MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 137536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015138	CCT	2	6	217831	217836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315021
5502	NC_015138	GCA	2	6	217841	217846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315021
5503	NC_015138	TCG	2	6	217897	217902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315021
5504	NC_015138	GGGT	2	8	217982	217989	0 %	25 %	75 %	0 %	326315021
5505	NC_015138	GCC	2	6	218073	218078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315021
5506	NC_015138	CGC	2	6	218081	218086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315021
5507	NC_015138	GGC	2	6	218120	218125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315021
5508	NC_015138	TGG	2	6	218141	218146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315021
5509	NC_015138	GCC	2	6	218151	218156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315021
5510	NC_015138	CGC	2	6	218188	218193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315021
5511	NC_015138	TGC	2	6	218203	218208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315021
5512	NC_015138	CGG	2	6	218234	218239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315021
5513	NC_015138	GCCG	2	8	218295	218302	0 %	0 %	50 %	50 %	326315021
5514	NC_015138	C	6	6	218335	218340	0 %	0 %	0 %	100 %	326315021
5515	NC_015138	GCCGG	2	10	218352	218361	0 %	0 %	60 %	40 %	326315021
5516	NC_015138	GCGCG	2	10	218432	218441	0 %	0 %	60 %	40 %	326315021
5517	NC_015138	CGG	2	6	218444	218449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315021
5518	NC_015138	GGGCC	2	10	218491	218500	0 %	0 %	60 %	40 %	326315021
5519	NC_015138	GCA	2	6	218558	218563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315021
5520	NC_015138	TCGGGC	2	12	218572	218583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326315021
5521	NC_015138	G	6	6	218585	218590	0 %	0 %	100 %	0 %	326315021
5522	NC_015138	GCCG	2	8	218598	218605	0 %	0 %	50 %	50 %	326315021
5523	NC_015138	CAG	2	6	218616	218621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315021
5524	NC_015138	GCC	2	6	218623	218628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315021
5525	NC_015138	GCG	2	6	218661	218666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315021
5526	NC_015138	ATCG	2	8	218668	218675	25 %	25 %	25 %	25 %	326315021
5527	NC_015138	GGC	2	6	218807	218812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5528	NC_015138	AGA	2	6	218830	218835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315022
5529	NC_015138	CAC	2	6	218903	218908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315022
5530	NC_015138	CCA	2	6	219010	219015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315022
5531	NC_015138	G	6	6	219019	219024	0 %	0 %	100 %	0 %	326315022
5532	NC_015138	GCCG	2	8	219041	219048	0 %	0 %	50 %	50 %	326315022
5533	NC_015138	CCAGG	2	10	219101	219110	20 %	0 %	40 %	40 %	326315022
5534	NC_015138	GGC	3	9	219166	219174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5535	NC_015138	CGA	3	9	219217	219225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5536	NC_015138	CAG	2	6	219242	219247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5537	NC_015138	GCC	2	6	219270	219275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315022
5538	NC_015138	AGC	2	6	219288	219293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5539	NC_015138	GCA	2	6	219295	219300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5540	NC_015138	GC	3	6	219352	219357	0 %	0 %	50 %	50 %	326315022
5541	NC_015138	GC	3	6	219372	219377	0 %	0 %	50 %	50 %	326315022
5542	NC_015138	GGC	2	6	219389	219394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5543	NC_015138	GC	3	6	219410	219415	0 %	0 %	50 %	50 %	326315022
5544	NC_015138	CGC	3	9	219433	219441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315022
5545	NC_015138	GCC	2	6	219444	219449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315022
5546	NC_015138	GTCGCG	2	12	219461	219472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326315022
5547	NC_015138	CAGG	2	8	219482	219489	25 %	0 %	50 %	25 %	326315022
5548	NC_015138	GAC	2	6	219518	219523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5549	NC_015138	GC	3	6	219535	219540	0 %	0 %	50 %	50 %	326315022
5550	NC_015138	CCAG	2	8	219541	219548	25 %	0 %	25 %	50 %	326315022
