MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CG	3	6	432	437	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
2	NC_014908	GC	5	10	766	775	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
3	NC_014908	GC	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
4	NC_014908	GC	3	6	1557	1562	0 %	0 %	50 %	50 %	319760026
5	NC_014908	AG	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760026
6	NC_014908	AC	3	6	3359	3364	50 %	0 %	0 %	50 %	319760028
7	NC_014908	CG	3	6	3487	3492	0 %	0 %	50 %	50 %	319760028
8	NC_014908	GA	3	6	3768	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760028
9	NC_014908	GC	3	6	4366	4371	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
10	NC_014908	CG	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
11	NC_014908	AG	3	6	5709	5714	50 %	0 %	50 %	0 %	319760032
12	NC_014908	GC	4	8	6343	6350	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
13	NC_014908	GC	3	6	6659	6664	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
14	NC_014908	GC	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
15	NC_014908	CT	3	6	8520	8525	0 %	50 %	0 %	50 %	319760034
16	NC_014908	CT	3	6	11630	11635	0 %	50 %	0 %	50 %	319760037
17	NC_014908	CG	3	6	11656	11661	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
18	NC_014908	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
19	NC_014908	GC	4	8	11873	11880	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
20	NC_014908	CG	3	6	12468	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
21	NC_014908	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	319760037
22	NC_014908	AG	3	6	13532	13537	50 %	0 %	50 %	0 %	319760037
23	NC_014908	GT	3	6	14017	14022	0 %	50 %	50 %	0 %	319760038
24	NC_014908	AG	3	6	14138	14143	50 %	0 %	50 %	0 %	319760038
25	NC_014908	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	319760040
26	NC_014908	CG	3	6	16180	16185	0 %	0 %	50 %	50 %	319760041
27	NC_014908	CT	3	6	16499	16504	0 %	50 %	0 %	50 %	319760042
28	NC_014908	CG	3	6	17457	17462	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
29	NC_014908	CG	3	6	17748	17753	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
30	NC_014908	AG	3	6	18882	18887	50 %	0 %	50 %	0 %	319760045
31	NC_014908	CG	3	6	19150	19155	0 %	0 %	50 %	50 %	319760045
32	NC_014908	GA	3	6	21261	21266	50 %	0 %	50 %	0 %	319760046
33	NC_014908	GC	3	6	21515	21520	0 %	0 %	50 %	50 %	319760046
34	NC_014908	CG	3	6	21895	21900	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
35	NC_014908	GA	3	6	21914	21919	50 %	0 %	50 %	0 %	319760047
36	NC_014908	CG	3	6	22095	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
37	NC_014908	AC	3	6	22221	22226	50 %	0 %	0 %	50 %	319760047
38	NC_014908	GC	3	6	22971	22976	0 %	0 %	50 %	50 %	319760048
39	NC_014908	GC	5	10	23063	23072	0 %	0 %	50 %	50 %	319760048
40	NC_014908	TG	3	6	24419	24424	0 %	50 %	50 %	0 %	319760049
41	NC_014908	AG	3	6	24489	24494	50 %	0 %	50 %	0 %	319760049
42	NC_014908	GA	3	6	24707	24712	50 %	0 %	50 %	0 %	319760049
43	NC_014908	GC	3	6	24935	24940	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
44	NC_014908	CG	3	6	24941	24946	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
45	NC_014908	CG	4	8	25018	25025	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
46	NC_014908	GC	3	6	25120	25125	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
47	NC_014908	CT	3	6	25332	25337	0 %	50 %	0 %	50 %	319760050
48	NC_014908	GA	3	6	25921	25926	50 %	0 %	50 %	0 %	319760050
49	NC_014908	CG	3	6	26092	26097	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
50	NC_014908	CG	3	6	26316	26321	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
51	NC_014908	GT	3	6	26813	26818	0 %	50 %	50 %	0 %	319760050
52	NC_014908	TA	3	6	27625	27630	50 %	50 %	0 %	0 %	319760050
53	NC_014908	CT	3	6	28269	28274	0 %	50 %	0 %	50 %	319760050
54	NC_014908	CT	4	8	29446	29453	0 %	50 %	0 %	50 %	319760051
55	NC_014908	TA	3	6	29727	29732	50 %	50 %	0 %	0 %	319760051
56	NC_014908	CG	3	6	29774	29779	0 %	0 %	50 %	50 %	319760051
57	NC_014908	CG	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	319760052
58	NC_014908	AT	3	6	31356	31361	50 %	50 %	0 %	0 %	319760053
59	NC_014908	GA	3	6	31513	31518	50 %	0 %	50 %	0 %	319760053
60	NC_014908	CG	3	6	32233	32238	0 %	0 %	50 %	50 %	319760053
61	NC_014908	CT	3	6	32433	32438	0 %	50 %	0 %	50 %	319760053
62	NC_014908	GC	3	6	32462	32467	0 %	0 %	50 %	50 %	319760053
63	NC_014908	GC	3	6	35505	35510	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
64	NC_014908	GC	3	6	36359	36364	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
65	NC_014908	GC	3	6	36428	36433	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
66	NC_014908	GC	3	6	36497	36502	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
67	NC_014908	GC	3	6	36842	36847	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
68	NC_014908	GC	3	6	36911	36916	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
69	NC_014908	GC	3	6	36980	36985	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
