MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX01

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014818	CGTGG	2	10	468	477	0 %	20 %	60 %	20 %	315500505
2	NC_014818	ACGCC	2	10	748	757	20 %	0 %	20 %	60 %	315500505
3	NC_014818	AGCGC	2	10	1799	1808	20 %	0 %	40 %	40 %	315500506
4	NC_014818	GCAGA	2	10	3559	3568	40 %	0 %	40 %	20 %	315500507
5	NC_014818	CTTCG	2	10	5068	5077	0 %	40 %	20 %	40 %	315500509
6	NC_014818	GCGCG	2	10	5775	5784	0 %	0 %	60 %	40 %	315500510
7	NC_014818	GCGCA	2	10	5913	5922	20 %	0 %	40 %	40 %	315500510
8	NC_014818	AGTTC	2	10	6039	6048	20 %	40 %	20 %	20 %	315500510
9	NC_014818	ACGGC	2	10	9667	9676	20 %	0 %	40 %	40 %	315500513
10	NC_014818	GCGCT	2	10	11200	11209	0 %	20 %	40 %	40 %	315500514
11	NC_014818	CGCGG	2	10	11459	11468	0 %	0 %	60 %	40 %	315500514
12	NC_014818	CTCAA	2	10	11564	11573	40 %	20 %	0 %	40 %	315500514
13	NC_014818	CCGGC	2	10	12204	12213	0 %	0 %	40 %	60 %	315500514
14	NC_014818	TCGGC	2	10	16690	16699	0 %	20 %	40 %	40 %	315500516
15	NC_014818	GCCCT	2	10	17205	17214	0 %	20 %	20 %	60 %	315500516
16	NC_014818	GAAGG	2	10	17599	17608	40 %	0 %	60 %	0 %	315500517
17	NC_014818	GCCTC	2	10	19877	19886	0 %	20 %	20 %	60 %	315500518
18	NC_014818	GAGTC	2	10	20695	20704	20 %	20 %	40 %	20 %	315500519
19	NC_014818	GAAGC	2	10	21007	21016	40 %	0 %	40 %	20 %	315500520
20	NC_014818	ACCGC	2	10	21092	21101	20 %	0 %	20 %	60 %	315500520
21	NC_014818	GCGCC	2	10	24214	24223	0 %	0 %	40 %	60 %	315500524
22	NC_014818	AGTCC	2	10	27884	27893	20 %	20 %	20 %	40 %	315500527
23	NC_014818	GAAGT	2	10	28041	28050	40 %	20 %	40 %	0 %	315500527
24	NC_014818	GACGC	2	10	29504	29513	20 %	0 %	40 %	40 %	315500528
25	NC_014818	GCCCC	2	10	30767	30776	0 %	0 %	20 %	80 %	315500528
26	NC_014818	CGACG	2	10	34189	34198	20 %	0 %	40 %	40 %	315500531
27	NC_014818	TCCGA	2	10	35422	35431	20 %	20 %	20 %	40 %	315500532
28	NC_014818	CCTTC	2	10	36969	36978	0 %	40 %	0 %	60 %	315500533
29	NC_014818	ATCTG	2	10	37191	37200	20 %	40 %	20 %	20 %	315500533
30	NC_014818	GGGTG	2	10	38404	38413	0 %	20 %	80 %	0 %	315500533
31	NC_014818	TCCGT	2	10	40509	40518	0 %	40 %	20 %	40 %	315500535
32	NC_014818	GGTCG	2	10	41416	41425	0 %	20 %	60 %	20 %	315500535
33	NC_014818	CTGCG	2	10	43420	43429	0 %	20 %	40 %	40 %	315500536
34	NC_014818	TGGCG	2	10	46048	46057	0 %	20 %	60 %	20 %	315500537
35	NC_014818	TGCCG	2	10	46260	46269	0 %	20 %	40 %	40 %	315500537
36	NC_014818	CCGAC	2	10	49741	49750	20 %	0 %	20 %	60 %	315500539
37	NC_014818	GGGAC	2	10	52873	52882	20 %	0 %	60 %	20 %	315500542
38	NC_014818	CAGCT	2	10	56249	56258	20 %	20 %	20 %	40 %	315500545
39	NC_014818	CTCGC	2	10	57781	57790	0 %	20 %	20 %	60 %	315500546
