MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 plasmid S57

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014629	GTTG	2	8	802	809	0 %	50 %	50 %	0 %	312193366
2	NC_014629	TGTT	2	8	1318	1325	0 %	75 %	25 %	0 %	312193367
3	NC_014629	AAAG	2	8	2275	2282	75 %	0 %	25 %	0 %	312193369
4	NC_014629	TCAA	2	8	2388	2395	50 %	25 %	0 %	25 %	312193369
5	NC_014629	CGCC	2	8	2590	2597	0 %	0 %	25 %	75 %	312193369
6	NC_014629	ATTT	2	8	2811	2818	25 %	75 %	0 %	0 %	312193370
7	NC_014629	CTAA	2	8	3888	3895	50 %	25 %	0 %	25 %	312193371
8	NC_014629	CAAG	2	8	5792	5799	50 %	0 %	25 %	25 %	312193375
9	NC_014629	CGCA	2	8	6284	6291	25 %	0 %	25 %	50 %	312193376
10	NC_014629	AAAC	2	8	6419	6426	75 %	0 %	0 %	25 %	312193377
11	NC_014629	TAAA	2	8	6658	6665	75 %	25 %	0 %	0 %	312193377
12	NC_014629	AATA	2	8	8670	8677	75 %	25 %	0 %	0 %	312193382
13	NC_014629	ACGA	2	8	9183	9190	50 %	0 %	25 %	25 %	312193383
14	NC_014629	TTTA	2	8	9394	9401	25 %	75 %	0 %	0 %	312193383
15	NC_014629	TTCT	2	8	9454	9461	0 %	75 %	0 %	25 %	312193383
16	NC_014629	AGTA	2	8	9726	9733	50 %	25 %	25 %	0 %	312193383
17	NC_014629	AAAG	2	8	9913	9920	75 %	0 %	25 %	0 %	312193383
18	NC_014629	GAAA	2	8	10594	10601	75 %	0 %	25 %	0 %	312193385
19	NC_014629	CATA	2	8	10811	10818	50 %	25 %	0 %	25 %	312193386
20	NC_014629	TAAG	2	8	11442	11449	50 %	25 %	25 %	0 %	312193388
21	NC_014629	GCAA	2	8	12101	12108	50 %	0 %	25 %	25 %	312193389
22	NC_014629	AATA	2	8	12557	12564	75 %	25 %	0 %	0 %	312193391
23	NC_014629	TTTA	2	8	13224	13231	25 %	75 %	0 %	0 %	312193394
24	NC_014629	ACAT	2	8	13233	13240	50 %	25 %	0 %	25 %	312193394
25	NC_014629	TTGA	2	8	13282	13289	25 %	50 %	25 %	0 %	312193394
26	NC_014629	TTCA	2	8	13745	13752	25 %	50 %	0 %	25 %	312193395
27	NC_014629	GCAA	2	8	14390	14397	50 %	0 %	25 %	25 %	312193396
28	NC_014629	GGTT	2	8	14596	14603	0 %	50 %	50 %	0 %	312193396
29	NC_014629	AAAT	2	8	14697	14704	75 %	25 %	0 %	0 %	312193396
30	NC_014629	ACCT	2	8	15766	15773	25 %	25 %	0 %	50 %	312193397
31	NC_014629	ATTT	2	8	15781	15788	25 %	75 %	0 %	0 %	312193397
32	NC_014629	CATG	2	8	15849	15856	25 %	25 %	25 %	25 %	312193397
33	NC_014629	GGCG	2	8	16498	16505	0 %	0 %	75 %	25 %	312193397
34	NC_014629	AAAT	2	8	17808	17815	75 %	25 %	0 %	0 %	312193398
35	NC_014629	TCGT	2	8	17929	17936	0 %	50 %	25 %	25 %	312193399
36	NC_014629	GTAC	2	8	18424	18431	25 %	25 %	25 %	25 %	312193399
37	NC_014629	AACG	2	8	18946	18953	50 %	0 %	25 %	25 %	312193400
38	NC_014629	TTGC	2	8	18969	18976	0 %	50 %	25 %	25 %	312193400
39	NC_014629	TAGG	2	8	19936	19943	25 %	25 %	50 %	0 %	312193402
40	NC_014629	ACAA	2	8	20234	20241	75 %	0 %	0 %	25 %	312193402
41	NC_014629	GACT	2	8	20627	20634	25 %	25 %	25 %	25 %	312193402
42	NC_014629	ATGA	2	8	20657	20664	50 %	25 %	25 %	0 %	312193402
43	NC_014629	CTTG	2	8	20737	20744	0 %	50 %	25 %	25 %	312193403
44	NC_014629	ATTA	2	8	20941	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	312193404
45	NC_014629	TCAT	2	8	21004	21011	25 %	50 %	0 %	25 %	312193404
46	NC_014629	CTTT	2	8	21115	21122	0 %	75 %	0 %	25 %	312193404
47	NC_014629	ATTT	2	8	21390	21397	25 %	75 %	0 %	0 %	312193404
48	NC_014629	AGAA	2	8	22200	22207	75 %	0 %	25 %	0 %	312193405
49	NC_014629	TAAC	2	8	22515	22522	50 %	25 %	0 %	25 %	312193405
50	NC_014629	CTGT	2	8	23269	23276	0 %	50 %	25 %	25 %	312193405
51	NC_014629	AAGC	2	8	23673	23680	50 %	0 %	25 %	25 %	312193405

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.