5551	NC_015138	GCC	2	6	219558	219563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315022
5552	NC_015138	CGG	2	6	219673	219678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5553	NC_015138	CAG	2	6	219680	219685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5554	NC_015138	GGCCA	2	10	219857	219866	20 %	0 %	40 %	40 %	326315022
5555	NC_015138	ACG	2	6	219879	219884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315022
5556	NC_015138	TGGTC	2	10	219892	219901	0 %	40 %	40 %	20 %	326315022
5557	NC_015138	AGGT	2	8	219918	219925	25 %	25 %	50 %	0 %	326315022
5558	NC_015138	GAA	2	6	219965	219970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315022
5559	NC_015138	CCAGG	2	10	219977	219986	20 %	0 %	40 %	40 %	326315022
5560	NC_015138	GAGG	2	8	219992	219999	25 %	0 %	75 %	0 %	326315022
5561	NC_015138	CGG	2	6	220003	220008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5562	NC_015138	CCG	2	6	220023	220028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315022
5563	NC_015138	GCG	2	6	220101	220106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315022
5564	NC_015138	GTG	2	6	220125	220130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315023
5565	NC_015138	GC	3	6	220187	220192	0 %	0 %	50 %	50 %	326315023
5566	NC_015138	GCGG	3	12	220199	220210	0 %	0 %	75 %	25 %	326315023
5567	NC_015138	GCTGCA	2	12	220238	220249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326315023
5568	NC_015138	CAC	2	6	220299	220304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315023
5569	NC_015138	TGG	2	6	220330	220335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315023
5570	NC_015138	GC	3	6	220357	220362	0 %	0 %	50 %	50 %	326315023
5571	NC_015138	TCGA	2	8	220396	220403	25 %	25 %	25 %	25 %	326315023
5572	NC_015138	GCC	2	6	220459	220464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315023
5573	NC_015138	ACG	2	6	220480	220485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315023
5574	NC_015138	CGG	2	6	220508	220513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315023
5575	NC_015138	GC	3	6	220522	220527	0 %	0 %	50 %	50 %	326315023
5576	NC_015138	CGC	2	6	220595	220600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315023
5577	NC_015138	GCG	2	6	220724	220729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5578	NC_015138	GCC	2	6	220731	220736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315024
5579	NC_015138	GGCCG	2	10	220737	220746	0 %	0 %	60 %	40 %	326315024
5580	NC_015138	GGA	2	6	220773	220778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315024
5581	NC_015138	GCA	2	6	220859	220864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315024
5582	NC_015138	GGC	2	6	220878	220883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5583	NC_015138	GCG	2	6	220889	220894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5584	NC_015138	AGC	2	6	220921	220926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315024
5585	NC_015138	CGC	2	6	220940	220945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315024
5586	NC_015138	CGG	2	6	220961	220966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5587	NC_015138	GCG	2	6	221009	221014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5588	NC_015138	GCA	2	6	221090	221095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315024
5589	NC_015138	GC	3	6	221143	221148	0 %	0 %	50 %	50 %	326315024
5590	NC_015138	GCG	2	6	221177	221182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5591	NC_015138	GCA	3	9	221207	221215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315024
5592	NC_015138	AGC	2	6	221242	221247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315024
5593	NC_015138	CGG	3	9	221285	221293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5594	NC_015138	CGGGC	2	10	221304	221313	0 %	0 %	60 %	40 %	326315024
5595	NC_015138	G	6	6	221328	221333	0 %	0 %	100 %	0 %	326315024
5596	NC_015138	GGA	2	6	221335	221340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315024
5597	NC_015138	GGGCT	2	10	221364	221373	0 %	20 %	60 %	20 %	326315024
5598	NC_015138	AGG	2	6	221395	221400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315024
5599	NC_015138	GCG	2	6	221401	221406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315024
5600	NC_015138	CATTC	2	10	221601	221610	20 %	40 %	0 %	40 %	326315025
5601	NC_015138	AGC	2	6	221634	221639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5602	NC_015138	GCG	2	6	221664	221669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5603	NC_015138	AGCG	2	8	221670	221677	25 %	0 %	50 %	25 %	326315025