40	NC_014818	AATTC	2	10	58049	58058	40 %	40 %	0 %	20 %	315500546
41	NC_014818	TATGG	2	10	59855	59864	20 %	40 %	40 %	0 %	315500548
42	NC_014818	GCGTC	2	10	59926	59935	0 %	20 %	40 %	40 %	315500548
43	NC_014818	AATCC	2	10	61834	61843	40 %	20 %	0 %	40 %	315500549
44	NC_014818	GGGCA	2	10	65445	65454	20 %	0 %	60 %	20 %	315500552
45	NC_014818	CATCG	2	10	66845	66854	20 %	20 %	20 %	40 %	315500553
46	NC_014818	TTGGG	2	10	70547	70556	0 %	40 %	60 %	0 %	315500556
47	NC_014818	CAGCC	2	10	73103	73112	20 %	0 %	20 %	60 %	315500557
48	NC_014818	CGCCC	2	10	75304	75313	0 %	0 %	20 %	80 %	315500558
49	NC_014818	ACTTC	2	10	75379	75388	20 %	40 %	0 %	40 %	315500559
50	NC_014818	GACGT	2	10	78743	78752	20 %	20 %	40 %	20 %	315500562
51	NC_014818	GCACC	2	10	80780	80789	20 %	0 %	20 %	60 %	315500563
52	NC_014818	CACGG	2	10	81208	81217	20 %	0 %	40 %	40 %	315500563
53	NC_014818	CACCT	2	10	83645	83654	20 %	20 %	0 %	60 %	315500566
54	NC_014818	TGCGG	2	10	83901	83910	0 %	20 %	60 %	20 %	315500566
55	NC_014818	GGTGC	2	10	87409	87418	0 %	20 %	60 %	20 %	315500568
56	NC_014818	GGGTC	2	10	89880	89889	0 %	20 %	60 %	20 %	315500570
57	NC_014818	GCCTG	2	10	90536	90545	0 %	20 %	40 %	40 %	315500570
58	NC_014818	AGCGT	2	10	91025	91034	20 %	20 %	40 %	20 %	315500571
59	NC_014818	GCGCC	2	10	91802	91811	0 %	0 %	40 %	60 %	315500571
60	NC_014818	GGGGC	2	10	92781	92790	0 %	0 %	80 %	20 %	315500571
61	NC_014818	GCGCG	2	10	96169	96178	0 %	0 %	60 %	40 %	315500572
62	NC_014818	GCCCC	2	10	98057	98066	0 %	0 %	20 %	80 %	315500574
63	NC_014818	CGTGG	2	10	99960	99969	0 %	20 %	60 %	20 %	315500575
64	NC_014818	CCGAT	2	10	100469	100478	20 %	20 %	20 %	40 %	315500575
65	NC_014818	GCGCC	2	10	101196	101205	0 %	0 %	40 %	60 %	315500575
66	NC_014818	GCTGG	2	10	101373	101382	0 %	20 %	60 %	20 %	315500575
67	NC_014818	CGGGA	2	10	101387	101396	20 %	0 %	60 %	20 %	315500575
68	NC_014818	CGGGC	2	10	101667	101676	0 %	0 %	60 %	40 %	315500575
69	NC_014818	GAAGG	2	10	103109	103118	40 %	0 %	60 %	0 %	315500577
70	NC_014818	ACGGT	2	10	103203	103212	20 %	20 %	40 %	20 %	315500577
71	NC_014818	CATTG	2	10	104062	104071	20 %	40 %	20 %	20 %	315500577
72	NC_014818	GCCCC	2	10	104946	104955	0 %	0 %	20 %	80 %	315500577
73	NC_014818	CCCAG	2	10	106334	106343	20 %	0 %	20 %	60 %	315500578
74	NC_014818	GCCGC	2	10	109336	109345	0 %	0 %	40 %	60 %	315500579
75	NC_014818	CCCGG	2	10	113669	113678	0 %	0 %	40 %	60 %	315500580
76	NC_014818	CGCGG	2	10	114764	114773	0 %	0 %	60 %	40 %	315500580
77	NC_014818	CGGCG	2	10	116637	116646	0 %	0 %	60 %	40 %	315500581
78	NC_014818	TGCGC	2	10	117333	117342	0 %	20 %	40 %	40 %	315500581
