MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015138	GCT	2	6	237079	237084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6002	NC_015138	CG	3	6	237093	237098	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6003	NC_015138	TGGGC	2	10	237225	237234	0 %	20 %	60 %	20 %	326315038
6004	NC_015138	AGG	2	6	237240	237245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315038
6005	NC_015138	TGC	2	6	237268	237273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6006	NC_015138	G	6	6	237301	237306	0 %	0 %	100 %	0 %	326315038
6007	NC_015138	GCCG	2	8	237359	237366	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6008	NC_015138	CTGC	2	8	237367	237374	0 %	25 %	25 %	50 %	326315038
6009	NC_015138	GCT	2	6	237424	237429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6010	NC_015138	TTC	2	6	237464	237469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315038
6011	NC_015138	TGG	2	6	237561	237566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6012	NC_015138	CG	3	6	237567	237572	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6013	NC_015138	CG	4	8	237625	237632	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6014	NC_015138	CG	3	6	237655	237660	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6015	NC_015138	CGG	3	9	237682	237690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6016	NC_015138	GGCGCC	2	12	237691	237702	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6017	NC_015138	GCC	2	6	237728	237733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6018	NC_015138	CTA	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6019	NC_015138	CG	3	6	237775	237780	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6020	NC_015138	ACT	3	9	237810	237818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6021	NC_015138	GGC	2	6	237827	237832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6022	NC_015138	GCCA	2	8	237854	237861	25 %	0 %	25 %	50 %	326315038
6023	NC_015138	CTG	2	6	237875	237880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6024	NC_015138	TGG	2	6	237900	237905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6025	NC_015138	CGGC	2	8	237910	237917	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6026	NC_015138	CGC	2	6	237962	237967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6027	NC_015138	GCCG	2	8	237988	237995	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6028	NC_015138	GAA	2	6	237997	238002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315038
6029	NC_015138	GCG	2	6	238018	238023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6030	NC_015138	CTG	2	6	238024	238029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6031	NC_015138	AGC	2	6	238047	238052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6032	NC_015138	GCT	2	6	238090	238095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6033	NC_015138	GCA	2	6	238105	238110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6034	NC_015138	GATG	2	8	238156	238163	25 %	25 %	50 %	0 %	326315038
6035	NC_015138	TGC	2	6	238191	238196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6036	NC_015138	GCT	2	6	238198	238203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6037	NC_015138	CTG	2	6	238217	238222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6038	NC_015138	GCC	2	6	238248	238253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6039	NC_015138	GCC	2	6	238265	238270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6040	NC_015138	TGCG	2	8	238286	238293	0 %	25 %	50 %	25 %	326315038
6041	NC_015138	ACT	2	6	238380	238385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315038
6042	NC_015138	GCAGC	2	10	238448	238457	20 %	0 %	40 %	40 %	326315038
6043	NC_015138	CG	3	6	238471	238476	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6044	NC_015138	CCGGC	2	10	238555	238564	0 %	0 %	40 %	60 %	326315038
6045	NC_015138	CAG	2	6	238582	238587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6046	NC_015138	GCA	2	6	238600	238605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6047	NC_015138	CGC	2	6	238661	238666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6048	NC_015138	AGG	2	6	238671	238676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315038
6049	NC_015138	GC	3	6	238684	238689	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6050	NC_015138	GCC	2	6	238776	238781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6051	NC_015138	ACCT	2	8	238889	238896	25 %	25 %	0 %	50 %	326315038
6052	NC_015138	GTG	2	6	238964	238969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6053	NC_015138	CGA	2	6	238978	238983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6054	NC_015138	CG	3	6	238990	238995	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6055	NC_015138	GCG	2	6	239005	239010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
6056	NC_015138	GCT	2	6	239011	239016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
6057	NC_015138	GTG	2	6	239023	239028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315038
6058	NC_015138	GCC	2	6	239042	239047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
6059	NC_015138	C	6	6	239445	239450	0 %	0 %	0 %	100 %	326315039
6060	NC_015138	TCG	3	9	239526	239534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6061	NC_015138	GCGG	2	8	239576	239583	0 %	0 %	75 %	25 %	326315039
6062	NC_015138	AG	3	6	239639	239644	50 %	0 %	50 %	0 %	326315039
6063	NC_015138	CTG	2	6	239693	239698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6064	NC_015138	CGG	2	6	239832	239837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315039
6065	NC_015138	CTC	2	6	239849	239854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315039
6066	NC_015138	CGT	2	6	239866	239871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315039
6067	NC_015138	CGC	2	6	239901	239906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315039
6068	NC_015138	CCCT	2	8	239939	239946	0 %	25 %	0 %	75 %	326315039
6069	NC_015138	GACC	2	8	240028	240035	25 %	0 %	25 %	50 %	326315039
6070	NC_015138	GAG	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315039
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6073	NC_015138	GCCC	2	8	240287	240294	0 %	0 %	25 %	75 %	326315040
6074	NC_015138	GCGCC	2	10	240298	240307	0 %	0 %	40 %	60 %	326315040
6075	NC_015138	TGCC	2	8	240317	240324	0 %	25 %	25 %	50 %	326315040
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6081	NC_015138	ACG	2	6	240522	240527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6090	NC_015138	CG	4	8	240877	240884	0 %	0 %	50 %	50 %	326315040
