MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015138	CAG	2	6	117945	117950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314924
3002	NC_015138	GCG	2	6	117971	117976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314924
3003	NC_015138	CCA	2	6	118019	118024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314924
3004	NC_015138	GCA	2	6	118025	118030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314924
3005	NC_015138	CCGT	2	8	118040	118047	0 %	25 %	25 %	50 %	326314924
3006	NC_015138	GAT	2	6	118095	118100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314924
3007	NC_015138	GGC	2	6	118119	118124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314924
3008	NC_015138	CGC	2	6	118131	118136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314924
3009	NC_015138	G	6	6	118160	118165	0 %	0 %	100 %	0 %	326314924
3010	NC_015138	ATC	2	6	118177	118182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314924
3011	NC_015138	GCA	2	6	118236	118241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314925
3012	NC_015138	ACAGCG	2	12	118269	118280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314925
3013	NC_015138	CCG	2	6	118281	118286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314925
3014	NC_015138	CACC	2	8	118311	118318	25 %	0 %	0 %	75 %	326314925
3015	NC_015138	CGGCG	2	10	118351	118360	0 %	0 %	60 %	40 %	326314925
3016	NC_015138	CAG	2	6	118399	118404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314925
3017	NC_015138	CCA	2	6	118417	118422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314925
3018	NC_015138	CAG	2	6	118426	118431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314925
3019	NC_015138	GGCG	2	8	118482	118489	0 %	0 %	75 %	25 %	326314925
3020	NC_015138	CGG	2	6	118505	118510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314925
3021	NC_015138	GCC	2	6	118543	118548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314926
3022	NC_015138	CAG	3	9	118555	118563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314926
3023	NC_015138	GCTCCT	2	12	118614	118625	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	326314926
3024	NC_015138	CAC	2	6	118654	118659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314926
3025	NC_015138	GTG	2	6	118661	118666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314926
3026	NC_015138	GC	3	6	118704	118709	0 %	0 %	50 %	50 %	326314926
3027	NC_015138	CGA	2	6	118731	118736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314926
3028	NC_015138	C	7	7	118936	118942	0 %	0 %	0 %	100 %	326314927
3029	NC_015138	GC	3	6	118943	118948	0 %	0 %	50 %	50 %	326314927
3030	NC_015138	CAG	2	6	118990	118995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314927
3031	NC_015138	CAC	2	6	119017	119022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314927
3032	NC_015138	CCAG	2	8	119034	119041	25 %	0 %	25 %	50 %	326314927
3033	NC_015138	CTGCAG	2	12	119068	119079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326314927
3034	NC_015138	CG	3	6	119124	119129	0 %	0 %	50 %	50 %	326314927
3035	NC_015138	GCG	3	9	119127	119135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314927
3036	NC_015138	GGC	2	6	119192	119197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314927
3037	NC_015138	GGC	2	6	119324	119329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314927
3038	NC_015138	GAA	2	6	119347	119352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314927
3039	NC_015138	CGCC	2	8	119376	119383	0 %	0 %	25 %	75 %	326314927
3040	NC_015138	ATCC	2	8	119399	119406	25 %	25 %	0 %	50 %	326314927
3041	NC_015138	GC	3	6	119485	119490	0 %	0 %	50 %	50 %	326314927
3042	NC_015138	CGG	2	6	119634	119639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314928
3043	NC_015138	CG	3	6	119649	119654	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3044	NC_015138	GCT	2	6	119682	119687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3045	NC_015138	GCG	2	6	119701	119706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314928
3046	NC_015138	CGC	2	6	119730	119735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314928
3047	NC_015138	CAG	2	6	119754	119759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3048	NC_015138	CTG	2	6	119763	119768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3049	NC_015138	GGT	2	6	119784	119789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314928
3050	NC_015138	CG	3	6	119843	119848	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3051	NC_015138	CG	3	6	119921	119926	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3052	NC_015138	GGCGCT	2	12	119949	119960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326314928
3053	NC_015138	TTC	2	6	119967	119972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314928
