MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	CAGGG	2	10	172	181	20 %	0 %	60 %	20 %	319765070
2	NC_014911	GCC	2	6	184	189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765070
3	NC_014911	GC	3	6	219	224	0 %	0 %	50 %	50 %	319765070
4	NC_014911	TCG	2	6	226	231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
5	NC_014911	CCG	2	6	265	270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765070
6	NC_014911	TCG	2	6	285	290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
7	NC_014911	TGC	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
8	NC_014911	GTC	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
9	NC_014911	TCG	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
10	NC_014911	GCG	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765070
11	NC_014911	CGAG	2	8	359	366	25 %	0 %	50 %	25 %	319765070
12	NC_014911	A	8	8	370	377	100 %	0 %	0 %	0 %	319765070
13	NC_014911	GGC	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765070
14	NC_014911	GAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765070
15	NC_014911	GGA	2	6	448	453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319765070
16	NC_014911	CG	3	6	458	463	0 %	0 %	50 %	50 %	319765070
17	NC_014911	GCT	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
18	NC_014911	CTG	2	6	544	549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
19	NC_014911	TGC	3	9	581	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
20	NC_014911	TCG	2	6	590	595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765070
21	NC_014911	GCTC	2	8	651	658	0 %	25 %	25 %	50 %	319765071
22	NC_014911	TGC	2	6	686	691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
23	NC_014911	GC	3	6	717	722	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
24	NC_014911	GCC	2	6	749	754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
25	NC_014911	TCG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
26	NC_014911	CGG	3	9	780	788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
27	NC_014911	GCT	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
28	NC_014911	GC	3	6	809	814	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
29	NC_014911	CG	3	6	855	860	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
30	NC_014911	CGGC	2	8	873	880	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
31	NC_014911	GCC	2	6	904	909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
32	NC_014911	GCC	2	6	923	928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
33	NC_014911	GTT	2	6	949	954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765071
34	NC_014911	GTC	3	9	979	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
35	NC_014911	GAT	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765071
36	NC_014911	GGC	2	6	1066	1071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
37	NC_014911	CGTGG	2	10	1075	1084	0 %	20 %	60 %	20 %	319765071
38	NC_014911	GCC	2	6	1106	1111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
39	NC_014911	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
40	NC_014911	GCC	2	6	1165	1170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
41	NC_014911	TCCT	2	8	1186	1193	0 %	50 %	0 %	50 %	319765071
42	NC_014911	TCC	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765071
43	NC_014911	TTGC	2	8	1252	1259	0 %	50 %	25 %	25 %	319765071
44	NC_014911	TCT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765071
45	NC_014911	CGGT	2	8	1301	1308	0 %	25 %	50 %	25 %	319765071
46	NC_014911	GCT	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
47	NC_014911	CCGA	2	8	1390	1397	25 %	0 %	25 %	50 %	319765071
48	NC_014911	CCT	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765071
49	NC_014911	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
50	NC_014911	TTG	3	9	1541	1549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765071
51	NC_014911	CCGG	2	8	1559	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
52	NC_014911	GC	3	6	1602	1607	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
53	NC_014911	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765071
54	NC_014911	GCC	2	6	1615	1620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
55	NC_014911	CCAT	2	8	1646	1653	25 %	25 %	0 %	50 %	319765071
56	NC_014911	TGC	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
57	NC_014911	CGC	2	6	1789	1794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
58	NC_014911	GC	3	6	1799	1804	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
59	NC_014911	GC	3	6	1842	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
60	NC_014911	CGG	2	6	1848	1853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
61	NC_014911	GCT	2	6	1869	1874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
62	NC_014911	CTG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
63	NC_014911	CTG	2	6	1912	1917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
64	NC_014911	CGG	2	6	2032	2037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
65	NC_014911	TGC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
66	NC_014911	CTG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
67	NC_014911	CG	3	6	2191	2196	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
68	NC_014911	CGG	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
69	NC_014911	GGC	2	6	2329	2334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
70	NC_014911	GC	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
71	NC_014911	CGA	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765071
72	NC_014911	GC	3	6	2467	2472	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
73	NC_014911	GGC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
74	NC_014911	CGA	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765071
75	NC_014911	GGC	2	6	2576	2581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
76	NC_014911	CGG	2	6	2640	2645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
77	NC_014911	GC	3	6	2656	2661	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
78	NC_014911	GGC	3	9	2662	2670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
79	NC_014911	CAG	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765071
80	NC_014911	GGC	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
81	NC_014911	CCT	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765071
82	NC_014911	TGC	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
83	NC_014911	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765071
84	NC_014911	TGG	2	6	2852	2857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765071
85	NC_014911	TGC	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
86	NC_014911	GCT	2	6	2958	2963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
87	NC_014911	TGTCGG	2	12	3033	3044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319765071
88	NC_014911	TGC	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
89	NC_014911	CTG	3	9	3283	3291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
90	NC_014911	TCT	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765071
91	NC_014911	CGG	2	6	3354	3359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
92	NC_014911	CG	3	6	3361	3366	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
93	NC_014911	GGC	2	6	3418	3423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
94	NC_014911	TCG	2	6	3455	3460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
95	NC_014911	CGA	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765071
96	NC_014911	GC	3	6	3485	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
97	NC_014911	GTA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765071
98	NC_014911	GTCG	2	8	3646	3653	0 %	25 %	50 %	25 %	319765071
99	NC_014911	CGG	2	6	3678	3683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
100	NC_014911	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
101	NC_014911	GC	3	6	3725	3730	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
102	NC_014911	CTT	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765071
103	NC_014911	GCG	2	6	3768	3773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
