MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014911	TCA	2	6	19484	19489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765087
502	NC_014911	GCC	2	6	19509	19514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765087
503	NC_014911	CCG	2	6	19540	19545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765087
504	NC_014911	TTC	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765087
505	NC_014911	GC	3	6	19607	19612	0 %	0 %	50 %	50 %	319765087
506	NC_014911	GAA	2	6	19867	19872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765088
507	NC_014911	TGA	2	6	19875	19880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765088
508	NC_014911	GGCC	2	8	19944	19951	0 %	0 %	50 %	50 %	319765088
509	NC_014911	GCA	2	6	19988	19993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765088
510	NC_014911	CGG	2	6	20026	20031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765088
511	NC_014911	CGCTC	2	10	20224	20233	0 %	20 %	20 %	60 %	319765089
512	NC_014911	GCC	3	9	20246	20254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765089
513	NC_014911	AGC	2	6	20255	20260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765089
514	NC_014911	TCC	2	6	20282	20287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765089
515	NC_014911	GCC	2	6	20299	20304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765089
516	NC_014911	TGC	2	6	20310	20315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765089
517	NC_014911	CAT	2	6	20331	20336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765089
518	NC_014911	GAT	2	6	20344	20349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765089
519	NC_014911	GCA	2	6	20389	20394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765089
520	NC_014911	GAT	2	6	20401	20406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765089
521	NC_014911	GGC	2	6	20564	20569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765090
522	NC_014911	GCC	2	6	20616	20621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765090
523	NC_014911	CGG	2	6	20649	20654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765090
524	NC_014911	CAG	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765091
525	NC_014911	CCCA	2	8	20964	20971	25 %	0 %	0 %	75 %	319765091
526	NC_014911	GCC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765091
527	NC_014911	GCA	2	6	21049	21054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765091
528	NC_014911	CGC	2	6	21070	21075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765091
529	NC_014911	CGGC	2	8	21094	21101	0 %	0 %	50 %	50 %	319765091
530	NC_014911	CGT	2	6	21127	21132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765091
531	NC_014911	CCA	2	6	21218	21223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765092
532	NC_014911	CGG	2	6	21226	21231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765092
533	NC_014911	CG	3	6	21234	21239	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
534	NC_014911	CCGG	2	8	21257	21264	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
535	NC_014911	GAT	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765092
536	NC_014911	TGG	2	6	21349	21354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765092
537	NC_014911	CCA	2	6	21398	21403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765092
538	NC_014911	TGC	2	6	21437	21442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765092
539	NC_014911	TCG	2	6	21467	21472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765092
540	NC_014911	TGC	2	6	21524	21529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765092
541	NC_014911	CCG	2	6	21545	21550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
542	NC_014911	TCGC	2	8	21561	21568	0 %	25 %	25 %	50 %	319765092
543	NC_014911	GGC	2	6	21600	21605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765092
544	NC_014911	GCC	2	6	21610	21615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
545	NC_014911	CGC	2	6	21627	21632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
546	NC_014911	GCC	2	6	21637	21642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
547	NC_014911	CG	3	6	21649	21654	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
548	NC_014911	GCA	2	6	21674	21679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765092
549	NC_014911	CGG	2	6	21702	21707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765092
550	NC_014911	CGCGC	2	10	21728	21737	0 %	0 %	40 %	60 %	319765092
551	NC_014911	CGG	2	6	21738	21743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765092
552	NC_014911	GGCC	2	8	21749	21756	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
553	NC_014911	CTT	2	6	21822	21827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765092
554	NC_014911	CG	3	6	21854	21859	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
555	NC_014911	GCGA	2	8	21902	21909	25 %	0 %	50 %	25 %	319765092
556	NC_014911	CCA	2	6	22001	22006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765092
557	NC_014911	GC	3	6	22009	22014	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
558	NC_014911	CGCC	2	8	22019	22026	0 %	0 %	25 %	75 %	319765092
559	NC_014911	CGGC	2	8	22102	22109	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
560	NC_014911	TCG	3	9	22114	22122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765092
561	NC_014911	GCC	2	6	22143	22148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
562	NC_014911	GAT	2	6	22161	22166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765092
563	NC_014911	GCC	3	9	22195	22203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
564	NC_014911	CGC	2	6	22208	22213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
565	NC_014911	CCA	2	6	22235	22240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765092
566	NC_014911	CAGC	2	8	22256	22263	25 %	0 %	25 %	50 %	319765092