79	NC_014818	CCATG	2	10	117804	117813	20 %	20 %	20 %	40 %	315500581
80	NC_014818	GCGCC	2	10	119763	119772	0 %	0 %	40 %	60 %	315500582
81	NC_014818	GCCGA	2	10	120036	120045	20 %	0 %	40 %	40 %	315500582
82	NC_014818	GGACG	2	10	123940	123949	20 %	0 %	60 %	20 %	315500584
83	NC_014818	TGGGG	2	10	125047	125056	0 %	20 %	80 %	0 %	315500585
84	NC_014818	GGATG	2	10	125372	125381	20 %	20 %	60 %	0 %	315500585
85	NC_014818	CTCAG	2	10	125385	125394	20 %	20 %	20 %	40 %	315500585
86	NC_014818	GATCG	2	10	128668	128677	20 %	20 %	40 %	20 %	315500586
87	NC_014818	AAGGC	2	10	130770	130779	40 %	0 %	40 %	20 %	315500587
88	NC_014818	GGCCG	2	10	132007	132016	0 %	0 %	60 %	40 %	315500588
89	NC_014818	CTGCC	2	10	135366	135375	0 %	20 %	20 %	60 %	315500589
90	NC_014818	AGTGG	2	10	135431	135440	20 %	20 %	60 %	0 %	315500589
91	NC_014818	CGGTC	2	10	136823	136832	0 %	20 %	40 %	40 %	315500591
92	NC_014818	AACGG	2	10	137049	137058	40 %	0 %	40 %	20 %	315500591
93	NC_014818	GTCGC	2	10	137075	137084	0 %	20 %	40 %	40 %	315500591
94	NC_014818	GCGCC	2	10	137666	137675	0 %	0 %	40 %	60 %	315500591
95	NC_014818	CAGTG	2	10	138266	138275	20 %	20 %	40 %	20 %	315500591
96	NC_014818	ATCAG	2	10	139202	139211	40 %	20 %	20 %	20 %	315500592
97	NC_014818	TCCAG	2	10	143115	143124	20 %	20 %	20 %	40 %	315500594
98	NC_014818	CTGGC	2	10	150595	150604	0 %	20 %	40 %	40 %	315500597
99	NC_014818	TTGTG	2	10	151461	151470	0 %	60 %	40 %	0 %	315500597
100	NC_014818	CAGTT	2	10	154233	154242	20 %	40 %	20 %	20 %	315500600
101	NC_014818	CGGTT	2	10	157496	157505	0 %	40 %	40 %	20 %	315500601
102	NC_014818	AGCGG	2	10	161243	161252	20 %	0 %	60 %	20 %	315500604
103	NC_014818	CAGCA	2	10	167424	167433	40 %	0 %	20 %	40 %	315500608
104	NC_014818	CCGTC	2	10	172041	172050	0 %	20 %	20 %	60 %	315500611
105	NC_014818	CTCGG	2	10	174332	174341	0 %	20 %	40 %	40 %	315500612
106	NC_014818	CTCGC	2	10	174536	174545	0 %	20 %	20 %	60 %	315500612
107	NC_014818	CAGGG	2	10	175254	175263	20 %	0 %	60 %	20 %	315500612
108	NC_014818	TCAGG	2	10	175345	175354	20 %	20 %	40 %	20 %	315500612
109	NC_014818	AGACC	2	10	176580	176589	40 %	0 %	20 %	40 %	315500613
110	NC_014818	CCATT	2	10	179904	179913	20 %	40 %	0 %	40 %	315500614
111	NC_014818	GCGAC	2	10	180460	180469	20 %	0 %	40 %	40 %	315500614
112	NC_014818	GCGCG	2	10	180806	180815	0 %	0 %	60 %	40 %	315500614
113	NC_014818	TGGTG	2	10	185108	185117	0 %	40 %	60 %	0 %	315500616
114	NC_014818	TCGTG	2	10	185162	185171	0 %	40 %	40 %	20 %	315500616
115	NC_014818	CACAC	2	10	186132	186141	40 %	0 %	0 %	60 %	315500617
116	NC_014818	CAGTT	2	10	187928	187937	20 %	40 %	20 %	20 %	315500619
117	NC_014818	CGGGC	2	10	187954	187963	0 %	0 %	60 %	40 %	315500619