5604	NC_015138	CGG	2	6	221782	221787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5605	NC_015138	GGGC	2	8	221813	221820	0 %	0 %	75 %	25 %	326315025
5606	NC_015138	AGGTCG	2	12	221823	221834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326315025
5607	NC_015138	CAC	2	6	221843	221848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315025
5608	NC_015138	GCCAG	2	10	221906	221915	20 %	0 %	40 %	40 %	326315025
5609	NC_015138	GCG	2	6	221968	221973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5610	NC_015138	CGCGG	2	10	221975	221984	0 %	0 %	60 %	40 %	326315025
5611	NC_015138	GCA	2	6	222052	222057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5612	NC_015138	CGG	3	9	222103	222111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5613	NC_015138	GGC	2	6	222128	222133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5614	NC_015138	CAC	2	6	222134	222139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326315025
5615	NC_015138	CCGG	2	8	222157	222164	0 %	0 %	50 %	50 %	326315025
5616	NC_015138	CCT	2	6	222190	222195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326315025
5617	NC_015138	GC	4	8	222199	222206	0 %	0 %	50 %	50 %	326315025
5618	NC_015138	AGC	2	6	222207	222212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5619	NC_015138	TCG	2	6	222246	222251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5620	NC_015138	AGC	3	9	222252	222260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5621	NC_015138	CGC	2	6	222262	222267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315025
5622	NC_015138	CG	3	6	222275	222280	0 %	0 %	50 %	50 %	326315025
5623	NC_015138	CGGT	2	8	222294	222301	0 %	25 %	50 %	25 %	326315025
5624	NC_015138	GGC	2	6	222302	222307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5625	NC_015138	CAG	2	6	222350	222355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315025
5626	NC_015138	GC	5	10	222424	222433	0 %	0 %	50 %	50 %	326315025
5627	NC_015138	CTCG	2	8	222482	222489	0 %	25 %	25 %	50 %	326315025
5628	NC_015138	CAGC	2	8	222493	222500	25 %	0 %	25 %	50 %	326315025
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5630	NC_015138	GCGG	2	8	222588	222595	0 %	0 %	75 %	25 %	326315025
5631	NC_015138	GC	3	6	222627	222632	0 %	0 %	50 %	50 %	326315025
5632	NC_015138	GGT	2	6	222676	222681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315025
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5634	NC_015138	GCG	2	6	222771	222776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315025
5635	NC_015138	CCAT	2	8	222798	222805	25 %	25 %	0 %	50 %	326315025
5636	NC_015138	GGT	2	6	222817	222822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315025
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5644	NC_015138	GCGCCA	2	12	223041	223052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326315026
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5648	NC_015138	CGT	2	6	223152	223157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315026
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5651	NC_015138	CAG	2	6	223252	223257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315026
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5653	NC_015138	CGC	2	6	223314	223319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315026
5654	NC_015138	CAG	2	6	223438	223443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315026
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5657	NC_015138	G	6	6	223513	223518	0 %	0 %	100 %	0 %	326315026
5658	NC_015138	CGC	2	6	223519	223524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315026
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5662	NC_015138	GCA	2	6	223737	223742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315026
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5667	NC_015138	GCG	2	6	223892	223897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315026
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5731	NC_015138	CG	3	6	226693	226698	0 %	0 %	50 %	50 %	326315029
5732	NC_015138	GC	4	8	226778	226785	0 %	0 %	50 %	50 %	326315029
5733	NC_015138	CG	3	6	226795	226800	0 %	0 %	50 %	50 %	326315029
5734	NC_015138	TGCT	2	8	226868	226875	0 %	50 %	25 %	25 %	326315029
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5740	NC_015138	GCA	2	6	227010	227015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315029
