MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	GC	3	6	219	224	0 %	0 %	50 %	50 %	319765070
2	NC_014911	CG	3	6	458	463	0 %	0 %	50 %	50 %	319765070
3	NC_014911	GC	3	6	717	722	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
4	NC_014911	GC	3	6	809	814	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
5	NC_014911	CG	3	6	855	860	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
6	NC_014911	GC	3	6	1602	1607	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
7	NC_014911	GC	3	6	1799	1804	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
8	NC_014911	GC	3	6	1842	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
9	NC_014911	CG	3	6	2191	2196	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
10	NC_014911	GC	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
11	NC_014911	GC	3	6	2467	2472	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
12	NC_014911	GC	3	6	2656	2661	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
13	NC_014911	CG	3	6	3361	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
14	NC_014911	GC	3	6	3485	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
15	NC_014911	GC	3	6	3725	3730	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
16	NC_014911	CG	3	6	3819	3824	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
17	NC_014911	GC	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
18	NC_014911	GC	3	6	4000	4005	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
19	NC_014911	GC	3	6	4436	4441	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
20	NC_014911	GC	3	6	4538	4543	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
21	NC_014911	GC	3	6	4785	4790	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
22	NC_014911	GC	3	6	4873	4878	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
23	NC_014911	GC	3	6	4998	5003	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
24	NC_014911	CG	3	6	5809	5814	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
25	NC_014911	GC	3	6	5836	5841	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
26	NC_014911	GC	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
27	NC_014911	CG	3	6	6291	6296	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
28	NC_014911	GC	3	6	6752	6757	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
29	NC_014911	GC	4	8	6771	6778	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
30	NC_014911	CG	3	6	6787	6792	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
31	NC_014911	GC	3	6	6821	6826	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
32	NC_014911	GC	3	6	6915	6920	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
33	NC_014911	CG	3	6	7152	7157	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
34	NC_014911	GC	3	6	7523	7528	0 %	0 %	50 %	50 %	319765074
35	NC_014911	GC	3	6	7730	7735	0 %	0 %	50 %	50 %	319765074
36	NC_014911	GC	3	6	7917	7922	0 %	0 %	50 %	50 %	319765075
37	NC_014911	CG	3	6	10662	10667	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
38	NC_014911	GC	3	6	10841	10846	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
39	NC_014911	CG	3	6	11023	11028	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
40	NC_014911	GC	3	6	11114	11119	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
41	NC_014911	GC	4	8	11132	11139	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
42	NC_014911	GC	3	6	11433	11438	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
43	NC_014911	CG	3	6	11761	11766	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
44	NC_014911	CG	3	6	11836	11841	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
45	NC_014911	GC	3	6	12311	12316	0 %	0 %	50 %	50 %	319765077
46	NC_014911	GT	3	6	13737	13742	0 %	50 %	50 %	0 %	319765079
47	NC_014911	GC	3	6	14733	14738	0 %	0 %	50 %	50 %	319765081
48	NC_014911	GC	3	6	14816	14821	0 %	0 %	50 %	50 %	319765081
49	NC_014911	CG	3	6	15118	15123	0 %	0 %	50 %	50 %	319765081
50	NC_014911	GC	3	6	15157	15162	0 %	0 %	50 %	50 %	319765081
51	NC_014911	CG	3	6	16031	16036	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
52	NC_014911	CG	3	6	16096	16101	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
53	NC_014911	GC	4	8	16263	16270	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
54	NC_014911	CG	3	6	16340	16345	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
55	NC_014911	GC	3	6	16487	16492	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
56	NC_014911	CG	3	6	17336	17341	0 %	0 %	50 %	50 %	319765084
57	NC_014911	CG	3	6	17710	17715	0 %	0 %	50 %	50 %	319765084
58	NC_014911	GC	3	6	17784	17789	0 %	0 %	50 %	50 %	319765084
59	NC_014911	CG	3	6	18096	18101	0 %	0 %	50 %	50 %	319765085
60	NC_014911	CG	3	6	18162	18167	0 %	0 %	50 %	50 %	319765085
61	NC_014911	CG	3	6	18243	18248	0 %	0 %	50 %	50 %	319765085
62	NC_014911	GC	3	6	19009	19014	0 %	0 %	50 %	50 %	319765086
63	NC_014911	GC	3	6	19411	19416	0 %	0 %	50 %	50 %	319765087
64	NC_014911	GC	3	6	19607	19612	0 %	0 %	50 %	50 %	319765087