118	NC_014818	ACGGG	2	10	198489	198498	20 %	0 %	60 %	20 %	315500634
119	NC_014818	CCGCT	2	10	200014	200023	0 %	20 %	20 %	60 %	315500634
120	NC_014818	GCGAG	2	10	201041	201050	20 %	0 %	60 %	20 %	315500635
121	NC_014818	CGCTC	2	10	201283	201292	0 %	20 %	20 %	60 %	315500635
122	NC_014818	GTCAG	2	10	202378	202387	20 %	20 %	40 %	20 %	315500636
123	NC_014818	GTCTG	2	10	203232	203241	0 %	40 %	40 %	20 %	315500637
124	NC_014818	GGGTT	2	10	204742	204751	0 %	40 %	60 %	0 %	315500638
125	NC_014818	CCGGC	2	10	205010	205019	0 %	0 %	40 %	60 %	315500639
126	NC_014818	GGCTG	2	10	207252	207261	0 %	20 %	60 %	20 %	315500641
127	NC_014818	CGCGT	2	10	209130	209139	0 %	20 %	40 %	40 %	315500642
128	NC_014818	TGGTG	2	10	209794	209803	0 %	40 %	60 %	0 %	315500644
129	NC_014818	TGCTG	2	10	209914	209923	0 %	40 %	40 %	20 %	315500644
130	NC_014818	GAGCC	2	10	210836	210845	20 %	0 %	40 %	40 %	315500645
131	NC_014818	GTCAT	2	10	211964	211973	20 %	40 %	20 %	20 %	315500646
132	NC_014818	TCGCC	2	10	212066	212075	0 %	20 %	20 %	60 %	315500646
133	NC_014818	GCAAG	2	10	214619	214628	40 %	0 %	40 %	20 %	315500647
134	NC_014818	GCCAC	2	10	214808	214817	20 %	0 %	20 %	60 %	315500648
135	NC_014818	GCCGA	2	10	216597	216606	20 %	0 %	40 %	40 %	315500649
136	NC_014818	GCCCG	2	10	217107	217116	0 %	0 %	40 %	60 %	315500650
137	NC_014818	ACGGC	2	10	217512	217521	20 %	0 %	40 %	40 %	315500650
138	NC_014818	ACCTG	2	10	220853	220862	20 %	20 %	20 %	40 %	315500654
139	NC_014818	CCCGC	2	10	222750	222759	0 %	0 %	20 %	80 %	315500654
140	NC_014818	CTGGA	2	10	224383	224392	20 %	20 %	40 %	20 %	315500656
141	NC_014818	ATTTC	2	10	225583	225592	20 %	60 %	0 %	20 %	315500657
142	NC_014818	TGCCG	2	10	228934	228943	0 %	20 %	40 %	40 %	315500661
143	NC_014818	CCGGC	2	10	229446	229455	0 %	0 %	40 %	60 %	315500662
144	NC_014818	CGTCG	2	10	230985	230994	0 %	20 %	40 %	40 %	315500664
145	NC_014818	CCCCG	2	10	233003	233012	0 %	0 %	20 %	80 %	315500664
146	NC_014818	GATAG	2	10	235431	235440	40 %	20 %	40 %	0 %	315500665
147	NC_014818	GGTCA	2	10	235704	235713	20 %	20 %	40 %	20 %	315500665
148	NC_014818	CCGCG	2	10	238254	238263	0 %	0 %	40 %	60 %	315500668
149	NC_014818	AGCCC	2	10	238869	238878	20 %	0 %	20 %	60 %	315500668
150	NC_014818	CGCCT	2	10	240518	240527	0 %	20 %	20 %	60 %	315500671
151	NC_014818	AGACG	2	10	241017	241026	40 %	0 %	40 %	20 %	315500672
152	NC_014818	GTTGA	2	10	241575	241584	20 %	40 %	40 %	0 %	315500673
153	NC_014818	GGGCT	2	10	242284	242293	0 %	20 %	60 %	20 %	315500674
154	NC_014818	TGGGC	2	10	242294	242303	0 %	20 %	60 %	20 %	315500674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.