3054	NC_015138	CGT	2	6	120032	120037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3055	NC_015138	GC	4	8	120065	120072	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3056	NC_015138	AGC	2	6	120073	120078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3057	NC_015138	CG	3	6	120152	120157	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3058	NC_015138	CCA	2	6	120194	120199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314928
3059	NC_015138	G	6	6	120223	120228	0 %	0 %	100 %	0 %	326314928
3060	NC_015138	CG	4	8	120237	120244	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3061	NC_015138	CGG	2	6	120246	120251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314928
3062	NC_015138	GC	3	6	120373	120378	0 %	0 %	50 %	50 %	326314928
3063	NC_015138	TGC	2	6	120387	120392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314928
3064	NC_015138	GCG	2	6	120410	120415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314928
3065	NC_015138	CCA	2	6	120434	120439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314928
3066	NC_015138	GCGGT	2	10	120467	120476	0 %	20 %	60 %	20 %	326314928
3067	NC_015138	GGCA	2	8	120483	120490	25 %	0 %	50 %	25 %	326314928
3068	NC_015138	CGG	2	6	120498	120503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314928
3069	NC_015138	CGC	2	6	120607	120612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3070	NC_015138	CACGC	2	10	120623	120632	20 %	0 %	20 %	60 %	326314929
3071	NC_015138	CTC	2	6	120679	120684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326314929
3072	NC_015138	CTT	2	6	120688	120693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314929
3073	NC_015138	CTG	3	9	120698	120706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3074	NC_015138	CCG	2	6	120707	120712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3075	NC_015138	CTG	2	6	120764	120769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3076	NC_015138	TTC	2	6	120779	120784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314929
3077	NC_015138	GC	3	6	120837	120842	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3078	NC_015138	TTC	2	6	120854	120859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314929
3079	NC_015138	GGC	2	6	120925	120930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314929
3080	NC_015138	CAA	2	6	120988	120993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326314929
3081	NC_015138	CTGGG	2	10	121052	121061	0 %	20 %	60 %	20 %	326314929
3082	NC_015138	GGCG	2	8	121110	121117	0 %	0 %	75 %	25 %	326314929
3083	NC_015138	GCG	2	6	121128	121133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314929
3084	NC_015138	CTG	2	6	121136	121141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3085	NC_015138	CAT	2	6	121159	121164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314929
3086	NC_015138	CGA	2	6	121186	121191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3087	NC_015138	CCG	2	6	121192	121197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3088	NC_015138	CGC	2	6	121213	121218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3089	NC_015138	GCC	2	6	121235	121240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3090	NC_015138	TTC	3	9	121313	121321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314929
3091	NC_015138	ACC	2	6	121325	121330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314929
3092	NC_015138	AGA	2	6	121374	121379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314929
3093	NC_015138	GTC	2	6	121412	121417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3094	NC_015138	GCC	2	6	121439	121444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3095	NC_015138	TGG	2	6	121449	121454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314929
3096	NC_015138	CGG	2	6	121456	121461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314929
3097	NC_015138	GGCC	2	8	121468	121475	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3098	NC_015138	CTGC	2	8	121507	121514	0 %	25 %	25 %	50 %	326314929
3099	NC_015138	TGC	2	6	121527	121532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3100	NC_015138	CGC	2	6	121537	121542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3101	NC_015138	CTG	2	6	121553	121558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3102	NC_015138	GCC	2	6	121568	121573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314929
3103	NC_015138	GGCG	2	8	121591	121598	0 %	0 %	75 %	25 %	326314929
3104	NC_015138	GGCC	2	8	121612	121619	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3105	NC_015138	CG	3	6	121623	121628	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3106	NC_015138	TCA	2	6	121635	121640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314929
3107	NC_015138	GC	3	6	121642	121647	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3108	NC_015138	C	6	6	121652	121657	0 %	0 %	0 %	100 %	326314929
3109	NC_015138	TCT	2	6	121767	121772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314929
3110	NC_015138	CGG	2	6	121809	121814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314929
3111	NC_015138	CGT	2	6	121816	121821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314929
