MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015138	GCCGT	2	10	440346	440355	0 %	20 %	40 %	40 %	326315215
11002	NC_015138	TGC	2	6	440491	440496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315215
11003	NC_015138	GCT	2	6	440501	440506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315215
11004	NC_015138	CTGC	2	8	440513	440520	0 %	25 %	25 %	50 %	326315215
11005	NC_015138	CGC	2	6	440579	440584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315215
11006	NC_015138	CCG	2	6	440608	440613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315215
11007	NC_015138	CGGCC	2	10	440624	440633	0 %	0 %	40 %	60 %	326315215
11008	NC_015138	CG	3	6	440662	440667	0 %	0 %	50 %	50 %	326315215
11009	NC_015138	TCG	2	6	440674	440679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315215
11010	NC_015138	GGC	2	6	440690	440695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315215
11011	NC_015138	GCT	3	9	440696	440704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315215
11012	NC_015138	GCCGC	3	15	440714	440728	0 %	0 %	40 %	60 %	326315215
11013	NC_015138	TGC	4	12	440734	440745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315215
11014	NC_015138	CCTGG	2	10	440813	440822	0 %	20 %	40 %	40 %	326315215
11015	NC_015138	GGCT	2	8	440868	440875	0 %	25 %	50 %	25 %	326315215
11016	NC_015138	GTG	2	6	440901	440906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315215
11017	NC_015138	GCC	2	6	440920	440925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315215
11018	NC_015138	GC	4	8	440937	440944	0 %	0 %	50 %	50 %	326315215
11019	NC_015138	CCT	2	6	440953	440958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315215
11020	NC_015138	CTA	2	6	440999	441004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315216
11021	NC_015138	CGCC	2	8	441005	441012	0 %	0 %	25 %	75 %	326315216
11022	NC_015138	TCT	2	6	441019	441024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315216
11023	NC_015138	CAC	2	6	441063	441068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315216
11024	NC_015138	AGG	2	6	441076	441081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315216
11025	NC_015138	GC	3	6	441099	441104	0 %	0 %	50 %	50 %	326315216
11026	NC_015138	GCGG	2	8	441174	441181	0 %	0 %	75 %	25 %	326315216
11027	NC_015138	GTC	2	6	441192	441197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315216
11028	NC_015138	CGA	2	6	441242	441247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315216
11029	NC_015138	GGT	2	6	441278	441283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315216
11030	NC_015138	CCG	2	6	441300	441305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315216
11031	NC_015138	CGGC	2	8	441446	441453	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11032	NC_015138	GCC	2	6	441478	441483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315217
11033	NC_015138	GCG	2	6	441494	441499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315217
11034	NC_015138	CG	3	6	441503	441508	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11035	NC_015138	CCCATC	2	12	441524	441535	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	326315217
11036	NC_015138	CGG	2	6	441543	441548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315217
11037	NC_015138	ACA	2	6	441557	441562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315217
11038	NC_015138	TCG	2	6	441590	441595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11039	NC_015138	CGG	2	6	441636	441641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315217
11040	NC_015138	ACG	2	6	441656	441661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11041	NC_015138	GAC	2	6	441679	441684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11042	NC_015138	CGCC	2	8	441710	441717	0 %	0 %	25 %	75 %	326315217
11043	NC_015138	GC	3	6	441788	441793	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11044	NC_015138	GC	3	6	441804	441809	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11045	NC_015138	GCC	2	6	441826	441831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315217
11046	NC_015138	GCCG	2	8	441855	441862	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11047	NC_015138	GTC	2	6	441883	441888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11048	NC_015138	GAC	2	6	441901	441906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11049	NC_015138	GC	3	6	441937	441942	0 %	0 %	50 %	50 %	326315217
11050	NC_015138	CGG	3	9	441972	441980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315217
11051	NC_015138	TTTC	2	8	441984	441991	0 %	75 %	0 %	25 %	326315217
11052	NC_015138	GCT	2	6	442005	442010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315217
11053	NC_015138	ATGC	2	8	442140	442147	25 %	25 %	25 %	25 %	326315218
11054	NC_015138	TCCT	2	8	442158	442165	0 %	50 %	0 %	50 %	326315218
11055	NC_015138	CTG	2	6	442170	442175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11056	NC_015138	GCC	3	9	442191	442199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11057	NC_015138	CTG	2	6	442207	442212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11058	NC_015138	C	6	6	442234	442239	0 %	0 %	0 %	100 %	326315218
11059	NC_015138	GCC	2	6	442241	442246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11060	NC_015138	CGC	2	6	442253	442258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11061	NC_015138	GC	3	6	442257	442262	0 %	0 %	50 %	50 %	326315218
11062	NC_015138	CTG	3	9	442269	442277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11063	NC_015138	GCC	2	6	442302	442307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11064	NC_015138	CCT	2	6	442493	442498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315218
11065	NC_015138	GTGG	2	8	442554	442561	0 %	25 %	75 %	0 %	326315218
11066	NC_015138	GAA	2	6	442616	442621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315218
11067	NC_015138	CCA	2	6	442741	442746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315218
11068	NC_015138	CGC	2	6	442768	442773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11069	NC_015138	GCT	2	6	442799	442804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11070	NC_015138	CGGC	2	8	442852	442859	0 %	0 %	50 %	50 %	326315218
11071	NC_015138	GCC	2	6	442909	442914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11072	NC_015138	CGAG	2	8	442939	442946	25 %	0 %	50 %	25 %	326315218
11073	NC_015138	CG	3	6	442949	442954	0 %	0 %	50 %	50 %	326315218