65	NC_014911	CG	3	6	21234	21239	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
66	NC_014911	CG	3	6	21649	21654	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
67	NC_014911	CG	3	6	21854	21859	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
68	NC_014911	GC	3	6	22009	22014	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
69	NC_014911	GC	3	6	22310	22315	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
70	NC_014911	CG	4	8	28034	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
71	NC_014911	GC	3	6	28082	28087	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
72	NC_014911	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
73	NC_014911	GC	3	6	28175	28180	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
74	NC_014911	GC	3	6	28331	28336	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
75	NC_014911	GC	3	6	28410	28415	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
76	NC_014911	GC	3	6	28628	28633	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
77	NC_014911	GC	3	6	28732	28737	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
78	NC_014911	CG	3	6	28805	28810	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
79	NC_014911	GC	3	6	28841	28846	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
80	NC_014911	GC	3	6	28992	28997	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
81	NC_014911	CA	3	6	29053	29058	50 %	0 %	0 %	50 %	319765096
82	NC_014911	GC	4	8	29171	29178	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
83	NC_014911	CG	4	8	29240	29247	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
84	NC_014911	CG	3	6	29341	29346	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
85	NC_014911	GC	3	6	29357	29362	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
86	NC_014911	CG	4	8	29427	29434	0 %	0 %	50 %	50 %	319765097
87	NC_014911	CG	3	6	29437	29442	0 %	0 %	50 %	50 %	319765097
88	NC_014911	GC	3	6	29529	29534	0 %	0 %	50 %	50 %	319765097
89	NC_014911	GC	3	6	29564	29569	0 %	0 %	50 %	50 %	319765097
90	NC_014911	GC	3	6	30111	30116	0 %	0 %	50 %	50 %	319765097
91	NC_014911	GC	3	6	30782	30787	0 %	0 %	50 %	50 %	319765099
92	NC_014911	CA	3	6	30812	30817	50 %	0 %	0 %	50 %	319765099
93	NC_014911	GC	3	6	30934	30939	0 %	0 %	50 %	50 %	319765100
94	NC_014911	CG	3	6	30989	30994	0 %	0 %	50 %	50 %	319765100
95	NC_014911	GC	3	6	31087	31092	0 %	0 %	50 %	50 %	319765100
96	NC_014911	CG	3	6	31510	31515	0 %	0 %	50 %	50 %	319765101
97	NC_014911	GC	3	6	31712	31717	0 %	0 %	50 %	50 %	319765101
98	NC_014911	GC	3	6	32657	32662	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
99	NC_014911	AC	3	6	32956	32961	50 %	0 %	0 %	50 %	319765102
100	NC_014911	GC	3	6	33038	33043	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
101	NC_014911	GC	3	6	33702	33707	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
102	NC_014911	GC	3	6	34101	34106	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
103	NC_014911	GC	3	6	34195	34200	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
104	NC_014911	GC	3	6	34568	34573	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
105	NC_014911	CG	4	8	38630	38637	0 %	0 %	50 %	50 %	319765104
106	NC_014911	GC	3	6	39145	39150	0 %	0 %	50 %	50 %	319765105
107	NC_014911	GC	3	6	39232	39237	0 %	0 %	50 %	50 %	319765105
108	NC_014911	CG	3	6	39940	39945	0 %	0 %	50 %	50 %	319765106
109	NC_014911	CT	3	6	40440	40445	0 %	50 %	0 %	50 %	319765106
110	NC_014911	GC	3	6	40449	40454	0 %	0 %	50 %	50 %	319765106
111	NC_014911	GC	3	6	40556	40561	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
112	NC_014911	CG	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
113	NC_014911	CG	3	6	40959	40964	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
114	NC_014911	CG	3	6	41118	41123	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
115	NC_014911	CG	3	6	41233	41238	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
116	NC_014911	GC	4	8	42576	42583	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
117	NC_014911	CG	3	6	42660	42665	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
118	NC_014911	CG	3	6	42854	42859	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
119	NC_014911	CG	3	6	45289	45294	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
120	NC_014911	GC	3	6	45655	45660	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
121	NC_014911	GC	3	6	45971	45976	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
122	NC_014911	GC	3	6	46035	46040	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
123	NC_014911	CG	3	6	47922	47927	0 %	0 %	50 %	50 %	319765116
124	NC_014911	CT	3	6	48588	48593	0 %	50 %	0 %	50 %	319765117
125	NC_014911	GC	3	6	48767	48772	0 %	0 %	50 %	50 %	319765117
126	NC_014911	GC	3	6	48830	48835	0 %	0 %	50 %	50 %	319765117
127	NC_014911	GC	3	6	48939	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
128	NC_014911	GC	3	6	49031	49036	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
129	NC_014911	GC	3	6	49094	49099	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