6091	NC_015138	GTC	2	6	240975	240980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6093	NC_015138	GAA	2	6	241004	241009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315040
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6097	NC_015138	CG	3	6	241264	241269	0 %	0 %	50 %	50 %	326315040
6098	NC_015138	TGC	2	6	241276	241281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315040
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6101	NC_015138	GGCC	2	8	241614	241621	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6102	NC_015138	CG	3	6	241625	241630	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6103	NC_015138	ACC	2	6	241640	241645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315041
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6105	NC_015138	AGG	2	6	241658	241663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315041
6106	NC_015138	CTG	2	6	241666	241671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315041
6107	NC_015138	GCG	2	6	241732	241737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315041
6108	NC_015138	CCG	3	9	241758	241766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315041
6109	NC_015138	ACCT	2	8	241774	241781	25 %	25 %	0 %	50 %	326315041
6110	NC_015138	CCG	2	6	241806	241811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315041
6111	NC_015138	CGGC	2	8	241868	241875	0 %	0 %	50 %	50 %	326315041
6112	NC_015138	CGC	2	6	241878	241883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315041
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6118	NC_015138	CGT	3	9	242206	242214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315042
6119	NC_015138	GAC	2	6	242237	242242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315042
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6121	NC_015138	GCT	2	6	242320	242325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315042
6122	NC_015138	GGC	2	6	242328	242333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315042
6123	NC_015138	CCCG	2	8	242356	242363	0 %	0 %	25 %	75 %	326315042
6124	NC_015138	CTG	2	6	242417	242422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315042
6125	NC_015138	CCA	2	6	242578	242583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315042
6126	NC_015138	GTG	2	6	242612	242617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315042
6127	NC_015138	GCG	2	6	242633	242638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315042
6128	NC_015138	CCA	2	6	242644	242649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315042
6129	NC_015138	GCG	2	6	242656	242661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315042
6130	NC_015138	CGA	2	6	242662	242667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315042
6131	NC_015138	TGC	2	6	242682	242687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315042
6132	NC_015138	GCT	2	6	242873	242878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6133	NC_015138	GTCGT	2	10	242928	242937	0 %	40 %	40 %	20 %	326315043
6134	NC_015138	ACA	2	6	243067	243072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326315043
6135	NC_015138	GC	3	6	243081	243086	0 %	0 %	50 %	50 %	326315043
6136	NC_015138	CGG	2	6	243101	243106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315043
6137	NC_015138	GAC	2	6	243185	243190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6138	NC_015138	TCA	2	6	243196	243201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315043
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6140	NC_015138	CGC	2	6	243340	243345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315043
6141	NC_015138	CTG	2	6	243372	243377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6142	NC_015138	AGC	2	6	243381	243386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6143	NC_015138	TGCG	2	8	243444	243451	0 %	25 %	50 %	25 %	326315043
6144	NC_015138	CAG	2	6	243458	243463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6145	NC_015138	TGA	2	6	243487	243492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315043
6146	NC_015138	ACG	2	6	243505	243510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6147	NC_015138	AGC	2	6	243534	243539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6148	NC_015138	CAG	2	6	243546	243551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315043
6149	NC_015138	CGC	2	6	243564	243569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315043
6150	NC_015138	CGGC	2	8	243613	243620	0 %	0 %	50 %	50 %	326315043
6151	NC_015138	CATC	2	8	243842	243849	25 %	25 %	0 %	50 %	326315044
6152	NC_015138	CCG	2	6	243853	243858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6153	NC_015138	CGC	2	6	243863	243868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6154	NC_015138	GC	3	6	243880	243885	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6155	NC_015138	TGC	2	6	243920	243925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315044
6156	NC_015138	ACCG	2	8	243931	243938	25 %	0 %	25 %	50 %	326315044
6157	NC_015138	CGGCCC	2	12	243959	243970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6158	NC_015138	CGC	2	6	243971	243976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6159	NC_015138	CGC	2	6	243995	244000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6160	NC_015138	CG	3	6	244048	244053	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6161	NC_015138	GC	3	6	244087	244092	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6162	NC_015138	GTG	2	6	244102	244107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315044
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6166	NC_015138	GCCTG	2	10	244161	244170	0 %	20 %	40 %	40 %	326315044
6167	NC_015138	GCCG	2	8	244182	244189	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6168	NC_015138	GGCCT	2	10	244221	244230	0 %	20 %	40 %	40 %	326315044
6169	NC_015138	CGG	2	6	244233	244238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
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6171	NC_015138	CTG	2	6	244261	244266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315044
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6179	NC_015138	CG	3	6	244490	244495	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6180	NC_015138	GGC	2	6	244524	244529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