567	NC_014911	CAG	2	6	22293	22298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765092
568	NC_014911	GCC	2	6	22303	22308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765092
569	NC_014911	GC	3	6	22310	22315	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
570	NC_014911	TTCGC	2	10	22349	22358	0 %	40 %	20 %	40 %	319765092
571	NC_014911	TCA	2	6	22410	22415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765093
572	NC_014911	GGCC	2	8	22451	22458	0 %	0 %	50 %	50 %	319765093
573	NC_014911	GCCG	2	8	22497	22504	0 %	0 %	50 %	50 %	319765093
574	NC_014911	CGG	2	6	22565	22570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765093
575	NC_014911	CCG	2	6	22654	22659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765093
576	NC_014911	GTA	2	6	22671	22676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765093
577	NC_014911	CGC	2	6	22739	22744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765093
578	NC_014911	CAT	2	6	22746	22751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765093
579	NC_014911	GTAG	2	8	22767	22774	25 %	25 %	50 %	0 %	319765093
580	NC_014911	AAG	2	6	22777	22782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765093
581	NC_014911	GCT	2	6	24072	24077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765094
582	NC_014911	GCT	2	6	24184	24189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765094
583	NC_014911	ATGG	2	8	24205	24212	25 %	25 %	50 %	0 %	319765094
584	NC_014911	GCG	2	6	24308	24313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765094
585	NC_014911	T	7	7	24344	24350	0 %	100 %	0 %	0 %	319765094
586	NC_014911	ATC	2	6	26533	26538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765095
587	NC_014911	TGT	2	6	26623	26628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765095
588	NC_014911	GAT	2	6	26672	26677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765095
589	NC_014911	GTG	2	6	26695	26700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765095
590	NC_014911	CTA	2	6	27965	27970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765096
591	NC_014911	CG	4	8	28034	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
592	NC_014911	GGCC	2	8	28052	28059	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
593	NC_014911	GC	3	6	28082	28087	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
594	NC_014911	TCC	2	6	28114	28119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765096
595	NC_014911	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
596	NC_014911	GC	3	6	28175	28180	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
597	NC_014911	CGCC	2	8	28223	28230	0 %	0 %	25 %	75 %	319765096
598	NC_014911	CCGC	2	8	28232	28239	0 %	0 %	25 %	75 %	319765096
599	NC_014911	GC	3	6	28331	28336	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
600	NC_014911	ATCT	2	8	28386	28393	25 %	50 %	0 %	25 %	319765096
601	NC_014911	CTT	2	6	28397	28402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765096
602	NC_014911	GC	3	6	28410	28415	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
603	NC_014911	GCTCGC	2	12	28550	28561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765096
604	NC_014911	CGGTGG	2	12	28588	28599	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319765096
605	NC_014911	GC	3	6	28628	28633	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
606	NC_014911	CTT	2	6	28655	28660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765096
607	NC_014911	GAC	2	6	28686	28691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765096
608	NC_014911	CAGGCC	2	12	28701	28712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765096
609	NC_014911	GCC	2	6	28725	28730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765096
610	NC_014911	GC	3	6	28732	28737	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
611	NC_014911	CGAGCG	2	12	28787	28798	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319765096
612	NC_014911	CG	3	6	28805	28810	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
613	NC_014911	CCGA	2	8	28827	28834	25 %	0 %	25 %	50 %	319765096
614	NC_014911	GC	3	6	28841	28846	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
615	NC_014911	CGG	2	6	28852	28857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765096
616	NC_014911	ACT	2	6	28891	28896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765096
617	NC_014911	GC	3	6	28992	28997	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
618	NC_014911	CCG	2	6	29006	29011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765096
619	NC_014911	CAG	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765096
620	NC_014911	TCG	2	6	29047	29052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765096
621	NC_014911	CA	3	6	29053	29058	50 %	0 %	0 %	50 %	319765096
622	NC_014911	ACCG	2	8	29085	29092	25 %	0 %	25 %	50 %	319765096
623	NC_014911	CGG	2	6	29098	29103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765096
624	NC_014911	GCT	2	6	29123	29128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765096
625	NC_014911	GCC	2	6	29136	29141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765096
626	NC_014911	GCG	2	6	29146	29151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765096
627	NC_014911	CAC	2	6	29165	29170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765096
628	NC_014911	GC	4	8	29171	29178	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
629	NC_014911	CGA	2	6	29228	29233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765096
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882	NC_014911	GAT	3	9	42549	42557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765109
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1000	NC_014911	CTG	2	6	48757	48762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765117

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