130	NC_014911	GC	3	6	49785	49790	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
131	NC_014911	CG	3	6	50847	50852	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
132	NC_014911	CG	3	6	51062	51067	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
133	NC_014911	GC	3	6	51281	51286	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
134	NC_014911	CG	3	6	51554	51559	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
135	NC_014911	CG	3	6	51855	51860	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
136	NC_014911	CG	3	6	51931	51936	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
137	NC_014911	GC	4	8	52188	52195	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
138	NC_014911	GC	3	6	52327	52332	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
139	NC_014911	CG	3	6	52416	52421	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
140	NC_014911	GC	4	8	52459	52466	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
141	NC_014911	GC	3	6	52725	52730	0 %	0 %	50 %	50 %	319765121
142	NC_014911	GC	3	6	52823	52828	0 %	0 %	50 %	50 %	319765121
143	NC_014911	TC	3	6	53202	53207	0 %	50 %	0 %	50 %	319765121
144	NC_014911	TC	4	8	53509	53516	0 %	50 %	0 %	50 %	319765122
145	NC_014911	GC	3	6	53655	53660	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
146	NC_014911	CG	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
147	NC_014911	CG	3	6	54312	54317	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
148	NC_014911	CG	3	6	54530	54535	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
149	NC_014911	GC	3	6	54828	54833	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
150	NC_014911	AC	3	6	54923	54928	50 %	0 %	0 %	50 %	319765123
151	NC_014911	GC	3	6	55006	55011	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
152	NC_014911	GC	3	6	55981	55986	0 %	0 %	50 %	50 %	319765124
153	NC_014911	GC	3	6	56181	56186	0 %	0 %	50 %	50 %	319765124
154	NC_014911	GC	3	6	58246	58251	0 %	0 %	50 %	50 %	319765127
155	NC_014911	CG	3	6	58468	58473	0 %	0 %	50 %	50 %	319765127
156	NC_014911	GC	3	6	58677	58682	0 %	0 %	50 %	50 %	319765127
157	NC_014911	GC	3	6	59677	59682	0 %	0 %	50 %	50 %	319765129
158	NC_014911	GC	3	6	59948	59953	0 %	0 %	50 %	50 %	319765130
159	NC_014911	CT	4	8	60448	60455	0 %	50 %	0 %	50 %	319765131
160	NC_014911	GC	3	6	60470	60475	0 %	0 %	50 %	50 %	319765131
161	NC_014911	CG	3	6	60719	60724	0 %	0 %	50 %	50 %	319765131
162	NC_014911	AG	3	6	61055	61060	50 %	0 %	50 %	0 %	319765132
163	NC_014911	GC	3	6	63566	63571	0 %	0 %	50 %	50 %	319765134
164	NC_014911	CG	3	6	65231	65236	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
165	NC_014911	GC	3	6	65552	65557	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
166	NC_014911	CG	3	6	65592	65597	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
167	NC_014911	CA	3	6	65702	65707	50 %	0 %	0 %	50 %	319765135
168	NC_014911	CG	3	6	66256	66261	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
169	NC_014911	CG	3	6	66465	66470	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
170	NC_014911	CG	4	8	66956	66963	0 %	0 %	50 %	50 %	319765136
171	NC_014911	CG	3	6	67400	67405	0 %	0 %	50 %	50 %	319765136
172	NC_014911	AC	3	6	68070	68075	50 %	0 %	0 %	50 %	319765137
173	NC_014911	AC	3	6	68437	68442	50 %	0 %	0 %	50 %	319765137
174	NC_014911	GC	3	6	68849	68854	0 %	0 %	50 %	50 %	319765137
175	NC_014911	AC	3	6	69199	69204	50 %	0 %	0 %	50 %	319765138
176	NC_014911	CG	5	10	69432	69441	0 %	0 %	50 %	50 %	319765138
177	NC_014911	GC	3	6	69858	69863	0 %	0 %	50 %	50 %	319765139
178	NC_014911	GT	3	6	70539	70544	0 %	50 %	50 %	0 %	319765141
179	NC_014911	GC	3	6	70928	70933	0 %	0 %	50 %	50 %	319765141
180	NC_014911	CA	3	6	71563	71568	50 %	0 %	0 %	50 %	319765141
181	NC_014911	GC	3	6	71829	71834	0 %	0 %	50 %	50 %	319765141
182	NC_014911	CG	3	6	72289	72294	0 %	0 %	50 %	50 %	319765143
183	NC_014911	GC	3	6	72805	72810	0 %	0 %	50 %	50 %	319765144
184	NC_014911	GC	3	6	73216	73221	0 %	0 %	50 %	50 %	319765145
185	NC_014911	CG	3	6	74159	74164	0 %	0 %	50 %	50 %	319765147
186	NC_014911	GC	3	6	74215	74220	0 %	0 %	50 %	50 %	319765147
187	NC_014911	GT	3	6	74322	74327	0 %	50 %	50 %	0 %	319765147
188	NC_014911	GC	3	6	74738	74743	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
189	NC_014911	CG	3	6	74889	74894	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
190	NC_014911	CG	4	8	75208	75215	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
191	NC_014911	CG	4	8	75290	75297	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
192	NC_014911	GC	4	8	75449	75456	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
193	NC_014911	CG	3	6	75483	75488	0 %	0 %	50 %	50 %	319765148
194	NC_014911	CG	3	6	75789	75794	0 %	0 %	50 %	50 %	319765149
195	NC_014911	GC	3	6	76057	76062	0 %	0 %	50 %	50 %	319765150
196	NC_014911	CG	3	6	78304	78309	0 %	0 %	50 %	50 %	319765155
197	NC_014911	GC	3	6	78434	78439	0 %	0 %	50 %	50 %	319765156

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.