3112	NC_015138	GC	5	10	121844	121853	0 %	0 %	50 %	50 %	326314929
3113	NC_015138	CGG	2	6	121946	121951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3114	NC_015138	TGCG	2	8	121968	121975	0 %	25 %	50 %	25 %	326314930
3115	NC_015138	GCGG	2	8	121985	121992	0 %	0 %	75 %	25 %	326314930
3116	NC_015138	TGC	2	6	121999	122004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314930
3117	NC_015138	CTG	2	6	122016	122021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314930
3118	NC_015138	GGC	2	6	122042	122047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3119	NC_015138	TGGG	2	8	122052	122059	0 %	25 %	75 %	0 %	326314930
3120	NC_015138	TGC	2	6	122131	122136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314930
3121	NC_015138	GCG	2	6	122140	122145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3122	NC_015138	GCG	2	6	122327	122332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3123	NC_015138	GAA	2	6	122334	122339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314930
3124	NC_015138	CTGCG	2	10	122346	122355	0 %	20 %	40 %	40 %	326314930
3125	NC_015138	CGG	2	6	122360	122365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3126	NC_015138	GGT	2	6	122384	122389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314930
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3128	NC_015138	CG	3	6	122433	122438	0 %	0 %	50 %	50 %	326314930
3129	NC_015138	CGC	2	6	122488	122493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314930
3130	NC_015138	GCC	2	6	122499	122504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314930
3131	NC_015138	GGC	2	6	122509	122514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
3132	NC_015138	C	6	6	122544	122549	0 %	0 %	0 %	100 %	326314930
3133	NC_015138	GGC	2	6	122588	122593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314930
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3135	NC_015138	TCG	2	6	122671	122676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314930
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3137	NC_015138	GCGCC	2	10	122716	122725	0 %	0 %	40 %	60 %	326314930
3138	NC_015138	TGGC	2	8	122790	122797	0 %	25 %	50 %	25 %	326314930
3139	NC_015138	CG	3	6	122872	122877	0 %	0 %	50 %	50 %	326314931
3140	NC_015138	GCTG	2	8	122882	122889	0 %	25 %	50 %	25 %	326314931
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3143	NC_015138	GGCCCC	2	12	122991	123002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314931
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3154	NC_015138	CTT	2	6	123801	123806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326314932
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3161	NC_015138	GCAG	2	8	123996	124003	25 %	0 %	50 %	25 %	326314932
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3233	NC_015138	T	6	6	128190	128195	0 %	100 %	0 %	0 %	326314938
3234	NC_015138	AGT	2	6	128384	128389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314938
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3240	NC_015138	GCG	2	6	128835	128840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314938
3241	NC_015138	TGT	2	6	129014	129019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326314939
3242	NC_015138	TGG	3	9	129072	129080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314939
3243	NC_015138	GGA	2	6	129087	129092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314939
3244	NC_015138	TCG	2	6	129184	129189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314939
3245	NC_015138	CCA	2	6	129191	129196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314939
3246	NC_015138	ACG	2	6	129241	129246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314939
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3248	NC_015138	TGAA	2	8	129806	129813	50 %	25 %	25 %	0 %	326314940
3249	NC_015138	TCG	2	6	129827	129832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314940
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3252	NC_015138	TGC	2	6	130075	130080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314941
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3262	NC_015138	TCG	3	9	130400	130408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314942
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3350	NC_015138	GACC	2	8	134283	134290	25 %	0 %	25 %	50 %	326314946
3351	NC_015138	CG	3	6	134294	134299	0 %	0 %	50 %	50 %	326314946
3352	NC_015138	GC	4	8	134325	134332	0 %	0 %	50 %	50 %	326314946
3353	NC_015138	CGG	2	6	134381	134386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314946
3354	NC_015138	CGGCG	2	10	134441	134450	0 %	0 %	60 %	40 %	326314947
3355	NC_015138	CTG	2	6	134451	134456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314947
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3360	NC_015138	GCG	2	6	134682	134687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3361	NC_015138	GCA	2	6	134698	134703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314947
