MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015138	GTG	2	6	21501	21506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314837
502	NC_015138	GCCG	2	8	21524	21531	0 %	0 %	50 %	50 %	326314837
503	NC_015138	GCG	2	6	21543	21548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314837
504	NC_015138	GCT	2	6	21560	21565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314837
505	NC_015138	GCG	2	6	21585	21590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314837
506	NC_015138	GCC	2	6	21593	21598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314837
507	NC_015138	CGAC	2	8	21649	21656	25 %	0 %	25 %	50 %	326314837
508	NC_015138	CGTTC	2	10	21665	21674	0 %	40 %	20 %	40 %	326314837
509	NC_015138	CGGG	2	8	21726	21733	0 %	0 %	75 %	25 %	326314837
510	NC_015138	GCTG	2	8	21824	21831	0 %	25 %	50 %	25 %	326314837
511	NC_015138	GGC	2	6	21890	21895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314837
512	NC_015138	GTG	3	9	21984	21992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314837
513	NC_015138	TGG	2	6	22084	22089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314837
514	NC_015138	TGC	2	6	22099	22104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314837
515	NC_015138	TGC	2	6	22126	22131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314837
516	NC_015138	AGG	2	6	22141	22146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314837
517	NC_015138	TGA	2	6	22180	22185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314837
518	NC_015138	GCC	2	6	22203	22208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314837
519	NC_015138	CGGTGG	2	12	22211	22222	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326314837
520	NC_015138	CTG	2	6	22248	22253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314837
521	NC_015138	GC	3	6	22262	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	326314837
522	NC_015138	GAA	2	6	22364	22369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314837
523	NC_015138	CGA	2	6	22417	22422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314837
524	NC_015138	GCC	2	6	22428	22433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314837
525	NC_015138	TGG	2	6	22486	22491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314837
526	NC_015138	CGC	2	6	22499	22504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314837
527	NC_015138	GA	3	6	22534	22539	50 %	0 %	50 %	0 %	326314837
528	NC_015138	AGA	2	6	22543	22548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314837
529	NC_015138	GATG	2	8	22980	22987	25 %	25 %	50 %	0 %	326314838
530	NC_015138	TCG	2	6	23013	23018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314838
531	NC_015138	GAA	2	6	23038	23043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314838
532	NC_015138	CGG	2	6	23083	23088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314838
533	NC_015138	CAG	2	6	23141	23146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
534	NC_015138	CAT	2	6	23257	23262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314838
535	NC_015138	GCC	2	6	23267	23272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314838
536	NC_015138	ATG	2	6	23297	23302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314838
537	NC_015138	GC	3	6	23320	23325	0 %	0 %	50 %	50 %	326314838
538	NC_015138	AGC	2	6	23430	23435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
539	NC_015138	CGA	2	6	23473	23478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
540	NC_015138	GAA	2	6	23512	23517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314838
541	NC_015138	AAC	2	6	23522	23527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326314838
542	NC_015138	TGC	2	6	23607	23612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314838
543	NC_015138	CGTGG	2	10	23624	23633	0 %	20 %	60 %	20 %	326314838
544	NC_015138	GAA	2	6	23668	23673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314838
545	NC_015138	CCA	2	6	23686	23691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314838
546	NC_015138	GAA	2	6	23791	23796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314838
547	NC_015138	TGA	2	6	23805	23810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314838
548	NC_015138	CCA	2	6	23884	23889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314838
549	NC_015138	GCA	2	6	23899	23904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
550	NC_015138	GC	3	6	23955	23960	0 %	0 %	50 %	50 %	326314838
551	NC_015138	ATC	2	6	23978	23983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326314838
552	NC_015138	GCA	2	6	23988	23993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
553	NC_015138	GC	4	8	23997	24004	0 %	0 %	50 %	50 %	326314838
554	NC_015138	GCCG	2	8	24062	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	326314838
555	NC_015138	TGA	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326314838
556	NC_015138	GAA	2	6	24091	24096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314838
557	NC_015138	CGG	2	6	24129	24134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314838
558	NC_015138	CGA	2	6	24166	24171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314838
559	NC_015138	GGC	2	6	24208	24213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314838
560	NC_015138	GGT	2	6	24232	24237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314838
561	NC_015138	GGT	2	6	24253	24258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314838
562	NC_015138	GATGC	2	10	24336	24345	20 %	20 %	40 %	20 %	326314839
563	NC_015138	GCC	3	9	24382	24390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314839
564	NC_015138	ACG	2	6	24460	24465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314839
565	NC_015138	AGC	2	6	24532	24537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314839
566	NC_015138	GCG	2	6	24544	24549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314839
567	NC_015138	GCT	2	6	24590	24595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314839
568	NC_015138	GCT	2	6	24614	24619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314839
569	NC_015138	ACC	2	6	24718	24723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314839
570	NC_015138	AAG	2	6	24786	24791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314839
571	NC_015138	TGC	2	6	24802	24807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314839
572	NC_015138	CTG	2	6	24813	24818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314839
573	NC_015138	CG	3	6	24821	24826	0 %	0 %	50 %	50 %	326314839
574	NC_015138	GCG	2	6	24844	24849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314839
