MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CTTC	2	8	258	265	0 %	50 %	0 %	50 %	319760025
2	NC_014908	TGCG	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	319760025
3	NC_014908	CGAG	2	8	1803	1810	25 %	0 %	50 %	25 %	319760026
4	NC_014908	GCCC	2	8	1910	1917	0 %	0 %	25 %	75 %	319760026
5	NC_014908	GAAT	2	8	3066	3073	50 %	25 %	25 %	0 %	319760027
6	NC_014908	CGCT	2	8	3499	3506	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
7	NC_014908	CGCT	2	8	3560	3567	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
8	NC_014908	AAGC	2	8	3787	3794	50 %	0 %	25 %	25 %	319760028
9	NC_014908	GGAC	2	8	5757	5764	25 %	0 %	50 %	25 %	319760032
10	NC_014908	TGGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	75 %	0 %	319760032
11	NC_014908	GGGC	2	8	6310	6317	0 %	0 %	75 %	25 %	319760032
12	NC_014908	CACG	2	8	6517	6524	25 %	0 %	25 %	50 %	319760032
13	NC_014908	TGAG	2	8	7179	7186	25 %	25 %	50 %	0 %	319760032
14	NC_014908	ACCA	2	8	7478	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	319760033
15	NC_014908	GCTG	2	8	7542	7549	0 %	25 %	50 %	25 %	319760033
16	NC_014908	CTGG	2	8	8142	8149	0 %	25 %	50 %	25 %	319760034
17	NC_014908	CATC	2	8	8316	8323	25 %	25 %	0 %	50 %	319760034
18	NC_014908	GGCG	2	8	9444	9451	0 %	0 %	75 %	25 %	319760036
19	NC_014908	AATG	2	8	9797	9804	50 %	25 %	25 %	0 %	319760036
20	NC_014908	ACAA	2	8	12144	12151	75 %	0 %	0 %	25 %	319760037
21	NC_014908	AAAC	2	8	13057	13064	75 %	0 %	0 %	25 %	319760037
22	NC_014908	AGGT	2	8	14272	14279	25 %	25 %	50 %	0 %	319760038
23	NC_014908	GCAA	2	8	14876	14883	50 %	0 %	25 %	25 %	319760040
24	NC_014908	TCAT	2	8	14935	14942	25 %	50 %	0 %	25 %	319760040
25	NC_014908	GCCG	2	8	15261	15268	0 %	0 %	50 %	50 %	319760040
26	NC_014908	CCTG	2	8	16813	16820	0 %	25 %	25 %	50 %	319760042
27	NC_014908	CGCC	2	8	17019	17026	0 %	0 %	25 %	75 %	319760042
28	NC_014908	GCCG	2	8	17068	17075	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
29	NC_014908	AGCG	2	8	17252	17259	25 %	0 %	50 %	25 %	319760042
30	NC_014908	GCGG	2	8	17269	17276	0 %	0 %	75 %	25 %	319760042
31	NC_014908	ACGG	2	8	17345	17352	25 %	0 %	50 %	25 %	319760042
32	NC_014908	CGGC	2	8	17783	17790	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
33	NC_014908	ACGC	2	8	18093	18100	25 %	0 %	25 %	50 %	319760043
34	NC_014908	AAGC	2	8	18458	18465	50 %	0 %	25 %	25 %	319760044
35	NC_014908	GCGG	2	8	18555	18562	0 %	0 %	75 %	25 %	319760044
36	NC_014908	CATG	2	8	19161	19168	25 %	25 %	25 %	25 %	319760045
37	NC_014908	GTTT	2	8	19334	19341	0 %	75 %	25 %	0 %	319760045
38	NC_014908	ACCT	2	8	19882	19889	25 %	25 %	0 %	50 %	319760045
39	NC_014908	GGGC	2	8	20189	20196	0 %	0 %	75 %	25 %	319760045
40	NC_014908	AAGC	2	8	20284	20291	50 %	0 %	25 %	25 %	319760045
41	NC_014908	TCAT	2	8	20308	20315	25 %	50 %	0 %	25 %	319760045
42	NC_014908	TCGC	2	8	20448	20455	0 %	25 %	25 %	50 %	319760045
43	NC_014908	ATTC	2	8	20949	20956	25 %	50 %	0 %	25 %	319760045
44	NC_014908	CAAG	2	8	21727	21734	50 %	0 %	25 %	25 %	319760046
45	NC_014908	GGCC	2	8	22164	22171	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
46	NC_014908	GCTC	2	8	23592	23599	0 %	25 %	25 %	50 %	319760049
47	NC_014908	CAGC	2	8	23979	23986	25 %	0 %	25 %	50 %	319760049
48	NC_014908	TGAT	2	8	24038	24045	25 %	50 %	25 %	0 %	319760049
