015138	GCA	2	6	148736	148741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314959
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3745	NC_015138	CGA	2	6	148850	148855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314959
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3849	NC_015138	CGC	2	6	152432	152437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314963
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3853	NC_015138	G	8	8	152846	152853	0 %	0 %	100 %	0 %	326314964
3854	NC_015138	GCA	2	6	152941	152946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314964
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3858	NC_015138	CGCC	2	8	153013	153020	0 %	0 %	25 %	75 %	326314964
3859	NC_015138	TGC	2	6	153093	153098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314964
3860	NC_015138	GCC	2	6	153127	153132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314964
3861	NC_015138	CGC	2	6	153154	153159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314964
3862	NC_015138	GCC	2	6	153168	153173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314964
3863	NC_015138	GCA	2	6	153205	153210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314964
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3865	NC_015138	G	6	6	153272	153277	0 %	0 %	100 %	0 %	326314964
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3986	NC_015138	GCCAC	2	10	157532	157541	20 %	0 %	20 %	60 %	326314967
3987	NC_015138	AGC	2	6	157544	157549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314967
3988	NC_015138	CTT	2	6	157553	157558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314967
3989	NC_015138	GTA	3	9	157581	157589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314967
3990	NC_015138	AGC	2	6	157618	157623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314967
3991	NC_015138	CGG	2	6	157697	157702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314967
3992	NC_015138	CAGGTG	2	12	157713	157724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326314967
3993	NC_015138	GCC	2	6	157736	157741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314967
3994	NC_015138	CGG	2	6	157742	157747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314967
3995	NC_015138	TGCC	3	12	157763	157774	0 %	25 %	25 %	50 %	326314967
3996	NC_015138	GTC	2	6	157782	157787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314967
3997	NC_015138	CGC	2	6	157827	157832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314967
3998	NC_015138	CG	3	6	157838	157843	0 %	0 %	50 %	50 %	326314967
3999	NC_015138	GGC	2	6	157856	157861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314967
4000	NC_015138	GCA	2	6	157871	157876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314967

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