MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014908	CGT	2	6	59191	59196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760084
1002	NC_014908	TGGC	2	8	59324	59331	0 %	25 %	50 %	25 %	319760084
1003	NC_014908	CA	3	6	59680	59685	50 %	0 %	0 %	50 %	319760085
1004	NC_014908	CGA	2	6	59754	59759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760085
1005	NC_014908	AGGA	2	8	59761	59768	50 %	0 %	50 %	0 %	319760085
1006	NC_014908	CAC	2	6	59868	59873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760085
1007	NC_014908	AGC	2	6	59923	59928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760086
1008	NC_014908	CG	3	6	59984	59989	0 %	0 %	50 %	50 %	319760086
1009	NC_014908	CTA	2	6	59991	59996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760086
1010	NC_014908	CGC	2	6	60038	60043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760086
1011	NC_014908	CAAG	2	8	60060	60067	50 %	0 %	25 %	25 %	319760086
1012	NC_014908	GCT	2	6	60085	60090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760086
1013	NC_014908	GCA	2	6	60471	60476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760087
1014	NC_014908	CAG	2	6	60519	60524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760087
1015	NC_014908	TGA	2	6	60652	60657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760087
1016	NC_014908	CGG	2	6	60670	60675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760087
1017	NC_014908	ACAA	2	8	60813	60820	75 %	0 %	0 %	25 %	319760087
1018	NC_014908	GCA	3	9	60867	60875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760087
1019	NC_014908	CA	3	6	60885	60890	50 %	0 %	0 %	50 %	319760087
1020	NC_014908	GTT	2	6	60902	60907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760087
1021	NC_014908	TTG	2	6	61003	61008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760087
1022	NC_014908	GCCAAG	2	12	61046	61057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760088
1023	NC_014908	ACCC	2	8	61069	61076	25 %	0 %	0 %	75 %	319760088
1024	NC_014908	GGGC	2	8	61104	61111	0 %	0 %	75 %	25 %	319760088
1025	NC_014908	GCA	3	9	61117	61125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760088
1026	NC_014908	AGC	2	6	61126	61131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760088
1027	NC_014908	GC	3	6	61155	61160	0 %	0 %	50 %	50 %	319760088
1028	NC_014908	GGC	2	6	61178	61183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760088
1029	NC_014908	AC	3	6	61258	61263	50 %	0 %	0 %	50 %	319760088
1030	NC_014908	TCG	2	6	61336	61341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760089
1031	NC_014908	GGCGC	2	10	61571	61580	0 %	0 %	60 %	40 %	319760089
1032	NC_014908	GGC	2	6	61600	61605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760089
1033	NC_014908	AG	3	6	61771	61776	50 %	0 %	50 %	0 %	319760090
1034	NC_014908	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	319760090
1035	NC_014908	GCA	2	6	61796	61801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760090
1036	NC_014908	GAT	2	6	61865	61870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760090
1037	NC_014908	CAA	2	6	62212	62217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760091
1038	NC_014908	CAA	2	6	62224	62229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760091
1039	NC_014908	CAG	2	6	62320	62325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760091
1040	NC_014908	TCG	2	6	62343	62348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760091
1041	NC_014908	GAAAG	2	10	62393	62402	60 %	0 %	40 %	0 %	319760091
1042	NC_014908	AGA	2	6	62437	62442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760092
1043	NC_014908	ACG	2	6	62446	62451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760092
1044	NC_014908	GCG	3	9	62460	62468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760092
1045	NC_014908	CGAG	2	8	62479	62486	25 %	0 %	50 %	25 %	319760092
1046	NC_014908	GCT	2	6	62517	62522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760092
1047	NC_014908	TG	3	6	62597	62602	0 %	50 %	50 %	0 %	319760092
1048	NC_014908	AGC	2	6	63129	63134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760093
1049	NC_014908	ATG	2	6	63254	63259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760094
1050	NC_014908	TGA	2	6	63267	63272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760094
1051	NC_014908	GC	3	6	63296	63301	0 %	0 %	50 %	50 %	319760094
1052	NC_014908	CTG	2	6	63571	63576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760094
1053	NC_014908	TTC	2	6	63578	63583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760094
1054	NC_014908	AC	3	6	63648	63653	50 %	0 %	0 %	50 %	319760095
1055	NC_014908	CTG	2	6	63664	63669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760095
1056	NC_014908	GGA	2	6	63696	63701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760095
1057	NC_014908	CCA	2	6	63813	63818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760095
1058	NC_014908	GC	3	6	63835	63840	0 %	0 %	50 %	50 %	319760095
1059	NC_014908	CGC	2	6	63877	63882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760095
1060	NC_014908	GAC	2	6	64356	64361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760096
1061	NC_014908	GGA	2	6	64391	64396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760096
1062	NC_014908	ACG	2	6	64426	64431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760096
1063	NC_014908	AAAG	2	8	64442	64449	75 %	0 %	25 %	0 %	319760096
1064	NC_014908	TAC	2	6	64503	64508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760096
1065	NC_014908	CAA	2	6	64624	64629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760097
1066	NC_014908	CAA	2	6	64636	64641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760097
1067	NC_014908	CAG	2	6	64732	64737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760097
1068	NC_014908	TCG	2	6	64755	64760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760097
1069	NC_014908	GAAAG	2	10	64805	64814	60 %	0 %	40 %	0 %	319760097
1070	NC_014908	GCT	2	6	64830	64835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760098
1071	NC_014908	CGT	2	6	64868	64873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760098
1072	NC_014908	GCA	2	6	65018	65023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760098
1073	NC_014908	AGC	2	6	65212	65217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760099
1074	NC_014908	GCA	2	6	66182	66187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1075	NC_014908	TTC	2	6	66189	66194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760100