104	NC_014911	CG	3	6	3819	3824	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
105	NC_014911	GCCG	2	8	3879	3886	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
106	NC_014911	GTC	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
107	NC_014911	GC	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
108	NC_014911	CGG	3	9	3972	3980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765071
109	NC_014911	GC	3	6	4000	4005	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
110	NC_014911	GGT	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765071
111	NC_014911	CGGTG	2	10	4123	4132	0 %	20 %	60 %	20 %	319765071
112	NC_014911	GCT	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
113	NC_014911	CTT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765071
114	NC_014911	CTG	2	6	4240	4245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
115	NC_014911	TGT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765071
116	NC_014911	GTC	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
117	NC_014911	GCT	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765071
118	NC_014911	GGCTC	2	10	4392	4401	0 %	20 %	40 %	40 %	319765071
119	NC_014911	GC	3	6	4436	4441	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
120	NC_014911	GGGT	2	8	4497	4504	0 %	25 %	75 %	0 %	319765071
121	NC_014911	GCGG	2	8	4510	4517	0 %	0 %	75 %	25 %	319765071
122	NC_014911	GC	3	6	4538	4543	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
123	NC_014911	TCA	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765071
124	NC_014911	CGGC	2	8	4667	4674	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
125	NC_014911	GCC	2	6	4699	4704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765071
126	NC_014911	CGGC	2	8	4713	4720	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
127	NC_014911	GC	3	6	4785	4790	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
128	NC_014911	GC	3	6	4873	4878	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
129	NC_014911	GGC	2	6	4879	4884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765072
130	NC_014911	GTG	3	9	4934	4942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765072
131	NC_014911	CGG	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765072
132	NC_014911	TCG	2	6	4973	4978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765072
133	NC_014911	GC	3	6	4998	5003	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
134	NC_014911	CCA	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765072
135	NC_014911	GTC	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765072
136	NC_014911	CGG	2	6	5034	5039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765072
137	NC_014911	TCC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765072
138	NC_014911	TCG	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765072
139	NC_014911	TCT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765072
140	NC_014911	CGGC	2	8	5159	5166	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
141	NC_014911	CGT	3	9	5169	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765072
142	NC_014911	CGG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765072
143	NC_014911	TCG	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765072
144	NC_014911	GCG	2	6	5213	5218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765072
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147	NC_014911	CCA	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765073
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149	NC_014911	CGGC	2	8	5389	5396	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
150	NC_014911	GCC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765073
151	NC_014911	TGA	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765073
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153	NC_014911	TGA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765073
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157	NC_014911	CG	3	6	5809	5814	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
158	NC_014911	GC	3	6	5836	5841	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
159	NC_014911	GGC	2	6	5843	5848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765073
160	NC_014911	GTC	3	9	5932	5940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765073
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164	NC_014911	GCGCTC	2	12	6124	6135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765073
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167	NC_014911	GTC	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765073
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169	NC_014911	CG	3	6	6291	6296	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
170	NC_014911	TGC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765073
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182	NC_014911	ACGGC	2	10	6663	6672	20 %	0 %	40 %	40 %	319765073
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188	NC_014911	CG	3	6	6787	6792	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
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240	NC_014911	GCATC	2	10	8848	8857	20 %	20 %	20 %	40 %	319765075
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250	NC_014911	TGA	2	6	9169	9174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765075
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257	NC_014911	GGCC	2	8	9391	9398	0 %	0 %	50 %	50 %	319765075
258	NC_014911	CTT	2	6	9410	9415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765075
259	NC_014911	GAC	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765075
260	NC_014911	GCCACG	2	12	9483	9494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765075
261	NC_014911	CAG	2	6	9497	9502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765075
262	NC_014911	TGC	2	6	9529	9534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765075
263	NC_014911	GAA	2	6	9659	9664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765075
264	NC_014911	GCC	2	6	9683	9688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765075
265	NC_014911	GCA	2	6	9715	9720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765075
266	NC_014911	GTT	2	6	9767	9772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765075
267	NC_014911	TCCT	2	8	9792	9799	0 %	50 %	0 %	50 %	319765076
268	NC_014911	TCA	2	6	9905	9910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765076
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270	NC_014911	CGG	2	6	10072	10077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765076
271	NC_014911	TGC	2	6	10145	10150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765076
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273	NC_014911	CCG	2	6	10193	10198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765076
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279	NC_014911	GCC	2	6	10423	10428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765076
280	NC_014911	GCC	2	6	10506	10511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765076
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287	NC_014911	TGT	2	6	10755	10760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765076
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291	NC_014911	GGC	2	6	10849	10854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765076
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299	NC_014911	CG	3	6	11023	11028	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
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303	NC_014911	GC	3	6	11114	11119	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
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381	NC_014911	GCTCCT	2	12	14644	14655	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319765081
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384	NC_014911	GC	3	6	14733	14738	0 %	0 %	50 %	50 %	319765081
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392	NC_014911	CTG	2	6	15062	15067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765081
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