575	NC_015138	GGC	2	6	24875	24880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314839
576	NC_015138	GC	3	6	24879	24884	0 %	0 %	50 %	50 %	326314839
577	NC_015138	CTG	2	6	24924	24929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314839
578	NC_015138	CGA	2	6	24958	24963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314839
579	NC_015138	AGCC	2	8	25046	25053	25 %	0 %	25 %	50 %	326314839
580	NC_015138	CCG	2	6	25104	25109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314839
581	NC_015138	GGC	2	6	25176	25181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
582	NC_015138	GCCG	2	8	25254	25261	0 %	0 %	50 %	50 %	326314840
583	NC_015138	GCA	2	6	25283	25288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314840
584	NC_015138	GGC	2	6	25301	25306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
585	NC_015138	GCG	2	6	25321	25326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
586	NC_015138	CCCGG	2	10	25374	25383	0 %	0 %	40 %	60 %	326314840
587	NC_015138	GCGG	2	8	25385	25392	0 %	0 %	75 %	25 %	326314840
588	NC_015138	CGG	2	6	25417	25422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
589	NC_015138	TGC	2	6	25438	25443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314840
590	NC_015138	GCT	2	6	25460	25465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314840
591	NC_015138	CGG	2	6	25499	25504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
592	NC_015138	GCC	2	6	25523	25528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314840
593	NC_015138	GCT	2	6	25559	25564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314840
594	NC_015138	CGC	2	6	25566	25571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314840
595	NC_015138	CGG	2	6	25582	25587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
596	NC_015138	TGC	2	6	25594	25599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314840
597	NC_015138	CGG	2	6	25618	25623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
598	NC_015138	GGC	2	6	25626	25631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314840
599	NC_015138	GCTGG	2	10	25784	25793	0 %	20 %	60 %	20 %	326314840
600	NC_015138	CA	3	6	25892	25897	50 %	0 %	0 %	50 %	326314840
601	NC_015138	GGA	2	6	25922	25927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314840
602	NC_015138	CTGGCC	2	12	26019	26030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326314840
603	NC_015138	TGG	2	6	26134	26139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314840
604	NC_015138	CG	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	326314841
605	NC_015138	TG	3	6	26290	26295	0 %	50 %	50 %	0 %	326314841
606	NC_015138	CTG	2	6	26312	26317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314841
607	NC_015138	GGCTGG	2	12	26356	26367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326314841
608	NC_015138	GAG	2	6	26391	26396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326314841
609	NC_015138	GTG	2	6	26460	26465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314841
610	NC_015138	GGCGC	2	10	26474	26483	0 %	0 %	60 %	40 %	326314841
611	NC_015138	AGA	3	9	26572	26580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314841
612	NC_015138	GCG	2	6	26629	26634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314841
613	NC_015138	GGCCAG	2	12	26845	26856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326314842
614	NC_015138	CGA	2	6	26916	26921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314842
615	NC_015138	GAA	2	6	26941	26946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326314842
616	NC_015138	TCG	2	6	26948	26953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314842
617	NC_015138	GCG	2	6	26956	26961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314842
618	NC_015138	GCC	2	6	26965	26970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314842
619	NC_015138	ACC	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326314842
620	NC_015138	AAGG	2	8	27058	27065	50 %	0 %	50 %	0 %	326314842
621	NC_015138	CGCTCA	2	12	27092	27103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326314842
622	NC_015138	CGA	2	6	27123	27128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314842
623	NC_015138	CGGC	2	8	27149	27156	0 %	0 %	50 %	50 %	326314842
624	NC_015138	GGC	2	6	27417	27422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314843
625	NC_015138	GC	3	6	27436	27441	0 %	0 %	50 %	50 %	326314843
626	NC_015138	CGGT	2	8	27465	27472	0 %	25 %	50 %	25 %	326314843
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754	NC_015138	CGC	2	6	32815	32820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314848
755	NC_015138	GCC	2	6	32824	32829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314848
756	NC_015138	GGC	2	6	32886	32891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314848
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864	NC_015138	GAGCGC	2	12	38240	38251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326314853
865	NC_015138	GTG	2	6	38255	38260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314853
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867	NC_015138	GTG	2	6	38294	38299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314853
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869	NC_015138	CGAG	2	8	38316	38323	25 %	0 %	50 %	25 %	326314853
870	NC_015138	CT	3	6	38343	38348	0 %	50 %	0 %	50 %	326314853
871	NC_015138	GC	3	6	38400	38405	0 %	0 %	50 %	50 %	326314853
872	NC_015138	GGGCA	2	10	38438	38447	20 %	0 %	60 %	20 %	326314853
873	NC_015138	CGACG	2	10	38512	38521	20 %	0 %	40 %	40 %	326314853
874	NC_015138	TCG	2	6	38607	38612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326314853
875	NC_015138	GTG	2	6	38693	38698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326314853
876	NC_015138	CG	3	6	38719	38724	0 %	0 %	50 %	50 %	326314853
877	NC_015138	GCA	2	6	38732	38737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326314853
878	NC_015138	CCG	2	6	38763	38768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314853
879	NC_015138	GCG	2	6	38857	38862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314854
880	NC_015138	GCCAT	2	10	38881	38890	20 %	20 %	20 %	40 %	326314854
881	NC_015138	GCCC	2	8	38909	38916	0 %	0 %	25 %	75 %	326314854
882	NC_015138	CGC	3	9	38933	38941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326314854
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998	NC_015138	GGC	2	6	43282	43287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326314856
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1000	NC_015138	G	7	7	43314	43320	0 %	0 %	100 %	0 %	326314856

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