1076	NC_014908	GC	3	6	66270	66275	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
1077	NC_014908	TCA	2	6	66290	66295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760100
1078	NC_014908	CGG	2	6	66296	66301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760100
1079	NC_014908	CCGC	2	8	66302	66309	0 %	0 %	25 %	75 %	319760100
1080	NC_014908	CG	3	6	66315	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
1081	NC_014908	AAC	2	6	66334	66339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760100
1082	NC_014908	TTG	2	6	66388	66393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760100
1083	NC_014908	CGG	2	6	66396	66401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760100
1084	NC_014908	CGA	2	6	66416	66421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1085	NC_014908	CTG	2	6	66492	66497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1086	NC_014908	GCA	2	6	66503	66508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1087	NC_014908	TGC	2	6	66547	66552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1088	NC_014908	GCC	2	6	66577	66582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760100
1089	NC_014908	GAA	2	6	66675	66680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760100
1090	NC_014908	GTC	2	6	66753	66758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1091	NC_014908	TCA	2	6	66934	66939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760100
1092	NC_014908	CCA	2	6	67112	67117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760100
1093	NC_014908	CAG	2	6	67128	67133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1094	NC_014908	GGT	2	6	67317	67322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760100
1095	NC_014908	CGCGG	2	10	67346	67355	0 %	0 %	60 %	40 %	319760100
1096	NC_014908	GGC	2	6	67414	67419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760100
1097	NC_014908	CCG	2	6	67445	67450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760100
1098	NC_014908	CAG	2	6	67476	67481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1099	NC_014908	GCG	2	6	67516	67521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760100
1100	NC_014908	AGC	2	6	67537	67542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1101	NC_014908	GC	3	6	67541	67546	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
1102	NC_014908	GC	4	8	67571	67578	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
1103	NC_014908	CAG	2	6	67596	67601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1104	NC_014908	TCG	2	6	67654	67659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760100
1105	NC_014908	TGGC	2	8	67667	67674	0 %	25 %	50 %	25 %	319760100
1106	NC_014908	GC	3	6	67888	67893	0 %	0 %	50 %	50 %	319760101
1107	NC_014908	GCCA	2	8	67895	67902	25 %	0 %	25 %	50 %	319760101
1108	NC_014908	CT	3	6	67944	67949	0 %	50 %	0 %	50 %	319760101
1109	NC_014908	CG	3	6	68029	68034	0 %	0 %	50 %	50 %	319760101
1110	NC_014908	GTG	2	6	68048	68053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760101
1111	NC_014908	GCCA	2	8	68054	68061	25 %	0 %	25 %	50 %	319760101
1112	NC_014908	CAA	2	6	68085	68090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760102
1113	NC_014908	GCA	2	6	68096	68101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760102
1114	NC_014908	CGG	2	6	68114	68119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760102
1115	NC_014908	CAG	2	6	68222	68227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760102
1116	NC_014908	CGG	2	6	68232	68237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760102
1117	NC_014908	CCG	2	6	68387	68392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760102
1118	NC_014908	GGCA	2	8	68414	68421	25 %	0 %	50 %	25 %	319760102
1119	NC_014908	CCA	2	6	68423	68428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760102
1120	NC_014908	GGTGC	2	10	68454	68463	0 %	20 %	60 %	20 %	319760102
1121	NC_014908	CCT	2	6	68599	68604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760103
1122	NC_014908	CGC	2	6	68647	68652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760103
1123	NC_014908	CAA	2	6	68725	68730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760103
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1125	NC_014908	GGC	2	6	68908	68913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760103
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1251	NC_014908	CGT	2	6	75932	75937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760110
1252	NC_014908	GTC	2	6	76006	76011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760110
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1254	NC_014908	GGC	2	6	76912	76917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760111
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1360	NC_014908	CCGG	2	8	82766	82773	0 %	0 %	50 %	50 %	319760119
1361	NC_014908	GCC	2	6	82806	82811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760119
1362	NC_014908	C	6	6	82810	82815	0 %	0 %	0 %	100 %	319760119
1363	NC_014908	CCA	2	6	82871	82876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760119
1364	NC_014908	TCAG	2	8	82885	82892	25 %	25 %	25 %	25 %	319760119
1365	NC_014908	GCG	2	6	82893	82898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760119
1366	NC_014908	GGCGTC	2	12	82902	82913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319760119
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1368	NC_014908	GGC	2	6	83158	83163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760120
1369	NC_014908	TCC	2	6	83166	83171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760120
1370	NC_014908	GGC	3	9	83178	83186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760120
1371	NC_014908	GTG	2	6	83187	83192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760120
1372	NC_014908	GGC	2	6	83199	83204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760120
1373	NC_014908	GCAGCG	2	12	83242	83253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319760120
1374	NC_014908	GTC	2	6	83297	83302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760120
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1376	NC_014908	CG	3	6	83371	83376	0 %	0 %	50 %	50 %	319760120
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1500	NC_014908	CTG	2	6	90170	90175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760125

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