70	NC_014908	GC	3	6	37049	37054	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
71	NC_014908	GC	3	6	37256	37261	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
72	NC_014908	GC	3	6	37325	37330	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
73	NC_014908	GC	3	6	37463	37468	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
74	NC_014908	GC	3	6	37601	37606	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
75	NC_014908	GC	3	6	37670	37675	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
76	NC_014908	GC	3	6	37877	37882	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
77	NC_014908	GC	3	6	37946	37951	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
78	NC_014908	GC	3	6	38015	38020	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
79	NC_014908	TC	3	6	38194	38199	0 %	50 %	0 %	50 %	319760054
80	NC_014908	GC	3	6	38557	38562	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
81	NC_014908	GC	3	6	38956	38961	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
82	NC_014908	GC	3	6	38984	38989	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
83	NC_014908	TG	3	6	39404	39409	0 %	50 %	50 %	0 %	319760056
84	NC_014908	CT	3	6	39486	39491	0 %	50 %	0 %	50 %	319760056
85	NC_014908	TA	4	8	39524	39531	50 %	50 %	0 %	0 %	319760056
86	NC_014908	GT	3	6	40553	40558	0 %	50 %	50 %	0 %	319760057
87	NC_014908	CG	4	8	41678	41685	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
88	NC_014908	GC	3	6	41991	41996	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
89	NC_014908	CG	3	6	42156	42161	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
90	NC_014908	CG	3	6	42488	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
91	NC_014908	GA	3	6	43703	43708	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
92	NC_014908	GC	3	6	43755	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	319760059
93	NC_014908	GA	4	8	44278	44285	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
94	NC_014908	TG	3	6	44470	44475	0 %	50 %	50 %	0 %	319760059
95	NC_014908	AG	3	6	44917	44922	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
96	NC_014908	GT	3	6	45789	45794	0 %	50 %	50 %	0 %	319760060
97	NC_014908	GC	3	6	46547	46552	0 %	0 %	50 %	50 %	319760061
98	NC_014908	TG	3	6	47380	47385	0 %	50 %	50 %	0 %	319760062
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101	NC_014908	GA	3	6	48065	48070	50 %	0 %	50 %	0 %	319760064
102	NC_014908	AC	3	6	48480	48485	50 %	0 %	0 %	50 %	319760065
103	NC_014908	GC	3	6	50708	50713	0 %	0 %	50 %	50 %	319760067
104	NC_014908	GC	3	6	51894	51899	0 %	0 %	50 %	50 %	319760070
105	NC_014908	CT	3	6	52192	52197	0 %	50 %	0 %	50 %	319760071
106	NC_014908	GC	3	6	52923	52928	0 %	0 %	50 %	50 %	319760072
107	NC_014908	AC	3	6	54246	54251	50 %	0 %	0 %	50 %	319760075
108	NC_014908	GC	3	6	54511	54516	0 %	0 %	50 %	50 %	319760075
109	NC_014908	CA	3	6	55756	55761	50 %	0 %	0 %	50 %	319760077
110	NC_014908	CG	3	6	56848	56853	0 %	0 %	50 %	50 %	319760080
111	NC_014908	GC	3	6	57296	57301	0 %	0 %	50 %	50 %	319760080
112	NC_014908	TG	3	6	57453	57458	0 %	50 %	50 %	0 %	319760080
113	NC_014908	CG	3	6	57593	57598	0 %	0 %	50 %	50 %	319760081
114	NC_014908	GA	3	6	57772	57777	50 %	0 %	50 %	0 %	319760082
115	NC_014908	CG	3	6	57876	57881	0 %	0 %	50 %	50 %	319760082
116	NC_014908	GT	3	6	58682	58687	0 %	50 %	50 %	0 %	319760083
117	NC_014908	CA	3	6	59680	59685	50 %	0 %	0 %	50 %	319760085
118	NC_014908	CG	3	6	59984	59989	0 %	0 %	50 %	50 %	319760086
119	NC_014908	CA	3	6	60885	60890	50 %	0 %	0 %	50 %	319760087
120	NC_014908	GC	3	6	61155	61160	0 %	0 %	50 %	50 %	319760088
121	NC_014908	AC	3	6	61258	61263	50 %	0 %	0 %	50 %	319760088
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123	NC_014908	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	319760090
124	NC_014908	TG	3	6	62597	62602	0 %	50 %	50 %	0 %	319760092
125	NC_014908	GC	3	6	63296	63301	0 %	0 %	50 %	50 %	319760094
126	NC_014908	AC	3	6	63648	63653	50 %	0 %	0 %	50 %	319760095
127	NC_014908	GC	3	6	63835	63840	0 %	0 %	50 %	50 %	319760095
128	NC_014908	GC	3	6	66270	66275	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
129	NC_014908	CG	3	6	66315	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
130	NC_014908	GC	3	6	67541	67546	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
131	NC_014908	GC	4	8	67571	67578	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
132	NC_014908	GC	3	6	67888	67893	0 %	0 %	50 %	50 %	319760101
133	NC_014908	CT	3	6	67944	67949	0 %	50 %	0 %	50 %	319760101
134	NC_014908	CG	3	6	68029	68034	0 %	0 %	50 %	50 %	319760101
135	NC_014908	TC	3	6	69325	69330	0 %	50 %	0 %	50 %	319760104
136	NC_014908	GC	3	6	69986	69991	0 %	0 %	50 %	50 %	319760105
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139	NC_014908	GC	3	6	71352	71357	0 %	0 %	50 %	50 %	319760108
140	NC_014908	GC	3	6	71538	71543	0 %	0 %	50 %	50 %	319760108
141	NC_014908	AC	3	6	71847	71852	50 %	0 %	0 %	50 %	319760109
142	NC_014908	GC	3	6	72071	72076	0 %	0 %	50 %	50 %	319760109
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.