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6182	NC_015138	GGC	2	6	244568	244573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
6183	NC_015138	TGC	2	6	244607	244612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315044
6184	NC_015138	GAC	2	6	244624	244629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315044
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6186	NC_015138	GCC	3	9	244677	244685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6187	NC_015138	CAG	2	6	244687	244692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315044
6188	NC_015138	GCCC	2	8	244719	244726	0 %	0 %	25 %	75 %	326315044
6189	NC_015138	GGC	2	6	244752	244757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315044
6190	NC_015138	CGAGGA	2	12	244782	244793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	326315044
6191	NC_015138	GCC	2	6	244801	244806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6192	NC_015138	GC	3	6	244807	244812	0 %	0 %	50 %	50 %	326315044
6193	NC_015138	GCC	2	6	244824	244829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315044
6194	NC_015138	AGC	2	6	244874	244879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315044
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6196	NC_015138	ATG	2	6	245219	245224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315045
6197	NC_015138	GGCG	2	8	245232	245239	0 %	0 %	75 %	25 %	326315045
6198	NC_015138	AGA	2	6	245259	245264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315045
6199	NC_015138	CGC	2	6	245307	245312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315045
6200	NC_015138	GCA	2	6	245334	245339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315045
6201	NC_015138	GTC	2	6	245365	245370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315045
6202	NC_015138	GGT	3	9	245377	245385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315045
6203	NC_015138	GCG	2	6	245462	245467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315045
6204	NC_015138	CTTC	2	8	245502	245509	0 %	50 %	0 %	50 %	326315045
6205	NC_015138	GCC	2	6	245533	245538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315045
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6211	NC_015138	GCC	2	6	245797	245802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315045
6212	NC_015138	CGGTGG	2	12	245832	245843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	326315045
6213	NC_015138	CAT	2	6	245869	245874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326315045
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6217	NC_015138	GCC	2	6	246019	246024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315045
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6220	NC_015138	TTC	2	6	246059	246064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326315045
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6222	NC_015138	CGC	2	6	246126	246131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315045
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6225	NC_015138	CTG	2	6	246301	246306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315045
6226	NC_015138	GGT	2	6	246330	246335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315045
6227	NC_015138	CGG	2	6	246378	246383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315045
6228	NC_015138	GTT	2	6	246581	246586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326315046
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6230	NC_015138	GTA	2	6	246635	246640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315046
6231	NC_015138	GCC	2	6	246641	246646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315046
6232	NC_015138	TCC	2	6	246721	246726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315046
6233	NC_015138	CGC	2	6	246727	246732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315046
6234	NC_015138	GC	3	6	246739	246744	0 %	0 %	50 %	50 %	326315046
6235	NC_015138	GGCA	2	8	246748	246755	25 %	0 %	50 %	25 %	326315046
6236	NC_015138	GCC	2	6	246800	246805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315046
6237	NC_015138	TGA	2	6	246829	246834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315046
6238	NC_015138	GTA	2	6	246893	246898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315046
6239	NC_015138	GAAG	2	8	246929	246936	50 %	0 %	50 %	0 %	326315046
6240	NC_015138	ATG	2	6	246975	246980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326315046
6241	NC_015138	GCC	2	6	246995	247000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315046
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6243	NC_015138	CG	3	6	247033	247038	0 %	0 %	50 %	50 %	326315046
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6361	NC_015138	GGCGC	2	10	251673	251682	0 %	0 %	60 %	40 %	326315049
6362	NC_015138	CGG	2	6	251708	251713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315049
6363	NC_015138	GC	3	6	251715	251720	0 %	0 %	50 %	50 %	326315049
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6484	NC_015138	GGT	2	6	256647	256652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315055
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6486	NC_015138	G	6	6	256747	256752	0 %	0 %	100 %	0 %	326315055
6487	NC_015138	CCT	2	6	256755	256760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315055
6488	NC_015138	GCG	2	6	256761	256766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315055
6489	NC_015138	GCA	2	6	256812	256817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6490	NC_015138	CCA	2	6	256827	256832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315055
6491	NC_015138	CG	4	8	256872	256879	0 %	0 %	50 %	50 %	326315055
6492	NC_015138	CGT	2	6	256881	256886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6493	NC_015138	GCA	2	6	256920	256925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6494	NC_015138	CGGC	2	8	256929	256936	0 %	0 %	50 %	50 %	326315055
6495	NC_015138	GCA	2	6	256947	256952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6496	NC_015138	GCG	2	6	256955	256960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315055
6497	NC_015138	CAG	2	6	256996	257001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6498	NC_015138	CAG	2	6	257086	257091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6499	NC_015138	AGC	2	6	257099	257104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315055
6500	NC_015138	GTC	2	6	257122	257127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315055

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