11074	NC_015138	GCT	2	6	442973	442978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11075	NC_015138	ACG	2	6	442999	443004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11076	NC_015138	CGG	2	6	443021	443026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315218
11077	NC_015138	TCG	2	6	443098	443103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11078	NC_015138	CCG	2	6	443122	443127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315218
11079	NC_015138	C	6	6	443170	443175	0 %	0 %	0 %	100 %	326315218
11080	NC_015138	CAG	2	6	443223	443228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315218
11081	NC_015138	TGG	2	6	443245	443250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315218
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11083	NC_015138	ACG	2	6	443594	443599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315219
11084	NC_015138	AAG	2	6	443603	443608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315219
11085	NC_015138	CGG	2	6	443677	443682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315219
11086	NC_015138	GTG	2	6	443711	443716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315219
11087	NC_015138	CGG	2	6	443725	443730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315219
11088	NC_015138	CGTG	2	8	443767	443774	0 %	25 %	50 %	25 %	326315219
11089	NC_015138	AAG	2	6	443834	443839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315219
11090	NC_015138	CGT	2	6	444025	444030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315220
11091	NC_015138	GGC	2	6	444115	444120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315220
11092	NC_015138	AAG	2	6	444121	444126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315220
11093	NC_015138	CAT	2	6	444141	444146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315220
11094	NC_015138	AGA	2	6	444170	444175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315220
11095	NC_015138	CAA	2	6	444219	444224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315220
11096	NC_015138	TGG	2	6	444236	444241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315220
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11099	NC_015138	GCC	2	6	444305	444310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315220
11100	NC_015138	GCC	2	6	444340	444345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315220
11101	NC_015138	GCG	2	6	444353	444358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315220
11102	NC_015138	GCT	2	6	444390	444395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315220
11103	NC_015138	GGC	2	6	444415	444420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315220
11104	NC_015138	CAA	2	6	444462	444467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315220
11105	NC_015138	CAT	2	6	444571	444576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315221
11106	NC_015138	ACG	2	6	444647	444652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315221
11107	NC_015138	ACG	2	6	444705	444710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315221
11108	NC_015138	TGGA	2	8	444728	444735	25 %	25 %	50 %	0 %	326315221
11109	NC_015138	GCAGGA	2	12	444736	444747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	326315221
11110	NC_015138	ATCACG	2	12	444755	444766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	326315221
11111	NC_015138	CCG	2	6	444768	444773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315221
11112	NC_015138	CAT	2	6	444829	444834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315221
11113	NC_015138	GTGG	2	8	444920	444927	0 %	25 %	75 %	0 %	326315221
11114	NC_015138	CAA	2	6	444964	444969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315221
11115	NC_015138	CAA	2	6	444997	445002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315221
11116	NC_015138	CTT	2	6	445024	445029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315221
11117	NC_015138	TGCGCC	2	12	445047	445058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326315221
11118	NC_015138	GTG	2	6	445079	445084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315221
11119	NC_015138	CAT	2	6	445144	445149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315221
11120	NC_015138	TGG	2	6	445206	445211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315221
11121	NC_015138	TGA	2	6	445272	445277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315221
11122	NC_015138	GCGCAC	2	12	445330	445341	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315221
11123	NC_015138	TCC	2	6	445450	445455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315221
11124	NC_015138	GACGAA	2	12	445469	445480	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	326315221
11125	NC_015138	ACC	2	6	445487	445492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315221
11126	NC_015138	GAC	2	6	445502	445507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315221
11127	NC_015138	TGA	2	6	445539	445544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315221
11128	NC_015138	AAG	2	6	445634	445639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315221
11129	NC_015138	CGAA	2	8	445671	445678	50 %	0 %	25 %	25 %	326315221
11130	NC_015138	TGGAAG	2	12	445683	445694	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	326315221
11131	NC_015138	CTGC	2	8	445716	445723	0 %	25 %	25 %	50 %	326315221
11132	NC_015138	CAAGAC	2	12	445834	445845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	326315221
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11136	NC_015138	ATC	2	6	445970	445975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315221
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11138	NC_015138	CGT	2	6	446119	446124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315221
11139	NC_015138	CGAA	2	8	446139	446146	50 %	0 %	25 %	25 %	326315221
11140	NC_015138	GGT	2	6	446269	446274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315221
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11143	NC_015138	AAGG	2	8	446363	446370	50 %	0 %	50 %	0 %	326315221
11144	NC_015138	AAG	2	6	446375	446380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315221
11145	NC_015138	CCGGT	2	10	446382	446391	0 %	20 %	40 %	40 %	326315221
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11149	NC_015138	CGG	3	9	446506	446514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315221
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11151	NC_015138	CAT	2	6	446653	446658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315221