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5742	NC_015138	GC	3	6	227256	227261	0 %	0 %	50 %	50 %	326315030
5743	NC_015138	GGC	2	6	227300	227305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315030
5744	NC_015138	GGC	2	6	227348	227353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315030
5745	NC_015138	TCCA	2	8	227385	227392	25 %	25 %	0 %	50 %	326315030
5746	NC_015138	TCGG	2	8	227434	227441	0 %	25 %	50 %	25 %	326315030
5747	NC_015138	GCCG	2	8	227468	227475	0 %	0 %	50 %	50 %	326315030
5748	NC_015138	CG	3	6	227474	227479	0 %	0 %	50 %	50 %	326315030
5749	NC_015138	CG	3	6	227489	227494	0 %	0 %	50 %	50 %	326315030
5750	NC_015138	CTCG	2	8	227510	227517	0 %	25 %	25 %	50 %	326315030
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5763	NC_015138	TGG	2	6	228138	228143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315030
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5852	NC_015138	GTG	2	6	231635	231640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326315034
5853	NC_015138	CGC	2	6	231642	231647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315034
5854	NC_015138	GC	3	6	231675	231680	0 %	0 %	50 %	50 %	326315034
5855	NC_015138	GGCG	2	8	231688	231695	0 %	0 %	75 %	25 %	326315034
5856	NC_015138	GCA	2	6	231730	231735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315034
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5858	NC_015138	GC	3	6	231761	231766	0 %	0 %	50 %	50 %	326315034
5859	NC_015138	GCT	2	6	231826	231831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315034
5860	NC_015138	CGA	2	6	231874	231879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315034
5861	NC_015138	CG	3	6	231926	231931	0 %	0 %	50 %	50 %	326315034
5862	NC_015138	TGC	2	6	231939	231944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315034
5863	NC_015138	CG	3	6	232002	232007	0 %	0 %	50 %	50 %	326315034
5864	NC_015138	GCA	2	6	232042	232047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326315034
5865	NC_015138	TCG	2	6	232089	232094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315034
5866	NC_015138	AGA	2	6	232095	232100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326315034
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5868	NC_015138	CCG	2	6	232200	232205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315034
5869	NC_015138	GCC	2	6	232252	232257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315034
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5974	NC_015138	GCCT	2	8	235920	235927	0 %	25 %	25 %	50 %	326315037
5975	NC_015138	CGG	2	6	236008	236013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315037
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5979	NC_015138	GCCT	2	8	236163	236170	0 %	25 %	25 %	50 %	326315037
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5981	NC_015138	GGCCC	2	10	236204	236213	0 %	0 %	40 %	60 %	326315037
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5986	NC_015138	CG	3	6	236468	236473	0 %	0 %	50 %	50 %	326315037
5987	NC_015138	GGCGAG	2	12	236538	236549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	326315037
5988	NC_015138	GCT	2	6	236561	236566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315037
5989	NC_015138	GAG	2	6	236571	236576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315037
5990	NC_015138	AGG	2	6	236581	236586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326315037
5991	NC_015138	GCCC	2	8	236609	236616	0 %	0 %	25 %	75 %	326315037
5992	NC_015138	GCG	2	6	236637	236642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315037
5993	NC_015138	GCC	2	6	236743	236748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
5994	NC_015138	CGACCT	2	12	236803	236814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326315038
5995	NC_015138	GGC	2	6	236869	236874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
5996	NC_015138	CCG	2	6	236875	236880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326315038
5997	NC_015138	GGC	2	6	236881	236886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326315038
5998	NC_015138	CTG	2	6	236936	236941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326315038
5999	NC_015138	GCCG	2	8	237028	237035	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038
6000	NC_015138	CG	3	6	237041	237046	0 %	0 %	50 %	50 %	326315038

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