3362	NC_015138	GCAC	2	8	134748	134755	25 %	0 %	25 %	50 %	326314947
3363	NC_015138	GC	3	6	134818	134823	0 %	0 %	50 %	50 %	326314947
3364	NC_015138	CGG	2	6	134861	134866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3365	NC_015138	CGA	2	6	134924	134929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314947
3366	NC_015138	GCC	2	6	134949	134954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314947
3367	NC_015138	GCG	2	6	135023	135028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3368	NC_015138	GCGGT	2	10	135076	135085	0 %	20 %	60 %	20 %	326314947
3369	NC_015138	GC	5	10	135093	135102	0 %	0 %	50 %	50 %	326314947
3370	NC_015138	GCGCA	2	10	135132	135141	20 %	0 %	40 %	40 %	326314947
3371	NC_015138	CGG	2	6	135193	135198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3372	NC_015138	GCT	2	6	135200	135205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314947
3373	NC_015138	GGC	2	6	135212	135217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
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3375	NC_015138	GGC	2	6	135257	135262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3376	NC_015138	GGC	2	6	135278	135283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3377	NC_015138	GGCG	2	8	135287	135294	0 %	0 %	75 %	25 %	326314947
3378	NC_015138	CG	3	6	135293	135298	0 %	0 %	50 %	50 %	326314947
3379	NC_015138	GTGC	2	8	135299	135306	0 %	25 %	50 %	25 %	326314947
3380	NC_015138	CGA	2	6	135308	135313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314947
3381	NC_015138	CG	3	6	135362	135367	0 %	0 %	50 %	50 %	326314947
3382	NC_015138	GCG	2	6	135372	135377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314947
3383	NC_015138	CGA	2	6	135416	135421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314947
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3387	NC_015138	GCC	2	6	135513	135518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314948
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3393	NC_015138	CTG	2	6	135644	135649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314948
3394	NC_015138	CCG	2	6	135679	135684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314948
3395	NC_015138	ATC	2	6	135701	135706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314948
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3397	NC_015138	CCG	2	6	135765	135770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314948
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3472	NC_015138	CG	4	8	138847	138854	0 %	0 %	50 %	50 %	326314951
3473	NC_015138	GCG	2	6	138870	138875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314951
3474	NC_015138	GAAG	2	8	138935	138942	50 %	0 %	50 %	0 %	326314951
3475	NC_015138	GCCCCT	2	12	139177	139188	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	326314952
3476	NC_015138	GCC	2	6	139192	139197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314952
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3478	NC_015138	ACC	2	6	139210	139215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314952
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3480	NC_015138	GC	3	6	139224	139229	0 %	0 %	50 %	50 %	326314952
3481	NC_015138	CGG	2	6	139232	139237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314952
3482	NC_015138	GCT	2	6	139337	139342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314952
3483	NC_015138	GCACCG	2	12	139343	139354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326314952
3484	NC_015138	CCGC	2	8	139367	139374	0 %	0 %	25 %	75 %	326314952
3485	NC_015138	GGGC	2	8	139439	139446	0 %	0 %	75 %	25 %	326314952
3486	NC_015138	GCGCG	2	10	139465	139474	0 %	0 %	60 %	40 %	326314952
3487	NC_015138	TGG	2	6	139507	139512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314952
3488	NC_015138	CGC	2	6	139537	139542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314952
3489	NC_015138	GCG	3	9	139594	139602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314952
3490	NC_015138	CATG	2	8	139623	139630	25 %	25 %	25 %	25 %	326314952
3491	NC_015138	GCT	2	6	139655	139660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314952
3492	NC_015138	CGCGC	2	10	139701	139710	0 %	0 %	40 %	60 %	326314952
3493	NC_015138	GCCC	2	8	139724	139731	0 %	0 %	25 %	75 %	326314952
3494	NC_015138	TCC	2	6	139821	139826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326314952
3495	NC_015138	TCTGG	2	10	139865	139874	0 %	40 %	40 %	20 %	326314952
3496	NC_015138	GCT	2	6	139877	139882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314952
3497	NC_015138	GCCGC	2	10	139916	139925	0 %	0 %	40 %	60 %	326314953
3498	NC_015138	CAG	2	6	139931	139936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314953
3499	NC_015138	GCC	2	6	139976	139981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314953
3500	NC_015138	GAT	2	6	140024	140029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314953

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