11152	NC_015138	GCC	2	6	446660	446665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315221
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11154	NC_015138	GAC	2	6	447003	447008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315222
11155	NC_015138	CGG	2	6	447048	447053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315222
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11157	NC_015138	ACG	2	6	447068	447073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315222
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11160	NC_015138	GCC	2	6	447250	447255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315222
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11162	NC_015138	CTG	2	6	447289	447294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315222
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11188	NC_015138	CGCA	2	8	448345	448352	25 %	0 %	25 %	50 %	326315223
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11192	NC_015138	GGT	2	6	448804	448809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315224
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11203	NC_015138	CG	3	6	449530	449535	0 %	0 %	50 %	50 %	326315225
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11220	NC_015138	TCA	2	6	450328	450333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315227
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11222	NC_015138	ACC	2	6	450385	450390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315227
11223	NC_015138	CGCTG	2	10	450410	450419	0 %	20 %	40 %	40 %	326315227
11224	NC_015138	CAA	3	9	450449	450457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315227
11225	NC_015138	CAC	2	6	450467	450472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315227
11226	NC_015138	CAC	2	6	450498	450503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315227
11227	NC_015138	GTG	2	6	450510	450515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315227
11228	NC_015138	CAA	2	6	450527	450532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315227
11229	NC_015138	CAT	2	6	450629	450634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315227
11230	NC_015138	CCA	2	6	450661	450666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315227
11231	NC_015138	CGA	2	6	450736	450741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315227
11232	NC_015138	CGGTGC	2	12	450764	450775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326315227
11233	NC_015138	CCG	2	6	450790	450795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315227
11234	NC_015138	GCT	2	6	450809	450814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315227
11235	NC_015138	CCA	2	6	450889	450894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315227
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11238	NC_015138	GCC	2	6	451045	451050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315227
11239	NC_015138	CAA	3	9	451097	451105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315227
11240	NC_015138	CA	3	6	451109	451114	50 %	0 %	0 %	50 %	326315227
11241	NC_015138	CGC	2	6	451131	451136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315227
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11331	NC_015138	TCCG	2	8	455807	455814	0 %	25 %	25 %	50 %	326315237
11332	NC_015138	GCT	2	6	455839	455844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315237
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11338	NC_015138	CGG	2	6	456042	456047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315237
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11340	NC_015138	GCG	2	6	456128	456133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315237
11341	NC_015138	GATG	2	8	456157	456164	25 %	25 %	50 %	0 %	326315237
11342	NC_015138	TCC	2	6	456330	456335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315238
11343	NC_015138	TGCGC	2	10	456361	456370	0 %	20 %	40 %	40 %	326315238
11344	NC_015138	CTG	2	6	456473	456478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315238
11345	NC_015138	GCGG	2	8	456485	456492	0 %	0 %	75 %	25 %	326315238
11346	NC_015138	GAC	2	6	456494	456499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315238
11347	NC_015138	GACG	2	8	456514	456521	25 %	0 %	50 %	25 %	326315238
11348	NC_015138	TGC	3	9	456606	456614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315238
11349	NC_015138	GC	3	6	456613	456618	0 %	0 %	50 %	50 %	326315238
11350	NC_015138	TCG	2	6	456651	456656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315238
11351	NC_015138	CG	3	6	456659	456664	0 %	0 %	50 %	50 %	326315238
11352	NC_015138	GGC	2	6	456671	456676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315238
11353	NC_015138	CGC	2	6	456703	456708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315238
11354	NC_015138	CAT	2	6	456734	456739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315238
11355	NC_015138	CAT	2	6	456875	456880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315239
11356	NC_015138	TGA	2	6	456886	456891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315239
11357	NC_015138	TCGA	2	8	456921	456928	25 %	25 %	25 %	25 %	326315239
11358	NC_015138	GCAGGA	2	12	456941	456952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	326315239
11359	NC_015138	GATG	2	8	456956	456963	25 %	25 %	50 %	0 %	326315239
11360	NC_015138	GC	4	8	456968	456975	0 %	0 %	50 %	50 %	326315239
11361	NC_015138	GAGT	2	8	457002	457009	25 %	25 %	50 %	0 %	326315239
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11477	NC_015138	GCA	2	6	461206	461211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315244
11478	NC_015138	ACG	2	6	461217	461222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315244
11479	NC_015138	CTG	2	6	461223	461228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315244
11480	NC_015138	GCA	2	6	461353	461358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315244
11481	NC_015138	AAG	2	6	461406	461411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315244
11482	NC_015138	GC	4	8	461431	461438	0 %	0 %	50 %	50 %	326315244
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11489	NC_015138	CTGG	2	8	461642	461649	0 %	25 %	50 %	25 %	326315244
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11491	NC_015138	GCC	2	6	461712	461717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315244
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