49	NC_014908	CGGC	2	8	24761	24768	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
50	NC_014908	CGGA	2	8	26439	26446	25 %	0 %	50 %	25 %	319760050
51	NC_014908	TGGG	2	8	26458	26465	0 %	25 %	75 %	0 %	319760050
52	NC_014908	CAGG	2	8	26610	26617	25 %	0 %	50 %	25 %	319760050
53	NC_014908	CCCA	2	8	26975	26982	25 %	0 %	0 %	75 %	319760050
54	NC_014908	ACGT	2	8	27695	27702	25 %	25 %	25 %	25 %	319760050
55	NC_014908	CAAG	2	8	27866	27873	50 %	0 %	25 %	25 %	319760050
56	NC_014908	GATT	2	8	28069	28076	25 %	50 %	25 %	0 %	319760050
57	NC_014908	TGCA	2	8	28091	28098	25 %	25 %	25 %	25 %	319760050
58	NC_014908	GAAC	2	8	28124	28131	50 %	0 %	25 %	25 %	319760050
59	NC_014908	CAAA	2	8	28259	28266	75 %	0 %	0 %	25 %	319760050
60	NC_014908	GACC	2	8	29427	29434	25 %	0 %	25 %	50 %	319760051
61	NC_014908	ACCG	2	8	29584	29591	25 %	0 %	25 %	50 %	319760051
62	NC_014908	ATGC	2	8	29869	29876	25 %	25 %	25 %	25 %	319760051
63	NC_014908	GGTT	2	8	29881	29888	0 %	50 %	50 %	0 %	319760051
64	NC_014908	GCCC	2	8	30305	30312	0 %	0 %	25 %	75 %	319760052
65	NC_014908	CGTG	2	8	30770	30777	0 %	25 %	50 %	25 %	319760052
66	NC_014908	GCTT	2	8	30976	30983	0 %	50 %	25 %	25 %	319760052
67	NC_014908	GCTG	2	8	31337	31344	0 %	25 %	50 %	25 %	319760053
68	NC_014908	TGAA	2	8	32514	32521	50 %	25 %	25 %	0 %	319760053
69	NC_014908	AGGG	2	8	32758	32765	25 %	0 %	75 %	0 %	319760054
70	NC_014908	ACAA	2	8	33411	33418	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
71	NC_014908	CAAA	2	8	33522	33529	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
72	NC_014908	TGGT	2	8	33807	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	319760054
73	NC_014908	CAAC	2	8	34228	34235	50 %	0 %	0 %	50 %	319760054
74	NC_014908	GGAT	2	8	34482	34489	25 %	25 %	50 %	0 %	319760054
75	NC_014908	AGTC	2	8	34495	34502	25 %	25 %	25 %	25 %	319760054
76	NC_014908	CAAA	2	8	35013	35020	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
77	NC_014908	CAAT	2	8	35551	35558	50 %	25 %	0 %	25 %	319760054
78	NC_014908	GAAA	2	8	35724	35731	75 %	0 %	25 %	0 %	319760054
79	NC_014908	CATC	2	8	35923	35930	25 %	25 %	0 %	50 %	319760054
80	NC_014908	GCAG	2	8	35964	35971	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
81	NC_014908	CGGC	2	8	36029	36036	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
82	NC_014908	CGAG	2	8	36503	36510	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
83	NC_014908	CCGA	2	8	36571	36578	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
84	NC_014908	CGAG	2	8	36779	36786	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
85	NC_014908	CGAG	2	8	36917	36924	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
86	NC_014908	CGAG	2	8	37055	37062	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
87	NC_014908	CCGA	2	8	37123	37130	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
88	NC_014908	CGAG	2	8	37193	37200	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
89	NC_014908	CGAG	2	8	37331	37338	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
90	NC_014908	CGAG	2	8	37400	37407	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
91	NC_014908	CGAG	2	8	37538	37545	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
92	NC_014908	CGAG	2	8	37676	37683	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
93	NC_014908	CCGA	2	8	37744	37751	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
94	NC_014908	CGAG	2	8	37814	37821	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
95	NC_014908	CGAG	2	8	38021	38028	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
96	NC_014908	AAGG	2	8	38327	38334	50 %	0 %	50 %	0 %	319760054
97	NC_014908	GACC	2	8	38621	38628	25 %	0 %	25 %	50 %	319760055
98	NC_014908	GGCC	2	8	39125	39132	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
99	NC_014908	CAGG	2	8	39242	39249	25 %	0 %	50 %	25 %	319760055
100	NC_014908	ATCG	2	8	39791	39798	25 %	25 %	25 %	25 %	319760056
101	NC_014908	GACG	2	8	39920	39927	25 %	0 %	50 %	25 %	319760056
102	NC_014908	GGCC	2	8	40674	40681	0 %	0 %	50 %	50 %	319760057
103	NC_014908	GCAC	2	8	41226	41233	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
104	NC_014908	TGGC	2	8	41542	41549	0 %	25 %	50 %	25 %	319760058
105	NC_014908	CCAG	2	8	41822	41829	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
106	NC_014908	CAGC	2	8	42528	42535	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
107	NC_014908	CGCC	2	8	43710	43717	0 %	0 %	25 %	75 %	319760059
108	NC_014908	GGCT	2	8	43834	43841	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
109	NC_014908	ACGC	2	8	44291	44298	25 %	0 %	25 %	50 %	319760059
110	NC_014908	CTGG	2	8	44354	44361	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
111	NC_014908	GCTG	2	8	44505	44512	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
112	NC_014908	CACC	2	8	44606	44613	25 %	0 %	0 %	75 %	319760059
113	NC_014908	GAGG	2	8	45141	45148	25 %	0 %	75 %	0 %	319760059
114	NC_014908	TCGC	2	8	46730	46737	0 %	25 %	25 %	50 %	319760061
115	NC_014908	TCGG	2	8	46996	47003	0 %	25 %	50 %	25 %	319760061
116	NC_014908	AAGA	2	8	47182	47189	75 %	0 %	25 %	0 %	319760061
117	NC_014908	CCCG	2	8	48640	48647	0 %	0 %	25 %	75 %	319760065
118	NC_014908	GCGT	2	8	49085	49092	0 %	25 %	50 %	25 %	319760065
119	NC_014908	ATCG	2	8	49199	49206	25 %	25 %	25 %	25 %	319760066
120	NC_014908	TGAG	2	8	49635	49642	25 %	25 %	50 %	0 %	319760066
121	NC_014908	AAGC	2	8	49818	49825	50 %	0 %	25 %	25 %	319760066
122	NC_014908	CGGC	2	8	49915	49922	0 %	0 %	50 %	50 %	319760066
123	NC_014908	ACCG	2	8	50619	50626	25 %	0 %	25 %	50 %	319760067
124	NC_014908	CAAC	2	8	51392	51399	50 %	0 %	0 %	50 %	319760069
125	NC_014908	CGTG	2	8	51510	51517	0 %	25 %	50 %	25 %	319760069
126	NC_014908	CGCA	2	8	51554	51561	25 %	0 %	25 %	50 %	319760069
127	NC_014908	ATCC	2	8	52668	52675	25 %	25 %	0 %	50 %	319760072
128	NC_014908	GCAT	2	8	53692	53699	25 %	25 %	25 %	25 %	319760074
129	NC_014908	CCAA	2	8	53937	53944	50 %	0 %	0 %	50 %	319760075
130	NC_014908	GAGG	2	8	54199	54206	25 %	0 %	75 %	0 %	319760075
131	NC_014908	CTCG	2	8	54260	54267	0 %	25 %	25 %	50 %	319760075
132	NC_014908	ATGC	2	8	54839	54846	25 %	25 %	25 %	25 %	319760076
133	NC_014908	CCAA	2	8	55072	55079	50 %	0 %	0 %	50 %	319760076
134	NC_014908	GTGG	2	8	55572	55579	0 %	25 %	75 %	0 %	319760077
135	NC_014908	GCTG	2	8	55657	55664	0 %	25 %	50 %	25 %	319760077
136	NC_014908	TGAG	2	8	55827	55834	25 %	25 %	50 %	0 %	319760077
137	NC_014908	ATCC	2	8	55968	55975	25 %	25 %	0 %	50 %	319760078
138	NC_014908	GCAT	2	8	56017	56024	25 %	25 %	25 %	25 %	319760078
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.